MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 19338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018644	GTT	2	6	259623	259628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707308
3502	NC_018644	TAA	2	6	259634	259639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707308
3503	NC_018644	TAT	2	6	259696	259701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707308
3504	NC_018644	TGA	2	6	259867	259872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707308
3505	NC_018644	TAA	2	6	259892	259897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707308
3506	NC_018644	AGA	2	6	260080	260085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707308
3507	NC_018644	AGA	2	6	260121	260126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707308
3508	NC_018644	TAG	2	6	260186	260191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_018644	TGT	2	6	260242	260247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_018644	CTT	2	6	260332	260337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_018644	GGT	2	6	260513	260518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_018644	GAT	2	6	260520	260525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707309
3513	NC_018644	TTC	2	6	260540	260545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707309
3514	NC_018644	CGT	2	6	260673	260678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707309
3515	NC_018644	GAA	2	6	260756	260761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707309
3516	NC_018644	ACA	2	6	260863	260868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707309
3517	NC_018644	TCG	2	6	260892	260897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707309
3518	NC_018644	GAA	2	6	260915	260920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707309
3519	NC_018644	ATT	2	6	261044	261049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707309
3520	NC_018644	TGA	2	6	261261	261266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707309
3521	NC_018644	ATG	2	6	261415	261420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707309
3522	NC_018644	ATT	2	6	261514	261519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707309
3523	NC_018644	TCC	2	6	261768	261773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707309
3524	NC_018644	CAC	2	6	261780	261785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707309
3525	NC_018644	AGA	2	6	261786	261791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707309
3526	NC_018644	AAT	2	6	261801	261806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707309
3527	NC_018644	GCT	2	6	261962	261967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707310
3528	NC_018644	AAT	2	6	261978	261983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707310
3529	NC_018644	TGA	2	6	262100	262105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707310
3530	NC_018644	ACA	2	6	262188	262193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707310
3531	NC_018644	AGT	2	6	262249	262254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707310
3532	NC_018644	CAG	3	9	262375	262383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707310
3533	NC_018644	ATG	2	6	262400	262405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707310
3534	NC_018644	GGC	2	6	262463	262468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707310
3535	NC_018644	CAC	2	6	262505	262510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707310
3536	NC_018644	ATT	2	6	262547	262552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707310
3537	NC_018644	ACA	2	6	262593	262598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707310
3538	NC_018644	ATA	2	6	262617	262622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707310
3539	NC_018644	GAA	2	6	262777	262782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707310
3540	NC_018644	AGG	2	6	262962	262967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_018644	TGA	2	6	263021	263026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707311
3542	NC_018644	CAA	2	6	263056	263061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707311
3543	NC_018644	ATA	2	6	263062	263067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707311
3544	NC_018644	CTT	2	6	263074	263079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707311
3545	NC_018644	TCT	2	6	263183	263188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707311
3546	NC_018644	TCA	2	6	263305	263310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707311
3547	NC_018644	TTA	2	6	263409	263414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707311
3548	NC_018644	AAT	2	6	263423	263428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707311
3549	NC_018644	CAA	2	6	263485	263490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707312
3550	NC_018644	AAT	2	6	263527	263532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707312
3551	NC_018644	ACT	2	6	263643	263648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707312
3552	NC_018644	GTT	2	6	263697	263702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707312
3553	NC_018644	CTT	2	6	263719	263724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707312
3554	NC_018644	TCC	3	9	263786	263794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707312
3555	NC_018644	ATT	2	6	263846	263851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707312
3556	NC_018644	GAC	2	6	263880	263885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707312
3557	NC_018644	TGA	2	6	263964	263969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707312
3558	NC_018644	ATG	2	6	263978	263983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707312
3559	NC_018644	CAT	2	6	264022	264027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707312
3560	NC_018644	TAT	2	6	264103	264108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_018644	GCT	2	6	264207	264212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707313
3562	NC_018644	TTC	2	6	264220	264225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707313
3563	NC_018644	ATT	2	6	264261	264266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707313
3564	NC_018644	ATC	2	6	264290	264295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707313
3565	NC_018644	AAC	2	6	264350	264355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707313
3566	NC_018644	ATT	2	6	264384	264389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707313
3567	NC_018644	TAA	2	6	264670	264675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707313
3568	NC_018644	ATT	2	6	264811	264816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707313
3569	NC_018644	TAG	2	6	265023	265028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707314
3570	NC_018644	CGA	2	6	265034	265039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707314
3571	NC_018644	CTG	2	6	265068	265073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707314
3572	NC_018644	TCA	2	6	265097	265102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707314
3573	NC_018644	TCT	2	6	265160	265165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707314
3574	NC_018644	TCA	2	6	265256	265261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707314
3575	NC_018644	CTT	2	6	265296	265301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707314
3576	NC_018644	CAT	2	6	265311	265316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707314
3577	NC_018644	CTT	2	6	265434	265439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707314
3578	NC_018644	ACA	2	6	265472	265477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707314
3579	NC_018644	GAT	2	6	265555	265560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707314
3580	NC_018644	ATA	2	6	265868	265873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707314
3581	NC_018644	ACG	2	6	265910	265915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707314
3582	NC_018644	CAT	2	6	266108	266113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707315
3583	NC_018644	ATT	2	6	266213	266218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707315
3584	NC_018644	AAG	2	6	266230	266235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707315
3585	NC_018644	GCA	2	6	266271	266276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707315
3586	NC_018644	ACT	2	6	266418	266423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707315
3587	NC_018644	ATA	2	6	266640	266645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707315
3588	NC_018644	AAC	2	6	266657	266662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707315
3589	NC_018644	ACC	2	6	266804	266809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707315
3590	NC_018644	CAT	2	6	266884	266889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707315
3591	NC_018644	GAA	2	6	267004	267009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707315
3592	NC_018644	AAG	2	6	267079	267084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707316
3593	NC_018644	TCT	2	6	267090	267095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707316
3594	NC_018644	GAT	2	6	267151	267156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707316
3595	NC_018644	AAC	2	6	267275	267280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707316
3596	NC_018644	ATT	2	6	267308	267313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707316
3597	NC_018644	CTA	2	6	267421	267426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707316
3598	NC_018644	GCG	2	6	267603	267608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707316
3599	NC_018644	TGC	2	6	267682	267687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707317
3600	NC_018644	GAC	2	6	267732	267737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707317
3601	NC_018644	CTT	3	9	267870	267878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707317
3602	NC_018644	TGA	2	6	268200	268205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707317
3603	NC_018644	CAT	2	6	268227	268232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707317
3604	NC_018644	AGT	2	6	268321	268326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707317
3605	NC_018644	TAT	2	6	268474	268479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707317
3606	NC_018644	CAC	2	6	268656	268661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707317
3607	NC_018644	GAT	2	6	268705	268710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707317
3608	NC_018644	CAT	2	6	268974	268979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707317
3609	NC_018644	GAT	2	6	268995	269000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707317
3610	NC_018644	AAT	2	6	269018	269023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707317
3611	NC_018644	CAG	2	6	269077	269082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707318
3612	NC_018644	CTT	2	6	269086	269091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707318
3613	NC_018644	CTT	3	9	269128	269136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707318
3614	NC_018644	CTT	3	9	269140	269148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707318
3615	NC_018644	GAG	2	6	269149	269154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707318
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3617	NC_018644	TTC	2	6	269222	269227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707318
3618	NC_018644	TAG	2	6	269251	269256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707318
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3620	NC_018644	TAA	2	6	269337	269342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707318
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3979	NC_018644	AGG	2	6	292585	292590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707348
3980	NC_018644	TCA	2	6	292697	292702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707348
3981	NC_018644	TCA	2	6	292979	292984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707348
3982	NC_018644	AAG	2	6	293016	293021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707348
3983	NC_018644	AAT	2	6	293052	293057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707348
3984	NC_018644	TTA	2	6	293169	293174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707348
3985	NC_018644	CAA	2	6	293226	293231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707348
3986	NC_018644	ATT	2	6	293266	293271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3987	NC_018644	GCG	2	6	293388	293393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707349
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3990	NC_018644	GCA	2	6	293628	293633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707349
3991	NC_018644	TTC	2	6	293639	293644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707349
3992	NC_018644	AGC	2	6	293714	293719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707349
3993	NC_018644	TCA	2	6	293814	293819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707349
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3999	NC_018644	GGA	2	6	294003	294008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707349
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