MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 19338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018644	CGA	2	6	149587	149592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707194
2002	NC_018644	CAG	2	6	149676	149681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707194
2003	NC_018644	TTG	2	6	149728	149733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707194
2004	NC_018644	ATC	2	6	149737	149742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707194
2005	NC_018644	TGT	2	6	149750	149755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707194
2006	NC_018644	TAC	2	6	149818	149823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707194
2007	NC_018644	AAT	2	6	149856	149861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707194
2008	NC_018644	CTT	2	6	149895	149900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707195
2009	NC_018644	GCA	2	6	150104	150109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707195
2010	NC_018644	TCA	2	6	150123	150128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707195
2011	NC_018644	ACT	2	6	150136	150141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707195
2012	NC_018644	AGC	2	6	150148	150153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707195
2013	NC_018644	ACC	2	6	150354	150359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_018644	GGA	2	6	150479	150484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707196
2015	NC_018644	AAT	2	6	150500	150505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707196
2016	NC_018644	ATT	2	6	150563	150568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707196
2017	NC_018644	TGA	2	6	150598	150603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
2018	NC_018644	AAG	2	6	150675	150680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707196
2019	NC_018644	CAA	2	6	150689	150694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707196
2020	NC_018644	GAA	2	6	150698	150703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707196
2021	NC_018644	ATT	2	6	150708	150713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707196
2022	NC_018644	CTC	2	6	150714	150719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707196
2023	NC_018644	TTC	2	6	150800	150805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
2024	NC_018644	GGT	2	6	150947	150952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707196
2025	NC_018644	GTG	2	6	150990	150995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707196
2026	NC_018644	GAT	2	6	151076	151081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
2027	NC_018644	ATG	2	6	151104	151109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
2028	NC_018644	CTA	2	6	151113	151118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707196
2029	NC_018644	TTC	2	6	151161	151166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
2030	NC_018644	CAC	2	6	151167	151172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707196
2031	NC_018644	TTC	2	6	151221	151226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
2032	NC_018644	TGA	2	6	151234	151239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
2033	NC_018644	ATC	2	6	151307	151312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707196
2034	NC_018644	CGT	2	6	151360	151365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707196
2035	NC_018644	AGA	2	6	151492	151497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707196
2036	NC_018644	ATT	2	6	151501	151506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707196
2037	NC_018644	TGA	2	6	151753	151758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
2038	NC_018644	GAC	2	6	151887	151892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707197
2039	NC_018644	ATA	2	6	151918	151923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707197
2040	NC_018644	ATA	3	9	152018	152026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707197
2041	NC_018644	AAC	2	6	152187	152192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707198
2042	NC_018644	AGG	2	6	152290	152295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707198
2043	NC_018644	TTA	2	6	152348	152353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707198
2044	NC_018644	GAG	2	6	152420	152425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707198
2045	NC_018644	TCA	2	6	152465	152470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707198
2046	NC_018644	CCA	2	6	152481	152486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707198
2047	NC_018644	CTT	2	6	152700	152705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707198
2048	NC_018644	TCT	2	6	152736	152741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707198
2049	NC_018644	GCT	2	6	152786	152791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707198
2050	NC_018644	ACT	2	6	152824	152829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707198
2051	NC_018644	TAA	2	6	152932	152937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707198
2052	NC_018644	GCA	2	6	153124	153129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707199
2053	NC_018644	CCT	2	6	153130	153135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707199
2054	NC_018644	AGG	2	6	153264	153269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707199
2055	NC_018644	TTA	2	6	153301	153306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707199
2056	NC_018644	AGC	2	6	153351	153356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707199
2057	NC_018644	TTG	2	6	153357	153362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707199
2058	NC_018644	ATA	2	6	153364	153369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707199
2059	NC_018644	GTG	2	6	153544	153549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707199
2060	NC_018644	TCA	2	6	153553	153558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707199
2061	NC_018644	AAT	2	6	153561	153566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707199
2062	NC_018644	TGA	2	6	153631	153636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707199
2063	NC_018644	AGT	2	6	153789	153794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707199
2064	NC_018644	TTA	2	6	153823	153828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707199
2065	NC_018644	AGA	2	6	153865	153870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707199
2066	NC_018644	CCT	2	6	153998	154003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707199
2067	NC_018644	CAT	2	6	154019	154024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707199
2068	NC_018644	GAT	2	6	154027	154032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707199
2069	NC_018644	ATA	2	6	154082	154087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707199
2070	NC_018644	TGG	2	6	154091	154096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707199
2071	NC_018644	TCC	2	6	154116	154121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707199
2072	NC_018644	ATG	2	6	154253	154258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707199
2073	NC_018644	TGA	2	6	154271	154276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707199
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2076	NC_018644	AGT	2	6	154383	154388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707199
2077	NC_018644	AGG	2	6	154414	154419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707199
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2079	NC_018644	ATA	2	6	154660	154665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707199
2080	NC_018644	TCC	2	6	154827	154832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707199
2081	NC_018644	CCG	2	6	154856	154861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406707199
2082	NC_018644	AAT	2	6	154920	154925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707199
2083	NC_018644	TCC	2	6	154938	154943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707199
2084	NC_018644	GCG	2	6	154948	154953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707199
2085	NC_018644	ATC	2	6	154987	154992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707199
2086	NC_018644	GAA	2	6	155302	155307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707200
2087	NC_018644	CAA	2	6	155353	155358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707200
2088	NC_018644	CCA	2	6	155412	155417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707200
2089	NC_018644	ATC	3	9	155478	155486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707200
2090	NC_018644	TAA	2	6	155536	155541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707200
2091	NC_018644	GGC	2	6	155567	155572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707200
2092	NC_018644	TCA	2	6	155664	155669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707200
2093	NC_018644	GAT	2	6	155714	155719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707200
2094	NC_018644	AAT	2	6	155867	155872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707200
2095	NC_018644	AAC	2	6	155885	155890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707200
2096	NC_018644	TCA	2	6	155914	155919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707200
2097	NC_018644	GCC	2	6	155957	155962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_018644	TTC	2	6	155993	155998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707201
2099	NC_018644	AAG	2	6	156017	156022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707201
2100	NC_018644	GCT	2	6	156052	156057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707201
2101	NC_018644	CAT	2	6	156105	156110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
2102	NC_018644	AGC	2	6	156175	156180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707201
2103	NC_018644	AAT	2	6	156210	156215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707201
2104	NC_018644	ACC	2	6	156457	156462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707201
2105	NC_018644	ATT	2	6	156559	156564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707201
2106	NC_018644	CTG	2	6	156597	156602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707201
2107	NC_018644	CAT	2	6	156627	156632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
2108	NC_018644	CTT	2	6	156642	156647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707201
2109	NC_018644	CTT	2	6	156699	156704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707201
2110	NC_018644	ACC	2	6	156766	156771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707201
2111	NC_018644	GGA	2	6	156791	156796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707201
2112	NC_018644	CCA	2	6	156801	156806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707201
2113	NC_018644	ACC	2	6	156817	156822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707201
2114	NC_018644	ACA	2	6	156926	156931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707201
2115	NC_018644	TTC	2	6	156984	156989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707201
2116	NC_018644	TCA	2	6	157008	157013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
2117	NC_018644	ATC	2	6	157105	157110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
2118	NC_018644	AGA	3	9	157137	157145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707201
2119	NC_018644	GAT	2	6	157179	157184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707201
2120	NC_018644	AAG	2	6	157233	157238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707201
2121	NC_018644	CAT	2	6	157242	157247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
2122	NC_018644	CAT	2	6	157290	157295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
2123	NC_018644	CAT	2	6	157365	157370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
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2126	NC_018644	TAA	2	6	157583	157588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2129	NC_018644	TTA	2	6	157719	157724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_018644	TAA	2	6	157725	157730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2188	NC_018644	AAT	2	6	162307	162312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2189	NC_018644	ATT	2	6	162395	162400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707206
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2226	NC_018644	TAA	2	6	165981	165986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2227	NC_018644	AAT	2	6	166133	166138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707210
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2235	NC_018644	TGA	2	6	166557	166562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707210
2236	NC_018644	TCG	2	6	166563	166568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707210
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2238	NC_018644	CAT	2	6	166603	166608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707210
2239	NC_018644	ATC	2	6	166616	166621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707210
2240	NC_018644	TGA	2	6	166650	166655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707210
2241	NC_018644	TCG	2	6	166656	166661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707210
2242	NC_018644	ATC	2	6	166664	166669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707210
2243	NC_018644	TCT	2	6	166785	166790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707210
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2245	NC_018644	TAC	2	6	166867	166872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707210
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2267	NC_018644	TTA	2	6	169139	169144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2353	NC_018644	AGA	2	6	175102	175107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707222
2354	NC_018644	TCA	2	6	175125	175130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707222
2355	NC_018644	ATG	2	6	175173	175178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707222
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2358	NC_018644	AGA	2	6	175249	175254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707222
2359	NC_018644	TAA	2	6	175294	175299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707222
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2361	NC_018644	AGA	2	6	175348	175353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707222
2362	NC_018644	TCA	2	6	175521	175526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707222
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2475	NC_018644	TAA	2	6	182454	182459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707229
2476	NC_018644	TAA	2	6	182577	182582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707229
2477	NC_018644	TGA	2	6	182761	182766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707229
2478	NC_018644	TTG	2	6	182922	182927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707229
2479	NC_018644	AGT	2	6	182963	182968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707229
2480	NC_018644	ATA	3	9	183207	183215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707229
2481	NC_018644	GAT	2	6	183308	183313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707230
2482	NC_018644	TCT	2	6	183405	183410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707230
2483	NC_018644	GCT	2	6	183497	183502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707230
2484	NC_018644	AAT	2	6	183515	183520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707230
2485	NC_018644	CGT	2	6	183551	183556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707230
2486	NC_018644	GGA	2	6	183688	183693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707230
2487	NC_018644	GGA	2	6	183712	183717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707230
2488	NC_018644	ATT	2	6	183924	183929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707230
2489	NC_018644	ACA	2	6	184058	184063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707230
2490	NC_018644	CTT	2	6	184100	184105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707230
2491	NC_018644	GGT	2	6	184112	184117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707230
2492	NC_018644	GAT	2	6	184187	184192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707230
2493	NC_018644	GCG	2	6	184357	184362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707231
2494	NC_018644	TGA	2	6	184545	184550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707231
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2497	NC_018644	ATC	2	6	184773	184778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707231
2498	NC_018644	CTC	2	6	184782	184787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707231
2499	NC_018644	GAT	2	6	184807	184812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707231
2500	NC_018644	TAA	2	6	184826	184831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707231

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