MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	AATTGA	2	12	7539	7550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406705604
2	NC_018643	TAAAGA	2	12	7650	7661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406705604
3	NC_018643	ATGATT	2	12	8523	8534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705605
4	NC_018643	AGATCA	2	12	12326	12337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406705610
5	NC_018643	TGATAT	2	12	13507	13518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705611
6	NC_018643	GAAAAA	2	12	16382	16393	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406705613
7	NC_018643	GTATTG	2	12	18157	18168	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406705615
8	NC_018643	ATTAAA	2	12	23229	23240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705618
9	NC_018643	GTTGAT	2	12	26720	26731	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406705620
10	NC_018643	AGATGA	2	12	29598	29609	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406705623
11	NC_018643	ACTGAA	2	12	30195	30206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406705624
12	NC_018643	GAGCAA	2	12	30493	30504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406705624
13	NC_018643	AAATAG	2	12	31269	31280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406705625
14	NC_018643	TCAGTT	2	12	32154	32165	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406705627
15	NC_018643	CTGAAG	2	12	32386	32397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406705627
16	NC_018643	TAAAAA	2	12	33206	33217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705627
17	NC_018643	ACAATT	2	12	36331	36342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406705631
18	NC_018643	TTTTGA	2	12	40022	40033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406705637
19	NC_018643	GTTTTA	2	12	40142	40153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406705637
20	NC_018643	TTTAAT	2	12	43827	43838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
21	NC_018643	TAAATA	2	12	44343	44354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705641
22	NC_018643	AAATTA	2	12	46145	46156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705642
23	NC_018643	TAAGCT	2	12	46326	46337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406705642
24	NC_018643	GATAAC	2	12	46667	46678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406705643
25	NC_018643	ATTAAA	2	12	46898	46909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705643
26	NC_018643	CTGTTA	2	12	47604	47615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406705643
27	NC_018643	TAAAAA	2	12	50870	50881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705646
28	NC_018643	TTATTT	2	12	52726	52737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406705649
29	NC_018643	ATCTTT	2	12	53258	53269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406705649
30	NC_018643	AATTTT	2	12	55785	55796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705652
31	NC_018643	GATATT	2	12	58147	58158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705653
32	NC_018643	AAAGCT	2	12	58225	58236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406705653
33	NC_018643	AAATTA	2	12	59231	59242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705654
34	NC_018643	TTTAGA	2	12	59832	59843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705655
35	NC_018643	TATTAA	2	12	59931	59942	50 %	50 %	0 %	0 %	406705655
36	NC_018643	GCAGAA	2	12	61132	61143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406705656
37	NC_018643	TTAATG	2	12	61631	61642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705656
38	NC_018643	GAATAA	2	12	62993	63004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406705658
39	NC_018643	ATTGAA	2	12	63051	63062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406705658
40	NC_018643	AACAAA	2	12	63282	63293	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406705658
41	NC_018643	AATAAA	2	12	63408	63419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705658
42	NC_018643	TTTATT	2	12	67132	67143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406705663
43	NC_018643	TGTTTT	2	12	69961	69972	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406705664
44	NC_018643	TCATTT	2	12	70297	70308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406705665
45	NC_018643	TCAAAC	2	12	75368	75379	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406705672
46	NC_018643	ATCCAT	2	12	77766	77777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705675
47	NC_018643	CTGTAT	2	12	78006	78017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406705675
48	NC_018643	GGTTTT	2	12	78353	78364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705675
49	NC_018643	TTAGTT	2	12	80134	80145	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406705677
50	NC_018643	ACCCAT	2	12	80601	80612	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	406705677
51	NC_018643	ATTTAA	2	12	81117	81128	50 %	50 %	0 %	0 %	406705678
52	NC_018643	CAATTA	2	12	81684	81695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406705679
53	NC_018643	ATTTTA	2	12	81903	81914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705679
54	NC_018643	TGGTTG	2	12	82114	82125	0 %	50 %	50 %	0 %	406705679
55	NC_018643	TCAATT	2	12	82705	82716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406705679
56	NC_018643	AAAAAC	2	12	83363	83374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406705680
57	NC_018643	AAAATT	2	12	83385	83396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705680
58	NC_018643	AAAAAG	2	12	83618	83629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406705680
59	NC_018643	AAAATT	2	12	83993	84004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705680
60	NC_018643	ATTTAG	2	12	86479	86490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705684
61	NC_018643	TCTTCA	2	12	86904	86915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406705684
62	NC_018643	AGGTCC	2	12	89597	89608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406705687
63	NC_018643	AGTTAT	2	12	90689	90700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406705688
64	NC_018643	CATTCC	2	12	91903	91914	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	406705689
65	NC_018643	AACTTC	2	12	92401	92412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705689
66	NC_018643	AACTTT	2	12	92593	92604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406705689
67	NC_018643	GGCTTT	2	12	96469	96480	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	406705693
68	NC_018643	TGATGG	2	12	96817	96828	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406705693
69	NC_018643	TAATTA	2	12	99586	99597	50 %	50 %	0 %	0 %	406705696
70	NC_018643	TTTCTT	2	12	100582	100593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406705697
71	NC_018643	TAAAAA	2	12	103259	103270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705700
72	NC_018643	TATAAA	2	12	103274	103285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705700
73	NC_018643	GTTTTT	2	12	103942	103953	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406705701
74	NC_018643	ATAAAA	2	12	107450	107461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705705
75	NC_018643	CAATTT	2	12	109741	109752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406705708
76	NC_018643	TTCAAC	2	12	110551	110562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705709
77	NC_018643	AGGAGC	2	12	115181	115192	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	406705715
78	NC_018643	TGTTTT	2	12	116395	116406	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406705717
79	NC_018643	ACTTTT	2	12	117125	117136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406705718
80	NC_018643	GAAAAT	2	12	119415	119426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406705721
81	NC_018643	TTTAAT	2	12	120380	120391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705723
82	NC_018643	AAAAAT	2	12	120634	120645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705723
83	NC_018643	TTTTAA	2	12	120862	120873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705723
84	NC_018643	TTTTAA	2	12	120991	121002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705723
85	NC_018643	TGATTT	2	12	124139	124150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406705726
86	NC_018643	TTCATT	2	12	130201	130212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406705734
87	NC_018643	ATTTAT	2	12	130267	130278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705734
88	NC_018643	TCTATT	2	12	130397	130408	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406705734
89	NC_018643	ATATGG	2	12	133377	133388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705737
90	NC_018643	ATTTTT	2	12	137943	137954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406705742
91	NC_018643	AAATTA	2	12	139095	139106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705743
92	NC_018643	CAAAAT	2	12	139536	139547	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406705743
93	NC_018643	CTCTTT	2	12	141673	141684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705746
94	NC_018643	AATTTT	2	12	144370	144381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705749
95	NC_018643	TTTTTA	2	12	144731	144742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406705750
96	NC_018643	CAGAAG	2	12	144935	144946	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406705750
97	NC_018643	TCTAAT	2	12	145700	145711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406705751
98	NC_018643	TCCAAT	2	12	146682	146693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705752
99	NC_018643	CAGCTT	2	12	147235	147246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406705753
100	NC_018643	GCTCTT	2	12	148281	148292	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	406705754
101	NC_018643	TATTGC	2	12	148780	148791	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406705754
102	NC_018643	TAAGCC	2	12	151765	151776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406705760
103	NC_018643	TAGTTT	2	12	153268	153279	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406705761
104	NC_018643	TAGCAA	2	12	155947	155958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406705765
105	NC_018643	TTTTTC	2	12	157728	157739	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406705766
106	NC_018643	TCAATC	2	12	161592	161603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705769
107	NC_018643	ACTAAT	2	12	163525	163536	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406705771
108	NC_018643	CTTTTG	2	12	165205	165216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406705773
109	NC_018643	CATCAA	2	12	165481	165492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406705773
110	NC_018643	CAATAT	2	12	173777	173788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406705778
111	NC_018643	TTTTAT	2	12	177074	177085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018643	TTTCAT	2	12	179881	179892	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406705785
113	NC_018643	TGAAAT	2	12	180799	180810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406705786
114	NC_018643	TAATTT	2	12	181022	181033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705787
115	NC_018643	TAAAAA	2	12	183361	183372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406705788
116	NC_018643	TAAAAG	2	12	184221	184232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406705788
117	NC_018643	CTTTTT	2	12	185404	185415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018643	CTTTTT	2	12	187064	187075	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406705790
119	NC_018643	AAAAAC	2	12	187548	187559	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406705790
120	NC_018643	TTTAAA	2	12	187563	187574	50 %	50 %	0 %	0 %	406705790
121	NC_018643	TTTAAT	2	12	188689	188700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705791
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231	NC_018643	ATTTTT	2	12	336550	336561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_018643	ATGCAG	2	12	336637	336648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406705949
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239	NC_018643	TTAAAT	2	12	349268	349279	50 %	50 %	0 %	0 %	406705963
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