MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018643	AAACTA	2	12	692254	692265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
502	NC_018643	TTTTGT	2	12	693086	693097	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406706357
503	NC_018643	TCTAAA	2	12	695862	695873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706357
504	NC_018643	CAATAA	2	12	696007	696018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406706357
505	NC_018643	AAGTTT	2	12	698595	698606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706358
506	NC_018643	TTTAAT	2	12	701510	701521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706361
507	NC_018643	TTTTTC	2	12	701593	701604	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406706361
508	NC_018643	TAATTT	2	12	704658	704669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018643	TGAAGG	2	12	705607	705618	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	406706365
510	NC_018643	ATTTTT	2	12	705891	705902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406706366
511	NC_018643	AATTAT	2	12	708750	708761	50 %	50 %	0 %	0 %	406706367
512	NC_018643	AGTTTT	2	12	709160	709171	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406706367
513	NC_018643	ATATTT	2	12	709235	709246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018643	ATAATT	2	12	710215	710226	50 %	50 %	0 %	0 %	406706369
515	NC_018643	TTAATG	2	12	714106	714117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706374
516	NC_018643	TAAAGC	2	12	714131	714142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406706374
517	NC_018643	CAATGA	2	12	714316	714327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406706375
518	NC_018643	GTGATT	2	12	717920	717931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406706379
519	NC_018643	CTTCAC	2	12	719322	719333	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	406706381
520	NC_018643	CAACAT	2	12	720297	720308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406706381
521	NC_018643	TTTCAT	2	12	721271	721282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406706382
522	NC_018643	TTTTCA	2	12	721567	721578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406706382
523	NC_018643	CGATAT	2	12	725085	725096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406706385
524	NC_018643	TAAAGT	2	12	727467	727478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706388
525	NC_018643	ATCCAA	2	12	728654	728665	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406706388
526	NC_018643	AATTTT	2	12	731113	731124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706391
527	NC_018643	TAAAAT	2	12	732353	732364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706392
528	NC_018643	TTTCTT	2	12	732778	732789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406706392
529	NC_018643	CTAATA	2	12	733226	733237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706393
530	NC_018643	TATAGA	2	12	733917	733928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706393
531	NC_018643	ACAATG	2	12	734724	734735	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406706394
532	NC_018643	ATTTAG	2	12	737440	737451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706396
533	NC_018643	TAAATC	2	12	738801	738812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706397
534	NC_018643	TTTTTC	2	12	738858	738869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406706397
535	NC_018643	ATCTCT	2	12	740454	740465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406706399
536	NC_018643	GATTTT	2	12	743208	743219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406706402
537	NC_018643	AATTTC	2	12	744380	744391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406706403
538	NC_018643	ATTTTG	2	12	744421	744432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406706403
539	NC_018643	ATTTTT	2	12	744452	744463	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406706403
540	NC_018643	TAAGTG	2	12	750335	750346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706406
541	NC_018643	TTCCAG	2	12	750824	750835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406706406
542	NC_018643	TACATC	2	12	751146	751157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706406
543	NC_018643	TTGAAA	2	12	751499	751510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706406
544	NC_018643	ACCAGA	2	12	751599	751610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406706406
545	NC_018643	AAGTTA	2	12	751910	751921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018643	TAATTC	2	12	755221	755232	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406706410
547	NC_018643	TTTATC	2	12	756133	756144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406706411
548	NC_018643	TACTTA	2	12	757204	757215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406706411
549	NC_018643	ATGAAG	2	12	758261	758272	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406706412
550	NC_018643	TAAAAT	2	12	760411	760422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706413
551	NC_018643	TGATAT	2	12	760762	760773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706413
552	NC_018643	TATTTT	2	12	761026	761037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406706414
553	NC_018643	AACTCT	2	12	762922	762933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706414
554	NC_018643	GATATA	2	12	763073	763084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706414
555	NC_018643	GTATTA	2	12	765134	765145	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706414
556	NC_018643	ATGTTG	2	12	766077	766088	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406706414
557	NC_018643	TAAATT	2	12	771117	771128	50 %	50 %	0 %	0 %	406706416
558	NC_018643	AGTTGA	2	12	771405	771416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706417
559	NC_018643	TCATTT	2	12	772705	772716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406706418
560	NC_018643	AATTGT	2	12	774123	774134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706419
561	NC_018643	ATTCAA	2	12	776663	776674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706421
562	NC_018643	TTTTGT	2	12	778149	778160	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406706422
563	NC_018643	TGCAGC	2	12	778181	778192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406706422
564	NC_018643	GTTTTT	2	12	779175	779186	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406706422
565	NC_018643	TTTAGT	2	12	779958	779969	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406706423
566	NC_018643	GTTAAA	2	12	780552	780563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706423
567	NC_018643	TAAAAA	2	12	780955	780966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018643	TCAACA	2	12	781981	781992	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406706427
569	NC_018643	TTAACA	2	12	782177	782188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706427
570	NC_018643	TCAGCC	2	12	785183	785194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406706430
571	NC_018643	TTATAA	2	12	786241	786252	50 %	50 %	0 %	0 %	406706431
572	NC_018643	TAAATT	2	12	786379	786390	50 %	50 %	0 %	0 %	406706431
573	NC_018643	TAATTT	2	12	789408	789419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706434
574	NC_018643	TAAACA	2	12	790043	790054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406706434
575	NC_018643	AGCTAG	2	12	791120	791131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406706436
576	NC_018643	TTAAAG	2	12	791935	791946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706436
577	NC_018643	TAAAGG	2	12	795177	795188	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406706442
578	NC_018643	ATCAGT	2	12	796321	796332	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406706443
579	NC_018643	ACCTTT	2	12	796816	796827	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406706443
580	NC_018643	AATGTA	2	12	797913	797924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706443
581	NC_018643	TACAAT	2	12	799051	799062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706445
582	NC_018643	TAAAAT	2	12	799117	799128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706445
583	NC_018643	AATTAA	2	12	799331	799342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706446
584	NC_018643	TTAAAA	2	12	799447	799458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706446
585	NC_018643	TATCTT	2	12	799763	799774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406706446
586	NC_018643	ATGCTT	2	12	801839	801850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406706449
587	NC_018643	TAAAAG	2	12	803050	803061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406706451
588	NC_018643	AATTTA	2	12	803394	803405	50 %	50 %	0 %	0 %	406706451
589	NC_018643	TTTAAG	2	12	804059	804070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406706452
590	NC_018643	TTTTAG	2	12	808172	808183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406706458
591	NC_018643	AACAAA	2	12	808243	808254	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406706458
592	NC_018643	AAACAT	2	12	808541	808552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406706458
593	NC_018643	TAATAT	2	12	809329	809340	50 %	50 %	0 %	0 %	406706459
594	NC_018643	CATTAG	2	12	810028	810039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406706459
595	NC_018643	TGTAAG	2	12	810901	810912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706460
596	NC_018643	AGATGG	2	12	813448	813459	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	406706464
597	NC_018643	TTTTAA	2	12	813834	813845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706465
598	NC_018643	TAAAAA	2	12	814971	814982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406706465
599	NC_018643	TTCCTC	2	12	815593	815604	0 %	50 %	0 %	50 %	406706466
600	NC_018643	TTTTCT	2	12	816626	816637	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406706467
601	NC_018643	CTGGAC	2	12	820751	820762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406706472
602	NC_018643	TGAAAT	2	12	821243	821254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406706473
603	NC_018643	TTTTTG	2	12	823458	823469	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406706476
604	NC_018643	ATCATT	2	12	823892	823903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406706477
605	NC_018643	GCTTTT	2	12	826546	826557	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406706479
606	NC_018643	TCAAAA	2	12	827982	827993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406706482
607	NC_018643	CAATTA	2	12	829099	829110	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406706484
608	NC_018643	TTTTAT	2	12	829295	829306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406706484
609	NC_018643	ATTTTT	2	12	831931	831942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406706486
610	NC_018643	TCCTGC	2	12	832804	832815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	406706489
611	NC_018643	TTTTAG	2	12	835233	835244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406706491
612	NC_018643	ACCAAT	2	12	835306	835317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406706491
613	NC_018643	ATTTAT	2	12	839350	839361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706497
614	NC_018643	AATTTT	2	12	840600	840611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706498
615	NC_018643	TCATTT	2	12	840691	840702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406706498
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617	NC_018643	TTACAT	2	12	841498	841509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406706499
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