MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018078	TCGGG	2	10	2020267	2020276	0 %	20 %	60 %	20 %	392432270
1502	NC_018078	GCTGG	2	10	2020285	2020294	0 %	20 %	60 %	20 %	392432270
1503	NC_018078	GCGCC	2	10	2022354	2022363	0 %	0 %	40 %	60 %	392432273
1504	NC_018078	GATCT	2	10	2023532	2023541	20 %	40 %	20 %	20 %	392432274
1505	NC_018078	GCAAG	2	10	2024057	2024066	40 %	0 %	40 %	20 %	392432275
1506	NC_018078	TCGTC	2	10	2024455	2024464	0 %	40 %	20 %	40 %	392432275
1507	NC_018078	TCGGC	2	10	2024578	2024587	0 %	20 %	40 %	40 %	392432275
1508	NC_018078	CCGAC	2	10	2025833	2025842	20 %	0 %	20 %	60 %	392432277
1509	NC_018078	CGGGC	2	10	2029726	2029735	0 %	0 %	60 %	40 %	392432280
1510	NC_018078	CGGCG	2	10	2030556	2030565	0 %	0 %	60 %	40 %	392432280
1511	NC_018078	CAACG	2	10	2030956	2030965	40 %	0 %	20 %	40 %	392432280
1512	NC_018078	ATCCA	2	10	2032875	2032884	40 %	20 %	0 %	40 %	392432281
1513	NC_018078	GGTCG	2	10	2033581	2033590	0 %	20 %	60 %	20 %	392432281
1514	NC_018078	GCATG	2	10	2033805	2033814	20 %	20 %	40 %	20 %	392432281
1515	NC_018078	GGTCG	2	10	2035042	2035051	0 %	20 %	60 %	20 %	392432283
1516	NC_018078	AGACC	2	10	2035142	2035151	40 %	0 %	20 %	40 %	392432283
1517	NC_018078	ACCGA	2	10	2037587	2037596	40 %	0 %	20 %	40 %	392432286
1518	NC_018078	TCGAT	2	10	2040585	2040594	20 %	40 %	20 %	20 %	392432289
1519	NC_018078	CCGAC	2	10	2042138	2042147	20 %	0 %	20 %	60 %	392432291
1520	NC_018078	GGCCG	2	10	2043011	2043020	0 %	0 %	60 %	40 %	392432292
1521	NC_018078	TCGTT	2	10	2045161	2045170	0 %	60 %	20 %	20 %	392432294
1522	NC_018078	GCTGA	2	10	2048293	2048302	20 %	20 %	40 %	20 %	392432298
1523	NC_018078	GTCGA	2	10	2048466	2048475	20 %	20 %	40 %	20 %	392432299
1524	NC_018078	GCTGA	2	10	2049964	2049973	20 %	20 %	40 %	20 %	392432300
1525	NC_018078	GTCGA	2	10	2050137	2050146	20 %	20 %	40 %	20 %	392432301
1526	NC_018078	ATGCT	2	10	2051793	2051802	20 %	40 %	20 %	20 %	392432302
1527	NC_018078	CGCTG	2	10	2052137	2052146	0 %	20 %	40 %	40 %	392432304
1528	NC_018078	GCCAC	2	10	2052771	2052780	20 %	0 %	20 %	60 %	392432305
1529	NC_018078	GCCGC	2	10	2053945	2053954	0 %	0 %	40 %	60 %	392432306
1530	NC_018078	GGCCC	2	10	2055340	2055349	0 %	0 %	40 %	60 %	392432306
1531	NC_018078	CGGCG	2	10	2057326	2057335	0 %	0 %	60 %	40 %	392432307
1532	NC_018078	GCGCA	2	10	2061111	2061120	20 %	0 %	40 %	40 %	392432310
1533	NC_018078	CGGCA	2	10	2062838	2062847	20 %	0 %	40 %	40 %	392432312
1534	NC_018078	TTCGG	2	10	2063038	2063047	0 %	40 %	40 %	20 %	392432312
1535	NC_018078	GATCC	2	10	2064205	2064214	20 %	20 %	20 %	40 %	392432314
1536	NC_018078	CCGGC	2	10	2065270	2065279	0 %	0 %	40 %	60 %	392432315
1537	NC_018078	GGCCT	2	10	2065832	2065841	0 %	20 %	40 %	40 %	392432315
1538	NC_018078	CGGCG	2	10	2067209	2067218	0 %	0 %	60 %	40 %	392432315
1539	NC_018078	TGATC	2	10	2068278	2068287	20 %	40 %	20 %	20 %	392432317
1540	NC_018078	ATCGG	2	10	2069183	2069192	20 %	20 %	40 %	20 %	392432317
1541	NC_018078	CGGCG	2	10	2069724	2069733	0 %	0 %	60 %	40 %	392432318
1542	NC_018078	GCACC	2	10	2070153	2070162	20 %	0 %	20 %	60 %	392432318
1543	NC_018078	CGGCC	2	10	2071573	2071582	0 %	0 %	40 %	60 %	392432319
1544	NC_018078	ACCGC	2	10	2073435	2073444	20 %	0 %	20 %	60 %	392432322
1545	NC_018078	TTGCA	2	10	2075285	2075294	20 %	40 %	20 %	20 %	392432324
1546	NC_018078	CGATT	2	10	2075687	2075696	20 %	40 %	20 %	20 %	392432324
1547	NC_018078	GTGGC	2	10	2076137	2076146	0 %	20 %	60 %	20 %	392432325
1548	NC_018078	TCGGC	2	10	2078186	2078195	0 %	20 %	40 %	40 %	392432326
1549	NC_018078	ACCGA	2	10	2079570	2079579	40 %	0 %	20 %	40 %	392432328
1550	NC_018078	GCCCC	2	10	2080624	2080633	0 %	0 %	20 %	80 %	392432328
1551	NC_018078	TGCAG	2	10	2082659	2082668	20 %	20 %	40 %	20 %	392432331
1552	NC_018078	TCCGA	2	10	2082921	2082930	20 %	20 %	20 %	40 %	392432331
1553	NC_018078	CCCGG	2	10	2084473	2084482	0 %	0 %	40 %	60 %	392432333
1554	NC_018078	ACCCG	2	10	2084748	2084757	20 %	0 %	20 %	60 %	392432333
1555	NC_018078	TCGCT	2	10	2085845	2085854	0 %	40 %	20 %	40 %	392432335
1556	NC_018078	GCGCC	2	10	2086068	2086077	0 %	0 %	40 %	60 %	392432335
1557	NC_018078	GGCAC	2	10	2088339	2088348	20 %	0 %	40 %	40 %	392432337
1558	NC_018078	CCCTG	2	10	2088470	2088479	0 %	20 %	20 %	60 %	392432338
1559	NC_018078	TCGGA	2	10	2091209	2091218	20 %	20 %	40 %	20 %	392432341
1560	NC_018078	TCGGT	2	10	2091229	2091238	0 %	40 %	40 %	20 %	392432341
1561	NC_018078	CGTCG	2	10	2094307	2094316	0 %	20 %	40 %	40 %	392432344
1562	NC_018078	AACGC	2	10	2094579	2094588	40 %	0 %	20 %	40 %	392432344
1563	NC_018078	CCGGC	2	10	2094827	2094836	0 %	0 %	40 %	60 %	392432344
1564	NC_018078	GGCCG	2	10	2098189	2098198	0 %	0 %	60 %	40 %	392432347
1565	NC_018078	CCCGA	2	10	2099028	2099037	20 %	0 %	20 %	60 %	392432347
1566	NC_018078	GGGGT	2	10	2100537	2100546	0 %	20 %	80 %	0 %	392432349
1567	NC_018078	GCCCG	2	10	2101103	2101112	0 %	0 %	40 %	60 %	392432349
1568	NC_018078	GACAA	2	10	2103099	2103108	60 %	0 %	20 %	20 %	392432354
1569	NC_018078	CTGGT	2	10	2103792	2103801	0 %	40 %	40 %	20 %	392432355
1570	NC_018078	GCAGC	2	10	2105854	2105863	20 %	0 %	40 %	40 %	392432357
1571	NC_018078	GGTGG	2	10	2106219	2106228	0 %	20 %	80 %	0 %	392432357
1572	NC_018078	GCACC	2	10	2107842	2107851	20 %	0 %	20 %	60 %	392432357
1573	NC_018078	GGCGC	2	10	2108686	2108695	0 %	0 %	60 %	40 %	392432358
1574	NC_018078	CGTGA	2	10	2108987	2108996	20 %	20 %	40 %	20 %	392432359
1575	NC_018078	GTGAG	2	10	2109084	2109093	20 %	20 %	60 %	0 %	392432359
1576	NC_018078	TGTCG	2	10	2109726	2109735	0 %	40 %	40 %	20 %	392432360
1577	NC_018078	TCGGG	2	10	2110151	2110160	0 %	20 %	60 %	20 %	392432360
1578	NC_018078	CCGCG	2	10	2110878	2110887	0 %	0 %	40 %	60 %	392432360
1579	NC_018078	GCAGT	2	10	2113358	2113367	20 %	20 %	40 %	20 %	392432360
1580	NC_018078	GGGTG	2	10	2114357	2114366	0 %	20 %	80 %	0 %	392432361
1581	NC_018078	GTGCG	2	10	2114553	2114562	0 %	20 %	60 %	20 %	392432361
1582	NC_018078	GGCCA	2	10	2115075	2115084	20 %	0 %	40 %	40 %	392432361
1583	NC_018078	CTGGG	2	10	2115159	2115168	0 %	20 %	60 %	20 %	392432361
1584	NC_018078	TCGGG	2	10	2116221	2116230	0 %	20 %	60 %	20 %	392432361
1585	NC_018078	CCGCG	2	10	2116948	2116957	0 %	0 %	40 %	60 %	392432361
1586	NC_018078	CTGCG	2	10	2118211	2118220	0 %	20 %	40 %	40 %	392432361
1587	NC_018078	AGGCG	2	10	2118308	2118317	20 %	0 %	60 %	20 %	392432361
1588	NC_018078	CGGTG	2	10	2119502	2119511	0 %	20 %	60 %	20 %	392432361
1589	NC_018078	GGGTG	2	10	2120447	2120456	0 %	20 %	80 %	0 %	392432361
1590	NC_018078	GACCG	2	10	2120554	2120563	20 %	0 %	40 %	40 %	392432361
1591	NC_018078	GTGCG	2	10	2120643	2120652	0 %	20 %	60 %	20 %	392432361
1592	NC_018078	GGCCA	2	10	2121165	2121174	20 %	0 %	40 %	40 %	392432361
1593	NC_018078	CTGGG	2	10	2121249	2121258	0 %	20 %	60 %	20 %	392432361
1594	NC_018078	AACGC	2	10	2124678	2124687	40 %	0 %	20 %	40 %	392432362
1595	NC_018078	GCGTT	2	10	2125910	2125919	0 %	40 %	40 %	20 %	392432363
1596	NC_018078	CGCTG	2	10	2126604	2126613	0 %	20 %	40 %	40 %	392432363
1597	NC_018078	CGGGA	2	10	2129340	2129349	20 %	0 %	60 %	20 %	392432366
1598	NC_018078	GGGCG	2	10	2130092	2130101	0 %	0 %	80 %	20 %	392432367
1599	NC_018078	CCCAT	2	10	2130499	2130508	20 %	20 %	0 %	60 %	392432367
1600	NC_018078	TGGGC	2	10	2130954	2130963	0 %	20 %	60 %	20 %	392432367
1601	NC_018078	GTGGG	2	10	2131361	2131370	0 %	20 %	80 %	0 %	392432368
1602	NC_018078	AGCAC	2	10	2132885	2132894	40 %	0 %	20 %	40 %	392432370
1603	NC_018078	ACCGA	2	10	2133501	2133510	40 %	0 %	20 %	40 %	392432370
1604	NC_018078	CGGTG	2	10	2135628	2135637	0 %	20 %	60 %	20 %	392432374
1605	NC_018078	CCGCG	2	10	2135744	2135753	0 %	0 %	40 %	60 %	392432374
1606	NC_018078	CCGGC	2	10	2135970	2135979	0 %	0 %	40 %	60 %	392432374
1607	NC_018078	TCGGC	2	10	2135988	2135997	0 %	20 %	40 %	40 %	392432374
1608	NC_018078	GGAAG	2	10	2138048	2138057	40 %	0 %	60 %	0 %	392432376
1609	NC_018078	TGCCG	2	10	2138620	2138629	0 %	20 %	40 %	40 %	392432377
1610	NC_018078	AACGG	2	10	2140000	2140009	40 %	0 %	40 %	20 %	392432377
1611	NC_018078	CGGCG	2	10	2141347	2141356	0 %	0 %	60 %	40 %	392432379
1612	NC_018078	GACGC	2	10	2141628	2141637	20 %	0 %	40 %	40 %	392432379
1613	NC_018078	CGCTG	2	10	2143797	2143806	0 %	20 %	40 %	40 %	392432380
1614	NC_018078	TCGGC	2	10	2145363	2145372	0 %	20 %	40 %	40 %	392432382
1615	NC_018078	GTGCT	2	10	2145428	2145437	0 %	40 %	40 %	20 %	392432382
1616	NC_018078	CCGGC	2	10	2145607	2145616	0 %	0 %	40 %	60 %	392432382
1617	NC_018078	CGCCA	2	10	2147430	2147439	20 %	0 %	20 %	60 %	392432383
1618	NC_018078	TGGCC	2	10	2147703	2147712	0 %	20 %	40 %	40 %	392432383
1619	NC_018078	GGACG	2	10	2147886	2147895	20 %	0 %	60 %	20 %	392432383
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1622	NC_018078	GGAAA	2	10	2153264	2153273	60 %	0 %	40 %	0 %	392432385
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1995	NC_018078	GTTAG	2	10	2725471	2725480	20 %	40 %	40 %	0 %	392432906
1996	NC_018078	CACCC	2	10	2726061	2726070	20 %	0 %	0 %	80 %	392432906
1997	NC_018078	TCGAC	2	10	2726360	2726369	20 %	20 %	20 %	40 %	392432906
1998	NC_018078	GATCG	2	10	2729743	2729752	20 %	20 %	40 %	20 %	392432910
1999	NC_018078	GCAGC	2	10	2730215	2730224	20 %	0 %	40 %	40 %	392432910
2000	NC_018078	GCCGC	2	10	2730285	2730294	0 %	0 %	40 %	60 %	392432910

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