MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018078	TCGGC	2	10	1336204	1336213	0 %	20 %	40 %	40 %	392431624
1002	NC_018078	TTCGC	2	10	1337689	1337698	0 %	40 %	20 %	40 %	392431625
1003	NC_018078	TGCGG	2	10	1339874	1339883	0 %	20 %	60 %	20 %	392431629
1004	NC_018078	GCCCA	2	10	1343115	1343124	20 %	0 %	20 %	60 %	392431633
1005	NC_018078	GGAAG	2	10	1345629	1345638	40 %	0 %	60 %	0 %	392431638
1006	NC_018078	CCAAC	2	10	1347650	1347659	40 %	0 %	0 %	60 %	392431640
1007	NC_018078	CGCGG	2	10	1348102	1348111	0 %	0 %	60 %	40 %	392431641
1008	NC_018078	CGGTG	2	10	1350253	1350262	0 %	20 %	60 %	20 %	392431642
1009	NC_018078	CCGAT	2	10	1350507	1350516	20 %	20 %	20 %	40 %	392431642
1010	NC_018078	CGGCC	2	10	1350708	1350717	0 %	0 %	40 %	60 %	392431643
1011	NC_018078	CGGTA	2	10	1350989	1350998	20 %	20 %	40 %	20 %	392431643
1012	NC_018078	CGCGG	2	10	1353011	1353020	0 %	0 %	60 %	40 %	392431646
1013	NC_018078	CTGGC	2	10	1354440	1354449	0 %	20 %	40 %	40 %	392431646
1014	NC_018078	CCGCG	2	10	1354630	1354639	0 %	0 %	40 %	60 %	392431646
1015	NC_018078	CGATC	2	10	1356175	1356184	20 %	20 %	20 %	40 %	392431648
1016	NC_018078	TCGGC	2	10	1356201	1356210	0 %	20 %	40 %	40 %	392431648
1017	NC_018078	CGGCG	2	10	1359440	1359449	0 %	0 %	60 %	40 %	392431652
1018	NC_018078	CGCGT	2	10	1359539	1359548	0 %	20 %	40 %	40 %	392431652
1019	NC_018078	GCCGG	2	10	1361957	1361966	0 %	0 %	60 %	40 %	392431656
1020	NC_018078	CGCAT	2	10	1364503	1364512	20 %	20 %	20 %	40 %	392431658
1021	NC_018078	CTCTT	2	10	1366743	1366752	0 %	60 %	0 %	40 %	392431660
1022	NC_018078	TGTGG	2	10	1367976	1367985	0 %	40 %	60 %	0 %	392431661
1023	NC_018078	CCGGA	2	10	1368133	1368142	20 %	0 %	40 %	40 %	392431661
1024	NC_018078	TGTCG	2	10	1371080	1371089	0 %	40 %	40 %	20 %	392431664
1025	NC_018078	CCGCT	2	10	1371092	1371101	0 %	20 %	20 %	60 %	392431664
1026	NC_018078	TGTGT	2	10	1373661	1373670	0 %	60 %	40 %	0 %	392431667
1027	NC_018078	CGATC	2	10	1374080	1374089	20 %	20 %	20 %	40 %	392431667
1028	NC_018078	CGCGC	2	10	1375133	1375142	0 %	0 %	40 %	60 %	392431668
1029	NC_018078	ACCGC	2	10	1376713	1376722	20 %	0 %	20 %	60 %	392431670
1030	NC_018078	GAATC	2	10	1379568	1379577	40 %	20 %	20 %	20 %	392431672
1031	NC_018078	GCGCG	2	10	1380964	1380973	0 %	0 %	60 %	40 %	392431673
1032	NC_018078	CGTCG	2	10	1382669	1382678	0 %	20 %	40 %	40 %	392431674
1033	NC_018078	GGGAT	2	10	1382685	1382694	20 %	20 %	60 %	0 %	392431674
1034	NC_018078	TTGGT	2	10	1383838	1383847	0 %	60 %	40 %	0 %	392431675
1035	NC_018078	CCCTG	2	10	1384784	1384793	0 %	20 %	20 %	60 %	392431677
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1039	NC_018078	GCTGT	2	10	1390690	1390699	0 %	40 %	40 %	20 %	392431682
1040	NC_018078	GTCTG	2	10	1390744	1390753	0 %	40 %	40 %	20 %	392431682
1041	NC_018078	GCGCG	2	10	1392976	1392985	0 %	0 %	60 %	40 %	392431685
1042	NC_018078	TGGTC	2	10	1396015	1396024	0 %	40 %	40 %	20 %	392431690
1043	NC_018078	CGTAG	2	10	1396250	1396259	20 %	20 %	40 %	20 %	392431690
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1045	NC_018078	TCGGT	2	10	1398942	1398951	0 %	40 %	40 %	20 %	392431692
1046	NC_018078	GCGCC	2	10	1401100	1401109	0 %	0 %	40 %	60 %	392431696
1047	NC_018078	GGATC	2	10	1402648	1402657	20 %	20 %	40 %	20 %	392431698
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1049	NC_018078	CGGCC	2	10	1405166	1405175	0 %	0 %	40 %	60 %	392431702
1050	NC_018078	TCGCC	2	10	1407621	1407630	0 %	20 %	20 %	60 %	392431703
1051	NC_018078	CTGCG	2	10	1410396	1410405	0 %	20 %	40 %	40 %	392431706
1052	NC_018078	CGGCG	2	10	1410949	1410958	0 %	0 %	60 %	40 %	392431706
1053	NC_018078	CTGCC	2	10	1411654	1411663	0 %	20 %	20 %	60 %	392431707
1054	NC_018078	GCCGC	2	10	1412694	1412703	0 %	0 %	40 %	60 %	392431708
1055	NC_018078	CGGCG	2	10	1412870	1412879	0 %	0 %	60 %	40 %	392431708
1056	NC_018078	CGATC	2	10	1415345	1415354	20 %	20 %	20 %	40 %	392431711
1057	NC_018078	CGCGG	2	10	1419702	1419711	0 %	0 %	60 %	40 %	392431714
1058	NC_018078	GCCTT	2	10	1419910	1419919	0 %	40 %	20 %	40 %	392431714
1059	NC_018078	CGCAG	2	10	1420076	1420085	20 %	0 %	40 %	40 %	392431714
1060	NC_018078	CGCTG	2	10	1420860	1420869	0 %	20 %	40 %	40 %	392431715
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1062	NC_018078	CCTGG	2	10	1422329	1422338	0 %	20 %	40 %	40 %	392431716
1063	NC_018078	CGGCG	2	10	1422533	1422542	0 %	0 %	60 %	40 %	392431716
1064	NC_018078	GGCCG	2	10	1422543	1422552	0 %	0 %	60 %	40 %	392431716
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1070	NC_018078	GCTGT	2	10	1432944	1432953	0 %	40 %	40 %	20 %	392431729
1071	NC_018078	AGCGC	2	10	1433354	1433363	20 %	0 %	40 %	40 %	392431730
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1076	NC_018078	CCGGG	2	10	1437945	1437954	0 %	0 %	60 %	40 %	392431738
1077	NC_018078	GGCCG	2	10	1439729	1439738	0 %	0 %	60 %	40 %	392431742
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1087	NC_018078	TGATC	2	10	1446249	1446258	20 %	40 %	20 %	20 %	392431748
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1095	NC_018078	CTGGA	2	10	1459462	1459471	20 %	20 %	40 %	20 %	392431763
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1101	NC_018078	CACCG	2	10	1464258	1464267	20 %	0 %	20 %	60 %	392431767
1102	NC_018078	TCGCC	2	10	1464916	1464925	0 %	20 %	20 %	60 %	392431768
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1108	NC_018078	GGTGG	2	10	1473206	1473215	0 %	20 %	80 %	0 %	392431777
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1494	NC_018078	GGAGA	2	10	2014305	2014314	40 %	0 %	60 %	0 %	392432262
1495	NC_018078	ACCCG	2	10	2014918	2014927	20 %	0 %	20 %	60 %	392432263
1496	NC_018078	GCCGA	2	10	2015464	2015473	20 %	0 %	40 %	40 %	392432264
1497	NC_018078	CCGTG	2	10	2017533	2017542	0 %	20 %	40 %	40 %	392432266
1498	NC_018078	CCGGT	2	10	2018197	2018206	0 %	20 %	40 %	40 %	392432267
1499	NC_018078	TGACC	2	10	2018258	2018267	20 %	20 %	20 %	40 %	392432267
1500	NC_018078	GGCTG	2	10	2018650	2018659	0 %	20 %	60 %	20 %	392432268

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