MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 77425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018078	CGA	2	6	235837	235842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430613
4002	NC_018078	CGG	2	6	235933	235938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430613
4003	NC_018078	GTA	2	6	235955	235960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430613
4004	NC_018078	TCG	2	6	235965	235970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
4005	NC_018078	GCC	3	9	236051	236059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430613
4006	NC_018078	GCG	2	6	236088	236093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430613
4007	NC_018078	TCG	2	6	236136	236141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
4008	NC_018078	TCG	2	6	236178	236183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
4009	NC_018078	GCA	2	6	236232	236237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430613
4010	NC_018078	GAT	2	6	236255	236260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430613
4011	NC_018078	GTC	2	6	236378	236383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430613
4012	NC_018078	AAG	2	6	236523	236528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430614
4013	NC_018078	GAC	2	6	236537	236542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430614
4014	NC_018078	CGC	2	6	236554	236559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430614
4015	NC_018078	GCC	2	6	236564	236569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430614
4016	NC_018078	ATC	2	6	236584	236589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430614
4017	NC_018078	ACT	2	6	236629	236634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430614
4018	NC_018078	CGC	2	6	236650	236655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430614
4019	NC_018078	GAT	2	6	236671	236676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430614
4020	NC_018078	CCG	2	6	236736	236741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430614
4021	NC_018078	ACA	2	6	236778	236783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430614
4022	NC_018078	ACG	2	6	236808	236813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430614
4023	NC_018078	GGT	2	6	236869	236874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430614
4024	NC_018078	CAG	2	6	236893	236898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430614
4025	NC_018078	GCC	2	6	236960	236965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430614
4026	NC_018078	GTA	2	6	236972	236977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430614
4027	NC_018078	TGC	2	6	237018	237023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430614
4028	NC_018078	TGA	2	6	237117	237122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430614
4029	NC_018078	GGC	2	6	237158	237163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430615
4030	NC_018078	TGG	2	6	237164	237169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430615
4031	NC_018078	CAC	2	6	237185	237190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430615
4032	NC_018078	CGC	2	6	237201	237206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430615
4033	NC_018078	TGG	2	6	237244	237249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430615
4034	NC_018078	TGC	2	6	237272	237277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430615
4035	NC_018078	TGG	2	6	237278	237283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430615
4036	NC_018078	CGT	2	6	237316	237321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430615
4037	NC_018078	CGA	3	9	237342	237350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430615
4038	NC_018078	GCC	2	6	237388	237393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430615
4039	NC_018078	CGG	3	9	237401	237409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430615
4040	NC_018078	GAC	2	6	237432	237437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430615
4041	NC_018078	GTG	2	6	237472	237477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430615
4042	NC_018078	GCC	2	6	237532	237537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430615
4043	NC_018078	GAT	2	6	237558	237563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430615
4044	NC_018078	GGC	2	6	237657	237662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430615
4045	NC_018078	GCG	2	6	237751	237756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430615
4046	NC_018078	CGG	2	6	237839	237844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430616
4047	NC_018078	GCC	2	6	237881	237886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430616
4048	NC_018078	ATC	2	6	237895	237900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430616
4049	NC_018078	CTT	2	6	238127	238132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430616
4050	NC_018078	CCG	2	6	238254	238259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430616
4051	NC_018078	GTT	2	6	238292	238297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430616
4052	NC_018078	GCG	2	6	238298	238303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430616
4053	NC_018078	CCT	2	6	238339	238344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430617
4054	NC_018078	CGC	2	6	238374	238379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4055	NC_018078	GCC	2	6	238486	238491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4056	NC_018078	AGT	2	6	238507	238512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430617
4057	NC_018078	CGG	3	9	238537	238545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430617
4058	NC_018078	GCT	2	6	238595	238600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4059	NC_018078	GTC	2	6	238692	238697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4060	NC_018078	GCC	2	6	238711	238716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4061	NC_018078	GGT	2	6	238763	238768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430617
4062	NC_018078	GCC	2	6	238977	238982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4063	NC_018078	CGC	2	6	239021	239026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4064	NC_018078	GTC	2	6	239033	239038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4065	NC_018078	ACG	2	6	239049	239054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4066	NC_018078	ACC	2	6	239128	239133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430617
4067	NC_018078	ACG	2	6	239184	239189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4068	NC_018078	GGC	3	9	239531	239539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430617
4069	NC_018078	CAG	2	6	239546	239551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4070	NC_018078	TCA	2	6	239554	239559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430617
4071	NC_018078	CAA	2	6	239600	239605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430617
4072	NC_018078	GTC	2	6	239666	239671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4073	NC_018078	CCG	2	6	239697	239702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4074	NC_018078	GTC	2	6	239825	239830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430617
4075	NC_018078	ACG	2	6	239856	239861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430617
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4077	NC_018078	CCG	2	6	239928	239933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4078	NC_018078	GCA	2	6	240040	240045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430617
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4082	NC_018078	GCC	2	6	240219	240224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
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4084	NC_018078	AGT	2	6	240484	240489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430617
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4089	NC_018078	GCC	2	6	240717	240722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4090	NC_018078	CCG	2	6	241153	241158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430617
4091	NC_018078	CAT	2	6	241226	241231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430617
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4095	NC_018078	TGA	2	6	241661	241666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430618
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4102	NC_018078	CAC	2	6	242107	242112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430619
4103	NC_018078	GCG	2	6	242123	242128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430619
4104	NC_018078	AGC	2	6	242132	242137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430619
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4107	NC_018078	GGC	3	9	242275	242283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430619
4108	NC_018078	CGG	2	6	242322	242327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430619
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4115	NC_018078	CCA	2	6	242706	242711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430619
4116	NC_018078	ACA	2	6	242760	242765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430619
4117	NC_018078	GTG	2	6	242783	242788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430619
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4353	NC_018078	TCG	2	6	255427	255432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430628
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4356	NC_018078	CGT	2	6	255524	255529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430628
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