MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 77425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_018078	AGA	3	9	32424	32432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430439
503	NC_018078	GCG	2	6	32540	32545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430439
504	NC_018078	CGG	2	6	32547	32552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430439
505	NC_018078	GCC	3	9	32635	32643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430439
506	NC_018078	CCT	2	6	32670	32675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430439
507	NC_018078	ACG	2	6	32737	32742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430439
508	NC_018078	TTG	2	6	32809	32814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430439
509	NC_018078	ACG	2	6	32860	32865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430439
510	NC_018078	ACG	2	6	33002	33007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430439
511	NC_018078	CGG	2	6	33038	33043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430439
512	NC_018078	GCC	3	9	33055	33063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430439
513	NC_018078	CCA	2	6	33105	33110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430439
514	NC_018078	TGT	2	6	33161	33166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430439
515	NC_018078	GCC	2	6	33169	33174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430439
516	NC_018078	TCG	2	6	33380	33385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430440
517	NC_018078	TTC	2	6	33392	33397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430440
518	NC_018078	GGC	2	6	33411	33416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430440
519	NC_018078	TGA	2	6	33539	33544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430440
520	NC_018078	CGA	2	6	33603	33608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430440
521	NC_018078	CGG	2	6	33636	33641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430440
522	NC_018078	CCA	2	6	34541	34546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430441
523	NC_018078	GGT	2	6	34589	34594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430441
524	NC_018078	GAC	2	6	34732	34737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430441
525	NC_018078	TGA	2	6	34751	34756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430441
526	NC_018078	CGA	2	6	34968	34973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430441
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529	NC_018078	GTT	2	6	35112	35117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430441
530	NC_018078	CTT	2	6	35142	35147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430441
531	NC_018078	GCG	2	6	35242	35247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430441
532	NC_018078	ATG	3	9	35413	35421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430441
533	NC_018078	CGA	2	6	35448	35453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430441
534	NC_018078	GGA	2	6	35460	35465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430441
535	NC_018078	CGG	2	6	35571	35576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430441
536	NC_018078	GGT	2	6	35697	35702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430441
537	NC_018078	CGG	2	6	35711	35716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430441
538	NC_018078	GCT	2	6	35741	35746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430441
539	NC_018078	CGC	2	6	35826	35831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430441
540	NC_018078	GGC	2	6	35865	35870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430441
541	NC_018078	ATC	2	6	35902	35907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430441
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543	NC_018078	CGC	2	6	35940	35945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430441
544	NC_018078	ACC	2	6	35993	35998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430441
545	NC_018078	CGC	2	6	36013	36018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430441
546	NC_018078	GCC	2	6	36029	36034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430441
547	NC_018078	ATC	2	6	36037	36042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430441
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551	NC_018078	CGG	2	6	36255	36260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430441
552	NC_018078	CGT	2	6	36282	36287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430441
553	NC_018078	GCC	2	6	36336	36341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430441
554	NC_018078	GCC	2	6	36343	36348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430441
555	NC_018078	CGG	2	6	36397	36402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430441
556	NC_018078	GGA	2	6	36589	36594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430441
557	NC_018078	ACC	2	6	36627	36632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430441
558	NC_018078	CCA	2	6	36728	36733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430442
559	NC_018078	TCG	2	6	36782	36787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430442
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561	NC_018078	CGA	2	6	36974	36979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430443
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563	NC_018078	CGC	2	6	37010	37015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430443
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565	NC_018078	CAG	2	6	37241	37246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430443
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569	NC_018078	GCA	2	6	37396	37401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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571	NC_018078	ACC	2	6	37643	37648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430444
572	NC_018078	CTG	2	6	37676	37681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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574	NC_018078	GCC	2	6	37736	37741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430444
575	NC_018078	CAG	2	6	37759	37764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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577	NC_018078	ACG	3	9	37866	37874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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579	NC_018078	GCA	2	6	37904	37909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430444
580	NC_018078	TCA	2	6	37923	37928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430444
581	NC_018078	CTG	2	6	37940	37945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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587	NC_018078	CGC	3	9	38422	38430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430444
588	NC_018078	GTC	2	6	38435	38440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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590	NC_018078	TGC	2	6	38454	38459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430444
591	NC_018078	CGC	2	6	38482	38487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430444
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593	NC_018078	GCC	2	6	38534	38539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430444
594	NC_018078	GAA	2	6	38557	38562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430444
595	NC_018078	CGA	2	6	38575	38580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430444
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601	NC_018078	CAC	3	9	38902	38910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430444
602	NC_018078	ACG	2	6	38926	38931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430444
603	NC_018078	CGG	2	6	38991	38996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430444
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605	NC_018078	CGG	2	6	39289	39294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430445
606	NC_018078	CGC	2	6	39343	39348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430445
607	NC_018078	GTT	2	6	39395	39400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430445
608	NC_018078	CGC	2	6	39545	39550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430445
609	NC_018078	CAG	2	6	39599	39604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430445
610	NC_018078	GCC	2	6	39616	39621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430445
611	NC_018078	GCC	2	6	39666	39671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430445
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615	NC_018078	TCA	2	6	39724	39729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430445
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619	NC_018078	CCA	2	6	39865	39870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430445
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622	NC_018078	CAC	2	6	40024	40029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430446
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995	NC_018078	CAG	2	6	64418	64423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430468
996	NC_018078	GCG	2	6	64534	64539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430468
997	NC_018078	CAG	2	6	64547	64552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430468
998	NC_018078	CGC	2	6	64553	64558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430468
999	NC_018078	ACT	2	6	64787	64792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430468
1000	NC_018078	GCT	2	6	64912	64917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430468

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