MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017909	CAAGAT	2	12	739	750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885755
2	NC_017909	ATAATG	2	12	2466	2477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885756
3	NC_017909	TTATAT	2	12	5631	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885759
4	NC_017909	CCACAG	2	12	6098	6109	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387885760
5	NC_017909	AATATT	2	12	9039	9050	50 %	50 %	0 %	0 %	387885762
6	NC_017909	GTTCTA	2	12	10001	10012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885763
7	NC_017909	ATCAGA	2	12	16208	16219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885767
8	NC_017909	TATAGA	2	12	19507	19518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885770
9	NC_017909	TGGATA	2	12	20954	20965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885772
10	NC_017909	TAAAGT	2	12	21465	21476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885772
11	NC_017909	TTTTAT	2	12	23246	23257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387885774
12	NC_017909	GATAAA	2	12	26212	26223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885778
13	NC_017909	GCAAAT	2	12	30842	30853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885780
14	NC_017909	TAAAAG	2	12	32200	32211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885781
15	NC_017909	ATTATA	2	12	34160	34171	50 %	50 %	0 %	0 %	387885782
16	NC_017909	TTCAGC	2	12	46478	46489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885786
17	NC_017909	TTATAT	2	12	46492	46503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885786
18	NC_017909	TGCTGT	2	12	47308	47319	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387885788
19	NC_017909	TTCTTT	2	12	51850	51861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387885793
20	NC_017909	AAAGCA	2	12	53014	53025	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387885795
21	NC_017909	TTGATC	2	12	53931	53942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885796
22	NC_017909	TGTACC	2	12	55085	55096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885797
23	NC_017909	TATGTA	2	12	63008	63019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885802
24	NC_017909	GATTAT	2	12	65938	65949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885806
25	NC_017909	AACTGT	2	12	66392	66403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885807
26	NC_017909	AAACTG	2	12	69001	69012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885810
27	NC_017909	TAAATA	2	12	69772	69783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387885811
28	NC_017909	AATTGC	2	12	71280	71291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885814
29	NC_017909	ACACCA	2	12	72187	72198	50 %	0 %	0 %	50 %	387885814
30	NC_017909	GGTTTT	2	12	78688	78699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885824
31	NC_017909	TAATAG	2	12	81587	81598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885826
32	NC_017909	TTTCAA	2	12	81869	81880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387885827
33	NC_017909	TGATTT	2	12	84846	84857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885831
34	NC_017909	AAAAAT	2	12	86393	86404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387885833
35	NC_017909	ACTCTT	2	12	92228	92239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387885840
36	NC_017909	GATATG	2	12	95479	95490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885844
37	NC_017909	GAGATA	2	12	96620	96631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885844
38	NC_017909	AGCTAA	2	12	103176	103187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885848
39	NC_017909	TAGAAA	2	12	104772	104783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885850
40	NC_017909	TGATTT	2	12	104848	104859	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885850
41	NC_017909	GAGTTA	2	12	104888	104899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885850
42	NC_017909	TACAGG	24	144	109885	110028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387885856
43	NC_017909	GTCTGG	24	144	110029	110172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387885856
44	NC_017909	CTATTC	2	12	111075	111086	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387885858
45	NC_017909	TTACTG	2	12	111102	111113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885858
46	NC_017909	GATAAA	2	12	117441	117452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885860
47	NC_017909	TTGATA	2	12	118908	118919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885863
48	NC_017909	ACTATA	2	12	125244	125255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387885868
49	NC_017909	AACTTC	2	12	131185	131196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885873
50	NC_017909	GTTCAA	2	12	139060	139071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885882
51	NC_017909	TGTGGC	12	72	139260	139331	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387885882
52	NC_017909	TCAATC	2	12	140223	140234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885882
53	NC_017909	TCAGGT	2	12	141845	141856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387885884
54	NC_017909	ATAGCT	2	12	145941	145952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885888
55	NC_017909	ATCAGT	2	12	152125	152136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885893
56	NC_017909	CATTAG	2	12	155307	155318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885896
57	NC_017909	TAGTAT	2	12	160857	160868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885902
58	NC_017909	TGGTCT	2	12	162184	162195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387885904
59	NC_017909	ATCTTT	2	12	166066	166077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387885907
60	NC_017909	ACTGAT	2	12	168122	168133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885908
61	NC_017909	AGTTTT	2	12	171178	171189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885910
62	NC_017909	TTTTTG	2	12	171231	171242	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387885910
63	NC_017909	TTCATC	2	12	171406	171417	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387885910
64	NC_017909	ATTTTC	2	12	175709	175720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387885916
65	NC_017909	ATTTTT	2	12	175884	175895	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387885916
66	NC_017909	TGTTTT	2	12	176736	176747	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387885917
67	NC_017909	TCTAAA	2	12	182828	182839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387885922
68	NC_017909	ACTGCT	2	12	183200	183211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885922
69	NC_017909	ATTAGT	2	12	184000	184011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885922
70	NC_017909	ATAGCT	2	12	189945	189956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885933
71	NC_017909	TTTGAC	2	12	196175	196186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885938
72	NC_017909	AGAAGC	2	12	199473	199484	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885941
73	NC_017909	CTGAGA	2	12	201986	201997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387885944
74	NC_017909	GTTTTT	2	12	203041	203052	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387885946
75	NC_017909	TGAAGT	2	12	205580	205591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885950
76	NC_017909	CTGTTG	2	12	207137	207148	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387885951
77	NC_017909	AGGTTG	2	12	207749	207760	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387885951
78	NC_017909	TAAAGG	2	12	208795	208806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885953
79	NC_017909	AGAGCA	2	12	209329	209340	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885954
80	NC_017909	TTGGTG	2	12	215140	215151	0 %	50 %	50 %	0 %	387885967
81	NC_017909	TAAAGG	2	12	215670	215681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885968
82	NC_017909	TGGTAT	2	12	222937	222948	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387885981
83	NC_017909	GGTATG	2	12	224393	224404	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387885981
84	NC_017909	TTTATC	2	12	227381	227392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387885984
85	NC_017909	TCTGTT	2	12	232941	232952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387885989
86	NC_017909	CCTGAG	2	12	234601	234612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387885991
87	NC_017909	GATGCT	2	12	237044	237055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387885992
88	NC_017909	AGCAGA	2	12	237850	237861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885993
89	NC_017909	AGAAGC	2	12	238006	238017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885993
90	NC_017909	GTTGAT	2	12	241084	241095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387885997
91	NC_017909	TATTTT	2	12	242012	242023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387885998
92	NC_017909	TACCAG	2	12	245876	245887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886001
93	NC_017909	TGATTA	2	12	246605	246616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387886002
94	NC_017909	TAAACT	2	12	246689	246700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886002
95	NC_017909	CAAAAG	2	12	247857	247868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387886004
96	NC_017909	ATCAAA	2	12	247886	247897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886004
97	NC_017909	CTAAAA	2	12	248778	248789	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886005
98	NC_017909	TGTTGA	2	12	248935	248946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387886005
99	NC_017909	TATTTT	2	12	249932	249943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387886007
100	NC_017909	GATATA	2	12	250445	250456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387886007
101	NC_017909	TTGAGT	2	12	255560	255571	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387886012
102	NC_017909	GGTGAA	2	12	259849	259860	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387886015
103	NC_017909	CTACAG	2	12	260267	260278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886015
104	NC_017909	TGGGTT	2	12	264290	264301	0 %	50 %	50 %	0 %	387886018
105	NC_017909	GAGATT	2	12	274761	274772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387886022
106	NC_017909	AATCAA	2	12	277388	277399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886026
107	NC_017909	TTAAAG	2	12	277492	277503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387886026
108	NC_017909	GATAAT	2	12	284260	284271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387886030
109	NC_017909	CTCAAA	2	12	284474	284485	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387886030
110	NC_017909	ATTAAT	2	12	290196	290207	50 %	50 %	0 %	0 %	387886039
111	NC_017909	TAAAAG	2	12	291786	291797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387886043
112	NC_017909	AGATTG	2	12	294096	294107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387886045
113	NC_017909	AATATT	2	12	305496	305507	50 %	50 %	0 %	0 %	387886050
114	NC_017909	TATTTT	2	12	310698	310709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387886059
115	NC_017909	GCTTTA	2	12	311431	311442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387886059
116	NC_017909	GCTATA	2	12	320827	320838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886069
117	NC_017909	TGATTC	2	12	323727	323738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387886073
118	NC_017909	ATCAAA	2	12	325453	325464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886074
119	NC_017909	ATGGAG	2	12	325900	325911	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387886075
120	NC_017909	GATGAA	2	12	329084	329095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387886080
121	NC_017909	AATCGC	2	12	333984	333995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886085
122	NC_017909	CAGCAC	2	12	342501	342512	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387886096
123	NC_017909	AATTCT	2	12	344807	344818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387886099
124	NC_017909	GGTGCT	2	12	345996	346007	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387886101
125	NC_017909	AATTAC	2	12	347453	347464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886102
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130	NC_017909	AACTAA	2	12	366557	366568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886117
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132	NC_017909	AGCAGT	2	12	369526	369537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387886118
133	NC_017909	TTAGGT	2	12	369539	369550	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387886118
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141	NC_017909	TTTGTT	2	12	381432	381443	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387886129
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144	NC_017909	CCTTGA	2	12	385527	385538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387886134
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147	NC_017909	CTTCAG	2	12	389323	389334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387886137
148	NC_017909	TAATAT	2	12	390168	390179	50 %	50 %	0 %	0 %	387886138
149	NC_017909	GTAGAT	2	12	393567	393578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387886140
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152	NC_017909	TAATGG	2	12	396068	396079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387886142
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217	NC_017909	AAAAGC	2	12	547501	547512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387886266
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219	NC_017909	GTGCTG	2	12	549420	549431	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387886266
220	NC_017909	TGATGG	2	12	552867	552878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387886269
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223	NC_017909	CTTATG	2	12	580289	580300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387886291
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226	NC_017909	ACTGAT	2	12	603678	603689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886304
227	NC_017909	TCAATA	2	12	604941	604952	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886305
228	NC_017909	ATTTTG	2	12	606113	606124	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387886306
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231	NC_017909	AATTTT	2	12	608995	609006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387886309
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