MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017909	GATTTA	2	12	1356981	1356992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387886931
502	NC_017909	GTGTAG	2	12	1361119	1361130	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387886934
503	NC_017909	TAATCG	2	12	1362344	1362355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886936
504	NC_017909	TAATAT	2	12	1364012	1364023	50 %	50 %	0 %	0 %	387886938
505	NC_017909	TAATAT	2	12	1364054	1364065	50 %	50 %	0 %	0 %	387886938
506	NC_017909	TTAGGT	2	12	1364287	1364298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387886938
507	NC_017909	TGTTTG	2	12	1364382	1364393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387886938
508	NC_017909	AGGTTT	2	12	1367175	1367186	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387886941
509	NC_017909	TAAACT	2	12	1372063	1372074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886945
510	NC_017909	CCTAAG	2	12	1372265	1372276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886945
511	NC_017909	ACTATA	2	12	1372679	1372690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886945
512	NC_017909	TTTTAG	2	12	1376203	1376214	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387886949
513	NC_017909	TAAAAA	2	12	1376456	1376467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387886949
514	NC_017909	ATTTTA	2	12	1382815	1382826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387886956
515	NC_017909	CAATAA	2	12	1383580	1383591	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886957
516	NC_017909	CATAAT	2	12	1383773	1383784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886957
517	NC_017909	ATTTTT	2	12	1386044	1386055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387886958
518	NC_017909	CTCGAT	2	12	1386827	1386838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387886958
519	NC_017909	TTTTCT	2	12	1386897	1386908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387886958
520	NC_017909	TTGATT	2	12	1389015	1389026	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387886961
521	NC_017909	ATAAAA	2	12	1389691	1389702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387886961
522	NC_017909	GTTAAT	2	12	1391956	1391967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387886965
523	NC_017909	AATTAA	2	12	1397414	1397425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387886973
524	NC_017909	GATATA	2	12	1398381	1398392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387886973
525	NC_017909	GCTTTT	2	12	1399127	1399138	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387886974
526	NC_017909	TGGTTT	2	12	1399524	1399535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387886974
527	NC_017909	AAAAGA	2	12	1402842	1402853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387886978
528	NC_017909	TTATAA	2	12	1403184	1403195	50 %	50 %	0 %	0 %	387886978
529	NC_017909	TCTTAT	2	12	1404381	1404392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387886981
530	NC_017909	TGGTAC	2	12	1407010	1407021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387886985
531	NC_017909	ATCATG	2	12	1417589	1417600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886996
532	NC_017909	GTATTT	2	12	1422891	1422902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387887001
533	NC_017909	AAAAAC	2	12	1423612	1423623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387887002
534	NC_017909	CTGAAG	2	12	1425288	1425299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387887005
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536	NC_017909	CAAAAA	2	12	1433846	1433857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387887011
537	NC_017909	TTGAAG	2	12	1433930	1433941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387887011
538	NC_017909	AGACTC	2	12	1434462	1434473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387887011
539	NC_017909	TGTAGT	2	12	1437577	1437588	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387887015
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541	NC_017909	TATCTG	2	12	1443565	1443576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387887019
542	NC_017909	GTATGT	2	12	1447891	1447902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387887023
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544	NC_017909	TGAAAT	2	12	1458903	1458914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387887042
545	NC_017909	GCTATA	2	12	1459868	1459879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387887044
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548	NC_017909	AAGTGA	2	12	1462520	1462531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387887047
549	NC_017909	CTAAAT	2	12	1463311	1463322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387887047
550	NC_017909	AATTTT	2	12	1464288	1464299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387887047
551	NC_017909	TAACTT	2	12	1472764	1472775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387887048
552	NC_017909	AAATTA	2	12	1475049	1475060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387887048
553	NC_017909	TGATCA	2	12	1477534	1477545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387887048
554	NC_017909	AGATAA	2	12	1479384	1479395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387887050
555	NC_017909	TTAAAA	2	12	1481338	1481349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387887050
556	NC_017909	ATCCAT	2	12	1482020	1482031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387887050
557	NC_017909	TAGATT	2	12	1482677	1482688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387887050
558	NC_017909	AGATAT	2	12	1485525	1485536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387887050
559	NC_017909	TATAAA	2	12	1485828	1485839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387887050
560	NC_017909	TAAATA	2	12	1486985	1486996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387887050
561	NC_017909	ATGGCT	2	12	1492164	1492175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387887054
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563	NC_017909	GCTGTA	2	12	1494981	1494992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387887055
564	NC_017909	AGATAC	2	12	1499054	1499065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387887060
565	NC_017909	TAGTGA	2	12	1500197	1500208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387887061
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567	NC_017909	AAGCTA	2	12	1501466	1501477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387887062
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575	NC_017909	CATATT	2	12	1531053	1531064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387887086
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580	NC_017909	TTTTGA	2	12	1553595	1553606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387887111
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582	NC_017909	TATTTA	2	12	1562737	1562748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387887118
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585	NC_017909	CAACAT	2	12	1574577	1574588	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387887123
586	NC_017909	CATGTT	2	12	1575156	1575167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387887123
587	NC_017909	ATAAAT	2	12	1577843	1577854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387887126
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589	NC_017909	CATTAT	2	12	1578614	1578625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387887127
590	NC_017909	CTTTTT	2	12	1578943	1578954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387887127
591	NC_017909	TGGTAT	2	12	1582664	1582675	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387887129
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593	NC_017909	TAGATG	2	12	1590953	1590964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387887135
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596	NC_017909	TTTCTT	2	12	1599670	1599681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387887146
597	NC_017909	TGTTGC	2	12	1602459	1602470	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387887149
598	NC_017909	GCAAAT	2	12	1604289	1604300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387887151
599	NC_017909	ATATTG	2	12	1605433	1605444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387887153
600	NC_017909	GATTAG	2	12	1605677	1605688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387887153
601	NC_017909	GTTGAT	2	12	1609957	1609968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387887157
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603	NC_017909	GATTTT	2	12	1615477	1615488	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387887162
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609	NC_017909	TTTGAT	2	12	1638957	1638968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387887184
610	NC_017909	CTGTAG	2	12	1639826	1639837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387887185
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612	NC_017909	TCAATA	2	12	1651032	1651043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387887194
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