MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 3092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	AGTGA	2	10	4906	4915	40 %	20 %	40 %	0 %	386311796
2	NC_017566	GTATT	2	10	5812	5821	20 %	60 %	20 %	0 %	386311796
3	NC_017566	TTTCG	2	10	9327	9336	0 %	60 %	20 %	20 %	386311798
4	NC_017566	GCTGA	2	10	9577	9586	20 %	20 %	40 %	20 %	386311798
5	NC_017566	TGGCG	2	10	9834	9843	0 %	20 %	60 %	20 %	386311799
6	NC_017566	CTTGG	2	10	12787	12796	0 %	40 %	40 %	20 %	386311801
7	NC_017566	GTTCA	2	10	16087	16096	20 %	40 %	20 %	20 %	386311804
8	NC_017566	ACATC	2	10	17458	17467	40 %	20 %	0 %	40 %	386311805
9	NC_017566	AGTTT	2	10	18759	18768	20 %	60 %	20 %	0 %	386311805
10	NC_017566	AGCGA	2	10	19068	19077	40 %	0 %	40 %	20 %	386311805
11	NC_017566	GCGCC	2	10	20177	20186	0 %	0 %	40 %	60 %	386311806
12	NC_017566	TAGAA	2	10	23772	23781	60 %	20 %	20 %	0 %	386311810
13	NC_017566	TTATT	2	10	24077	24086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017566	CAACA	2	10	25710	25719	60 %	0 %	0 %	40 %	386311812
15	NC_017566	TTGTC	2	10	27790	27799	0 %	60 %	20 %	20 %	386311814
16	NC_017566	TGCGC	2	10	28342	28351	0 %	20 %	40 %	40 %	386311814
17	NC_017566	TTGTG	2	10	29907	29916	0 %	60 %	40 %	0 %	386311815
18	NC_017566	CGAAA	2	10	32393	32402	60 %	0 %	20 %	20 %	386311818
19	NC_017566	TTCGT	2	10	33065	33074	0 %	60 %	20 %	20 %	386311819
20	NC_017566	GGATC	2	10	36077	36086	20 %	20 %	40 %	20 %	386311823
21	NC_017566	GGTCA	2	10	38159	38168	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017566	AGTCG	2	10	41688	41697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017566	AGGCT	2	10	42017	42026	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017566	ATCCC	2	10	43690	43699	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017566	CAGCA	2	10	46334	46343	40 %	0 %	20 %	40 %	386311827
26	NC_017566	GACTC	2	10	47220	47229	20 %	20 %	20 %	40 %	386311828
27	NC_017566	TGGCT	2	10	47392	47401	0 %	40 %	40 %	20 %	386311828
28	NC_017566	GATCT	2	10	48940	48949	20 %	40 %	20 %	20 %	386311829
29	NC_017566	ATCTT	2	10	48968	48977	20 %	60 %	0 %	20 %	386311829
30	NC_017566	GCAAC	2	10	50445	50454	40 %	0 %	20 %	40 %	386311830
31	NC_017566	TTTTG	2	10	51179	51188	0 %	80 %	20 %	0 %	386311831
32	NC_017566	ATTAT	2	10	54631	54640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017566	CATGC	2	10	55068	55077	20 %	20 %	20 %	40 %	386311835
34	NC_017566	TGCGC	2	10	55269	55278	0 %	20 %	40 %	40 %	386311835
35	NC_017566	CCATG	2	10	55363	55372	20 %	20 %	20 %	40 %	386311835
36	NC_017566	GCATT	2	10	57415	57424	20 %	40 %	20 %	20 %	386311837
37	NC_017566	CTGTT	2	10	57659	57668	0 %	60 %	20 %	20 %	386311837
38	NC_017566	GATTG	2	10	61512	61521	20 %	40 %	40 %	0 %	386311839
39	NC_017566	GCCTG	2	10	63621	63630	0 %	20 %	40 %	40 %	386311842
40	NC_017566	CCATT	2	10	65837	65846	20 %	40 %	0 %	40 %	386311844
41	NC_017566	GATTT	2	10	67087	67096	20 %	60 %	20 %	0 %	386311845
42	NC_017566	CATTC	2	10	69335	69344	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017566	AGCCC	2	10	72949	72958	20 %	0 %	20 %	60 %	386311850
44	NC_017566	AAACT	2	10	73945	73954	60 %	20 %	0 %	20 %	386311852
45	NC_017566	TCAGT	2	10	74602	74611	20 %	40 %	20 %	20 %	386311852
46	NC_017566	AGAAA	2	10	75118	75127	80 %	0 %	20 %	0 %	386311853
47	NC_017566	GCTTG	2	10	76387	76396	0 %	40 %	40 %	20 %	386311854
48	NC_017566	AGCAG	2	10	76924	76933	40 %	0 %	40 %	20 %	386311855
49	NC_017566	GTTGT	2	10	77868	77877	0 %	60 %	40 %	0 %	386311856
50	NC_017566	AGCTA	2	10	78761	78770	40 %	20 %	20 %	20 %	386311857
51	NC_017566	AGTTG	2	10	79114	79123	20 %	40 %	40 %	0 %	386311857
52	NC_017566	TAGGT	2	10	79283	79292	20 %	40 %	40 %	0 %	386311857
53	NC_017566	TTTAA	2	10	80073	80082	40 %	60 %	0 %	0 %	386311857
54	NC_017566	CTCAA	2	10	82328	82337	40 %	20 %	0 %	40 %	386311859
55	NC_017566	GGTAT	2	10	83626	83635	20 %	40 %	40 %	0 %	386311861
56	NC_017566	GCAGG	2	10	85271	85280	20 %	0 %	60 %	20 %	386311863
57	NC_017566	AGTTT	2	10	89023	89032	20 %	60 %	20 %	0 %	386311867
58	NC_017566	CCTTA	2	10	91387	91396	20 %	40 %	0 %	40 %	386311869
59	NC_017566	AGTTT	2	10	91421	91430	20 %	60 %	20 %	0 %	386311869
60	NC_017566	AACGT	2	10	92649	92658	40 %	20 %	20 %	20 %	386311869
61	NC_017566	TGAGT	2	10	93013	93022	20 %	40 %	40 %	0 %	386311869
62	NC_017566	TGGTA	2	10	94756	94765	20 %	40 %	40 %	0 %	386311871
63	NC_017566	TGGCT	2	10	96740	96749	0 %	40 %	40 %	20 %	386311873
64	NC_017566	TTAAG	2	10	103580	103589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017566	TCTGC	2	10	104057	104066	0 %	40 %	20 %	40 %	386311880
66	NC_017566	CATTT	2	10	104526	104535	20 %	60 %	0 %	20 %	386311880
67	NC_017566	AAGCT	2	10	105005	105014	40 %	20 %	20 %	20 %	386311881
68	NC_017566	AAGTT	2	10	105253	105262	40 %	40 %	20 %	0 %	386311881
69	NC_017566	TAAAG	2	10	105535	105544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017566	TAGTC	2	10	107936	107945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017566	TGTTT	2	10	109726	109735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017566	CCCAA	2	10	110622	110631	40 %	0 %	0 %	60 %	386311887
73	NC_017566	CGGGC	2	10	112069	112078	0 %	0 %	60 %	40 %	386311888
74	NC_017566	CTAAG	2	10	115892	115901	40 %	20 %	20 %	20 %	386311891
75	NC_017566	GCGCT	2	10	116271	116280	0 %	20 %	40 %	40 %	386311892
76	NC_017566	GCCAT	2	10	116415	116424	20 %	20 %	20 %	40 %	386311892
77	NC_017566	AAGCC	2	10	116933	116942	40 %	0 %	20 %	40 %	386311893
78	NC_017566	TCCAG	2	10	119308	119317	20 %	20 %	20 %	40 %	386311894
79	NC_017566	AACAG	2	10	121556	121565	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017566	CACTG	2	10	122414	122423	20 %	20 %	20 %	40 %	386311896
81	NC_017566	ATTAC	2	10	124719	124728	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017566	GGCTT	2	10	127455	127464	0 %	40 %	40 %	20 %	386311898
83	NC_017566	TTCAC	2	10	129270	129279	20 %	40 %	0 %	40 %	386311900
84	NC_017566	TTCGC	2	10	133017	133026	0 %	40 %	20 %	40 %	386311904
85	NC_017566	TGACT	2	10	135321	135330	20 %	40 %	20 %	20 %	386311905
86	NC_017566	ACGCA	2	10	135523	135532	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017566	ATTGC	2	10	138173	138182	20 %	40 %	20 %	20 %	386311908
88	NC_017566	AACAA	2	10	139503	139512	80 %	0 %	0 %	20 %	386311908
89	NC_017566	TTTAG	2	10	141224	141233	20 %	60 %	20 %	0 %	386311909
90	NC_017566	GTTCA	2	10	141235	141244	20 %	40 %	20 %	20 %	386311909
91	NC_017566	TGGGC	2	10	141620	141629	0 %	20 %	60 %	20 %	386311909
92	NC_017566	GCATC	2	10	142652	142661	20 %	20 %	20 %	40 %	386311911
93	NC_017566	AGAGA	2	10	145598	145607	60 %	0 %	40 %	0 %	386311914
94	NC_017566	AAAGT	2	10	146272	146281	60 %	20 %	20 %	0 %	386311915
95	NC_017566	GGTTT	2	10	146887	146896	0 %	60 %	40 %	0 %	386311915
96	NC_017566	TTGAG	2	10	150606	150615	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017566	CTATT	2	10	151048	151057	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017566	TAGAA	2	10	151629	151638	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017566	AAAAT	2	10	152089	152098	80 %	20 %	0 %	0 %	386311920
100	NC_017566	CTGTG	2	10	153239	153248	0 %	40 %	40 %	20 %	386311921
101	NC_017566	ATCCT	2	10	154630	154639	20 %	40 %	0 %	40 %	386311922
102	NC_017566	ACTGC	2	10	155302	155311	20 %	20 %	20 %	40 %	386311922
103	NC_017566	TAGGC	2	10	155587	155596	20 %	20 %	40 %	20 %	386311923
104	NC_017566	GCCAA	2	10	160057	160066	40 %	0 %	20 %	40 %	386311929
105	NC_017566	CGGCA	2	10	161572	161581	20 %	0 %	40 %	40 %	386311931
106	NC_017566	TGGCG	2	10	165618	165627	0 %	20 %	60 %	20 %	386311934
107	NC_017566	GTTAA	2	10	168270	168279	40 %	40 %	20 %	0 %	386311935
108	NC_017566	AACAA	2	10	168658	168667	80 %	0 %	0 %	20 %	386311936
109	NC_017566	TACTG	2	10	170231	170240	20 %	40 %	20 %	20 %	386311937
110	NC_017566	CTGTA	2	10	170678	170687	20 %	40 %	20 %	20 %	386311937
111	NC_017566	AGCGA	2	10	176396	176405	40 %	0 %	40 %	20 %	386311942
112	NC_017566	CAGTT	2	10	178331	178340	20 %	40 %	20 %	20 %	386311945
113	NC_017566	GAATT	2	10	179277	179286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017566	TACTC	2	10	180561	180570	20 %	40 %	0 %	40 %	386311948
115	NC_017566	AGCAA	2	10	184062	184071	60 %	0 %	20 %	20 %	386311949
116	NC_017566	CTGAT	2	10	184113	184122	20 %	40 %	20 %	20 %	386311949
117	NC_017566	TCTGT	2	10	184198	184207	0 %	60 %	20 %	20 %	386311949
118	NC_017566	GAAAA	2	10	189039	189048	80 %	0 %	20 %	0 %	386311951
119	NC_017566	GTTCT	2	10	189522	189531	0 %	60 %	20 %	20 %	386311952
120	NC_017566	TGGCG	2	10	194349	194358	0 %	20 %	60 %	20 %	386311956
121	NC_017566	AAGCC	2	10	199996	200005	40 %	0 %	20 %	40 %	386311969
122	NC_017566	TCGCG	2	10	202043	202052	0 %	20 %	40 %	40 %	386311974
123	NC_017566	CATTG	2	10	203923	203932	20 %	40 %	20 %	20 %	386311977
124	NC_017566	ATGGC	2	10	204303	204312	20 %	20 %	40 %	20 %	386311978
125	NC_017566	CGTGA	2	10	206017	206026	20 %	20 %	40 %	20 %	386311980
126	NC_017566	GATGT	2	10	207338	207347	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017566	TTCTG	2	10	207405	207414	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017566	GCTTT	2	10	213153	213162	0 %	60 %	20 %	20 %	386311989
129	NC_017566	GCTGA	2	10	214912	214921	20 %	20 %	40 %	20 %	386311990
130	NC_017566	AGTCG	2	10	219724	219733	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017566	AGGCT	2	10	220053	220062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017566	ATAAG	2	10	221618	221627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017566	ATCCC	2	10	221728	221737	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_017566	TCCGC	2	10	221914	221923	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017566	CCATG	2	10	222257	222266	20 %	20 %	20 %	40 %	386311993
136	NC_017566	TGGTT	2	10	224824	224833	0 %	60 %	40 %	0 %	386311995
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138	NC_017566	TTCTT	2	10	228262	228271	0 %	80 %	0 %	20 %	386311998
139	NC_017566	GCATG	2	10	229569	229578	20 %	20 %	40 %	20 %	386311999
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141	NC_017566	TTTGT	2	10	231880	231889	0 %	80 %	20 %	0 %	386312002
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143	NC_017566	TTTGA	2	10	235039	235048	20 %	60 %	20 %	0 %	386312005
144	NC_017566	TTGAA	2	10	236445	236454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_017566	CTTTA	2	10	261340	261349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_017566	TGGTT	2	10	272979	272988	0 %	60 %	40 %	0 %	386312042
175	NC_017566	TATGG	2	10	273129	273138	20 %	40 %	40 %	0 %	386312042
176	NC_017566	TGCAT	2	10	280066	280075	20 %	40 %	20 %	20 %	386312049
177	NC_017566	GTCGT	2	10	280634	280643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_017566	TGCTC	2	10	289183	289192	0 %	40 %	20 %	40 %	386312059
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185	NC_017566	ACATA	2	10	295995	296004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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208	NC_017566	CATCT	2	10	332872	332881	20 %	40 %	0 %	40 %	386312101
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250	NC_017566	GATAA	2	10	392750	392759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017566	AGTCG	2	10	393995	394004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_017566	AGGCT	2	10	394324	394333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
253	NC_017566	ATAAG	2	10	395889	395898	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017566	ATCCC	2	10	395999	396008	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
255	NC_017566	GATTT	2	10	396260	396269	20 %	60 %	20 %	0 %	386312152
256	NC_017566	GCTCG	2	10	397633	397642	0 %	20 %	40 %	40 %	386312153
257	NC_017566	TCGGC	2	10	399786	399795	0 %	20 %	40 %	40 %	386312154
258	NC_017566	TGATC	2	10	400427	400436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
259	NC_017566	CATCT	2	10	400799	400808	20 %	40 %	0 %	40 %	386312155
260	NC_017566	CAAAG	2	10	401494	401503	60 %	0 %	20 %	20 %	386312155
261	NC_017566	GCAGG	2	10	403719	403728	20 %	0 %	60 %	20 %	386312158
262	NC_017566	CGCAG	2	10	407835	407844	20 %	0 %	40 %	40 %	386312161
263	NC_017566	AAGCC	2	10	408839	408848	40 %	0 %	20 %	40 %	386312162
264	NC_017566	CTGAG	2	10	409601	409610	20 %	20 %	40 %	20 %	386312163
265	NC_017566	TTTAT	2	10	412801	412810	20 %	80 %	0 %	0 %	386312166
266	NC_017566	GATTA	2	10	412841	412850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017566	GATGA	2	10	413616	413625	40 %	20 %	40 %	0 %	386312168
268	NC_017566	TGGCA	2	10	416566	416575	20 %	20 %	40 %	20 %	386312169
269	NC_017566	CGATT	2	10	416731	416740	20 %	40 %	20 %	20 %	386312170
270	NC_017566	ACATC	2	10	418969	418978	40 %	20 %	0 %	40 %	386312171
271	NC_017566	AGCAT	2	10	421169	421178	40 %	20 %	20 %	20 %	386312173
272	NC_017566	TAAAT	2	10	422055	422064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017566	TACGC	2	10	427120	427129	20 %	20 %	20 %	40 %	386312179
274	NC_017566	GTTAA	2	10	427827	427836	40 %	40 %	20 %	0 %	386312179
275	NC_017566	AGCCA	2	10	431221	431230	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
276	NC_017566	TTTAA	2	10	433689	433698	40 %	60 %	0 %	0 %	386312186
277	NC_017566	TGCTT	2	10	437701	437710	0 %	60 %	20 %	20 %	386312191
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282	NC_017566	GGCAT	2	10	450345	450354	20 %	20 %	40 %	20 %	386312193
283	NC_017566	CTTTG	2	10	451346	451355	0 %	60 %	20 %	20 %	386312194
284	NC_017566	AGATG	2	10	452041	452050	40 %	20 %	40 %	0 %	386312194
285	NC_017566	AGATC	2	10	452412	452421	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_017566	GATAG	2	10	452640	452649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017566	CGAGC	2	10	456063	456072	20 %	0 %	40 %	40 %	386312199
288	NC_017566	TGAGT	2	10	458664	458673	20 %	40 %	40 %	0 %	386312200
289	NC_017566	TAATT	2	10	458755	458764	40 %	60 %	0 %	0 %	386312200
290	NC_017566	CTATG	2	10	460525	460534	20 %	40 %	20 %	20 %	386312202
291	NC_017566	TAGCG	2	10	462219	462228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
292	NC_017566	TCCGC	2	10	464197	464206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
293	NC_017566	GATAA	2	10	468617	468626	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017566	AGTCG	2	10	469862	469871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_017566	AGGCT	2	10	470191	470200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
296	NC_017566	ATAAG	2	10	471756	471765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017566	ATCCC	2	10	471866	471875	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
298	NC_017566	ATCCC	2	10	472168	472177	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
299	NC_017566	TCAAC	2	10	476137	476146	40 %	20 %	0 %	40 %	386312210
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323	NC_017566	ATCTT	2	10	517873	517882	20 %	60 %	0 %	20 %	386312252
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332	NC_017566	GATAA	2	10	532604	532613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_017566	CGTGG	2	10	559147	559156	0 %	20 %	60 %	20 %	386312289
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353	NC_017566	ATTTG	2	10	575491	575500	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_017566	GGTGA	2	10	591614	591623	20 %	20 %	60 %	0 %	386312312
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379	NC_017566	GTTTA	2	10	605784	605793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_017566	AGATC	2	10	607246	607255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
383	NC_017566	TGGAC	2	10	608429	608438	20 %	20 %	40 %	20 %	386312324
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385	NC_017566	CAAAA	2	10	609932	609941	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
386	NC_017566	GCGCC	2	10	611039	611048	0 %	0 %	40 %	60 %	386312327
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392	NC_017566	TGGCG	2	10	616926	616935	0 %	20 %	60 %	20 %	386312333
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394	NC_017566	CTGTG	2	10	620938	620947	0 %	40 %	40 %	20 %	386312335
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396	NC_017566	ATGCG	2	10	624104	624113	20 %	20 %	40 %	20 %	386312338
397	NC_017566	GGTTG	2	10	624150	624159	0 %	40 %	60 %	0 %	386312338
398	NC_017566	GCGAG	2	10	624752	624761	20 %	0 %	60 %	20 %	386312338
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400	NC_017566	CATTG	2	10	626987	626996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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