MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 11115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	ATGG	2	8	171	178	25 %	25 %	50 %	0 %	386311793
2	NC_017566	GCCC	2	8	338	345	0 %	0 %	25 %	75 %	386311793
3	NC_017566	CTTG	2	8	824	831	0 %	50 %	25 %	25 %	386311793
4	NC_017566	TTGG	2	8	913	920	0 %	50 %	50 %	0 %	386311793
5	NC_017566	CGTG	2	8	1052	1059	0 %	25 %	50 %	25 %	386311793
6	NC_017566	TAAC	2	8	1306	1313	50 %	25 %	0 %	25 %	386311793
7	NC_017566	CAAT	2	8	2413	2420	50 %	25 %	0 %	25 %	386311794
8	NC_017566	TGAT	2	8	2499	2506	25 %	50 %	25 %	0 %	386311794
9	NC_017566	ATGT	2	8	2552	2559	25 %	50 %	25 %	0 %	386311794
10	NC_017566	CCAT	2	8	2676	2683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017566	ATTT	2	8	2904	2911	25 %	75 %	0 %	0 %	386311795
12	NC_017566	CGTT	2	8	2925	2932	0 %	50 %	25 %	25 %	386311795
13	NC_017566	TGAT	2	8	4490	4497	25 %	50 %	25 %	0 %	386311796
14	NC_017566	ATTG	2	8	5439	5446	25 %	50 %	25 %	0 %	386311796
15	NC_017566	ACTA	2	8	5896	5903	50 %	25 %	0 %	25 %	386311796
16	NC_017566	TGAT	2	8	6315	6322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017566	GCTG	2	8	6844	6851	0 %	25 %	50 %	25 %	386311797
18	NC_017566	ATTT	2	8	7064	7071	25 %	75 %	0 %	0 %	386311797
19	NC_017566	TTGC	2	8	7307	7314	0 %	50 %	25 %	25 %	386311797
20	NC_017566	GGCG	2	8	7410	7417	0 %	0 %	75 %	25 %	386311797
21	NC_017566	TGCT	2	8	7872	7879	0 %	50 %	25 %	25 %	386311798
22	NC_017566	AGTG	2	8	8168	8175	25 %	25 %	50 %	0 %	386311798
23	NC_017566	GGCG	2	8	8456	8463	0 %	0 %	75 %	25 %	386311798
24	NC_017566	TCAA	2	8	9190	9197	50 %	25 %	0 %	25 %	386311798
25	NC_017566	CTTG	2	8	11888	11895	0 %	50 %	25 %	25 %	386311801
26	NC_017566	ACAT	2	8	11912	11919	50 %	25 %	0 %	25 %	386311801
27	NC_017566	GGTT	2	8	12206	12213	0 %	50 %	50 %	0 %	386311801
28	NC_017566	GATG	2	8	13060	13067	25 %	25 %	50 %	0 %	386311801
29	NC_017566	GTAG	2	8	13830	13837	25 %	25 %	50 %	0 %	386311801
30	NC_017566	TCAA	2	8	13925	13932	50 %	25 %	0 %	25 %	386311801
31	NC_017566	TAGG	2	8	14744	14751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017566	TTCA	2	8	15270	15277	25 %	50 %	0 %	25 %	386311802
33	NC_017566	TGAT	2	8	15735	15742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017566	AATT	2	8	15798	15805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017566	TTAA	2	8	16403	16410	50 %	50 %	0 %	0 %	386311804
36	NC_017566	CAGA	2	8	16917	16924	50 %	0 %	25 %	25 %	386311804
37	NC_017566	TCTT	2	8	17376	17383	0 %	75 %	0 %	25 %	386311805
38	NC_017566	CCAA	2	8	17585	17592	50 %	0 %	0 %	50 %	386311805
39	NC_017566	TTGA	2	8	17883	17890	25 %	50 %	25 %	0 %	386311805
40	NC_017566	TCAC	2	8	17925	17932	25 %	25 %	0 %	50 %	386311805
41	NC_017566	GCTG	2	8	18141	18148	0 %	25 %	50 %	25 %	386311805
42	NC_017566	TGCT	2	8	18401	18408	0 %	50 %	25 %	25 %	386311805
43	NC_017566	TTGC	2	8	19183	19190	0 %	50 %	25 %	25 %	386311805
44	NC_017566	GAGT	2	8	20243	20250	25 %	25 %	50 %	0 %	386311806
45	NC_017566	CGTT	2	8	20537	20544	0 %	50 %	25 %	25 %	386311806
46	NC_017566	CCAT	2	8	20756	20763	25 %	25 %	0 %	50 %	386311806
47	NC_017566	ATTG	2	8	21220	21227	25 %	50 %	25 %	0 %	386311807
48	NC_017566	CAAA	2	8	21416	21423	75 %	0 %	0 %	25 %	386311807
49	NC_017566	TATT	2	8	21854	21861	25 %	75 %	0 %	0 %	386311808
50	NC_017566	ATTT	2	8	21975	21982	25 %	75 %	0 %	0 %	386311808
51	NC_017566	TGCT	2	8	22145	22152	0 %	50 %	25 %	25 %	386311808
52	NC_017566	TTGG	2	8	22314	22321	0 %	50 %	50 %	0 %	386311808
53	NC_017566	TTCT	2	8	22444	22451	0 %	75 %	0 %	25 %	386311808
54	NC_017566	GCTT	2	8	23011	23018	0 %	50 %	25 %	25 %	386311808
55	NC_017566	GCAG	2	8	23288	23295	25 %	0 %	50 %	25 %	386311809
56	NC_017566	GATT	2	8	23549	23556	25 %	50 %	25 %	0 %	386311809
57	NC_017566	CCGA	2	8	23619	23626	25 %	0 %	25 %	50 %	386311809
58	NC_017566	TCAC	2	8	24061	24068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017566	GAGC	2	8	25123	25130	25 %	0 %	50 %	25 %	386311812
60	NC_017566	AGAA	2	8	25469	25476	75 %	0 %	25 %	0 %	386311812
61	NC_017566	TACC	2	8	25581	25588	25 %	25 %	0 %	50 %	386311812
62	NC_017566	GAAA	2	8	26249	26256	75 %	0 %	25 %	0 %	386311812
63	NC_017566	TGAG	2	8	26611	26618	25 %	25 %	50 %	0 %	386311813
64	NC_017566	GCTC	2	8	26893	26900	0 %	25 %	25 %	50 %	386311813
65	NC_017566	GGTA	2	8	26996	27003	25 %	25 %	50 %	0 %	386311813
66	NC_017566	CACC	2	8	27662	27669	25 %	0 %	0 %	75 %	386311813
67	NC_017566	TCTA	2	8	27873	27880	25 %	50 %	0 %	25 %	386311814
68	NC_017566	TCGC	2	8	28444	28451	0 %	25 %	25 %	50 %	386311814
69	NC_017566	CAGC	2	8	29009	29016	25 %	0 %	25 %	50 %	386311814
70	NC_017566	GGCT	2	8	29491	29498	0 %	25 %	50 %	25 %	386311815
71	NC_017566	CGCC	2	8	29599	29606	0 %	0 %	25 %	75 %	386311815
72	NC_017566	TTTG	2	8	30040	30047	0 %	75 %	25 %	0 %	386311816
73	NC_017566	GATA	2	8	30069	30076	50 %	25 %	25 %	0 %	386311816
74	NC_017566	ACAA	2	8	30081	30088	75 %	0 %	0 %	25 %	386311816
75	NC_017566	AGTT	2	8	30547	30554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017566	GTTT	2	8	30693	30700	0 %	75 %	25 %	0 %	386311817
77	NC_017566	TTAT	2	8	30854	30861	25 %	75 %	0 %	0 %	386311817
78	NC_017566	TGAT	2	8	31928	31935	25 %	50 %	25 %	0 %	386311818
79	NC_017566	ACTC	2	8	32951	32958	25 %	25 %	0 %	50 %	386311819
80	NC_017566	AACC	2	8	33205	33212	50 %	0 %	0 %	50 %	386311819
81	NC_017566	GTGG	2	8	35309	35316	0 %	25 %	75 %	0 %	386311822
82	NC_017566	TTTG	2	8	35518	35525	0 %	75 %	25 %	0 %	386311822
83	NC_017566	GACA	2	8	36296	36303	50 %	0 %	25 %	25 %	386311824
84	NC_017566	TTCA	2	8	36348	36355	25 %	50 %	0 %	25 %	386311824
85	NC_017566	CCCA	2	8	36372	36379	25 %	0 %	0 %	75 %	386311824
86	NC_017566	GCGG	2	8	36453	36460	0 %	0 %	75 %	25 %	386311824
87	NC_017566	ATGA	2	8	36834	36841	50 %	25 %	25 %	0 %	386311824
88	NC_017566	TTTG	2	8	37327	37334	0 %	75 %	25 %	0 %	386311825
89	NC_017566	ACTA	2	8	37528	37535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017566	GTTT	2	8	38585	38592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017566	GCGA	2	8	40839	40846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017566	CTGA	2	8	41018	41025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017566	CGTC	2	8	41543	41550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017566	AAAG	2	8	41666	41673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017566	GGTG	2	8	42061	42068	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017566	ATTG	2	8	42436	42443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017566	GAAC	2	8	43255	43262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017566	ATTA	2	8	43905	43912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017566	AATT	2	8	44474	44481	50 %	50 %	0 %	0 %	386311827
100	NC_017566	ATTG	2	8	44574	44581	25 %	50 %	25 %	0 %	386311827
101	NC_017566	ATTA	2	8	44607	44614	50 %	50 %	0 %	0 %	386311827
102	NC_017566	TTTC	2	8	44848	44855	0 %	75 %	0 %	25 %	386311827
103	NC_017566	AGTT	2	8	45158	45165	25 %	50 %	25 %	0 %	386311827
104	NC_017566	TTTA	2	8	45330	45337	25 %	75 %	0 %	0 %	386311827
105	NC_017566	CTTG	2	8	45414	45421	0 %	50 %	25 %	25 %	386311827
106	NC_017566	AGCA	2	8	45929	45936	50 %	0 %	25 %	25 %	386311827
107	NC_017566	GATT	2	8	45999	46006	25 %	50 %	25 %	0 %	386311827
108	NC_017566	CGTA	2	8	46033	46040	25 %	25 %	25 %	25 %	386311827
109	NC_017566	TGAA	2	8	46109	46116	50 %	25 %	25 %	0 %	386311827
110	NC_017566	CAAC	2	8	46691	46698	50 %	0 %	0 %	50 %	386311828
111	NC_017566	GCAT	2	8	47795	47802	25 %	25 %	25 %	25 %	386311829
112	NC_017566	AGTT	2	8	47974	47981	25 %	50 %	25 %	0 %	386311829
113	NC_017566	AGCG	2	8	49048	49055	25 %	0 %	50 %	25 %	386311829
114	NC_017566	CCGC	2	8	49466	49473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017566	TGAT	2	8	49523	49530	25 %	50 %	25 %	0 %	386311830
116	NC_017566	GAAA	2	8	49674	49681	75 %	0 %	25 %	0 %	386311830
117	NC_017566	CTGA	2	8	50983	50990	25 %	25 %	25 %	25 %	386311831
118	NC_017566	GTTG	2	8	51355	51362	0 %	50 %	50 %	0 %	386311831
119	NC_017566	AAAT	2	8	51402	51409	75 %	25 %	0 %	0 %	386311831
120	NC_017566	TGTC	2	8	52111	52118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017566	TTAA	2	8	52381	52388	50 %	50 %	0 %	0 %	386311832
122	NC_017566	AGGC	2	8	52850	52857	25 %	0 %	50 %	25 %	386311833
123	NC_017566	TCTT	2	8	53128	53135	0 %	75 %	0 %	25 %	386311833
124	NC_017566	CTTT	2	8	53209	53216	0 %	75 %	0 %	25 %	386311833
125	NC_017566	TGAG	2	8	53512	53519	25 %	25 %	50 %	0 %	386311834
126	NC_017566	AAAT	2	8	53849	53856	75 %	25 %	0 %	0 %	386311834
127	NC_017566	CGGT	2	8	54227	54234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017566	CCAT	2	8	54387	54394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017566	CCAG	2	8	54429	54436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017566	ATTT	2	8	54708	54715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017566	GATA	2	8	54876	54883	50 %	25 %	25 %	0 %	386311835
132	NC_017566	ATTA	2	8	55615	55622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017566	TGAA	2	8	56149	56156	50 %	25 %	25 %	0 %	386311836
134	NC_017566	AATG	2	8	56253	56260	50 %	25 %	25 %	0 %	386311836
135	NC_017566	CTAA	2	8	56308	56315	50 %	25 %	0 %	25 %	386311836
136	NC_017566	AATG	2	8	56870	56877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017566	CTTA	2	8	56982	56989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017566	TTTG	2	8	57220	57227	0 %	75 %	25 %	0 %	386311837
139	NC_017566	AAGT	2	8	57543	57550	50 %	25 %	25 %	0 %	386311837
140	NC_017566	ATAA	2	8	57620	57627	75 %	25 %	0 %	0 %	386311837
141	NC_017566	TTGA	2	8	58454	58461	25 %	50 %	25 %	0 %	386311837
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