MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017449	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823584
2	NC_017449	CTATTT	2	12	2981	2992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387823586
3	NC_017449	CAGGTA	2	12	5167	5178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387823588
4	NC_017449	ATTTAT	2	12	7005	7016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823590
5	NC_017449	GATTTT	2	12	8488	8499	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387823591
6	NC_017449	CAAAGC	2	12	11014	11025	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387823596
7	NC_017449	TGGTAA	2	12	12088	12099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823596
8	NC_017449	TTTTGC	2	12	12193	12204	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387823597
9	NC_017449	TACAAA	2	12	12486	12497	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387823597
10	NC_017449	TTAGCA	2	12	12541	12552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823597
11	NC_017449	TTTATT	2	12	12948	12959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387823597
12	NC_017449	CTTAAT	2	12	13231	13242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387823598
13	NC_017449	ATGATT	2	12	13972	13983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387823599
14	NC_017449	AGATAT	2	12	19120	19131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387823602
15	NC_017449	TCACCA	2	12	19816	19827	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387823603
16	NC_017449	ATCGCC	2	12	22452	22463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387823604
17	NC_017449	ACCAAT	2	12	25613	25624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387823606
18	NC_017449	TACTAG	2	12	28997	29008	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823609
19	NC_017449	TTTTTC	2	12	29590	29601	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387823610
20	NC_017449	AGAACT	2	12	30362	30373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823611
21	NC_017449	ATCTAT	2	12	34214	34225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387823614
22	NC_017449	GCAAAT	2	12	36732	36743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823616
23	NC_017449	TAGCTG	2	12	44598	44609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823623
24	NC_017449	CTTGAG	2	12	44892	44903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823623
25	NC_017449	AATTTT	2	12	48447	48458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823626
26	NC_017449	AACCAA	2	12	52537	52548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823628
27	NC_017449	AATACC	2	12	53258	53269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387823628
28	NC_017449	AATGAA	2	12	56535	56546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387823633
29	NC_017449	TTTATC	2	12	57532	57543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387823634
30	NC_017449	AGTTAG	2	12	59062	59073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823635
31	NC_017449	CTAATA	2	12	63673	63684	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387823642
32	NC_017449	ATAATT	2	12	65645	65656	50 %	50 %	0 %	0 %	387823645
33	NC_017449	TTGATA	2	12	65909	65920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387823645
34	NC_017449	TAAAAA	2	12	66156	66167	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387823645
35	NC_017449	TAAAAA	2	12	68940	68951	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387823646
36	NC_017449	GAAAAT	2	12	69736	69747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387823647
37	NC_017449	GATGTT	2	12	69835	69846	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387823647
38	NC_017449	GCTAAG	2	12	70399	70410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387823648
39	NC_017449	AGCTTA	2	12	71683	71694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823649
40	NC_017449	ATAATT	2	12	73724	73735	50 %	50 %	0 %	0 %	387823652
41	NC_017449	GTTGCT	2	12	74882	74893	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387823652
42	NC_017449	ATATTT	2	12	75030	75041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823653
43	NC_017449	AACAGT	2	12	75418	75429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823654
44	NC_017449	AATGGC	2	12	76821	76832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387823655
45	NC_017449	ATTATC	2	12	78505	78516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387823658
46	NC_017449	AACTGA	2	12	78875	78886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823658
47	NC_017449	AAGGAT	2	12	81959	81970	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823662
48	NC_017449	CAAATA	2	12	82218	82229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387823662
49	NC_017449	CTAAAA	2	12	84089	84100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387823665
50	NC_017449	GTTATT	2	12	86472	86483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387823667
51	NC_017449	CTTGAG	2	12	87689	87700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823668
52	NC_017449	GGTTTT	2	12	92042	92053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823673
53	NC_017449	TTTGGA	2	12	99011	99022	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387823681
54	NC_017449	ATCTAA	2	12	101728	101739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387823683
55	NC_017449	GTTGAT	2	12	106160	106171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387823689
56	NC_017449	AGCAAC	2	12	110492	110503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387823694
57	NC_017449	GAGATA	2	12	111224	111235	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823694
58	NC_017449	TTATAC	2	12	114444	114455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387823696
59	NC_017449	TTAGGC	2	12	122679	122690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823702
60	NC_017449	TAGTTT	2	12	125762	125773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387823705
61	NC_017449	TAAATA	2	12	126890	126901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823707
62	NC_017449	AAAGAT	2	12	128480	128491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387823709
63	NC_017449	GATCTA	2	12	130860	130871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823711
64	NC_017449	AAATAT	2	12	133736	133747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823712
65	NC_017449	ACTTAA	2	12	134743	134754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387823714
66	NC_017449	ACTTTT	2	12	136259	136270	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387823716
67	NC_017449	TACAAC	2	12	137727	137738	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387823717
68	NC_017449	TCCTTG	2	12	141072	141083	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387823720
69	NC_017449	TTGAGC	2	12	145339	145350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823723
70	NC_017449	AAATAA	2	12	148249	148260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387823725
71	NC_017449	AACTTC	2	12	150198	150209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823727
72	NC_017449	TTATGA	2	12	152400	152411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387823729
73	NC_017449	TTTAAG	2	12	154733	154744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387823731
74	NC_017449	ATCAAA	2	12	154928	154939	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387823732
75	NC_017449	GGTGCT	2	12	154986	154997	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387823732
76	NC_017449	GTACAG	2	12	155101	155112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387823732
77	NC_017449	TATTGA	2	12	159302	159313	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387823735
78	NC_017449	CAAAGT	2	12	159432	159443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823735
79	NC_017449	AATACT	2	12	159639	159650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387823735
80	NC_017449	TGAGGA	2	12	161995	162006	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387823737
81	NC_017449	TATAGC	2	12	163182	163193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823739
82	NC_017449	TTAAGC	2	12	165532	165543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823741
83	NC_017449	TCATTT	2	12	165781	165792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387823741
84	NC_017449	TTTCAT	2	12	168052	168063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387823743
85	NC_017449	GATTAG	2	12	169799	169810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823744
86	NC_017449	CAGATA	2	12	170210	170221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823744
87	NC_017449	ATCGTA	2	12	170432	170443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823745
88	NC_017449	AGGTAA	2	12	170464	170475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823745
89	NC_017449	TTGACT	2	12	175992	176003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387823751
90	NC_017449	ATCATT	2	12	178679	178690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387823754
91	NC_017449	TACCAA	2	12	182217	182228	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387823757
92	NC_017449	AAATAA	2	12	182290	182301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387823757
93	NC_017449	TCTGTA	2	12	186196	186207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387823761
94	NC_017449	TTTTTG	2	12	187737	187748	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387823762
95	NC_017449	TTAAGT	2	12	188347	188358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387823762
96	NC_017449	TATGCA	2	12	190308	190319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823764
97	NC_017449	ATTATA	2	12	193702	193713	50 %	50 %	0 %	0 %	387823768
98	NC_017449	CACCAA	2	12	195495	195506	50 %	0 %	0 %	50 %	387823770
99	NC_017449	CATCGC	2	12	201567	201578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387823777
100	NC_017449	TGTTTT	2	12	202000	202011	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387823778
101	NC_017449	ACTAGT	2	12	203033	203044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823779
102	NC_017449	AAGATG	2	12	208570	208581	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823784
103	NC_017449	TAGCTT	2	12	215759	215770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387823789
104	NC_017449	CATCAC	2	12	219019	219030	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387823792
105	NC_017449	TTTTGA	2	12	219032	219043	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387823792
106	NC_017449	CAATAT	2	12	220266	220277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387823793
107	NC_017449	TGAAGC	2	12	222724	222735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387823796
108	NC_017449	AAAAGA	2	12	225309	225320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387823799
109	NC_017449	TGGTGT	2	12	226338	226349	0 %	50 %	50 %	0 %	387823801
110	NC_017449	GCAAGA	2	12	229304	229315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387823806
111	NC_017449	GGCATT	2	12	230090	230101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823806
112	NC_017449	CTGTTG	2	12	230386	230397	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387823806
113	NC_017449	TAAAGG	2	12	232040	232051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823808
114	NC_017449	CAAGAA	2	12	232169	232180	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387823808
115	NC_017449	GTAAAG	2	12	235708	235719	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823815
116	NC_017449	TGGGTG	2	12	237258	237269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823820
117	NC_017449	TTGGTG	2	12	238387	238398	0 %	50 %	50 %	0 %	387823822
118	NC_017449	TAAAGG	2	12	238916	238927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823823
119	NC_017449	TGGTAT	2	12	245466	245477	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387823835
120	NC_017449	GGTATG	2	12	246922	246933	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387823835
121	NC_017449	AAAGGT	2	12	255026	255037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387823842
122	NC_017449	AGTTAC	2	12	259753	259764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823846
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125	NC_017449	TGAATC	2	12	268667	268678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387823857
126	NC_017449	TCATCC	2	12	272121	272132	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387823860
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141	NC_017449	AATCGC	2	12	303439	303450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387823894
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223	NC_017449	TCAACA	2	12	465869	465880	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387824055
224	NC_017449	ATTTTT	2	12	468298	468309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387824056
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228	NC_017449	ATCAGG	2	12	485942	485953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387824068
229	NC_017449	ATTCCA	2	12	488547	488558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387824070
230	NC_017449	TTCACC	2	12	491114	491125	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387824072
231	NC_017449	AAAAGT	2	12	493670	493681	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387824074
232	NC_017449	ATCAGC	2	12	494039	494050	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387824075
233	NC_017449	AGTTGG	2	12	495310	495321	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387824076
234	NC_017449	CATATT	2	12	497248	497259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824079
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343	NC_017449	TATGAG	2	12	726827	726838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387824296
344	NC_017449	ATAGCA	2	12	734404	734415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824303
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459	NC_017449	TTATCA	2	12	1017567	1017578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824576
460	NC_017449	CAGTAT	2	12	1029591	1029602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824595
461	NC_017449	TACCAC	2	12	1030536	1030547	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387824596
462	NC_017449	TTAAGC	2	12	1030625	1030636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824596
463	NC_017449	TTGTAT	2	12	1032587	1032598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387824597
464	NC_017449	TCTGTA	2	12	1033588	1033599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824597
465	NC_017449	CATCTG	2	12	1034276	1034287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824599
466	NC_017449	GTATTG	2	12	1035568	1035579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387824601
467	NC_017449	TTTTGG	2	12	1040144	1040155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387824609
468	NC_017449	TATAAA	2	12	1048928	1048939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387824618
469	NC_017449	CTGCTC	2	12	1050180	1050191	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387824619
470	NC_017449	TATACA	2	12	1055341	1055352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824620
471	NC_017449	ACCTGC	2	12	1062876	1062887	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387824626
472	NC_017449	ATCTAA	2	12	1063232	1063243	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824627
473	NC_017449	AAAACC	2	12	1064842	1064853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387824631
474	NC_017449	ATAGCT	2	12	1064921	1064932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824631
475	NC_017449	TTTACG	2	12	1070210	1070221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824637
476	NC_017449	CTGATA	2	12	1071916	1071927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824641
477	NC_017449	CTAAAG	2	12	1072911	1072922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824642
478	NC_017449	TTTAAT	2	12	1073225	1073236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387824642
479	NC_017449	CCTGAA	2	12	1076361	1076372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387824646
480	NC_017449	TGTAGC	2	12	1077241	1077252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387824647
481	NC_017449	AAGCTC	2	12	1081856	1081867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387824652
482	NC_017449	TACCCA	2	12	1082951	1082962	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387824653
483	NC_017449	GCTTCA	2	12	1085389	1085400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824656
484	NC_017449	TTTTAG	2	12	1086861	1086872	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387824658
485	NC_017449	TATTGA	2	12	1090159	1090170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387824662
486	NC_017449	AAGAAC	2	12	1091215	1091226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387824662
487	NC_017449	ATTATG	2	12	1091820	1091831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387824663
488	NC_017449	ATGCAA	2	12	1092514	1092525	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824665
489	NC_017449	TATTAA	2	12	1094468	1094479	50 %	50 %	0 %	0 %	387824668
490	NC_017449	CTAGAA	2	12	1094824	1094835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824668
491	NC_017449	GTCTAG	2	12	1096382	1096393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387824669
492	NC_017449	AATATC	2	12	1099420	1099431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824672
493	NC_017449	GCTTTA	2	12	1099706	1099717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824672
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497	NC_017449	TCAGCT	2	12	1106721	1106732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824679
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499	NC_017449	AATTTG	2	12	1110919	1110930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387824682
500	NC_017449	TCTAAA	2	12	1111103	1111114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824682

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