MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017449	TATCAA	2	12	1117307	1117318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824689
502	NC_017449	ATCAAA	2	12	1120622	1120633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824692
503	NC_017449	CACAAA	2	12	1121193	1121204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387824693
504	NC_017449	AATTTT	2	12	1121215	1121226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387824693
505	NC_017449	TTCAAA	2	12	1122764	1122775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824694
506	NC_017449	TTATTT	2	12	1127782	1127793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387824700
507	NC_017449	GTTCTA	2	12	1128448	1128459	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824701
508	NC_017449	TCTTAT	2	12	1128774	1128785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824702
509	NC_017449	AGAATC	2	12	1129999	1130010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824704
510	NC_017449	CGATTA	2	12	1131188	1131199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824704
511	NC_017449	CTTTGT	2	12	1132583	1132594	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387824704
512	NC_017449	ATCTTT	2	12	1133248	1133259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824704
513	NC_017449	CTATTG	2	12	1134438	1134449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824704
514	NC_017449	AAACTA	2	12	1135076	1135087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824705
515	NC_017449	AGCACC	2	12	1136283	1136294	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387824706
516	NC_017449	CTAACT	2	12	1137438	1137449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387824709
517	NC_017449	GCATCT	2	12	1137800	1137811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824709
518	NC_017449	CATTTA	2	12	1137837	1137848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824709
519	NC_017449	TTTTAG	2	12	1139097	1139108	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387824711
520	NC_017449	AATCAA	2	12	1140752	1140763	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824712
521	NC_017449	GTTTTT	2	12	1141320	1141331	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387824713
522	NC_017449	TAAATC	2	12	1142860	1142871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824715
523	NC_017449	TTATCT	2	12	1146034	1146045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824717
524	NC_017449	AATCAA	2	12	1148503	1148514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824720
525	NC_017449	ATTTTT	2	12	1149473	1149484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387824721
526	NC_017449	AAATCA	2	12	1150536	1150547	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824721
527	NC_017449	CAACGT	2	12	1154845	1154856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387824724
528	NC_017449	CACTGT	2	12	1157913	1157924	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824728
529	NC_017449	AATAGC	2	12	1158684	1158695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824729
530	NC_017449	ATATTA	2	12	1159643	1159654	50 %	50 %	0 %	0 %	387824730
531	NC_017449	ATCTGC	2	12	1162020	1162031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824733
532	NC_017449	AACTTT	2	12	1163252	1163263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824734
533	NC_017449	TCTTGG	2	12	1163593	1163604	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387824735
534	NC_017449	TATCAG	2	12	1164631	1164642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824736
535	NC_017449	TTATGT	2	12	1168067	1168078	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387824741
536	NC_017449	ATGATT	2	12	1169057	1169068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387824741
537	NC_017449	GCTTTA	2	12	1169850	1169861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824742
538	NC_017449	TGATAG	2	12	1171005	1171016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387824743
539	NC_017449	ATAGCT	2	12	1172590	1172601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824743
540	NC_017449	TAAAGT	2	12	1176273	1176284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387824746
541	NC_017449	CTACCA	2	12	1176673	1176684	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387824746
542	NC_017449	TAAAAC	2	12	1179189	1179200	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824748
543	NC_017449	TTTCTA	2	12	1185239	1185250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824752
544	NC_017449	TAGCTC	2	12	1185782	1185793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824753
545	NC_017449	TGGGGT	2	12	1187743	1187754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387824755
546	NC_017449	CATTAA	2	12	1188414	1188425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824755
547	NC_017449	CTTAAA	2	12	1188457	1188468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824755
548	NC_017449	TCTTTT	2	12	1189930	1189941	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387824757
549	NC_017449	TCAATA	2	12	1190785	1190796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824759
550	NC_017449	ATAACT	2	12	1193053	1193064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824761
551	NC_017449	TTTTTG	2	12	1193614	1193625	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387824761
552	NC_017449	ATTTTT	2	12	1195486	1195497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387824762
553	NC_017449	TTTTTG	2	12	1198941	1198952	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387824766
554	NC_017449	AAATCT	2	12	1199329	1199340	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824766
555	NC_017449	ATGGAT	2	12	1200447	1200458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387824767
556	NC_017449	CCAAAA	2	12	1201825	1201836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387824769
557	NC_017449	CTTTAT	2	12	1205223	1205234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824771
558	NC_017449	TCTTAT	2	12	1205599	1205610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824772
559	NC_017449	ATTTTC	2	12	1207048	1207059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824773
560	NC_017449	TTGTTT	2	12	1208707	1208718	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387824773
561	NC_017449	TCAATA	2	12	1209553	1209564	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824774
562	NC_017449	TACCAG	2	12	1211440	1211451	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387824775
563	NC_017449	TATTGG	2	12	1215246	1215257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387824778
564	NC_017449	CCCTAT	2	12	1221547	1221558	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387824783
565	NC_017449	AATCTA	2	12	1221571	1221582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824783
566	NC_017449	AAAGAT	2	12	1222674	1222685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387824785
567	NC_017449	TGTTGC	2	12	1223727	1223738	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387824787
568	NC_017449	CAAAAT	2	12	1224692	1224703	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824787
569	NC_017449	TACTTG	2	12	1225075	1225086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387824789
570	NC_017449	ATATAC	2	12	1231670	1231681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824793
571	NC_017449	TTATAT	2	12	1234229	1234240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387824795
572	NC_017449	ATTTGT	2	12	1239677	1239688	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387824800
573	NC_017449	AAGCAT	2	12	1240496	1240507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824801
574	NC_017449	TATATT	2	12	1245352	1245363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387824805
575	NC_017449	TAAACA	2	12	1245375	1245386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824805
576	NC_017449	TTCAGC	2	12	1245823	1245834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387824805
577	NC_017449	CACAAA	2	12	1250655	1250666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387824809
578	NC_017449	GCATCA	2	12	1254123	1254134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387824813
579	NC_017449	CTTTTT	2	12	1254487	1254498	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387824813
580	NC_017449	TTGCTC	2	12	1257756	1257767	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387824818
581	NC_017449	CAACAT	2	12	1260656	1260667	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387824819
582	NC_017449	CATCAA	2	12	1260805	1260816	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387824819
583	NC_017449	ATTTCA	2	12	1262216	1262227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824821
584	NC_017449	AAAACA	2	12	1262648	1262659	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387824822
585	NC_017449	TAGCTG	2	12	1262705	1262716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387824822
586	NC_017449	CAAAAA	2	12	1263122	1263133	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387824822
587	NC_017449	AACTAC	2	12	1264798	1264809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387824825
588	NC_017449	AAATAC	2	12	1265665	1265676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824825
589	NC_017449	CAACAG	2	12	1267133	1267144	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387824826
590	NC_017449	ACCAAC	2	12	1268671	1268682	50 %	0 %	0 %	50 %	387824828
591	NC_017449	GAAAAA	2	12	1270306	1270317	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387824829
592	NC_017449	AGCATA	2	12	1271869	1271880	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387824830
593	NC_017449	TATCAC	2	12	1276632	1276643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387824833
594	NC_017449	TACACA	2	12	1279034	1279045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387824836
595	NC_017449	CTTTTA	2	12	1279542	1279553	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387824837
596	NC_017449	CTTTTT	2	12	1280691	1280702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387824839
597	NC_017449	CAAAAG	2	12	1282876	1282887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387824842
598	NC_017449	CATTAT	2	12	1284050	1284061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824843
599	NC_017449	GCTGTT	2	12	1284160	1284171	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387824843
600	NC_017449	ACATTA	2	12	1285199	1285210	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824844
601	NC_017449	ATTTAA	2	12	1286284	1286295	50 %	50 %	0 %	0 %	387824845
602	NC_017449	AAAATC	2	12	1290170	1290181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387824848
603	NC_017449	TTAAAA	2	12	1290736	1290747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387824849
604	NC_017449	CTTAAT	2	12	1293081	1293092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387824850
605	NC_017449	TATTAA	2	12	1294476	1294487	50 %	50 %	0 %	0 %	387824851
606	NC_017449	GCTATA	2	12	1295509	1295520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387824852
607	NC_017449	ACCATA	2	12	1296345	1296356	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387824852
608	NC_017449	GATTAA	2	12	1298359	1298370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387824853
609	NC_017449	CTTGGT	2	12	1302273	1302284	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387824856
610	NC_017449	GTTGCT	2	12	1304518	1304529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387824859
611	NC_017449	AAATTA	2	12	1307504	1307515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387824862
612	NC_017449	AATCTA	2	12	1308966	1308977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387824863
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834	NC_017449	TTAGCT	2	12	1831609	1831620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387825334
835	NC_017449	GATTTG	2	12	1833099	1833110	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387825335
836	NC_017449	TATAAA	2	12	1837129	1837140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825338
837	NC_017449	CTTTAC	2	12	1838711	1838722	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387825340
838	NC_017449	ATCTGG	2	12	1839255	1839266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387825340
839	NC_017449	AGCATC	2	12	1839321	1839332	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387825340
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.