MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 1515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017449	AAGAA	2	10	1325	1334	80 %	0 %	20 %	0 %	387823584
2	NC_017449	TAAAG	2	10	3889	3898	60 %	20 %	20 %	0 %	387823586
3	NC_017449	CATAC	2	10	3976	3985	40 %	20 %	0 %	40 %	387823586
4	NC_017449	AAATG	2	10	5210	5219	60 %	20 %	20 %	0 %	387823588
5	NC_017449	AAAGC	2	10	5223	5232	60 %	0 %	20 %	20 %	387823588
6	NC_017449	ATTTT	2	10	5862	5871	20 %	80 %	0 %	0 %	387823589
7	NC_017449	AAATA	2	10	6242	6251	80 %	20 %	0 %	0 %	387823589
8	NC_017449	CATTT	2	10	7693	7702	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017449	TTTAG	2	10	8770	8779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017449	CTTTT	2	10	9491	9500	0 %	80 %	0 %	20 %	387823592
11	NC_017449	TTAGT	2	10	9806	9815	20 %	60 %	20 %	0 %	387823593
12	NC_017449	TATTG	2	10	9865	9874	20 %	60 %	20 %	0 %	387823593
13	NC_017449	ATAGG	2	10	11897	11906	40 %	20 %	40 %	0 %	387823596
14	NC_017449	TAGCT	2	10	16239	16248	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017449	AGATA	2	10	17039	17048	60 %	20 %	20 %	0 %	387823601
16	NC_017449	CCGTA	2	10	17811	17820	20 %	20 %	20 %	40 %	387823601
17	NC_017449	AATTT	2	10	19281	19290	40 %	60 %	0 %	0 %	387823603
18	NC_017449	ATTTG	2	10	19337	19346	20 %	60 %	20 %	0 %	387823603
19	NC_017449	CATTT	2	10	21674	21683	20 %	60 %	0 %	20 %	387823604
20	NC_017449	TAATA	2	10	28892	28901	60 %	40 %	0 %	0 %	387823609
21	NC_017449	TGAAT	2	10	29009	29018	40 %	40 %	20 %	0 %	387823609
22	NC_017449	ATATA	2	10	29308	29317	60 %	40 %	0 %	0 %	387823610
23	NC_017449	TAAAC	2	10	41576	41585	60 %	20 %	0 %	20 %	387823620
24	NC_017449	ATGAT	2	10	41671	41680	40 %	40 %	20 %	0 %	387823620
25	NC_017449	TTTGC	2	10	42272	42281	0 %	60 %	20 %	20 %	387823621
26	NC_017449	ATAAG	2	10	43209	43218	60 %	20 %	20 %	0 %	387823622
27	NC_017449	AAAAC	2	10	43566	43575	80 %	0 %	0 %	20 %	387823622
28	NC_017449	CAATA	2	10	47258	47267	60 %	20 %	0 %	20 %	387823625
29	NC_017449	GATTT	2	10	47739	47748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017449	TCTAG	2	10	48241	48250	20 %	40 %	20 %	20 %	387823626
31	NC_017449	TTTTA	2	10	50756	50765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017449	CCTTA	2	10	53916	53925	20 %	40 %	0 %	40 %	387823629
33	NC_017449	TTTGA	2	10	54003	54012	20 %	60 %	20 %	0 %	387823629
34	NC_017449	AATTG	2	10	54656	54665	40 %	40 %	20 %	0 %	387823630
35	NC_017449	TGGTA	2	10	54684	54693	20 %	40 %	40 %	0 %	387823630
36	NC_017449	AGATT	2	10	54955	54964	40 %	40 %	20 %	0 %	387823630
37	NC_017449	CTTTT	2	10	57324	57333	0 %	80 %	0 %	20 %	387823634
38	NC_017449	CTTCT	2	10	58273	58282	0 %	60 %	0 %	40 %	387823635
39	NC_017449	CAACC	2	10	58755	58764	40 %	0 %	0 %	60 %	387823635
40	NC_017449	GATTA	2	10	58948	58957	40 %	40 %	20 %	0 %	387823635
41	NC_017449	TTATA	2	10	58998	59007	40 %	60 %	0 %	0 %	387823635
42	NC_017449	ATAGT	2	10	59222	59231	40 %	40 %	20 %	0 %	387823635
43	NC_017449	ATTTT	2	10	60262	60271	20 %	80 %	0 %	0 %	387823638
44	NC_017449	CTAGA	2	10	60701	60710	40 %	20 %	20 %	20 %	387823639
45	NC_017449	CAAAA	2	10	60770	60779	80 %	0 %	0 %	20 %	387823639
46	NC_017449	CAAAA	2	10	63558	63567	80 %	0 %	0 %	20 %	387823642
47	NC_017449	CTTAT	2	10	64481	64490	20 %	60 %	0 %	20 %	387823643
48	NC_017449	CTATA	2	10	64780	64789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017449	TATTT	2	10	65395	65404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017449	TCAAG	2	10	67540	67549	40 %	20 %	20 %	20 %	387823646
51	NC_017449	TAGTT	2	10	68265	68274	20 %	60 %	20 %	0 %	387823646
52	NC_017449	TTAAC	2	10	70613	70622	40 %	40 %	0 %	20 %	387823648
53	NC_017449	TACAA	2	10	73182	73191	60 %	20 %	0 %	20 %	387823651
54	NC_017449	AAGTT	2	10	73313	73322	40 %	40 %	20 %	0 %	387823651
55	NC_017449	TAGAG	2	10	75487	75496	40 %	20 %	40 %	0 %	387823654
56	NC_017449	AAAAG	2	10	77504	77513	80 %	0 %	20 %	0 %	387823656
57	NC_017449	AATCA	2	10	77602	77611	60 %	20 %	0 %	20 %	387823656
58	NC_017449	ATATT	2	10	78324	78333	40 %	60 %	0 %	0 %	387823657
59	NC_017449	TATTT	2	10	79186	79195	20 %	80 %	0 %	0 %	387823658
60	NC_017449	TATTT	2	10	80207	80216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017449	AATTT	2	10	80230	80239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017449	TTATT	2	10	80483	80492	20 %	80 %	0 %	0 %	387823661
63	NC_017449	TTTAA	2	10	81145	81154	40 %	60 %	0 %	0 %	387823661
64	NC_017449	TTTGA	2	10	81818	81827	20 %	60 %	20 %	0 %	387823662
65	NC_017449	AGGCT	2	10	83126	83135	20 %	20 %	40 %	20 %	387823664
66	NC_017449	TTCAA	2	10	83322	83331	40 %	40 %	0 %	20 %	387823664
67	NC_017449	AACTA	2	10	84606	84615	60 %	20 %	0 %	20 %	387823665
68	NC_017449	GATAA	2	10	84783	84792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017449	AATTT	2	10	86367	86376	40 %	60 %	0 %	0 %	387823667
70	NC_017449	TATTT	2	10	87672	87681	20 %	80 %	0 %	0 %	387823668
71	NC_017449	TATAT	2	10	87777	87786	40 %	60 %	0 %	0 %	387823668
72	NC_017449	CTTGA	2	10	87813	87822	20 %	40 %	20 %	20 %	387823668
73	NC_017449	TTGTT	2	10	89118	89127	0 %	80 %	20 %	0 %	387823668
74	NC_017449	TAGGA	2	10	90599	90608	40 %	20 %	40 %	0 %	387823672
75	NC_017449	CATTA	2	10	92961	92970	40 %	40 %	0 %	20 %	387823674
76	NC_017449	ACAAG	2	10	93695	93704	60 %	0 %	20 %	20 %	387823675
77	NC_017449	AAAGT	2	10	95455	95464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017449	TTTAT	2	10	98687	98696	20 %	80 %	0 %	0 %	387823681
79	NC_017449	ACTTA	2	10	99340	99349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017449	GCCCT	2	10	99582	99591	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_017449	CAACA	2	10	103249	103258	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017449	TAAAC	2	10	104217	104226	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017449	GCAAA	2	10	104366	104375	60 %	0 %	20 %	20 %	387823686
84	NC_017449	AGATA	2	10	105446	105455	60 %	20 %	20 %	0 %	387823688
85	NC_017449	CAAGA	2	10	107934	107943	60 %	0 %	20 %	20 %	387823691
86	NC_017449	AACAA	2	10	108127	108136	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017449	TTCAT	2	10	110064	110073	20 %	60 %	0 %	20 %	387823694
88	NC_017449	TAAAT	2	10	110421	110430	60 %	40 %	0 %	0 %	387823694
89	NC_017449	TTAAA	2	10	110627	110636	60 %	40 %	0 %	0 %	387823694
90	NC_017449	TTGAT	2	10	110948	110957	20 %	60 %	20 %	0 %	387823694
91	NC_017449	AGGGT	2	10	112465	112474	20 %	20 %	60 %	0 %	387823695
92	NC_017449	AATCA	2	10	113322	113331	60 %	20 %	0 %	20 %	387823695
93	NC_017449	ATGGT	2	10	113356	113365	20 %	40 %	40 %	0 %	387823695
94	NC_017449	TTTGC	2	10	113615	113624	0 %	60 %	20 %	20 %	387823696
95	NC_017449	CGTAC	2	10	113759	113768	20 %	20 %	20 %	40 %	387823696
96	NC_017449	TTCAA	2	10	114130	114139	40 %	40 %	0 %	20 %	387823696
97	NC_017449	TTGCG	2	10	114218	114227	0 %	40 %	40 %	20 %	387823696
98	NC_017449	GTTTT	2	10	114758	114767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017449	ATGCA	2	10	116270	116279	40 %	20 %	20 %	20 %	387823697
100	NC_017449	ATTTA	2	10	116436	116445	40 %	60 %	0 %	0 %	387823697
101	NC_017449	ATAAA	2	10	118521	118530	80 %	20 %	0 %	0 %	387823699
102	NC_017449	AATAA	2	10	118674	118683	80 %	20 %	0 %	0 %	387823699
103	NC_017449	AAAAT	2	10	121600	121609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017449	TGGGA	2	10	123188	123197	20 %	20 %	60 %	0 %	387823702
105	NC_017449	AATAG	2	10	124171	124180	60 %	20 %	20 %	0 %	387823703
106	NC_017449	GCAAA	2	10	124813	124822	60 %	0 %	20 %	20 %	387823704
107	NC_017449	TTATT	2	10	127019	127028	20 %	80 %	0 %	0 %	387823707
108	NC_017449	AGATG	2	10	130036	130045	40 %	20 %	40 %	0 %	387823710
109	NC_017449	TTTAG	2	10	134621	134630	20 %	60 %	20 %	0 %	387823713
110	NC_017449	ATATC	2	10	136938	136947	40 %	40 %	0 %	20 %	387823717
111	NC_017449	CTTGC	2	10	137271	137280	0 %	40 %	20 %	40 %	387823717
112	NC_017449	TATGA	2	10	138720	138729	40 %	40 %	20 %	0 %	387823719
113	NC_017449	ATTTT	2	10	141890	141899	20 %	80 %	0 %	0 %	387823721
114	NC_017449	ATCTT	2	10	142835	142844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017449	TAAAT	2	10	144586	144595	60 %	40 %	0 %	0 %	387823722
116	NC_017449	ACTAA	2	10	144851	144860	60 %	20 %	0 %	20 %	387823722
117	NC_017449	TCATG	2	10	146833	146842	20 %	40 %	20 %	20 %	387823724
118	NC_017449	TAGTT	2	10	149174	149183	20 %	60 %	20 %	0 %	387823726
119	NC_017449	CTTCT	2	10	149644	149653	0 %	60 %	0 %	40 %	387823727
120	NC_017449	AACAA	2	10	150306	150315	80 %	0 %	0 %	20 %	387823727
121	NC_017449	ATGTA	2	10	151276	151285	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017449	TTATC	2	10	151286	151295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017449	AATTA	2	10	151792	151801	60 %	40 %	0 %	0 %	387823728
124	NC_017449	TTGCA	2	10	151985	151994	20 %	40 %	20 %	20 %	387823729
125	NC_017449	CAAAG	2	10	153093	153102	60 %	0 %	20 %	20 %	387823730
126	NC_017449	TTTAT	2	10	153379	153388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017449	TAAAG	2	10	154763	154772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017449	AATCT	2	10	156820	156829	40 %	40 %	0 %	20 %	387823734
129	NC_017449	ATCTA	2	10	156988	156997	40 %	40 %	0 %	20 %	387823734
130	NC_017449	AAGAA	2	10	160165	160174	80 %	0 %	20 %	0 %	387823736
131	NC_017449	AGACA	2	10	161321	161330	60 %	0 %	20 %	20 %	387823736
132	NC_017449	AATTA	2	10	162041	162050	60 %	40 %	0 %	0 %	387823738
133	NC_017449	CTACA	2	10	163853	163862	40 %	20 %	0 %	40 %	387823739
134	NC_017449	TTTCT	2	10	163967	163976	0 %	80 %	0 %	20 %	387823739
135	NC_017449	CTTAG	2	10	165093	165102	20 %	40 %	20 %	20 %	387823740
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137	NC_017449	TTTGT	2	10	165950	165959	0 %	80 %	20 %	0 %	387823741
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