MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 1515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017449	AGAGA	2	10	1303124	1303133	60 %	0 %	40 %	0 %	387824857
1002	NC_017449	ATAGT	2	10	1304049	1304058	40 %	40 %	20 %	0 %	387824858
1003	NC_017449	TCATT	2	10	1304201	1304210	20 %	60 %	0 %	20 %	387824858
1004	NC_017449	AAACC	2	10	1304485	1304494	60 %	0 %	0 %	40 %	387824859
1005	NC_017449	ATATT	2	10	1304599	1304608	40 %	60 %	0 %	0 %	387824859
1006	NC_017449	ATAAA	2	10	1305093	1305102	80 %	20 %	0 %	0 %	387824859
1007	NC_017449	TTGCC	2	10	1305199	1305208	0 %	40 %	20 %	40 %	387824859
1008	NC_017449	TAAGC	2	10	1305344	1305353	40 %	20 %	20 %	20 %	387824860
1009	NC_017449	TATTT	2	10	1306244	1306253	20 %	80 %	0 %	0 %	387824861
1010	NC_017449	GTTTT	2	10	1307199	1307208	0 %	80 %	20 %	0 %	387824862
1011	NC_017449	CCAAA	2	10	1311075	1311084	60 %	0 %	0 %	40 %	387824865
1012	NC_017449	GACTT	2	10	1311628	1311637	20 %	40 %	20 %	20 %	387824866
1013	NC_017449	AATAT	2	10	1313617	1313626	60 %	40 %	0 %	0 %	387824868
1014	NC_017449	TAAAA	2	10	1315524	1315533	80 %	20 %	0 %	0 %	387824871
1015	NC_017449	ATACC	2	10	1315639	1315648	40 %	20 %	0 %	40 %	387824871
1016	NC_017449	GTATA	2	10	1315927	1315936	40 %	40 %	20 %	0 %	387824871
1017	NC_017449	TAAAG	2	10	1316238	1316247	60 %	20 %	20 %	0 %	387824871
1018	NC_017449	AGCAA	2	10	1316500	1316509	60 %	0 %	20 %	20 %	387824871
1019	NC_017449	CAAAT	2	10	1319066	1319075	60 %	20 %	0 %	20 %	387824874
1020	NC_017449	AGCTA	2	10	1319621	1319630	40 %	20 %	20 %	20 %	387824874
1021	NC_017449	TAAAT	2	10	1320305	1320314	60 %	40 %	0 %	0 %	387824875
1022	NC_017449	ATTAA	2	10	1322143	1322152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017449	AGCTC	2	10	1323095	1323104	20 %	20 %	20 %	40 %	387824877
1024	NC_017449	GGAAA	2	10	1323486	1323495	60 %	0 %	40 %	0 %	387824878
1025	NC_017449	ATTAT	2	10	1323995	1324004	40 %	60 %	0 %	0 %	387824878
1026	NC_017449	ATGGA	2	10	1324031	1324040	40 %	20 %	40 %	0 %	387824878
1027	NC_017449	TAGAT	2	10	1324819	1324828	40 %	40 %	20 %	0 %	387824880
1028	NC_017449	GTAAT	2	10	1325701	1325710	40 %	40 %	20 %	0 %	387824882
1029	NC_017449	ACTTA	2	10	1325885	1325894	40 %	40 %	0 %	20 %	387824882
1030	NC_017449	TTACT	2	10	1328889	1328898	20 %	60 %	0 %	20 %	387824885
1031	NC_017449	TTTTA	2	10	1332603	1332612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017449	AAATA	2	10	1334458	1334467	80 %	20 %	0 %	0 %	387824892
1033	NC_017449	TTGAT	2	10	1335206	1335215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017449	AGTAT	2	10	1335475	1335484	40 %	40 %	20 %	0 %	387824894
1035	NC_017449	AAGCT	2	10	1336082	1336091	40 %	20 %	20 %	20 %	387824895
1036	NC_017449	AGCTA	2	10	1336108	1336117	40 %	20 %	20 %	20 %	387824895
1037	NC_017449	AACTT	2	10	1336235	1336244	40 %	40 %	0 %	20 %	387824895
1038	NC_017449	CAGAG	2	10	1338967	1338976	40 %	0 %	40 %	20 %	387824897
1039	NC_017449	AAATC	2	10	1339166	1339175	60 %	20 %	0 %	20 %	387824897
1040	NC_017449	AAATC	2	10	1340054	1340063	60 %	20 %	0 %	20 %	387824897
1041	NC_017449	TTGCA	2	10	1340399	1340408	20 %	40 %	20 %	20 %	387824898
1042	NC_017449	TTATT	2	10	1340918	1340927	20 %	80 %	0 %	0 %	387824898
1043	NC_017449	CGTAA	2	10	1342370	1342379	40 %	20 %	20 %	20 %	387824900
1044	NC_017449	GTAAT	2	10	1342719	1342728	40 %	40 %	20 %	0 %	387824900
1045	NC_017449	TAAAA	2	10	1344811	1344820	80 %	20 %	0 %	0 %	387824902
1046	NC_017449	CCAAA	2	10	1345326	1345335	60 %	0 %	0 %	40 %	387824902
1047	NC_017449	CATAG	2	10	1345400	1345409	40 %	20 %	20 %	20 %	387824902
1048	NC_017449	ATGCC	2	10	1345548	1345557	20 %	20 %	20 %	40 %	387824902
1049	NC_017449	TAGTT	2	10	1348162	1348171	20 %	60 %	20 %	0 %	387824904
1050	NC_017449	TAAAC	2	10	1348371	1348380	60 %	20 %	0 %	20 %	387824905
1051	NC_017449	GAGAA	2	10	1349027	1349036	60 %	0 %	40 %	0 %	387824906
1052	NC_017449	CAGTT	2	10	1349139	1349148	20 %	40 %	20 %	20 %	387824906
1053	NC_017449	ACATC	2	10	1349262	1349271	40 %	20 %	0 %	40 %	387824906
1054	NC_017449	TGTTT	2	10	1349867	1349876	0 %	80 %	20 %	0 %	387824907
1055	NC_017449	TATAA	2	10	1350573	1350582	60 %	40 %	0 %	0 %	387824908
1056	NC_017449	TATAA	2	10	1351528	1351537	60 %	40 %	0 %	0 %	387824909
1057	NC_017449	TAGAT	2	10	1351762	1351771	40 %	40 %	20 %	0 %	387824909
1058	NC_017449	TATTT	2	10	1351894	1351903	20 %	80 %	0 %	0 %	387824909
1059	NC_017449	CTAAA	2	10	1355392	1355401	60 %	20 %	0 %	20 %	387824912
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1061	NC_017449	AAGAT	2	10	1355845	1355854	60 %	20 %	20 %	0 %	387824912
1062	NC_017449	TAATT	2	10	1357749	1357758	40 %	60 %	0 %	0 %	387824913
1063	NC_017449	TAAAT	2	10	1358333	1358342	60 %	40 %	0 %	0 %	387824913
1064	NC_017449	CATCT	2	10	1358408	1358417	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_017449	ATTAA	2	10	1358643	1358652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017449	CTAAA	2	10	1359237	1359246	60 %	20 %	0 %	20 %	387824914
1067	NC_017449	AAGAT	2	10	1359690	1359699	60 %	20 %	20 %	0 %	387824914
1068	NC_017449	AATAA	2	10	1360383	1360392	80 %	20 %	0 %	0 %	387824915
1069	NC_017449	TAAAA	2	10	1362488	1362497	80 %	20 %	0 %	0 %	387824916
1070	NC_017449	TCATA	2	10	1362650	1362659	40 %	40 %	0 %	20 %	387824916
1071	NC_017449	GATTT	2	10	1365214	1365223	20 %	60 %	20 %	0 %	387824919
1072	NC_017449	ATATA	2	10	1366765	1366774	60 %	40 %	0 %	0 %	387824920
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1075	NC_017449	TAAAT	2	10	1369924	1369933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017449	AACAA	2	10	1372235	1372244	80 %	0 %	0 %	20 %	387824926
1077	NC_017449	AAATA	2	10	1376883	1376892	80 %	20 %	0 %	0 %	387824930
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1079	NC_017449	ATTTT	2	10	1380142	1380151	20 %	80 %	0 %	0 %	387824933
1080	NC_017449	AATTA	2	10	1380698	1380707	60 %	40 %	0 %	0 %	387824934
1081	NC_017449	TAAAA	2	10	1380783	1380792	80 %	20 %	0 %	0 %	387824934
1082	NC_017449	AAAAG	2	10	1383303	1383312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017449	AAATC	2	10	1383899	1383908	60 %	20 %	0 %	20 %	387824937
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1087	NC_017449	TGATT	2	10	1388396	1388405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017449	AAAAG	2	10	1388734	1388743	80 %	0 %	20 %	0 %	387824941
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1093	NC_017449	CTTCT	2	10	1395624	1395633	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_017449	ACTAA	2	10	1398072	1398081	60 %	20 %	0 %	20 %	387824954
1095	NC_017449	TAACT	2	10	1398389	1398398	40 %	40 %	0 %	20 %	387824954
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1098	NC_017449	TTGAA	2	10	1400213	1400222	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017449	TATTC	2	10	1403494	1403503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_017449	TAAAT	2	10	1410234	1410243	60 %	40 %	0 %	0 %	387824957
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1102	NC_017449	TTAAT	2	10	1415109	1415118	40 %	60 %	0 %	0 %	387824962
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1104	NC_017449	CAAAA	2	10	1416764	1416773	80 %	0 %	0 %	20 %	387824964
1105	NC_017449	AAAAT	2	10	1418996	1419005	80 %	20 %	0 %	0 %	387824966
1106	NC_017449	AGTAG	2	10	1420735	1420744	40 %	20 %	40 %	0 %	387824966
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1108	NC_017449	GAAAA	2	10	1422969	1422978	80 %	0 %	20 %	0 %	387824967
1109	NC_017449	ATTTA	2	10	1423543	1423552	40 %	60 %	0 %	0 %	387824968
1110	NC_017449	TTTCA	2	10	1426707	1426716	20 %	60 %	0 %	20 %	387824971
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1112	NC_017449	TTATT	2	10	1433996	1434005	20 %	80 %	0 %	0 %	387824975
1113	NC_017449	TTTAC	2	10	1435256	1435265	20 %	60 %	0 %	20 %	387824976
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1116	NC_017449	ATTTG	2	10	1438775	1438784	20 %	60 %	20 %	0 %	387824979
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1119	NC_017449	TAATA	2	10	1445438	1445447	60 %	40 %	0 %	0 %	387824985
1120	NC_017449	CAAAA	2	10	1446649	1446658	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_017449	ATGCT	2	10	1447612	1447621	20 %	40 %	20 %	20 %	387824988
1122	NC_017449	GCTTT	2	10	1449623	1449632	0 %	60 %	20 %	20 %	387824991
1123	NC_017449	TTAAT	2	10	1450755	1450764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017449	TTTAA	2	10	1451028	1451037	40 %	60 %	0 %	0 %	387824992
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