MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 3288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016946	GAGCGC	2	12	4936279	4936290	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749426
3002	NC_016946	GGGCCA	2	12	4936494	4936505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749426
3003	NC_016946	CAGGAG	2	12	4937525	4937536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379749427
3004	NC_016946	GCACCG	2	12	4938137	4938148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749427
3005	NC_016946	GGCGCC	2	12	4938328	4938339	0 %	0 %	50 %	50 %	379749427
3006	NC_016946	CGGCCA	2	12	4941702	4941713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749430
3007	NC_016946	GTCCGT	2	12	4942246	4942257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379749430
3008	NC_016946	CTTGCC	2	12	4944919	4944930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749431
3009	NC_016946	ACTTCG	2	12	4946465	4946476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379749434
3010	NC_016946	CACATC	2	12	4950281	4950292	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379749438
3011	NC_016946	CGGCAC	2	12	4952642	4952653	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749441
3012	NC_016946	GGAACT	2	12	4953711	4953722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749443
3013	NC_016946	GTGTCA	2	12	4954570	4954581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749444
3014	NC_016946	CGAAGC	2	12	4961003	4961014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379749448
3015	NC_016946	ATCTGG	2	12	4961776	4961787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749449
3016	NC_016946	GCCACC	2	12	4965579	4965590	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379749451
3017	NC_016946	GAAGAC	2	12	4965853	4965864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379749451
3018	NC_016946	ATCGGC	2	12	4969001	4969012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749456
3019	NC_016946	GCTGAA	2	12	4971842	4971853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749457
3020	NC_016946	CCAGCG	2	12	4971901	4971912	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749457
3021	NC_016946	CGGCCG	2	12	4972381	4972392	0 %	0 %	50 %	50 %	379749457
3022	NC_016946	CTGGAC	2	12	4973857	4973868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749458
3023	NC_016946	GGATCG	2	12	4974167	4974178	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749459
3024	NC_016946	CGGCCG	2	12	4974573	4974584	0 %	0 %	50 %	50 %	379749459
3025	NC_016946	GGATCG	2	12	4974908	4974919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749460
3026	NC_016946	TGCAGC	2	12	4975612	4975623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749461
3027	NC_016946	CGGGCG	2	12	4979247	4979258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379749464
3028	NC_016946	GTCAGC	2	12	4979860	4979871	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749465
3029	NC_016946	GATCGG	2	12	4980557	4980568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749467
3030	NC_016946	GCGGGC	2	12	4980816	4980827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379749467
3031	NC_016946	GGGCGC	2	12	4980851	4980862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379749467
3032	NC_016946	GTCTTC	2	12	4981091	4981102	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379749467
3033	NC_016946	CGTGGT	2	12	4982267	4982278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379749469
3034	NC_016946	CCGGCG	2	12	4982419	4982430	0 %	0 %	50 %	50 %	379749469
3035	NC_016946	GGCGGT	2	12	4982454	4982465	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749469
3036	NC_016946	TGCCGC	2	12	4983532	4983543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749469
3037	NC_016946	GAAGTC	2	12	4984755	4984766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749470
3038	NC_016946	TCACCG	2	12	4986400	4986411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749472
3039	NC_016946	TCTTGT	2	12	4986777	4986788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379749473
3040	NC_016946	GCCGGT	2	12	4987102	4987113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749473
3041	NC_016946	GCCACC	2	12	4987536	4987547	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379749474
3042	NC_016946	CCAGCA	2	12	4987750	4987761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379749474
3043	NC_016946	GCGCCC	2	12	4987897	4987908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379749474
3044	NC_016946	CGGCAT	2	12	4990398	4990409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749478
3045	NC_016946	GTGGCC	2	12	4990735	4990746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749478
3046	NC_016946	CAGCGG	2	12	4993943	4993954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749481
3047	NC_016946	TCGCCG	2	12	4996942	4996953	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749483
3048	NC_016946	GCCACT	2	12	5002147	5002158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749489
3049	NC_016946	CGATGG	2	12	5004493	5004504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749489
3050	NC_016946	GCGGTC	2	12	5006634	5006645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749491
3051	NC_016946	ACGCGG	2	12	5010367	5010378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749494
3052	NC_016946	CACCCG	2	12	5010609	5010620	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379749494
3053	NC_016946	GGTGCG	2	12	5011624	5011635	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749497
3054	NC_016946	GGGTCC	2	12	5011695	5011706	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749497
3055	NC_016946	TCGACA	2	12	5012645	5012656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379749501
3056	NC_016946	TGCGCG	2	12	5012727	5012738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749501
3057	NC_016946	CGGCCG	2	12	5012739	5012750	0 %	0 %	50 %	50 %	379749501
3058	NC_016946	ATGGCG	2	12	5012996	5013007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749501
3059	NC_016946	CGGGGC	2	12	5013948	5013959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379749501
3060	NC_016946	GGGGTG	2	12	5021209	5021220	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	379749509
3061	NC_016946	CGACCT	2	12	5021487	5021498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749509
3062	NC_016946	ACGCCG	2	12	5021879	5021890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749509
3063	NC_016946	ACACGA	2	12	5026364	5026375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379749512
3064	NC_016946	GTCACC	2	12	5027493	5027504	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749513
3065	NC_016946	TGCTGG	2	12	5028355	5028366	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379749513
3066	NC_016946	ACCAAG	2	12	5028474	5028485	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379749513
3067	NC_016946	CCGGAT	2	12	5028602	5028613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749513
3068	NC_016946	TCGCCT	2	12	5031215	5031226	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749516
3069	NC_016946	GGCCGG	2	12	5034100	5034111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379749520
3070	NC_016946	CCTTCG	2	12	5035210	5035221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749522
3071	NC_016946	GCACCG	2	12	5035711	5035722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749522
3072	NC_016946	CGAAGA	2	12	5036092	5036103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379749523
3073	NC_016946	TCGGGA	2	12	5036870	5036881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749523
3074	NC_016946	ACGCCG	2	12	5038638	5038649	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749526
3075	NC_016946	ACGCGC	2	12	5038672	5038683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749526
3076	NC_016946	ATCTTG	2	12	5039246	5039257	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379749527
3077	NC_016946	GATCAG	2	12	5039521	5039532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749527
3078	NC_016946	CGGTGC	2	12	5040630	5040641	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749527
3079	NC_016946	CATCAC	2	12	5046004	5046015	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379749532
3080	NC_016946	CGTTGA	2	12	5052276	5052287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749540
3081	NC_016946	CCAGCC	2	12	5052321	5052332	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379749540
3082	NC_016946	GAAATC	2	12	5052412	5052423	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379749540
3083	NC_016946	CGTGCA	2	12	5055292	5055303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749542
3084	NC_016946	CCGTGC	2	12	5058533	5058544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749545
3085	NC_016946	CAGCGG	2	12	5058868	5058879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749545
3086	NC_016946	GCGCGG	2	12	5059086	5059097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379749545
3087	NC_016946	TCGACG	2	12	5059110	5059121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749545
3088	NC_016946	TGGTTG	2	12	5059822	5059833	0 %	50 %	50 %	0 %	379749548
3089	NC_016946	GACGCT	2	12	5062773	5062784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749548
3090	NC_016946	TCGCGG	2	12	5063150	5063161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749548
3091	NC_016946	CGCCGG	2	12	5063748	5063759	0 %	0 %	50 %	50 %	379749548
3092	NC_016946	CAAGTA	2	12	5066457	5066468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379749550
3093	NC_016946	CGGCGA	3	18	5068074	5068091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749551
3094	NC_016946	CGATGA	2	12	5068506	5068517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749551
3095	NC_016946	GCGGCC	2	12	5069731	5069742	0 %	0 %	50 %	50 %	379749552
3096	NC_016946	TGCTGT	2	12	5071183	5071194	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379749554
3097	NC_016946	AGCTTG	2	12	5071278	5071289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749554
3098	NC_016946	GCGCGA	2	12	5072609	5072620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749555
3099	NC_016946	GCTGGC	2	12	5074530	5074541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749559
3100	NC_016946	CTGACC	2	12	5074687	5074698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749559
3101	NC_016946	GCGCCA	2	12	5075556	5075567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749561
3102	NC_016946	GCGCCA	2	12	5079947	5079958	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749565
3103	NC_016946	TGACCC	2	12	5084871	5084882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749570
3104	NC_016946	GGGCGT	2	12	5084935	5084946	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749570
3105	NC_016946	GGTGCC	2	12	5085325	5085336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749570
3106	NC_016946	GCGGGG	2	12	5088710	5088721	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	379749573
3107	NC_016946	GCCGAG	2	12	5090281	5090292	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749574
3108	NC_016946	GCACCA	2	12	5092987	5092998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379749576
3109	NC_016946	GCCAGC	2	12	5093461	5093472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749577
3110	NC_016946	CGCCGG	2	12	5095621	5095632	0 %	0 %	50 %	50 %	379749579
3111	NC_016946	CGGTGG	2	12	5099198	5099209	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749584
3112	NC_016946	CGGGGT	2	12	5099291	5099302	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749584
3113	NC_016946	GATGGC	2	12	5100946	5100957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749585
3114	NC_016946	TGCCGA	2	12	5101901	5101912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749586
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3208	NC_016946	CGGCCG	2	12	5258313	5258324	0 %	0 %	50 %	50 %	379749737
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3213	NC_016946	ACGTCG	2	12	5266664	5266675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749743
3214	NC_016946	CGACCT	2	12	5269158	5269169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749745
3215	NC_016946	CCCGTA	2	12	5269369	5269380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749745
3216	NC_016946	AGCCGA	2	12	5269428	5269439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379749745
3217	NC_016946	GTTGAC	2	12	5269561	5269572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749745
3218	NC_016946	GTAGTC	2	12	5271865	5271876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749747
3219	NC_016946	CGGCCG	2	12	5276572	5276583	0 %	0 %	50 %	50 %	379749750
3220	NC_016946	TCGCGA	2	12	5279956	5279967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749754
3221	NC_016946	GTCGAC	2	12	5284655	5284666	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749760
3222	NC_016946	GCCGGT	2	12	5285041	5285052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749760
3223	NC_016946	ACCTGG	2	12	5286831	5286842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749762
3224	NC_016946	GCCGCG	2	12	5287208	5287219	0 %	0 %	50 %	50 %	379749762
3225	NC_016946	CGCGGC	2	12	5287684	5287695	0 %	0 %	50 %	50 %	379749762
3226	NC_016946	GCCCGA	2	12	5287960	5287971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749762
3227	NC_016946	CCGACG	2	12	5290221	5290232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749762
3228	NC_016946	AGCCGT	2	12	5292049	5292060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749763
3229	NC_016946	TCAGCA	2	12	5292313	5292324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379749763
3230	NC_016946	TCGCCT	2	12	5294896	5294907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749765
3231	NC_016946	TGGGCA	2	12	5296855	5296866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749767
3232	NC_016946	TTGCCG	2	12	5300355	5300366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379749771
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3234	NC_016946	CGTTGA	2	12	5301209	5301220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749772
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3237	NC_016946	GACCGG	2	12	5303047	5303058	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749777
3238	NC_016946	CACGCT	2	12	5304228	5304239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749778
3239	NC_016946	CCCGCA	2	12	5308503	5308514	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379749782
3240	NC_016946	GCGCCG	2	12	5309362	5309373	0 %	0 %	50 %	50 %	379749784
3241	NC_016946	GGGCTG	2	12	5310712	5310723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749785
3242	NC_016946	CGCTCG	2	12	5311911	5311922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749786
3243	NC_016946	GGCGGG	2	12	5312131	5312142	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	379749786
3244	NC_016946	GTGACG	2	12	5314644	5314655	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749789
3245	NC_016946	CACCGA	2	12	5315448	5315459	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379749790
3246	NC_016946	ACGCCG	2	12	5315576	5315587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749790
3247	NC_016946	CGAGCT	2	12	5317095	5317106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749792
3248	NC_016946	GCCATG	2	12	5322821	5322832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749799
3249	NC_016946	AGATGA	2	12	5331714	5331725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379749806
3250	NC_016946	TCGCCG	2	12	5334855	5334866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749809
3251	NC_016946	TCGTCC	2	12	5335982	5335993	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749810
3252	NC_016946	TCGCGG	2	12	5336751	5336762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749811
3253	NC_016946	CGGCCG	2	12	5337900	5337911	0 %	0 %	50 %	50 %	379749811
3254	NC_016946	GGTGAA	2	12	5339074	5339085	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379749812
3255	NC_016946	GATCAG	2	12	5339782	5339793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749812
3256	NC_016946	CTCGGC	2	12	5350161	5350172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749822
3257	NC_016946	CGAGAT	2	12	5350179	5350190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379749822
3258	NC_016946	GCCGCA	2	12	5352857	5352868	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379749825
3259	NC_016946	TCGGCC	2	12	5356969	5356980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749829
3260	NC_016946	ATGCTG	2	12	5357574	5357585	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379749829
3261	NC_016946	ACCTCG	2	12	5358547	5358558	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379749830
3262	NC_016946	GTCGAC	2	12	5358651	5358662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379749830
3263	NC_016946	CAGGGC	2	12	5361538	5361549	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379749833
3264	NC_016946	GCTGGC	3	18	5362895	5362912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749835
3265	NC_016946	CGTCGC	2	12	5379876	5379887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749845
3266	NC_016946	GCCGTC	2	12	5379913	5379924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749845
3267	NC_016946	GCCGTC	2	12	5380198	5380209	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379749845
3268	NC_016946	GTCGAG	2	12	5380285	5380296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749845
3269	NC_016946	CCGACC	2	12	5381546	5381557	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379749846
3270	NC_016946	GCCGAA	2	12	5382123	5382134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379749847
3271	NC_016946	GGTCGC	2	12	5383766	5383777	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749848
3272	NC_016946	CCGCGG	2	12	5385103	5385114	0 %	0 %	50 %	50 %	379749850
3273	NC_016946	GTCAAC	2	12	5385471	5385482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379749850
3274	NC_016946	GGTCGC	2	12	5386289	5386300	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379749850
3275	NC_016946	CGGGTG	2	12	5386998	5387009	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379749850
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3277	NC_016946	TCGCCT	2	12	5387919	5387930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749851
3278	NC_016946	GGCCGC	2	12	5389915	5389926	0 %	0 %	50 %	50 %	379749851
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3280	NC_016946	CGGGCC	2	12	5393210	5393221	0 %	0 %	50 %	50 %	379749854
3281	NC_016946	GTTGCG	2	12	5393290	5393301	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379749854
3282	NC_016946	GGTCGA	2	12	5398044	5398055	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379749859
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3284	NC_016946	CTCGCT	2	12	5399243	5399254	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379749861
3285	NC_016946	CGCCGG	2	12	5399391	5399402	0 %	0 %	50 %	50 %	379749861
3286	NC_016946	GCGTTT	2	12	5399852	5399863	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379749862
3287	NC_016946	CTCCGC	2	12	5399945	5399956	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	379749862
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