MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 3288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016946	GCGCCG	2	12	3514744	3514755	0 %	0 %	50 %	50 %	379747975
2002	NC_016946	TGGCCT	2	12	3516103	3516114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379747977
2003	NC_016946	CGCGTG	2	12	3516719	3516730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379747977
2004	NC_016946	CGGCGA	2	12	3516985	3516996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379747977
2005	NC_016946	GCTGGC	2	12	3519344	3519355	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379747979
2006	NC_016946	ACCGCG	2	12	3520041	3520052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379747980
2007	NC_016946	CCGCGA	2	12	3520894	3520905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379747982
2008	NC_016946	GCGACC	2	12	3521253	3521264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379747982
2009	NC_016946	CTTCAC	2	12	3522389	3522400	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379747983
2010	NC_016946	CCGGCG	2	12	3522933	3522944	0 %	0 %	50 %	50 %	379747983
2011	NC_016946	GCGGGC	2	12	3524549	3524560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379747984
2012	NC_016946	GGCGCC	2	12	3525724	3525735	0 %	0 %	50 %	50 %	379747985
2013	NC_016946	CGCGGC	2	12	3527522	3527533	0 %	0 %	50 %	50 %	379747987
2014	NC_016946	TCCAGG	2	12	3527950	3527961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379747987
2015	NC_016946	CGGGGG	2	12	3529066	3529077	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	379747989
2016	NC_016946	CGATGA	2	12	3530131	3530142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379747990
2017	NC_016946	CGGCGC	2	12	3530398	3530409	0 %	0 %	50 %	50 %	379747991
2018	NC_016946	CCTCGG	2	12	3530574	3530585	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379747991
2019	NC_016946	CGTTGC	2	12	3530664	3530675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379747991
2020	NC_016946	TGGTCG	2	12	3533470	3533481	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379747993
2021	NC_016946	GGGATG	2	12	3533634	3533645	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	379747994
2022	NC_016946	GACGTC	2	12	3536506	3536517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379747997
2023	NC_016946	CCGCGA	2	12	3538806	3538817	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379747999
2024	NC_016946	GCCGGC	2	12	3539240	3539251	0 %	0 %	50 %	50 %	379748000
2025	NC_016946	GGCGTG	2	12	3539385	3539396	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379748000
2026	NC_016946	GGGTGC	2	12	3541415	3541426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379748004
2027	NC_016946	GGCGCC	2	12	3541932	3541943	0 %	0 %	50 %	50 %	379748004
2028	NC_016946	TCGGCG	2	12	3542044	3542055	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748004
2029	NC_016946	CGTGGC	2	12	3545001	3545012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748007
2030	NC_016946	TGGCCA	2	12	3545561	3545572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748007
2031	NC_016946	CTTGGC	2	12	3546556	3546567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379748008
2032	NC_016946	TGCGGA	2	12	3546926	3546937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748008
2033	NC_016946	GGATGC	2	12	3547191	3547202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748008
2034	NC_016946	GGTGTT	2	12	3550352	3550363	0 %	50 %	50 %	0 %	379748010
2035	NC_016946	CGCGAC	2	12	3551653	3551664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748011
2036	NC_016946	GCCGGT	2	12	3551719	3551730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748011
2037	NC_016946	GCGGGC	2	12	3553224	3553235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379748012
2038	NC_016946	CCGCGG	2	12	3555441	3555452	0 %	0 %	50 %	50 %	379748015
2039	NC_016946	ACGGCT	2	12	3557048	3557059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748016
2040	NC_016946	ATCGCC	2	12	3560249	3560260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379748018
2041	NC_016946	CGCGGC	2	12	3560323	3560334	0 %	0 %	50 %	50 %	379748018
2042	NC_016946	CGATGC	2	12	3560400	3560411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748018
2043	NC_016946	GGTCCA	2	12	3561216	3561227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748019
2044	NC_016946	ACCGCC	2	12	3561655	3561666	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379748020
2045	NC_016946	TCGCCA	2	12	3562873	3562884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379748021
2046	NC_016946	GTGTCG	2	12	3562935	3562946	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379748021
2047	NC_016946	CGGTCC	2	12	3563008	3563019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379748021
2048	NC_016946	AGCGCG	2	12	3563243	3563254	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748022
2049	NC_016946	GCGCCC	2	12	3563614	3563625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379748022
2050	NC_016946	TGGGCG	2	12	3566134	3566145	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379748027
2051	NC_016946	GGTGCT	2	12	3566855	3566866	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379748027
2052	NC_016946	TCCCGA	2	12	3567095	3567106	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379748027
2053	NC_016946	CACGTG	2	12	3567279	3567290	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748027
2054	NC_016946	CGGTTG	2	12	3568035	3568046	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379748028
2055	NC_016946	ACGGCG	2	12	3570819	3570830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748031
2056	NC_016946	GCCAGC	2	12	3571650	3571661	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748032
2057	NC_016946	TTCGTC	2	12	3572488	3572499	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379748033
2058	NC_016946	CGTCAG	2	12	3572803	3572814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748033
2059	NC_016946	GTGCAG	2	12	3572905	3572916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748033
2060	NC_016946	TCGCGA	2	12	3573416	3573427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748034
2061	NC_016946	GCCACG	2	12	3574668	3574679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748035
2062	NC_016946	TCGACC	2	12	3575618	3575629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379748037
2063	NC_016946	TCGGCG	2	12	3577250	3577261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748037
2064	NC_016946	CGAGGG	2	12	3578003	3578014	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	379748038
2065	NC_016946	GTGGAC	2	12	3578994	3579005	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748038
2066	NC_016946	CGCCAG	2	12	3580187	3580198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748040
2067	NC_016946	GCCACC	2	12	3581675	3581686	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379748042
2068	NC_016946	GCCCGC	2	12	3582131	3582142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379748043
2069	NC_016946	ACGGCG	2	12	3582547	3582558	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748043
2070	NC_016946	GCACCG	2	12	3583213	3583224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748044
2071	NC_016946	CGGCGA	2	12	3584284	3584295	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748046
2072	NC_016946	GGTCGT	2	12	3589558	3589569	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379748054
2073	NC_016946	CGATGC	2	12	3591139	3591150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748056
2074	NC_016946	TCGAGG	2	12	3593998	3594009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748059
2075	NC_016946	CAGCGC	2	12	3600064	3600075	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748068
2076	NC_016946	CCGACA	2	12	3600816	3600827	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379748069
2077	NC_016946	GCGATC	2	12	3603151	3603162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748072
2078	NC_016946	GGCCGA	2	12	3603525	3603536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748072
2079	NC_016946	GACACC	2	12	3609008	3609019	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379748078
2080	NC_016946	CTTCGA	2	12	3610650	3610661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379748081
2081	NC_016946	GCCGCG	2	12	3611057	3611068	0 %	0 %	50 %	50 %	379748081
2082	NC_016946	TCGGCG	2	12	3611372	3611383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748081
2083	NC_016946	GGCGTT	2	12	3613396	3613407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379748086
2084	NC_016946	GGGCAT	2	12	3617375	3617386	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748091
2085	NC_016946	CGATCG	2	12	3619408	3619419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748093
2086	NC_016946	CGGCGT	2	12	3622423	3622434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748096
2087	NC_016946	TGCCCG	2	12	3623441	3623452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379748097
2088	NC_016946	AGCTCG	2	12	3623632	3623643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748097
2089	NC_016946	TGGTCA	2	12	3625669	3625680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379748099
2090	NC_016946	TGGTCG	2	12	3632814	3632825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379748109
2091	NC_016946	CGCCGA	2	12	3633127	3633138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748109
2092	NC_016946	TGCGCC	2	12	3633200	3633211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379748109
2093	NC_016946	GGCTGG	2	12	3634717	3634728	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379748111
2094	NC_016946	GTGGAA	2	12	3634924	3634935	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379748111
2095	NC_016946	CGGCAT	2	12	3640138	3640149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748119
2096	NC_016946	ATCGGC	2	12	3640379	3640390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748119
2097	NC_016946	CAACGC	2	12	3641074	3641085	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379748119
2098	NC_016946	CTGACG	2	12	3641847	3641858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748120
2099	NC_016946	GTTGCT	2	12	3641879	3641890	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379748120
2100	NC_016946	TCCGGG	2	12	3644605	3644616	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748124
2101	NC_016946	GCCAGC	2	12	3645055	3645066	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748124
2102	NC_016946	GGCCAA	2	12	3647621	3647632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379748126
2103	NC_016946	GCCGTG	2	12	3648160	3648171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748127
2104	NC_016946	CTGGGA	2	12	3649840	3649851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748128
2105	NC_016946	GACGCG	2	12	3652106	3652117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748130
2106	NC_016946	GCGCCA	2	12	3653656	3653667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748131
2107	NC_016946	TGCCGG	2	12	3654265	3654276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748132
2108	NC_016946	CACCCG	3	18	3654887	3654904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379748132
2109	NC_016946	ACAGGA	2	12	3655908	3655919	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379748133
2110	NC_016946	TGCCGG	2	12	3657887	3657898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379748135
2111	NC_016946	ACGTCG	2	12	3657976	3657987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748135
2112	NC_016946	GCCGTC	2	12	3658260	3658271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379748135
2113	NC_016946	TGGCGG	2	12	3660262	3660273	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379748138
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2220	NC_016946	GCCGTA	2	12	3799431	3799442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748281
2221	NC_016946	CCCATG	2	12	3800983	3800994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379748283
2222	NC_016946	CAGCAC	2	12	3801716	3801727	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379748284
2223	NC_016946	CTGACC	2	12	3805105	3805116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379748288
2224	NC_016946	CGGCAG	2	12	3805591	3805602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748289
2225	NC_016946	GCGCCG	2	12	3806467	3806478	0 %	0 %	50 %	50 %	379748290
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2232	NC_016946	CCTCGG	2	12	3817070	3817081	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379748303
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2234	NC_016946	TCGACG	2	12	3821539	3821550	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748308
2235	NC_016946	CGCCGA	2	12	3822180	3822191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748309
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2242	NC_016946	TGCCGA	2	12	3827521	3827532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748313
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2247	NC_016946	GTGGAC	2	12	3835298	3835309	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748323
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2249	NC_016946	CGGCGA	2	12	3835881	3835892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379748324
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2295	NC_016946	CGAGCT	2	12	3918678	3918689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748403
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2322	NC_016946	CGACGT	2	12	3973093	3973104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748460
2323	NC_016946	CGGTGA	2	12	3973558	3973569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379748460
2324	NC_016946	GATCAG	2	12	3974705	3974716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379748461
2325	NC_016946	TCGCCG	2	12	3975700	3975711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379748463
2326	NC_016946	CGCCGA	2	12	3976559	3976570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748463
2327	NC_016946	TCGACG	2	12	3977649	3977660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379748464
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2438	NC_016946	CGACAG	2	12	4147303	4147314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379748645
2439	NC_016946	AGCGAA	2	12	4147420	4147431	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379748645
2440	NC_016946	CGCCGA	2	12	4149192	4149203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379748647
2441	NC_016946	CGGCGC	2	12	4150420	4150431	0 %	0 %	50 %	50 %	379748648
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2443	NC_016946	GGCCAA	2	12	4153867	4153878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379748651
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