MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016946	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	379744721
2	NC_016946	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	379744721
3	NC_016946	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	379744722
4	NC_016946	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	379744722
5	NC_016946	GCGCC	2	10	4275	4284	0 %	0 %	40 %	60 %	379744723
6	NC_016946	GCACC	2	10	5992	6001	20 %	0 %	20 %	60 %	379744725
7	NC_016946	GAAGT	2	10	6386	6395	40 %	20 %	40 %	0 %	379744725
8	NC_016946	GCAGC	2	10	6970	6979	20 %	0 %	40 %	40 %	379744725
9	NC_016946	GCAGC	2	10	7405	7414	20 %	0 %	40 %	40 %	379744726
10	NC_016946	GGGCA	2	10	7667	7676	20 %	0 %	60 %	20 %	379744726
11	NC_016946	CGGGC	2	10	9845	9854	0 %	0 %	60 %	40 %	379744726
12	NC_016946	CGCGG	2	10	11150	11159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016946	CGAGG	2	10	11487	11496	20 %	0 %	60 %	20 %	379744727
14	NC_016946	CCGCA	2	10	11647	11656	20 %	0 %	20 %	60 %	379744727
15	NC_016946	CGCTC	2	10	13524	13533	0 %	20 %	20 %	60 %	379744729
16	NC_016946	CCGCG	2	10	14313	14322	0 %	0 %	40 %	60 %	379744729
17	NC_016946	TCCCG	2	10	18163	18172	0 %	20 %	20 %	60 %	379744736
18	NC_016946	CCAGC	2	10	18269	18278	20 %	0 %	20 %	60 %	379744736
19	NC_016946	TCACC	2	10	18415	18424	20 %	20 %	0 %	60 %	379744736
20	NC_016946	GTTGC	2	10	18485	18494	0 %	40 %	40 %	20 %	379744736
21	NC_016946	GCCGG	2	10	20292	20301	0 %	0 %	60 %	40 %	379744737
22	NC_016946	GGCCC	2	10	20410	20419	0 %	0 %	40 %	60 %	379744737
23	NC_016946	GGCGG	2	10	20439	20448	0 %	0 %	80 %	20 %	379744737
24	NC_016946	CGGCG	2	10	21327	21336	0 %	0 %	60 %	40 %	379744738
25	NC_016946	TTAGC	2	10	21560	21569	20 %	40 %	20 %	20 %	379744738
26	NC_016946	CGGCG	2	10	22017	22026	0 %	0 %	60 %	40 %	379744738
27	NC_016946	GGGGC	2	10	23498	23507	0 %	0 %	80 %	20 %	379744739
28	NC_016946	AGACC	2	10	23704	23713	40 %	0 %	20 %	40 %	379744739
29	NC_016946	GCTGA	2	10	23846	23855	20 %	20 %	40 %	20 %	379744739
30	NC_016946	CCAAT	2	10	25338	25347	40 %	20 %	0 %	40 %	379744740
31	NC_016946	CTGCG	2	10	25417	25426	0 %	20 %	40 %	40 %	379744740
32	NC_016946	AGGGC	2	10	28117	28126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016946	ATCGC	2	10	28429	28438	20 %	20 %	20 %	40 %	379744743
34	NC_016946	CAGCG	2	10	29333	29342	20 %	0 %	40 %	40 %	379744745
35	NC_016946	GCGAT	2	10	30276	30285	20 %	20 %	40 %	20 %	379744747
36	NC_016946	TCGGC	2	10	32324	32333	0 %	20 %	40 %	40 %	379744748
37	NC_016946	AGGCG	2	10	33505	33514	20 %	0 %	60 %	20 %	379744749
38	NC_016946	CAGAA	2	10	33978	33987	60 %	0 %	20 %	20 %	379744749
39	NC_016946	AAGAT	2	10	34425	34434	60 %	20 %	20 %	0 %	379744749
40	NC_016946	CGTGG	2	10	34858	34867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016946	CTTTC	2	10	35480	35489	0 %	60 %	0 %	40 %	379744752
42	NC_016946	CAGCG	2	10	37523	37532	20 %	0 %	40 %	40 %	379744753
43	NC_016946	CCAAA	2	10	38372	38381	60 %	0 %	0 %	40 %	379744754
44	NC_016946	CGGCG	2	10	38825	38834	0 %	0 %	60 %	40 %	379744755
45	NC_016946	ACCGG	2	10	38836	38845	20 %	0 %	40 %	40 %	379744755
46	NC_016946	CAGCG	2	10	40334	40343	20 %	0 %	40 %	40 %	379744757
47	NC_016946	CCGTC	2	10	42295	42304	0 %	20 %	20 %	60 %	379744759
48	NC_016946	GGCCG	2	10	43865	43874	0 %	0 %	60 %	40 %	379744762
49	NC_016946	GTCGG	2	10	45981	45990	0 %	20 %	60 %	20 %	379744764
50	NC_016946	TTGTC	2	10	48168	48177	0 %	60 %	20 %	20 %	379744766
51	NC_016946	GCCGG	2	10	48829	48838	0 %	0 %	60 %	40 %	379744768
52	NC_016946	TCGGG	2	10	49450	49459	0 %	20 %	60 %	20 %	379744768
53	NC_016946	TGGGC	2	10	50540	50549	0 %	20 %	60 %	20 %	379744769
54	NC_016946	GGGTG	2	10	53045	53054	0 %	20 %	80 %	0 %	379744770
55	NC_016946	CGGTG	2	10	54742	54751	0 %	20 %	60 %	20 %	379744772
56	NC_016946	TCGCC	2	10	56942	56951	0 %	20 %	20 %	60 %	379744774
57	NC_016946	GGGGT	2	10	57346	57355	0 %	20 %	80 %	0 %	379744774
58	NC_016946	GCGAC	2	10	59165	59174	20 %	0 %	40 %	40 %	379744776
59	NC_016946	CGGCG	2	10	59184	59193	0 %	0 %	60 %	40 %	379744776
60	NC_016946	TCGGC	2	10	60919	60928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016946	CAGCG	2	10	62149	62158	20 %	0 %	40 %	40 %	379744778
62	NC_016946	CAGGT	2	10	64014	64023	20 %	20 %	40 %	20 %	379744780
63	NC_016946	TGTCA	2	10	64331	64340	20 %	40 %	20 %	20 %	379744780
64	NC_016946	GGCCC	2	10	67044	67053	0 %	0 %	40 %	60 %	379744783
65	NC_016946	ATCGT	2	10	68576	68585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016946	GCGCC	2	10	70587	70596	0 %	0 %	40 %	60 %	379744787
67	NC_016946	GCGCG	2	10	71091	71100	0 %	0 %	60 %	40 %	379744787
68	NC_016946	CTGGC	2	10	73299	73308	0 %	20 %	40 %	40 %	379744788
69	NC_016946	ACGCG	2	10	73683	73692	20 %	0 %	40 %	40 %	379744788
70	NC_016946	CATGA	2	10	74335	74344	40 %	20 %	20 %	20 %	379744788
71	NC_016946	GCGTC	2	10	76228	76237	0 %	20 %	40 %	40 %	379744792
72	NC_016946	GCTGA	2	10	80152	80161	20 %	20 %	40 %	20 %	379744795
73	NC_016946	GACCC	2	10	80847	80856	20 %	0 %	20 %	60 %	379744795
74	NC_016946	CCGTC	2	10	83248	83257	0 %	20 %	20 %	60 %	379744797
75	NC_016946	TCGCG	2	10	83997	84006	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016946	TGCCG	2	10	85434	85443	0 %	20 %	40 %	40 %	379744800
77	NC_016946	CGGCG	2	10	88447	88456	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016946	GGGCC	2	10	91688	91697	0 %	0 %	60 %	40 %	379744807
79	NC_016946	TGCGC	2	10	95495	95504	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016946	GCAGC	2	10	97218	97227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016946	GCTGC	2	10	98145	98154	0 %	20 %	40 %	40 %	379744816
82	NC_016946	TCTGC	2	10	99542	99551	0 %	40 %	20 %	40 %	379744817
83	NC_016946	CGACG	2	10	99827	99836	20 %	0 %	40 %	40 %	379744817
84	NC_016946	CGGCA	2	10	100247	100256	20 %	0 %	40 %	40 %	379744817
85	NC_016946	GCATG	2	10	100540	100549	20 %	20 %	40 %	20 %	379744818
86	NC_016946	CGCAA	2	10	101640	101649	40 %	0 %	20 %	40 %	379744820
87	NC_016946	ACGGC	2	10	101835	101844	20 %	0 %	40 %	40 %	379744820
88	NC_016946	GCGAC	2	10	103092	103101	20 %	0 %	40 %	40 %	379744821
89	NC_016946	CGCGA	2	10	104279	104288	20 %	0 %	40 %	40 %	379744822
90	NC_016946	GCGTC	2	10	107591	107600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016946	CTCGC	2	10	107909	107918	0 %	20 %	20 %	60 %	379744828
92	NC_016946	CCGTG	2	10	108788	108797	0 %	20 %	40 %	40 %	379744829
93	NC_016946	CATGC	2	10	109440	109449	20 %	20 %	20 %	40 %	379744829
94	NC_016946	CGGTC	2	10	113108	113117	0 %	20 %	40 %	40 %	379744832
95	NC_016946	CGGCC	2	10	115026	115035	0 %	0 %	40 %	60 %	379744834
96	NC_016946	GGCCT	2	10	115671	115680	0 %	20 %	40 %	40 %	379744835
97	NC_016946	GCTGG	2	10	117036	117045	0 %	20 %	60 %	20 %	379744836
98	NC_016946	GCACG	2	10	117258	117267	20 %	0 %	40 %	40 %	379744836
99	NC_016946	CCGCG	2	10	117987	117996	0 %	0 %	40 %	60 %	379744837
100	NC_016946	CGACG	2	10	118617	118626	20 %	0 %	40 %	40 %	379744838
101	NC_016946	GCGTG	2	10	121024	121033	0 %	20 %	60 %	20 %	379744842
102	NC_016946	GCCAG	2	10	121378	121387	20 %	0 %	40 %	40 %	379744842
103	NC_016946	ATCCT	2	10	122026	122035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016946	GGGCC	2	10	122848	122857	0 %	0 %	60 %	40 %	379744845
105	NC_016946	CGGGC	2	10	123009	123018	0 %	0 %	60 %	40 %	379744846
106	NC_016946	CCTGG	2	10	123165	123174	0 %	20 %	40 %	40 %	379744846
107	NC_016946	CCATG	2	10	123288	123297	20 %	20 %	20 %	40 %	379744846
108	NC_016946	GCCAG	2	10	125894	125903	20 %	0 %	40 %	40 %	379744848
109	NC_016946	TCGAC	2	10	126296	126305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016946	ACCAA	2	10	126725	126734	60 %	0 %	0 %	40 %	379744849
111	NC_016946	GCCCG	2	10	126824	126833	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_016946	CATCG	2	10	127902	127911	20 %	20 %	20 %	40 %	379744850
113	NC_016946	GTCGA	2	10	129287	129296	20 %	20 %	40 %	20 %	379744851
114	NC_016946	GGTCC	2	10	129420	129429	0 %	20 %	40 %	40 %	379744851
115	NC_016946	GGACA	2	10	132657	132666	40 %	0 %	40 %	20 %	379744855
116	NC_016946	CAGCG	2	10	133305	133314	20 %	0 %	40 %	40 %	379744855
117	NC_016946	CGGCC	2	10	134009	134018	0 %	0 %	40 %	60 %	379744855
118	NC_016946	ACAGC	2	10	135266	135275	40 %	0 %	20 %	40 %	379744857
119	NC_016946	TCAGC	2	10	136467	136476	20 %	20 %	20 %	40 %	379744858
120	NC_016946	CGGGG	2	10	139939	139948	0 %	0 %	80 %	20 %	379744861
121	NC_016946	TCGAT	2	10	140755	140764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016946	CGCGG	2	10	142255	142264	0 %	0 %	60 %	40 %	379744863
123	NC_016946	CCATC	2	10	142567	142576	20 %	20 %	0 %	60 %	379744864
124	NC_016946	CTCGA	2	10	143206	143215	20 %	20 %	20 %	40 %	379744866
125	NC_016946	CAGGG	2	10	143494	143503	20 %	0 %	60 %	20 %	379744866
126	NC_016946	ACCCG	2	10	144400	144409	20 %	0 %	20 %	60 %	379744867
127	NC_016946	TCACC	2	10	144934	144943	20 %	20 %	0 %	60 %	379744868
128	NC_016946	GGATT	2	10	145918	145927	20 %	40 %	40 %	0 %	379744869
129	NC_016946	CCGCG	2	10	150718	150727	0 %	0 %	40 %	60 %	379744875
130	NC_016946	GCCGC	2	10	151271	151280	0 %	0 %	40 %	60 %	379744875
131	NC_016946	TCGCG	2	10	152721	152730	0 %	20 %	40 %	40 %	379744877
132	NC_016946	GTCCC	2	10	153573	153582	0 %	20 %	20 %	60 %	379744877
133	NC_016946	TCGGC	2	10	153654	153663	0 %	20 %	40 %	40 %	379744877
134	NC_016946	GCCGC	2	10	155089	155098	0 %	0 %	40 %	60 %	379744879
135	NC_016946	CCGCG	2	10	155625	155634	0 %	0 %	40 %	60 %	379744879
136	NC_016946	CACTA	2	10	156383	156392	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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196	NC_016946	AGCGA	2	10	214464	214473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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