MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016946	GAGAG	2	10	5285433	5285442	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016946	GTTTG	2	10	5286376	5286385	0 %	60 %	40 %	0 %	379749761
4503	NC_016946	CGGGC	2	10	5286741	5286750	0 %	0 %	60 %	40 %	379749762
4504	NC_016946	GGCCG	2	10	5287591	5287600	0 %	0 %	60 %	40 %	379749762
4505	NC_016946	CGCAC	2	10	5288148	5288157	20 %	0 %	20 %	60 %	379749762
4506	NC_016946	CCCGA	2	10	5288660	5288669	20 %	0 %	20 %	60 %	379749762
4507	NC_016946	GCGCC	2	10	5289529	5289538	0 %	0 %	40 %	60 %	379749762
4508	NC_016946	CGCGG	2	10	5291045	5291054	0 %	0 %	60 %	40 %	379749762
4509	NC_016946	TCGCC	2	10	5293775	5293784	0 %	20 %	20 %	60 %	379749764
4510	NC_016946	CGGCC	2	10	5294042	5294051	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4511	NC_016946	GACGT	2	10	5295409	5295418	20 %	20 %	40 %	20 %	379749766
4512	NC_016946	GGCCC	2	10	5296655	5296664	0 %	0 %	40 %	60 %	379749767
4513	NC_016946	GCCGC	2	10	5297055	5297064	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4514	NC_016946	CAGGA	2	10	5300824	5300833	40 %	0 %	40 %	20 %	379749772
4515	NC_016946	TTGCT	2	10	5301252	5301261	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4516	NC_016946	CGGAC	2	10	5301414	5301423	20 %	0 %	40 %	40 %	379749773
4517	NC_016946	GCCCG	2	10	5303724	5303733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4518	NC_016946	CACCG	2	10	5305037	5305046	20 %	0 %	20 %	60 %	379749779
4519	NC_016946	CACGA	2	10	5305399	5305408	40 %	0 %	20 %	40 %	379749780
4520	NC_016946	GGTCA	2	10	5306572	5306581	20 %	20 %	40 %	20 %	379749780
4521	NC_016946	CCGCG	2	10	5307062	5307071	0 %	0 %	40 %	60 %	379749781
4522	NC_016946	GATCG	2	10	5307363	5307372	20 %	20 %	40 %	20 %	379749781
4523	NC_016946	GCGCG	2	10	5308315	5308324	0 %	0 %	60 %	40 %	379749782
4524	NC_016946	GTCGC	2	10	5310836	5310845	0 %	20 %	40 %	40 %	379749785
4525	NC_016946	GCGCT	2	10	5311216	5311225	0 %	20 %	40 %	40 %	379749785
4526	NC_016946	CGGTC	2	10	5311985	5311994	0 %	20 %	40 %	40 %	379749786
4527	NC_016946	GCCGC	2	10	5312626	5312635	0 %	0 %	40 %	60 %	379749787
4528	NC_016946	CCGAA	2	10	5313412	5313421	40 %	0 %	20 %	40 %	379749787
4529	NC_016946	CGGCG	2	10	5313763	5313772	0 %	0 %	60 %	40 %	379749787
4530	NC_016946	CCGGA	2	10	5318642	5318651	20 %	0 %	40 %	40 %	379749794
4531	NC_016946	CGAGC	2	10	5319395	5319404	20 %	0 %	40 %	40 %	379749794
4532	NC_016946	GATCA	2	10	5320948	5320957	40 %	20 %	20 %	20 %	379749796
4533	NC_016946	GCACG	2	10	5324020	5324029	20 %	0 %	40 %	40 %	379749799
4534	NC_016946	CGGCG	2	10	5324164	5324173	0 %	0 %	60 %	40 %	379749799
4535	NC_016946	GGTCG	2	10	5326286	5326295	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4536	NC_016946	GAGCC	2	10	5327449	5327458	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4537	NC_016946	GGGCA	2	10	5327917	5327926	20 %	0 %	60 %	20 %	379749802
4538	NC_016946	CTCGC	2	10	5328238	5328247	0 %	20 %	20 %	60 %	379749802
4539	NC_016946	CATCA	2	10	5329908	5329917	40 %	20 %	0 %	40 %	379749804
4540	NC_016946	CGTCT	2	10	5331907	5331916	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4541	NC_016946	CGCCA	2	10	5334471	5334480	20 %	0 %	20 %	60 %	379749808
4542	NC_016946	GGCCG	2	10	5335550	5335559	0 %	0 %	60 %	40 %	379749809
4543	NC_016946	CAGCA	2	10	5338814	5338823	40 %	0 %	20 %	40 %	379749812
4544	NC_016946	CCCGC	2	10	5341015	5341024	0 %	0 %	20 %	80 %	379749813
4545	NC_016946	GCGCG	2	10	5341351	5341360	0 %	0 %	60 %	40 %	379749814
4546	NC_016946	GCCGG	2	10	5342932	5342941	0 %	0 %	60 %	40 %	379749816
4547	NC_016946	CCGCG	2	10	5344479	5344488	0 %	0 %	40 %	60 %	379749816
4548	NC_016946	CGGGC	2	10	5344683	5344692	0 %	0 %	60 %	40 %	379749816
4549	NC_016946	CGTCT	2	10	5345025	5345034	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4550	NC_016946	CGCGC	2	10	5346430	5346439	0 %	0 %	40 %	60 %	379749819
4551	NC_016946	GACCG	2	10	5346919	5346928	20 %	0 %	40 %	40 %	379749819
4552	NC_016946	GCACC	2	10	5347053	5347062	20 %	0 %	20 %	60 %	379749819
4553	NC_016946	GCCGC	2	10	5347269	5347278	0 %	0 %	40 %	60 %	379749819
4554	NC_016946	GCGTG	2	10	5349566	5349575	0 %	20 %	60 %	20 %	379749821
4555	NC_016946	AGCCC	2	10	5354002	5354011	20 %	0 %	20 %	60 %	379749826
4556	NC_016946	GCTGG	2	10	5355596	5355605	0 %	20 %	60 %	20 %	379749828
4557	NC_016946	GACGT	2	10	5355624	5355633	20 %	20 %	40 %	20 %	379749828
4558	NC_016946	CGCCA	2	10	5356195	5356204	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4559	NC_016946	GACCC	2	10	5357385	5357394	20 %	0 %	20 %	60 %	379749829
4560	NC_016946	GGGCC	2	10	5362934	5362943	0 %	0 %	60 %	40 %	379749835
4561	NC_016946	GATCG	2	10	5363114	5363123	20 %	20 %	40 %	20 %	379749835
4562	NC_016946	CGGCG	2	10	5363305	5363314	0 %	0 %	60 %	40 %	379749835
4563	NC_016946	CCGCC	2	10	5365017	5365026	0 %	0 %	20 %	80 %	379749835
4564	NC_016946	GCCCG	2	10	5365573	5365582	0 %	0 %	40 %	60 %	379749836
4565	NC_016946	TCGCC	2	10	5365665	5365674	0 %	20 %	20 %	60 %	379749836
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4572	NC_016946	GATGG	2	10	5373835	5373844	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016946	GACGC	2	10	5380366	5380375	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4574	NC_016946	AACAA	2	10	5383878	5383887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4575	NC_016946	CGCGC	2	10	5386469	5386478	0 %	0 %	40 %	60 %	379749850
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4584	NC_016946	TCAGC	2	10	5394952	5394961	20 %	20 %	20 %	40 %	379749856
4585	NC_016946	GGTGA	2	10	5395992	5396001	20 %	20 %	60 %	0 %	379749857
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4587	NC_016946	TGCGG	2	10	5398418	5398427	0 %	20 %	60 %	20 %	379749860
4588	NC_016946	GGCCG	2	10	5399094	5399103	0 %	0 %	60 %	40 %	379749860
4589	NC_016946	CGTCG	2	10	5401505	5401514	0 %	20 %	40 %	40 %	379749864
4590	NC_016946	TTCCG	2	10	5402028	5402037	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4591	NC_016946	CTCGG	2	10	5402044	5402053	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.