MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 1699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016077	CAAAG	2	10	480	489	60 %	0 %	20 %	20 %	352683412
2	NC_016077	TTTCG	2	10	3101	3110	0 %	60 %	20 %	20 %	352683415
3	NC_016077	CTATC	2	10	3628	3637	20 %	40 %	0 %	40 %	352683415
4	NC_016077	TATCC	2	10	3904	3913	20 %	40 %	0 %	40 %	352683415
5	NC_016077	CGCGG	2	10	4444	4453	0 %	0 %	60 %	40 %	352683416
6	NC_016077	GCAGA	2	10	5113	5122	40 %	0 %	40 %	20 %	352683418
7	NC_016077	GGGCT	2	10	7171	7180	0 %	20 %	60 %	20 %	352683419
8	NC_016077	TCCTT	2	10	11850	11859	0 %	60 %	0 %	40 %	352683423
9	NC_016077	CATTT	2	10	11938	11947	20 %	60 %	0 %	20 %	352683423
10	NC_016077	TTTCT	2	10	13375	13384	0 %	80 %	0 %	20 %	352683424
11	NC_016077	CGTTC	2	10	13467	13476	0 %	40 %	20 %	40 %	352683424
12	NC_016077	TGATA	2	10	15399	15408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016077	ATTTT	2	10	15580	15589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016077	TCGTG	2	10	16666	16675	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016077	CCTAT	2	10	16710	16719	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016077	GGGCT	2	10	19956	19965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016077	ATAAA	2	10	20728	20737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016077	GAAAA	2	10	22568	22577	80 %	0 %	20 %	0 %	352683430
19	NC_016077	TCTGA	2	10	23989	23998	20 %	40 %	20 %	20 %	352683431
20	NC_016077	GAAGG	2	10	24378	24387	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016077	GGTCA	2	10	24499	24508	20 %	20 %	40 %	20 %	352683432
22	NC_016077	TGGGG	2	10	25590	25599	0 %	20 %	80 %	0 %	352683433
23	NC_016077	AAAAG	2	10	25623	25632	80 %	0 %	20 %	0 %	352683433
24	NC_016077	AAACC	2	10	26394	26403	60 %	0 %	0 %	40 %	352683434
25	NC_016077	TTGCC	2	10	29799	29808	0 %	40 %	20 %	40 %	352683437
26	NC_016077	GGCGC	2	10	30678	30687	0 %	0 %	60 %	40 %	352683438
27	NC_016077	GTCCC	2	10	32318	32327	0 %	20 %	20 %	60 %	352683439
28	NC_016077	GCCCT	2	10	33409	33418	0 %	20 %	20 %	60 %	352683441
29	NC_016077	GATGG	2	10	34064	34073	20 %	20 %	60 %	0 %	352683442
30	NC_016077	GAAAA	2	10	35076	35085	80 %	0 %	20 %	0 %	352683443
31	NC_016077	CCGGC	2	10	37969	37978	0 %	0 %	40 %	60 %	352683447
32	NC_016077	TTCCA	2	10	38583	38592	20 %	40 %	0 %	40 %	352683447
33	NC_016077	ATTTT	2	10	38976	38985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016077	AATCT	2	10	41137	41146	40 %	40 %	0 %	20 %	352683450
35	NC_016077	CTAAA	2	10	41290	41299	60 %	20 %	0 %	20 %	352683450
36	NC_016077	CTTGC	2	10	43388	43397	0 %	40 %	20 %	40 %	352683451
37	NC_016077	CTTGT	2	10	46085	46094	0 %	60 %	20 %	20 %	352683455
38	NC_016077	TGGCA	2	10	50400	50409	20 %	20 %	40 %	20 %	352683458
39	NC_016077	TCAAA	2	10	51504	51513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016077	CATCG	2	10	51935	51944	20 %	20 %	20 %	40 %	352683460
41	NC_016077	TACGA	2	10	52962	52971	40 %	20 %	20 %	20 %	352683461
42	NC_016077	GACGG	2	10	54375	54384	20 %	0 %	60 %	20 %	352683462
43	NC_016077	CGCTC	2	10	55427	55436	0 %	20 %	20 %	60 %	352683463
44	NC_016077	CACGG	2	10	58252	58261	20 %	0 %	40 %	40 %	352683466
45	NC_016077	GAATG	2	10	59280	59289	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016077	TTCCT	2	10	59835	59844	0 %	60 %	0 %	40 %	352683468
47	NC_016077	CTGAA	2	10	62646	62655	40 %	20 %	20 %	20 %	352683468
48	NC_016077	GAAAC	2	10	63815	63824	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016077	TTCTT	2	10	65985	65994	0 %	80 %	0 %	20 %	352683469
50	NC_016077	AAAGG	2	10	67014	67023	60 %	0 %	40 %	0 %	352683471
51	NC_016077	GCTCA	2	10	68654	68663	20 %	20 %	20 %	40 %	352683472
52	NC_016077	AAGAA	2	10	69373	69382	80 %	0 %	20 %	0 %	352683472
53	NC_016077	GCCTT	2	10	69399	69408	0 %	40 %	20 %	40 %	352683472
54	NC_016077	CAGGG	2	10	71997	72006	20 %	0 %	60 %	20 %	352683474
55	NC_016077	CTTTT	2	10	74399	74408	0 %	80 %	0 %	20 %	352683475
56	NC_016077	AGAAT	2	10	78936	78945	60 %	20 %	20 %	0 %	352683478
57	NC_016077	AAACA	2	10	80877	80886	80 %	0 %	0 %	20 %	352683480
58	NC_016077	AGAAA	2	10	81216	81225	80 %	0 %	20 %	0 %	352683480
59	NC_016077	GACGG	2	10	82036	82045	20 %	0 %	60 %	20 %	352683481
60	NC_016077	CATGG	2	10	82552	82561	20 %	20 %	40 %	20 %	352683483
61	NC_016077	GCGAT	2	10	86947	86956	20 %	20 %	40 %	20 %	352683486
62	NC_016077	GGCCG	2	10	89691	89700	0 %	0 %	60 %	40 %	352683490
63	NC_016077	AAAGG	2	10	90707	90716	60 %	0 %	40 %	0 %	352683491
64	NC_016077	TGCCC	2	10	92253	92262	0 %	20 %	20 %	60 %	352683492
65	NC_016077	GGCCA	2	10	92305	92314	20 %	0 %	40 %	40 %	352683492
66	NC_016077	CCTTT	2	10	99360	99369	0 %	60 %	0 %	40 %	352683498
67	NC_016077	TCACC	2	10	100037	100046	20 %	20 %	0 %	60 %	352683499
68	NC_016077	CTTCC	2	10	101099	101108	0 %	40 %	0 %	60 %	352683500
69	NC_016077	GTAAA	2	10	102726	102735	60 %	20 %	20 %	0 %	352683501
70	NC_016077	TTTCT	2	10	104351	104360	0 %	80 %	0 %	20 %	352683503
71	NC_016077	GCGCA	2	10	110839	110848	20 %	0 %	40 %	40 %	352683506
72	NC_016077	GCAAG	2	10	111295	111304	40 %	0 %	40 %	20 %	352683507
73	NC_016077	CTTTT	2	10	113282	113291	0 %	80 %	0 %	20 %	352683509
74	NC_016077	ATTTC	2	10	115242	115251	20 %	60 %	0 %	20 %	352683511
75	NC_016077	TCCGT	2	10	115365	115374	0 %	40 %	20 %	40 %	352683511
76	NC_016077	ACCGT	2	10	117231	117240	20 %	20 %	20 %	40 %	352683512
77	NC_016077	ATAAA	2	10	118311	118320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016077	CTGCG	2	10	118921	118930	0 %	20 %	40 %	40 %	352683515
79	NC_016077	ATTTT	2	10	120418	120427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016077	TCGTG	2	10	121504	121513	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016077	CCTAT	2	10	121548	121557	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016077	GGGCT	2	10	124794	124803	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016077	GGACC	2	10	128160	128169	20 %	0 %	40 %	40 %	352683517
84	NC_016077	GGAAT	2	10	128348	128357	40 %	20 %	40 %	0 %	352683517
85	NC_016077	TAAAA	2	10	129741	129750	80 %	20 %	0 %	0 %	352683519
86	NC_016077	ATAAA	2	10	130099	130108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016077	CATGG	2	10	134049	134058	20 %	20 %	40 %	20 %	352683522
88	NC_016077	CTTTG	2	10	134743	134752	0 %	60 %	20 %	20 %	352683524
89	NC_016077	TGCTG	2	10	137187	137196	0 %	40 %	40 %	20 %	352683526
90	NC_016077	GGCGC	2	10	138040	138049	0 %	0 %	60 %	40 %	352683526
91	NC_016077	GCTTC	2	10	138868	138877	0 %	40 %	20 %	40 %	352683527
92	NC_016077	CTGAC	2	10	139363	139372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016077	GTCGG	2	10	143399	143408	0 %	20 %	60 %	20 %	352683533
94	NC_016077	TGTTC	2	10	144553	144562	0 %	60 %	20 %	20 %	352683534
95	NC_016077	GCCTT	2	10	145635	145644	0 %	40 %	20 %	40 %	352683535
96	NC_016077	TCTTT	2	10	146604	146613	0 %	80 %	0 %	20 %	352683536
97	NC_016077	AAGCA	3	15	149938	149952	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016077	TTCCT	2	10	158431	158440	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016077	AATAG	2	10	160758	160767	60 %	20 %	20 %	0 %	352683551
100	NC_016077	GGGCG	2	10	160892	160901	0 %	0 %	80 %	20 %	352683551
101	NC_016077	AGGAC	2	10	162426	162435	40 %	0 %	40 %	20 %	352683552
102	NC_016077	CCTTG	2	10	164592	164601	0 %	40 %	20 %	40 %	352683555
103	NC_016077	TTGGT	2	10	168031	168040	0 %	60 %	40 %	0 %	352683559
104	NC_016077	GACGG	2	10	168969	168978	20 %	0 %	60 %	20 %	352683560
105	NC_016077	GCCGC	2	10	173610	173619	0 %	0 %	40 %	60 %	352683567
106	NC_016077	TCTTT	2	10	173927	173936	0 %	80 %	0 %	20 %	352683568
107	NC_016077	TCCGC	2	10	173981	173990	0 %	20 %	20 %	60 %	352683568
108	NC_016077	TTCCC	2	10	177453	177462	0 %	40 %	0 %	60 %	352683570
109	NC_016077	AAGGA	2	10	178242	178251	60 %	0 %	40 %	0 %	352683570
110	NC_016077	CCTTC	2	10	179219	179228	0 %	40 %	0 %	60 %	352683571
111	NC_016077	GCTGA	2	10	179573	179582	20 %	20 %	40 %	20 %	352683572
112	NC_016077	AAGGA	2	10	181153	181162	60 %	0 %	40 %	0 %	352683573
113	NC_016077	AAAAG	2	10	181305	181314	80 %	0 %	20 %	0 %	352683573
114	NC_016077	TGGAA	2	10	183012	183021	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016077	GCGGG	2	10	183119	183128	0 %	0 %	80 %	20 %	352683575
116	NC_016077	CCTTT	2	10	192383	192392	0 %	60 %	0 %	40 %	352683582
117	NC_016077	CCTTG	2	10	192877	192886	0 %	40 %	20 %	40 %	352683583
118	NC_016077	AAGCA	2	10	196565	196574	60 %	0 %	20 %	20 %	352683587
119	NC_016077	GCCCA	2	10	197108	197117	20 %	0 %	20 %	60 %	352683588
120	NC_016077	GCCGT	2	10	200842	200851	0 %	20 %	40 %	40 %	352683591
121	NC_016077	GTACG	2	10	202210	202219	20 %	20 %	40 %	20 %	352683592
122	NC_016077	TTTCT	2	10	204322	204331	0 %	80 %	0 %	20 %	352683595
123	NC_016077	AAGAT	2	10	205498	205507	60 %	20 %	20 %	0 %	352683597
124	NC_016077	GGCTT	2	10	206581	206590	0 %	40 %	40 %	20 %	352683597
125	NC_016077	TCCCT	2	10	207829	207838	0 %	40 %	0 %	60 %	352683599
126	NC_016077	GAAAA	2	10	210296	210305	80 %	0 %	20 %	0 %	352683602
127	NC_016077	GGGCA	2	10	215804	215813	20 %	0 %	60 %	20 %	352683610
128	NC_016077	TTCGG	2	10	216397	216406	0 %	40 %	40 %	20 %	352683610
129	NC_016077	TGACC	2	10	216890	216899	20 %	20 %	20 %	40 %	352683610
130	NC_016077	CAAAA	2	10	217109	217118	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016077	CCACG	2	10	220028	220037	20 %	0 %	20 %	60 %	352683613
132	NC_016077	CGGTG	2	10	222342	222351	0 %	20 %	60 %	20 %	352683615
133	NC_016077	AATCA	2	10	223278	223287	60 %	20 %	0 %	20 %	352683616
134	NC_016077	CAAAA	2	10	225854	225863	80 %	0 %	0 %	20 %	352683617
135	NC_016077	GTCCT	2	10	227511	227520	0 %	40 %	20 %	40 %	352683619
136	NC_016077	TGGCG	2	10	227893	227902	0 %	20 %	60 %	20 %	352683619
137	NC_016077	GGCCA	2	10	227939	227948	20 %	0 %	40 %	40 %	352683619
138	NC_016077	AGAAA	2	10	228942	228951	80 %	0 %	20 %	0 %	352683620
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148	NC_016077	ATTTA	2	10	242068	242077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016077	GCTCA	2	10	246824	246833	20 %	20 %	20 %	40 %	352683634
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259	NC_016077	ATTTT	2	10	391395	391404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_016077	TCGTG	2	10	392481	392490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_016077	CCTAT	2	10	392525	392534	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_016077	GGGCT	2	10	395771	395780	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
263	NC_016077	GATCT	2	10	396579	396588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_016077	CTTTC	2	10	398145	398154	0 %	60 %	0 %	40 %	352683776
265	NC_016077	TCTTT	2	10	398506	398515	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_016077	AAGGA	2	10	398824	398833	60 %	0 %	40 %	0 %	352683777
267	NC_016077	TTCAT	2	10	400247	400256	20 %	60 %	0 %	20 %	352683778
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