MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 1699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016077	TTCCT	2	10	1468126	1468135	0 %	60 %	0 %	40 %	352684818
1002	NC_016077	GAAAC	2	10	1470413	1470422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_016077	ATTCC	2	10	1472491	1472500	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_016077	TCATT	2	10	1474648	1474657	20 %	60 %	0 %	20 %	352684824
1005	NC_016077	ATTTT	2	10	1474776	1474785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016077	TTGAT	2	10	1476392	1476401	20 %	60 %	20 %	0 %	352684825
1007	NC_016077	AAGGC	2	10	1476676	1476685	40 %	0 %	40 %	20 %	352684826
1008	NC_016077	CGTCC	2	10	1478522	1478531	0 %	20 %	20 %	60 %	352684827
1009	NC_016077	CATCC	2	10	1479962	1479971	20 %	20 %	0 %	60 %	352684828
1010	NC_016077	ATAAA	2	10	1481397	1481406	80 %	20 %	0 %	0 %	352684829
1011	NC_016077	CAGGA	2	10	1483154	1483163	40 %	0 %	40 %	20 %	352684831
1012	NC_016077	ATCAA	2	10	1483278	1483287	60 %	20 %	0 %	20 %	352684831
1013	NC_016077	GATGC	2	10	1486499	1486508	20 %	20 %	40 %	20 %	352684836
1014	NC_016077	TGTTC	2	10	1486663	1486672	0 %	60 %	20 %	20 %	352684836
1015	NC_016077	GGATT	2	10	1487174	1487183	20 %	40 %	40 %	0 %	352684836
1016	NC_016077	ATGAT	2	10	1487231	1487240	40 %	40 %	20 %	0 %	352684836
1017	NC_016077	GAAAG	2	10	1487403	1487412	60 %	0 %	40 %	0 %	352684837
1018	NC_016077	TATTT	2	10	1490203	1490212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016077	CAAAA	2	10	1491867	1491876	80 %	0 %	0 %	20 %	352684839
1020	NC_016077	TCAAA	2	10	1492833	1492842	60 %	20 %	0 %	20 %	352684840
1021	NC_016077	TCTTT	2	10	1494170	1494179	0 %	80 %	0 %	20 %	352684841
1022	NC_016077	GCTTT	2	10	1494533	1494542	0 %	60 %	20 %	20 %	352684842
1023	NC_016077	CCCTT	2	10	1495331	1495340	0 %	40 %	0 %	60 %	352684843
1024	NC_016077	AATGG	2	10	1496418	1496427	40 %	20 %	40 %	0 %	352684844
1025	NC_016077	TCCTT	2	10	1498047	1498056	0 %	60 %	0 %	40 %	352684845
1026	NC_016077	TATAT	2	10	1498062	1498071	40 %	60 %	0 %	0 %	352684845
1027	NC_016077	CTCTT	2	10	1498109	1498118	0 %	60 %	0 %	40 %	352684845
1028	NC_016077	CGACG	2	10	1499325	1499334	20 %	0 %	40 %	40 %	352684847
1029	NC_016077	GGATG	2	10	1500824	1500833	20 %	20 %	60 %	0 %	352684849
1030	NC_016077	TTCAT	2	10	1502163	1502172	20 %	60 %	0 %	20 %	352684851
1031	NC_016077	AGGAA	2	10	1506636	1506645	60 %	0 %	40 %	0 %	352684855
1032	NC_016077	AACGT	2	10	1507023	1507032	40 %	20 %	20 %	20 %	352684855
1033	NC_016077	CGGCG	2	10	1508208	1508217	0 %	0 %	60 %	40 %	352684856
1034	NC_016077	CCTTC	2	10	1508814	1508823	0 %	40 %	0 %	60 %	352684856
1035	NC_016077	GCTGT	2	10	1509057	1509066	0 %	40 %	40 %	20 %	352684856
1036	NC_016077	TTCTT	2	10	1509584	1509593	0 %	80 %	0 %	20 %	352684856
1037	NC_016077	ACTTC	2	10	1509693	1509702	20 %	40 %	0 %	40 %	352684856
1038	NC_016077	TTTTC	2	10	1509951	1509960	0 %	80 %	0 %	20 %	352684856
1039	NC_016077	TTCGG	2	10	1510750	1510759	0 %	40 %	40 %	20 %	352684857
1040	NC_016077	CTGTA	2	10	1511199	1511208	20 %	40 %	20 %	20 %	352684858
1041	NC_016077	TTACC	2	10	1512045	1512054	20 %	40 %	0 %	40 %	352684858
1042	NC_016077	TGGAA	2	10	1513488	1513497	40 %	20 %	40 %	0 %	352684859
1043	NC_016077	CCCCA	2	10	1516354	1516363	20 %	0 %	0 %	80 %	352684862
1044	NC_016077	TGTAA	2	10	1517484	1517493	40 %	40 %	20 %	0 %	352684862
1045	NC_016077	AAGCC	2	10	1517548	1517557	40 %	0 %	20 %	40 %	352684862
1046	NC_016077	ATGCC	2	10	1519769	1519778	20 %	20 %	20 %	40 %	352684865
1047	NC_016077	AGCCC	2	10	1520242	1520251	20 %	0 %	20 %	60 %	352684865
1048	NC_016077	TTCCC	2	10	1521487	1521496	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1049	NC_016077	TGGCA	2	10	1521877	1521886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_016077	TTTAT	2	10	1522875	1522884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016077	CCCCA	2	10	1523253	1523262	20 %	0 %	0 %	80 %	352684868
1052	NC_016077	GCCTT	2	10	1523876	1523885	0 %	40 %	20 %	40 %	352684869
1053	NC_016077	GCTTT	2	10	1525769	1525778	0 %	60 %	20 %	20 %	352684869
1054	NC_016077	ATCGA	2	10	1528170	1528179	40 %	20 %	20 %	20 %	352684871
1055	NC_016077	ATGAA	2	10	1528540	1528549	60 %	20 %	20 %	0 %	352684871
1056	NC_016077	TCCTA	2	10	1529043	1529052	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1057	NC_016077	TGCGT	2	10	1529244	1529253	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_016077	AAGGA	2	10	1529376	1529385	60 %	0 %	40 %	0 %	352684872
1059	NC_016077	GCTGC	2	10	1533915	1533924	0 %	20 %	40 %	40 %	352684877
1060	NC_016077	GCCAC	2	10	1535362	1535371	20 %	0 %	20 %	60 %	352684878
1061	NC_016077	CGCTG	2	10	1535971	1535980	0 %	20 %	40 %	40 %	352684880
1062	NC_016077	ATAAG	2	10	1538035	1538044	60 %	20 %	20 %	0 %	352684883
1063	NC_016077	TTCCT	2	10	1539263	1539272	0 %	60 %	0 %	40 %	352684884
1064	NC_016077	GTCCA	2	10	1539777	1539786	20 %	20 %	20 %	40 %	352684884
1065	NC_016077	AAATG	2	10	1541418	1541427	60 %	20 %	20 %	0 %	352684885
1066	NC_016077	AAAGC	2	10	1542421	1542430	60 %	0 %	20 %	20 %	352684886
1067	NC_016077	GAAAA	2	10	1543215	1543224	80 %	0 %	20 %	0 %	352684887
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1069	NC_016077	GCAGC	2	10	1546904	1546913	20 %	0 %	40 %	40 %	352684893
1070	NC_016077	AACGG	2	10	1548388	1548397	40 %	0 %	40 %	20 %	352684894
1071	NC_016077	TTTGG	2	10	1550101	1550110	0 %	60 %	40 %	0 %	352684897
1072	NC_016077	CCGGC	2	10	1553152	1553161	0 %	0 %	40 %	60 %	352684900
1073	NC_016077	GCCTT	2	10	1553348	1553357	0 %	40 %	20 %	40 %	352684900
1074	NC_016077	CTTGA	2	10	1553362	1553371	20 %	40 %	20 %	20 %	352684900
1075	NC_016077	TGATC	2	10	1553967	1553976	20 %	40 %	20 %	20 %	352684900
1076	NC_016077	GGCAT	2	10	1554729	1554738	20 %	20 %	40 %	20 %	352684901
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1079	NC_016077	AATTG	2	10	1558987	1558996	40 %	40 %	20 %	0 %	352684905
1080	NC_016077	CGCAG	2	10	1559388	1559397	20 %	0 %	40 %	40 %	352684905
1081	NC_016077	TAAGG	2	10	1560945	1560954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016077	TCAAT	2	10	1562412	1562421	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_016077	TTCCG	2	10	1564310	1564319	0 %	40 %	20 %	40 %	352684913
1084	NC_016077	TTCAT	2	10	1564392	1564401	20 %	60 %	0 %	20 %	352684913
1085	NC_016077	CATTT	2	10	1564722	1564731	20 %	60 %	0 %	20 %	352684913
1086	NC_016077	TTCCG	2	10	1564980	1564989	0 %	40 %	20 %	40 %	352684913
1087	NC_016077	TACTT	2	10	1565840	1565849	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_016077	CTTCC	2	10	1566764	1566773	0 %	40 %	0 %	60 %	352684914
1089	NC_016077	GTTTC	2	10	1567759	1567768	0 %	60 %	20 %	20 %	352684915
1090	NC_016077	CCGTT	2	10	1569166	1569175	0 %	40 %	20 %	40 %	352684915
1091	NC_016077	ATTTT	2	10	1570147	1570156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016077	TATAT	2	10	1570174	1570183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016077	CCCCG	2	10	1571834	1571843	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1094	NC_016077	TAAGG	2	10	1574606	1574615	40 %	20 %	40 %	0 %	352684923
1095	NC_016077	CTGAA	2	10	1575226	1575235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_016077	TCCTT	2	10	1575259	1575268	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_016077	CTTCC	2	10	1576492	1576501	0 %	40 %	0 %	60 %	352684925
1098	NC_016077	ATGAT	2	10	1578692	1578701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016077	ATGAA	2	10	1582957	1582966	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016077	TGAAG	2	10	1584987	1584996	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016077	TCATG	2	10	1585625	1585634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_016077	ATCAC	2	10	1586216	1586225	40 %	20 %	0 %	40 %	352684934
1103	NC_016077	CCCGC	2	10	1587057	1587066	0 %	0 %	20 %	80 %	352684935
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1106	NC_016077	GCAGA	2	10	1593617	1593626	40 %	0 %	40 %	20 %	352684942
1107	NC_016077	TGCAA	2	10	1595046	1595055	40 %	20 %	20 %	20 %	352684944
1108	NC_016077	TGGAA	2	10	1595793	1595802	40 %	20 %	40 %	0 %	352684944
1109	NC_016077	CAAGG	2	10	1597257	1597266	40 %	0 %	40 %	20 %	352684945
1110	NC_016077	TGATC	2	10	1599696	1599705	20 %	40 %	20 %	20 %	352684947
1111	NC_016077	AAAAG	2	10	1600101	1600110	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016077	GTCTT	2	10	1601044	1601053	0 %	60 %	20 %	20 %	352684949
1113	NC_016077	GGGCA	2	10	1601772	1601781	20 %	0 %	60 %	20 %	352684949
1114	NC_016077	TCCTT	2	10	1602992	1603001	0 %	60 %	0 %	40 %	352684951
1115	NC_016077	CATTT	2	10	1603080	1603089	20 %	60 %	0 %	20 %	352684951
1116	NC_016077	GATCC	2	10	1605293	1605302	20 %	20 %	20 %	40 %	352684954
1117	NC_016077	AAAGG	2	10	1605446	1605455	60 %	0 %	40 %	0 %	352684954
1118	NC_016077	AAAGG	2	10	1609604	1609613	60 %	0 %	40 %	0 %	352684959
1119	NC_016077	CCGGT	2	10	1613841	1613850	0 %	20 %	40 %	40 %	352684963
1120	NC_016077	ATTTT	2	10	1616196	1616205	20 %	80 %	0 %	0 %	352684966
1121	NC_016077	TTTCT	2	10	1616341	1616350	0 %	80 %	0 %	20 %	352684966
1122	NC_016077	TTTCC	2	10	1616724	1616733	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_016077	TTTTA	2	10	1616755	1616764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016077	CTTTC	2	10	1616828	1616837	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1125	NC_016077	TTGCG	2	10	1618307	1618316	0 %	40 %	40 %	20 %	352684969
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1127	NC_016077	TCCTT	2	10	1622189	1622198	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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