MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 3041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015945	CAATT	2	10	1548	1557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015945	AGTTA	2	10	3663	3672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015945	GTTTT	2	10	5707	5716	0 %	80 %	20 %	0 %	344201344
4	NC_015945	AAATA	2	10	7503	7512	80 %	20 %	0 %	0 %	344201345
5	NC_015945	CAAAT	2	10	8990	8999	60 %	20 %	0 %	20 %	344201346
6	NC_015945	AATTT	2	10	11477	11486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015945	TGGAT	2	10	13519	13528	20 %	40 %	40 %	0 %	344201351
8	NC_015945	CAATG	2	10	15185	15194	40 %	20 %	20 %	20 %	344201352
9	NC_015945	CCAAT	2	10	15424	15433	40 %	20 %	0 %	40 %	344201352
10	NC_015945	ATTCC	2	10	17590	17599	20 %	40 %	0 %	40 %	344201355
11	NC_015945	CTCTG	2	10	17670	17679	0 %	40 %	20 %	40 %	344201355
12	NC_015945	GACTT	2	10	18439	18448	20 %	40 %	20 %	20 %	344201356
13	NC_015945	CAACC	2	10	18969	18978	40 %	0 %	0 %	60 %	344201357
14	NC_015945	TCTCC	2	10	19163	19172	0 %	40 %	0 %	60 %	344201357
15	NC_015945	CAAAT	2	10	20420	20429	60 %	20 %	0 %	20 %	344201358
16	NC_015945	ATTTT	2	10	21241	21250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015945	ATTTC	2	10	21478	21487	20 %	60 %	0 %	20 %	344201360
18	NC_015945	CAATT	2	10	21914	21923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015945	ATTTC	2	10	22201	22210	20 %	60 %	0 %	20 %	344201361
20	NC_015945	CAATT	2	10	22637	22646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015945	CAAAA	2	10	22733	22742	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015945	GCCCT	2	10	25259	25268	0 %	20 %	20 %	60 %	344201366
23	NC_015945	CTTTG	2	10	25977	25986	0 %	60 %	20 %	20 %	344201366
24	NC_015945	TTCAA	2	10	27767	27776	40 %	40 %	0 %	20 %	344201368
25	NC_015945	GCTTT	2	10	29421	29430	0 %	60 %	20 %	20 %	344201369
26	NC_015945	TTGTT	2	10	30418	30427	0 %	80 %	20 %	0 %	344201371
27	NC_015945	TAGGT	2	10	31449	31458	20 %	40 %	40 %	0 %	344201371
28	NC_015945	TGTCT	2	10	32388	32397	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015945	TTTGA	2	10	32512	32521	20 %	60 %	20 %	0 %	344201372
30	NC_015945	CAGTA	2	10	35922	35931	40 %	20 %	20 %	20 %	344201375
31	NC_015945	GGATT	2	10	37907	37916	20 %	40 %	40 %	0 %	344201376
32	NC_015945	TCCAA	2	10	39084	39093	40 %	20 %	0 %	40 %	344201379
33	NC_015945	CGGGG	2	10	40605	40614	0 %	0 %	80 %	20 %	344201380
34	NC_015945	CCAAA	2	10	41657	41666	60 %	0 %	0 %	40 %	344201382
35	NC_015945	TTGGA	2	10	42016	42025	20 %	40 %	40 %	0 %	344201382
36	NC_015945	GTTTG	2	10	42085	42094	0 %	60 %	40 %	0 %	344201382
37	NC_015945	CCAAG	2	10	44548	44557	40 %	0 %	20 %	40 %	344201385
38	NC_015945	TAAAC	2	10	44860	44869	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015945	TGGAT	2	10	45358	45367	20 %	40 %	40 %	0 %	344201386
40	NC_015945	TGGGT	2	10	46463	46472	0 %	40 %	60 %	0 %	344201387
41	NC_015945	ACTTT	2	10	51108	51117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015945	TTTTC	2	10	53253	53262	0 %	80 %	0 %	20 %	344201396
43	NC_015945	GCTTC	2	10	54426	54435	0 %	40 %	20 %	40 %	344201396
44	NC_015945	CGTTT	2	10	54678	54687	0 %	60 %	20 %	20 %	344201396
45	NC_015945	TTTCC	2	10	55428	55437	0 %	60 %	0 %	40 %	344201396
46	NC_015945	TTTAA	2	10	55970	55979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015945	ATAAA	2	10	56532	56541	80 %	20 %	0 %	0 %	344201398
48	NC_015945	AACAT	2	10	57772	57781	60 %	20 %	0 %	20 %	344201401
49	NC_015945	CTGAT	2	10	59875	59884	20 %	40 %	20 %	20 %	344201403
50	NC_015945	ATTTC	2	10	64173	64182	20 %	60 %	0 %	20 %	344201408
51	NC_015945	ACAAA	2	10	66965	66974	80 %	0 %	0 %	20 %	344201410
52	NC_015945	CAAAT	2	10	69277	69286	60 %	20 %	0 %	20 %	344201411
53	NC_015945	AATAA	2	10	71213	71222	80 %	20 %	0 %	0 %	344201413
54	NC_015945	GGAAG	2	10	71822	71831	40 %	0 %	60 %	0 %	344201414
55	NC_015945	GTTCA	2	10	74459	74468	20 %	40 %	20 %	20 %	344201417
56	NC_015945	GGTTG	2	10	74484	74493	0 %	40 %	60 %	0 %	344201417
57	NC_015945	TGGCT	2	10	74816	74825	0 %	40 %	40 %	20 %	344201417
58	NC_015945	TTGAT	2	10	75942	75951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015945	GCCCT	2	10	76758	76767	0 %	20 %	20 %	60 %	344201419
60	NC_015945	CTTTG	2	10	77256	77265	0 %	60 %	20 %	20 %	344201419
61	NC_015945	CCAAA	2	10	77387	77396	60 %	0 %	0 %	40 %	344201419
62	NC_015945	TTGAG	2	10	78495	78504	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015945	ACATT	2	10	78930	78939	40 %	40 %	0 %	20 %	344201420
64	NC_015945	CTTCT	2	10	79965	79974	0 %	60 %	0 %	40 %	344201421
65	NC_015945	GATTG	2	10	81005	81014	20 %	40 %	40 %	0 %	344201423
66	NC_015945	CAATC	2	10	81026	81035	40 %	20 %	0 %	40 %	344201423
67	NC_015945	AAAGT	2	10	83541	83550	60 %	20 %	20 %	0 %	344201424
68	NC_015945	ATTGA	2	10	84769	84778	40 %	40 %	20 %	0 %	344201425
69	NC_015945	CGTGC	2	10	85213	85222	0 %	20 %	40 %	40 %	344201425
70	NC_015945	AGTCG	2	10	85827	85836	20 %	20 %	40 %	20 %	344201426
71	NC_015945	TTTTA	2	10	86037	86046	20 %	80 %	0 %	0 %	344201426
72	NC_015945	TTTTG	2	10	86743	86752	0 %	80 %	20 %	0 %	344201426
73	NC_015945	CCCTA	2	10	88921	88930	20 %	20 %	0 %	60 %	344201428
74	NC_015945	ATTTC	2	10	90777	90786	20 %	60 %	0 %	20 %	344201430
75	NC_015945	AATGG	2	10	91078	91087	40 %	20 %	40 %	0 %	344201430
76	NC_015945	GGAAA	2	10	93230	93239	60 %	0 %	40 %	0 %	344201431
77	NC_015945	CTTTG	2	10	95234	95243	0 %	60 %	20 %	20 %	344201431
78	NC_015945	TTGTT	2	10	96848	96857	0 %	80 %	20 %	0 %	344201432
79	NC_015945	CATTC	2	10	98802	98811	20 %	40 %	0 %	40 %	344201433
80	NC_015945	ATCAT	2	10	99479	99488	40 %	40 %	0 %	20 %	344201433
81	NC_015945	CCGTA	2	10	101054	101063	20 %	20 %	20 %	40 %	344201435
82	NC_015945	TGAAA	2	10	101600	101609	60 %	20 %	20 %	0 %	344201435
83	NC_015945	TCCAA	2	10	101827	101836	40 %	20 %	0 %	40 %	344201435
84	NC_015945	TTGGT	2	10	102157	102166	0 %	60 %	40 %	0 %	344201435
85	NC_015945	ACATT	2	10	102524	102533	40 %	40 %	0 %	20 %	344201435
86	NC_015945	ATGCC	2	10	103344	103353	20 %	20 %	20 %	40 %	344201437
87	NC_015945	ATTGA	2	10	104114	104123	40 %	40 %	20 %	0 %	344201437
88	NC_015945	CATTA	2	10	105167	105176	40 %	40 %	0 %	20 %	344201439
89	NC_015945	AGAAA	2	10	105470	105479	80 %	0 %	20 %	0 %	344201439
90	NC_015945	CAACA	2	10	107360	107369	60 %	0 %	0 %	40 %	344201440
91	NC_015945	ATCAA	2	10	107705	107714	60 %	20 %	0 %	20 %	344201440
92	NC_015945	TTCCC	2	10	109191	109200	0 %	40 %	0 %	60 %	344201441
93	NC_015945	TCAGG	2	10	109474	109483	20 %	20 %	40 %	20 %	344201441
94	NC_015945	TCCAA	2	10	111016	111025	40 %	20 %	0 %	40 %	344201442
95	NC_015945	TGTTT	2	10	111084	111093	0 %	80 %	20 %	0 %	344201442
96	NC_015945	ACGGT	2	10	112239	112248	20 %	20 %	40 %	20 %	344201442
97	NC_015945	ATTTT	2	10	113950	113959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015945	AGGTA	2	10	115829	115838	40 %	20 %	40 %	0 %	344201445
99	NC_015945	TTCAT	2	10	117568	117577	20 %	60 %	0 %	20 %	344201445
100	NC_015945	TACGG	2	10	117674	117683	20 %	20 %	40 %	20 %	344201445
101	NC_015945	TTACT	2	10	118358	118367	20 %	60 %	0 %	20 %	344201445
102	NC_015945	AGTTT	2	10	119183	119192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015945	AAAGC	2	10	120484	120493	60 %	0 %	20 %	20 %	344201446
104	NC_015945	CGGGG	2	10	121000	121009	0 %	0 %	80 %	20 %	344201447
105	NC_015945	ATGGA	2	10	121108	121117	40 %	20 %	40 %	0 %	344201447
106	NC_015945	ATGCC	2	10	121511	121520	20 %	20 %	20 %	40 %	344201447
107	NC_015945	AAACC	2	10	121962	121971	60 %	0 %	0 %	40 %	344201447
108	NC_015945	CGTAT	2	10	122189	122198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015945	CATTT	2	10	122212	122221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015945	AAAGC	2	10	125296	125305	60 %	0 %	20 %	20 %	344201452
111	NC_015945	TCTTG	2	10	129846	129855	0 %	60 %	20 %	20 %	344201457
112	NC_015945	TGGTT	2	10	130363	130372	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015945	ACAAA	2	10	131098	131107	80 %	0 %	0 %	20 %	344201458
114	NC_015945	TTTGG	2	10	131238	131247	0 %	60 %	40 %	0 %	344201458
115	NC_015945	GAAGA	2	10	131499	131508	60 %	0 %	40 %	0 %	344201458
116	NC_015945	CTTTT	2	10	132798	132807	0 %	80 %	0 %	20 %	344201460
117	NC_015945	TGATG	2	10	133803	133812	20 %	40 %	40 %	0 %	344201463
118	NC_015945	CAATA	2	10	134020	134029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015945	AGAAA	2	10	134167	134176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015945	CAATA	2	10	134616	134625	60 %	20 %	0 %	20 %	344201464
121	NC_015945	ATCTC	2	10	137805	137814	20 %	40 %	0 %	40 %	344201467
122	NC_015945	TGAAA	2	10	138567	138576	60 %	20 %	20 %	0 %	344201467
123	NC_015945	ATTGA	2	10	139266	139275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015945	CGTAT	2	10	140958	140967	20 %	40 %	20 %	20 %	344201470
125	NC_015945	ACCCA	2	10	143552	143561	40 %	0 %	0 %	60 %	344201472
126	NC_015945	CACTT	2	10	144526	144535	20 %	40 %	0 %	40 %	344201473
127	NC_015945	ACAGC	2	10	145122	145131	40 %	0 %	20 %	40 %	344201474
128	NC_015945	CCTTT	2	10	145744	145753	0 %	60 %	0 %	40 %	344201474
129	NC_015945	GGATT	2	10	148156	148165	20 %	40 %	40 %	0 %	344201476
130	NC_015945	TTGTT	2	10	148913	148922	0 %	80 %	20 %	0 %	344201477
131	NC_015945	GGAAG	2	10	151672	151681	40 %	0 %	60 %	0 %	344201482
132	NC_015945	TCAAA	2	10	152052	152061	60 %	20 %	0 %	20 %	344201482
133	NC_015945	GGTGA	2	10	152185	152194	20 %	20 %	60 %	0 %	344201482
134	NC_015945	TTAAT	2	10	152478	152487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015945	AAAAT	2	10	152825	152834	80 %	20 %	0 %	0 %	344201483
136	NC_015945	AAAAG	2	10	155208	155217	80 %	0 %	20 %	0 %	344201485
137	NC_015945	GTATG	2	10	157579	157588	20 %	40 %	40 %	0 %	344201489
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253	NC_015945	CAGTA	2	10	312146	312155	40 %	20 %	20 %	20 %	344201637
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260	NC_015945	TTGAT	2	10	324218	324227	20 %	60 %	20 %	0 %	344201649
261	NC_015945	TTTTG	2	10	324474	324483	0 %	80 %	20 %	0 %	344201649
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263	NC_015945	CACTA	2	10	325339	325348	40 %	20 %	0 %	40 %	344201649
264	NC_015945	AAAAG	2	10	325403	325412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015945	AACTC	2	10	325691	325700	40 %	20 %	0 %	40 %	344201651
266	NC_015945	TTTTC	2	10	326019	326028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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