MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 3041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015945	TTGAT	2	10	3789517	3789526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015945	AGATA	2	10	3790414	3790423	60 %	20 %	20 %	0 %	344204716
3003	NC_015945	TATGG	2	10	3791603	3791612	20 %	40 %	40 %	0 %	344204718
3004	NC_015945	AAAGC	2	10	3795469	3795478	60 %	0 %	20 %	20 %	344204721
3005	NC_015945	CAAAC	2	10	3796880	3796889	60 %	0 %	0 %	40 %	344204722
3006	NC_015945	GAAAT	2	10	3799440	3799449	60 %	20 %	20 %	0 %	344204724
3007	NC_015945	TAAAA	2	10	3799588	3799597	80 %	20 %	0 %	0 %	344204724
3008	NC_015945	TTGCT	2	10	3801774	3801783	0 %	60 %	20 %	20 %	344204725
3009	NC_015945	TGGAA	2	10	3802832	3802841	40 %	20 %	40 %	0 %	344204727
3010	NC_015945	AGCGA	2	10	3805188	3805197	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_015945	TCAAA	2	10	3807502	3807511	60 %	20 %	0 %	20 %	344204732
3012	NC_015945	AACAG	2	10	3809345	3809354	60 %	0 %	20 %	20 %	344204734
3013	NC_015945	ATTGG	2	10	3811478	3811487	20 %	40 %	40 %	0 %	344204736
3014	NC_015945	TTCAA	2	10	3811653	3811662	40 %	40 %	0 %	20 %	344204736
3015	NC_015945	AGCGA	2	10	3811698	3811707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_015945	TTTGT	2	10	3811730	3811739	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015945	GCAGG	2	10	3811816	3811825	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3018	NC_015945	AAAGG	2	10	3812026	3812035	60 %	0 %	40 %	0 %	344204737
3019	NC_015945	AAAAT	2	10	3813409	3813418	80 %	20 %	0 %	0 %	344204739
3020	NC_015945	AAACC	2	10	3813458	3813467	60 %	0 %	0 %	40 %	344204739
3021	NC_015945	ATCAA	2	10	3815263	3815272	60 %	20 %	0 %	20 %	344204740
3022	NC_015945	AAAAG	2	10	3817512	3817521	80 %	0 %	20 %	0 %	344204743
3023	NC_015945	TTAAA	2	10	3818431	3818440	60 %	40 %	0 %	0 %	344204745
3024	NC_015945	CAAAA	2	10	3820681	3820690	80 %	0 %	0 %	20 %	344204747
3025	NC_015945	TTGAT	2	10	3821082	3821091	20 %	60 %	20 %	0 %	344204747
3026	NC_015945	AAGGT	2	10	3822073	3822082	40 %	20 %	40 %	0 %	344204748
3027	NC_015945	TCCCC	2	10	3822190	3822199	0 %	20 %	0 %	80 %	344204748
3028	NC_015945	CTCTT	2	10	3824383	3824392	0 %	60 %	0 %	40 %	344204750
3029	NC_015945	TCAAA	2	10	3826418	3826427	60 %	20 %	0 %	20 %	344204752
3030	NC_015945	ATTGT	2	10	3829495	3829504	20 %	60 %	20 %	0 %	344204755
3031	NC_015945	GAAGA	2	10	3831120	3831129	60 %	0 %	40 %	0 %	344204758
3032	NC_015945	CCTTC	2	10	3831263	3831272	0 %	40 %	0 %	60 %	344204758
3033	NC_015945	CGAAA	2	10	3831337	3831346	60 %	0 %	20 %	20 %	344204758
3034	NC_015945	CGAAG	2	10	3832349	3832358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_015945	CCCAA	2	10	3833023	3833032	40 %	0 %	0 %	60 %	344204759
3036	NC_015945	TCTCC	2	10	3834274	3834283	0 %	40 %	0 %	60 %	344204759
3037	NC_015945	GGGTT	2	10	3834759	3834768	0 %	40 %	60 %	0 %	344204760
3038	NC_015945	TGCGT	2	10	3841029	3841038	0 %	40 %	40 %	20 %	344204767
3039	NC_015945	CTTTA	2	10	3841065	3841074	20 %	60 %	0 %	20 %	344204767
3040	NC_015945	TCGGT	2	10	3841737	3841746	0 %	40 %	40 %	20 %	344204768
3041	NC_015945	CGCTG	2	10	3841853	3841862	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.