MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 2000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015942	CGGGC	2	10	1615002	1615011	0 %	0 %	60 %	40 %	344199745
1002	NC_015942	CTGGA	2	10	1618225	1618234	20 %	20 %	40 %	20 %	344199750
1003	NC_015942	GCGCG	2	10	1618697	1618706	0 %	0 %	60 %	40 %	344199752
1004	NC_015942	CCGGC	2	10	1619885	1619894	0 %	0 %	40 %	60 %	344199753
1005	NC_015942	CGAGC	2	10	1621230	1621239	20 %	0 %	40 %	40 %	344199754
1006	NC_015942	AGGGC	2	10	1625779	1625788	20 %	0 %	60 %	20 %	344199758
1007	NC_015942	CAGTG	2	10	1628186	1628195	20 %	20 %	40 %	20 %	344199763
1008	NC_015942	GGGCA	2	10	1629375	1629384	20 %	0 %	60 %	20 %	344199764
1009	NC_015942	CAGGG	2	10	1629463	1629472	20 %	0 %	60 %	20 %	344199764
1010	NC_015942	GCAGC	2	10	1629743	1629752	20 %	0 %	40 %	40 %	344199764
1011	NC_015942	GGGTT	2	10	1630384	1630393	0 %	40 %	60 %	0 %	344199764
1012	NC_015942	CCGGC	2	10	1630415	1630424	0 %	0 %	40 %	60 %	344199764
1013	NC_015942	CCGTT	2	10	1630517	1630526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1014	NC_015942	AGGGG	2	10	1630930	1630939	20 %	0 %	80 %	0 %	344199766
1015	NC_015942	GCACG	2	10	1631023	1631032	20 %	0 %	40 %	40 %	344199766
1016	NC_015942	CCGAC	2	10	1633147	1633156	20 %	0 %	20 %	60 %	344199768
1017	NC_015942	CCGGC	2	10	1633387	1633396	0 %	0 %	40 %	60 %	344199768
1018	NC_015942	CGGAC	2	10	1634139	1634148	20 %	0 %	40 %	40 %	344199769
1019	NC_015942	TCAGT	2	10	1634749	1634758	20 %	40 %	20 %	20 %	344199769
1020	NC_015942	GTCAT	2	10	1640081	1640090	20 %	40 %	20 %	20 %	344199778
1021	NC_015942	CTTCA	2	10	1642847	1642856	20 %	40 %	0 %	40 %	344199781
1022	NC_015942	CGGTA	2	10	1642931	1642940	20 %	20 %	40 %	20 %	344199781
1023	NC_015942	GTGCC	2	10	1646180	1646189	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_015942	CGGCG	2	10	1647472	1647481	0 %	0 %	60 %	40 %	344199785
1025	NC_015942	TGCGC	2	10	1648306	1648315	0 %	20 %	40 %	40 %	344199786
1026	NC_015942	CCATC	2	10	1650579	1650588	20 %	20 %	0 %	60 %	344199787
1027	NC_015942	CAGCG	2	10	1653800	1653809	20 %	0 %	40 %	40 %	344199792
1028	NC_015942	GCAGC	2	10	1659700	1659709	20 %	0 %	40 %	40 %	344199803
1029	NC_015942	CCTGT	2	10	1659962	1659971	0 %	40 %	20 %	40 %	344199803
1030	NC_015942	GCCCA	2	10	1661141	1661150	20 %	0 %	20 %	60 %	344199805
1031	NC_015942	GGCCA	2	10	1661279	1661288	20 %	0 %	40 %	40 %	344199805
1032	NC_015942	GCCCG	2	10	1666960	1666969	0 %	0 %	40 %	60 %	344199810
1033	NC_015942	ACATC	2	10	1668237	1668246	40 %	20 %	0 %	40 %	344199810
1034	NC_015942	CTGGC	2	10	1668542	1668551	0 %	20 %	40 %	40 %	344199811
1035	NC_015942	CCCAG	2	10	1668554	1668563	20 %	0 %	20 %	60 %	344199811
1036	NC_015942	CGGCG	2	10	1669961	1669970	0 %	0 %	60 %	40 %	344199811
1037	NC_015942	CGGCA	2	10	1670960	1670969	20 %	0 %	40 %	40 %	344199812
1038	NC_015942	TGCGA	2	10	1671399	1671408	20 %	20 %	40 %	20 %	344199813
1039	NC_015942	CCAGT	2	10	1673664	1673673	20 %	20 %	20 %	40 %	344199815
1040	NC_015942	ACCGG	2	10	1675661	1675670	20 %	0 %	40 %	40 %	344199819
1041	NC_015942	TCAGC	2	10	1676878	1676887	20 %	20 %	20 %	40 %	344199819
1042	NC_015942	CAGAA	2	10	1677319	1677328	60 %	0 %	20 %	20 %	344199820
1043	NC_015942	TGAGA	2	10	1677595	1677604	40 %	20 %	40 %	0 %	344199820
1044	NC_015942	AGAGC	2	10	1678471	1678480	40 %	0 %	40 %	20 %	344199821
1045	NC_015942	CGGAC	2	10	1679855	1679864	20 %	0 %	40 %	40 %	344199823
1046	NC_015942	CACCG	2	10	1681723	1681732	20 %	0 %	20 %	60 %	344199823
1047	NC_015942	GCCGC	2	10	1682246	1682255	0 %	0 %	40 %	60 %	344199824
1048	NC_015942	GCGCC	2	10	1687211	1687220	0 %	0 %	40 %	60 %	344199828
1049	NC_015942	CCGCT	2	10	1687246	1687255	0 %	20 %	20 %	60 %	344199828
1050	NC_015942	GCCTG	2	10	1692896	1692905	0 %	20 %	40 %	40 %	344199834
1051	NC_015942	ATTGC	2	10	1697713	1697722	20 %	40 %	20 %	20 %	344199838
1052	NC_015942	GGACG	2	10	1699949	1699958	20 %	0 %	60 %	20 %	344199839
1053	NC_015942	ATGCC	2	10	1701597	1701606	20 %	20 %	20 %	40 %	344199840
1054	NC_015942	AGGGC	2	10	1704834	1704843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_015942	CTGCA	2	10	1705711	1705720	20 %	20 %	20 %	40 %	344199842
1056	NC_015942	GCACG	2	10	1707122	1707131	20 %	0 %	40 %	40 %	344199844
1057	NC_015942	CGGAA	2	10	1707400	1707409	40 %	0 %	40 %	20 %	344199845
1058	NC_015942	TGGCA	2	10	1708433	1708442	20 %	20 %	40 %	20 %	344199845
1059	NC_015942	TTGAG	2	10	1709310	1709319	20 %	40 %	40 %	0 %	344199847
1060	NC_015942	GCCTT	2	10	1710382	1710391	0 %	40 %	20 %	40 %	344199848
1061	NC_015942	CCAGC	2	10	1711346	1711355	20 %	0 %	20 %	60 %	344199849
1062	NC_015942	ATGGT	2	10	1711859	1711868	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015942	GGGCG	2	10	1715161	1715170	0 %	0 %	80 %	20 %	344199855
1064	NC_015942	GCTTT	2	10	1716382	1716391	0 %	60 %	20 %	20 %	344199857
1065	NC_015942	ACCAA	2	10	1717912	1717921	60 %	0 %	0 %	40 %	344199859
1066	NC_015942	CGCAC	2	10	1719321	1719330	20 %	0 %	20 %	60 %	344199863
1067	NC_015942	ACAGA	2	10	1722108	1722117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_015942	TGGTC	2	10	1722738	1722747	0 %	40 %	40 %	20 %	344199868
1069	NC_015942	CCATG	2	10	1723569	1723578	20 %	20 %	20 %	40 %	344199869
1070	NC_015942	CTCGT	2	10	1725118	1725127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1071	NC_015942	GGGTA	3	15	1726308	1726322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015942	TTCGT	2	10	1727358	1727367	0 %	60 %	20 %	20 %	344199871
1073	NC_015942	CAGGG	2	10	1727979	1727988	20 %	0 %	60 %	20 %	344199871
1074	NC_015942	CAGGG	2	10	1728923	1728932	20 %	0 %	60 %	20 %	344199872
1075	NC_015942	CAGGG	2	10	1729491	1729500	20 %	0 %	60 %	20 %	344199872
1076	NC_015942	TGTCT	2	10	1731145	1731154	0 %	60 %	20 %	20 %	344199872
1077	NC_015942	GCCAG	2	10	1731268	1731277	20 %	0 %	40 %	40 %	344199872
1078	NC_015942	GGAGG	2	10	1733368	1733377	20 %	0 %	80 %	0 %	344199873
1079	NC_015942	CAGTA	2	10	1733456	1733465	40 %	20 %	20 %	20 %	344199873
1080	NC_015942	CGCAC	2	10	1734971	1734980	20 %	0 %	20 %	60 %	344199875
1081	NC_015942	GTTCG	2	10	1737890	1737899	0 %	40 %	40 %	20 %	344199878
1082	NC_015942	ATTTG	2	10	1739380	1739389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015942	AGGCC	2	10	1742967	1742976	20 %	0 %	40 %	40 %	344199883
1084	NC_015942	TCCGC	2	10	1743243	1743252	0 %	20 %	20 %	60 %	344199883
1085	NC_015942	CAAAG	2	10	1745238	1745247	60 %	0 %	20 %	20 %	344199886
1086	NC_015942	CGGTG	2	10	1746594	1746603	0 %	20 %	60 %	20 %	344199887
1087	NC_015942	CGCGC	2	10	1747083	1747092	0 %	0 %	40 %	60 %	344199888
1088	NC_015942	ATCAC	2	10	1750896	1750905	40 %	20 %	0 %	40 %	344199892
1089	NC_015942	CGTAG	2	10	1752641	1752650	20 %	20 %	40 %	20 %	344199893
1090	NC_015942	GGCGG	2	10	1754345	1754354	0 %	0 %	80 %	20 %	344199895
1091	NC_015942	CACTC	2	10	1757800	1757809	20 %	20 %	0 %	60 %	344199899
1092	NC_015942	GCGCC	2	10	1758759	1758768	0 %	0 %	40 %	60 %	344199900
1093	NC_015942	TGCCG	2	10	1760243	1760252	0 %	20 %	40 %	40 %	344199902
1094	NC_015942	CCCTG	2	10	1761351	1761360	0 %	20 %	20 %	60 %	344199903
1095	NC_015942	ATTGT	2	10	1761865	1761874	20 %	60 %	20 %	0 %	344199904
1096	NC_015942	AGAAC	2	10	1765393	1765402	60 %	0 %	20 %	20 %	344199908
1097	NC_015942	GCGTT	2	10	1766074	1766083	0 %	40 %	40 %	20 %	344199910
1098	NC_015942	GGTGG	2	10	1766179	1766188	0 %	20 %	80 %	0 %	344199910
1099	NC_015942	GCGTG	2	10	1768070	1768079	0 %	20 %	60 %	20 %	344199911
1100	NC_015942	CTGCC	2	10	1770075	1770084	0 %	20 %	20 %	60 %	344199912
1101	NC_015942	GCGCC	2	10	1771696	1771705	0 %	0 %	40 %	60 %	344199914
1102	NC_015942	GCACG	2	10	1773365	1773374	20 %	0 %	40 %	40 %	344199915
1103	NC_015942	GAAAA	2	10	1774847	1774856	80 %	0 %	20 %	0 %	344199917
1104	NC_015942	CGGCA	2	10	1776593	1776602	20 %	0 %	40 %	40 %	344199919
1105	NC_015942	AGGCA	2	10	1778732	1778741	40 %	0 %	40 %	20 %	344199922
1106	NC_015942	CCACC	2	10	1779324	1779333	20 %	0 %	0 %	80 %	344199923
1107	NC_015942	AGACC	2	10	1781056	1781065	40 %	0 %	20 %	40 %	344199926
1108	NC_015942	CAGTG	2	10	1781870	1781879	20 %	20 %	40 %	20 %	344199926
1109	NC_015942	GTACG	2	10	1782219	1782228	20 %	20 %	40 %	20 %	344199926
1110	NC_015942	CGGTA	2	10	1782808	1782817	20 %	20 %	40 %	20 %	344199926
1111	NC_015942	ATTCC	2	10	1783718	1783727	20 %	40 %	0 %	40 %	344199928
1112	NC_015942	CGCCA	2	10	1784863	1784872	20 %	0 %	20 %	60 %	344199928
1113	NC_015942	ATTAT	2	10	1785299	1785308	40 %	60 %	0 %	0 %	344199929
1114	NC_015942	TTATT	2	10	1785489	1785498	20 %	80 %	0 %	0 %	344199930
1115	NC_015942	CTTAT	2	10	1787536	1787545	20 %	60 %	0 %	20 %	344199932
1116	NC_015942	TGCCG	2	10	1788304	1788313	0 %	20 %	40 %	40 %	344199933
1117	NC_015942	AGCAA	2	10	1789374	1789383	60 %	0 %	20 %	20 %	344199933
1118	NC_015942	GACCA	2	10	1790707	1790716	40 %	0 %	20 %	40 %	344199934
1119	NC_015942	GCAGG	2	10	1791200	1791209	20 %	0 %	60 %	20 %	344199934
1120	NC_015942	GATGC	2	10	1791513	1791522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_015942	GCCCT	2	10	1792162	1792171	0 %	20 %	20 %	60 %	344199935
1122	NC_015942	CGTCG	2	10	1794206	1794215	0 %	20 %	40 %	40 %	344199936
1123	NC_015942	ATGCC	2	10	1794311	1794320	20 %	20 %	20 %	40 %	344199936
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1125	NC_015942	CTCCA	2	10	1795733	1795742	20 %	20 %	0 %	60 %	344199939
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1235	NC_015942	GGCTT	2	10	1959306	1959315	0 %	40 %	40 %	20 %	344200101
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1252	NC_015942	TCACC	2	10	1988521	1988530	20 %	20 %	0 %	60 %	344200130
1253	NC_015942	TGGAC	2	10	1991813	1991822	20 %	20 %	40 %	20 %	344200132
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1255	NC_015942	ACCTG	2	10	1994014	1994023	20 %	20 %	20 %	40 %	344200134
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1264	NC_015942	AGCGC	2	10	2004116	2004125	20 %	0 %	40 %	40 %	344200146
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1269	NC_015942	CATCC	2	10	2017157	2017166	20 %	20 %	0 %	60 %	344200159
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1273	NC_015942	TGCTC	2	10	2021195	2021204	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1274	NC_015942	GCGCG	2	10	2022210	2022219	0 %	0 %	60 %	40 %	344200162
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1280	NC_015942	TCCTG	2	10	2030235	2030244	0 %	40 %	20 %	40 %	344200168
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1286	NC_015942	CGTGC	2	10	2038451	2038460	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1297	NC_015942	CGTTC	2	10	2062278	2062287	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1301	NC_015942	TGGTC	2	10	2071202	2071211	0 %	40 %	40 %	20 %	344200213
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1309	NC_015942	GGCAG	2	10	2080806	2080815	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1310	NC_015942	GTGAC	2	10	2082464	2082473	20 %	20 %	40 %	20 %	344200233
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1313	NC_015942	CCATA	2	10	2086900	2086909	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1314	NC_015942	CGCGC	3	15	2087138	2087152	0 %	0 %	40 %	60 %	344200237
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1325	NC_015942	CGGGT	2	10	2104802	2104811	0 %	20 %	60 %	20 %	344200249
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1343	NC_015942	GCAAA	2	10	2131978	2131987	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1344	NC_015942	GGCGG	2	10	2132596	2132605	0 %	0 %	80 %	20 %	344200273
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1359	NC_015942	GGCAA	2	10	2155842	2155851	40 %	0 %	40 %	20 %	344200292
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1362	NC_015942	GCCAT	2	10	2160256	2160265	20 %	20 %	20 %	40 %	344200295
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1365	NC_015942	GCCGT	2	10	2165273	2165282	0 %	20 %	40 %	40 %	344200298
1366	NC_015942	AGGCA	2	10	2165704	2165713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1367	NC_015942	AGGGA	2	10	2165720	2165729	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1368	NC_015942	GCGCC	2	10	2165888	2165897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1369	NC_015942	CATGC	2	10	2167114	2167123	20 %	20 %	20 %	40 %	344200300
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1372	NC_015942	TCATT	2	10	2173158	2173167	20 %	60 %	0 %	20 %	344200305
1373	NC_015942	CCGCC	2	10	2173755	2173764	0 %	0 %	20 %	80 %	344200306
1374	NC_015942	TGGGC	2	10	2174822	2174831	0 %	20 %	60 %	20 %	344200307
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1376	NC_015942	GCCGC	2	10	2176712	2176721	0 %	0 %	40 %	60 %	344200309
1377	NC_015942	CCGCA	2	10	2177271	2177280	20 %	0 %	20 %	60 %	344200309
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1423	NC_015942	CTGTC	2	10	2247192	2247201	0 %	40 %	20 %	40 %	344200382
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1447	NC_015942	CACCC	2	10	2278080	2278089	20 %	0 %	0 %	80 %	344200408
1448	NC_015942	CGCGG	2	10	2279019	2279028	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1451	NC_015942	TCACG	2	10	2282033	2282042	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1452	NC_015942	GCGTG	2	10	2282728	2282737	0 %	20 %	60 %	20 %	344200413
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1469	NC_015942	CGGGT	2	10	2314316	2314325	0 %	20 %	60 %	20 %	344200434
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1472	NC_015942	GGCCG	2	10	2321463	2321472	0 %	0 %	60 %	40 %	344200437
1473	NC_015942	CCGCG	2	10	2323205	2323214	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1474	NC_015942	TACGC	2	10	2325866	2325875	20 %	20 %	20 %	40 %	344200441
1475	NC_015942	ATTAT	2	10	2327207	2327216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1476	NC_015942	CTTAT	2	10	2328928	2328937	20 %	60 %	0 %	20 %	344200443
1477	NC_015942	GCTTG	2	10	2333258	2333267	0 %	40 %	40 %	20 %	344200447
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1479	NC_015942	GGCTT	2	10	2334313	2334322	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1480	NC_015942	CATTC	2	10	2335126	2335135	20 %	40 %	0 %	40 %	344200449
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1482	NC_015942	CCGAC	2	10	2338478	2338487	20 %	0 %	20 %	60 %	344200451
1483	NC_015942	CCTGA	2	10	2338825	2338834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1484	NC_015942	GTGTG	2	10	2341320	2341329	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1485	NC_015942	GAAGC	2	10	2341471	2341480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1486	NC_015942	AAAGT	2	10	2343676	2343685	60 %	20 %	20 %	0 %	344200455
1487	NC_015942	ATCCC	2	10	2345565	2345574	20 %	20 %	0 %	60 %	344200456
1488	NC_015942	CAGAG	2	10	2348005	2348014	40 %	0 %	40 %	20 %	344200457
1489	NC_015942	ATTGC	2	10	2348676	2348685	20 %	40 %	20 %	20 %	344200458
1490	NC_015942	AACCA	2	10	2349483	2349492	60 %	0 %	0 %	40 %	344200458
1491	NC_015942	CCGGA	2	10	2351909	2351918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1492	NC_015942	TCGCC	2	10	2360407	2360416	0 %	20 %	20 %	60 %	344200464
1493	NC_015942	GCGCG	2	10	2368811	2368820	0 %	0 %	60 %	40 %	344200469
1494	NC_015942	GCTCC	2	10	2369367	2369376	0 %	20 %	20 %	60 %	344200469
1495	NC_015942	TATTT	2	10	2370226	2370235	20 %	80 %	0 %	0 %	344200470
1496	NC_015942	CGACC	2	10	2373781	2373790	20 %	0 %	20 %	60 %	344200473
1497	NC_015942	GCCGC	2	10	2375353	2375362	0 %	0 %	40 %	60 %	344200473
1498	NC_015942	TACCG	2	10	2376605	2376614	20 %	20 %	20 %	40 %	344200474
1499	NC_015942	TACGC	2	10	2376952	2376961	20 %	20 %	20 %	40 %	344200474
1500	NC_015942	TGGAC	2	10	2377616	2377625	20 %	20 %	40 %	20 %	344200474

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