MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 2000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015942	CATGG	2	10	807049	807058	20 %	20 %	40 %	20 %	344198986
502	NC_015942	GACGA	2	10	807469	807478	40 %	0 %	40 %	20 %	344198986
503	NC_015942	AGGGT	2	10	809115	809124	20 %	20 %	60 %	0 %	344198988
504	NC_015942	CTTGG	2	10	810013	810022	0 %	40 %	40 %	20 %	344198988
505	NC_015942	ATGAC	2	10	811696	811705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
506	NC_015942	TTCAG	2	10	811898	811907	20 %	40 %	20 %	20 %	344198989
507	NC_015942	GGCTC	2	10	812355	812364	0 %	20 %	40 %	40 %	344198989
508	NC_015942	TGGAT	2	10	812612	812621	20 %	40 %	40 %	0 %	344198989
509	NC_015942	GAACA	2	10	816176	816185	60 %	0 %	20 %	20 %	344198993
510	NC_015942	GATCA	2	10	819334	819343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
511	NC_015942	ACTCG	2	10	821156	821165	20 %	20 %	20 %	40 %	344198996
512	NC_015942	AACCG	2	10	821171	821180	40 %	0 %	20 %	40 %	344198996
513	NC_015942	CCGAC	2	10	822114	822123	20 %	0 %	20 %	60 %	344198997
514	NC_015942	CCGCT	2	10	823885	823894	0 %	20 %	20 %	60 %	344198999
515	NC_015942	CCGTG	2	10	825084	825093	0 %	20 %	40 %	40 %	344199000
516	NC_015942	CGGCA	2	10	825280	825289	20 %	0 %	40 %	40 %	344199000
517	NC_015942	TCCGG	2	10	826009	826018	0 %	20 %	40 %	40 %	344199000
518	NC_015942	CATGG	2	10	827530	827539	20 %	20 %	40 %	20 %	344199001
519	NC_015942	GGGCA	2	10	830212	830221	20 %	0 %	60 %	20 %	344199003
520	NC_015942	GGGCC	2	10	831314	831323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
521	NC_015942	GTCCG	2	10	832625	832634	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
522	NC_015942	CGGTG	2	10	834741	834750	0 %	20 %	60 %	20 %	344199007
523	NC_015942	CAGGG	2	10	835275	835284	20 %	0 %	60 %	20 %	344199007
524	NC_015942	GCGCG	2	10	836129	836138	0 %	0 %	60 %	40 %	344199007
525	NC_015942	GCCAG	2	10	839558	839567	20 %	0 %	40 %	40 %	344199010
526	NC_015942	GTGGC	2	10	840794	840803	0 %	20 %	60 %	20 %	344199010
527	NC_015942	GTCTG	2	10	842293	842302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
528	NC_015942	CGTGG	2	10	848170	848179	0 %	20 %	60 %	20 %	344199014
529	NC_015942	GGGCA	2	10	849421	849430	20 %	0 %	60 %	20 %	344199014
530	NC_015942	CCACG	2	10	853162	853171	20 %	0 %	20 %	60 %	344199017
531	NC_015942	GGCAT	2	10	853353	853362	20 %	20 %	40 %	20 %	344199017
532	NC_015942	TCATC	2	10	855797	855806	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
533	NC_015942	ACGCC	2	10	856335	856344	20 %	0 %	20 %	60 %	344199020
534	NC_015942	GCGCC	2	10	856408	856417	0 %	0 %	40 %	60 %	344199020
535	NC_015942	GGGCT	2	10	858856	858865	0 %	20 %	60 %	20 %	344199021
536	NC_015942	GCGCG	2	10	858916	858925	0 %	0 %	60 %	40 %	344199021
537	NC_015942	GGCCG	2	10	859129	859138	0 %	0 %	60 %	40 %	344199021
538	NC_015942	TCTTT	2	10	860533	860542	0 %	80 %	0 %	20 %	344199022
539	NC_015942	CCCGA	2	10	861174	861183	20 %	0 %	20 %	60 %	344199023
540	NC_015942	GGTGC	2	10	862246	862255	0 %	20 %	60 %	20 %	344199024
541	NC_015942	GTTGC	2	10	865962	865971	0 %	40 %	40 %	20 %	344199027
542	NC_015942	GCCGG	2	10	868982	868991	0 %	0 %	60 %	40 %	344199034
543	NC_015942	CTGCC	2	10	869208	869217	0 %	20 %	20 %	60 %	344199034
544	NC_015942	GCCGC	2	10	870593	870602	0 %	0 %	40 %	60 %	344199035
545	NC_015942	TGAGC	2	10	871470	871479	20 %	20 %	40 %	20 %	344199036
546	NC_015942	CGTGC	2	10	871885	871894	0 %	20 %	40 %	40 %	344199036
547	NC_015942	GGCGT	2	10	872437	872446	0 %	20 %	60 %	20 %	344199037
548	NC_015942	ACCCG	2	10	875955	875964	20 %	0 %	20 %	60 %	344199040
549	NC_015942	CGCAG	2	10	876731	876740	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
550	NC_015942	GCACC	2	10	881655	881664	20 %	0 %	20 %	60 %	344199046
551	NC_015942	CGCGG	2	10	882615	882624	0 %	0 %	60 %	40 %	344199047
552	NC_015942	CAATG	2	10	882728	882737	40 %	20 %	20 %	20 %	344199047
553	NC_015942	CATTT	2	10	883059	883068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
554	NC_015942	CGCGG	2	10	883377	883386	0 %	0 %	60 %	40 %	344199048
555	NC_015942	GGCGG	2	10	884468	884477	0 %	0 %	80 %	20 %	344199049
556	NC_015942	GCCCG	3	15	885142	885156	0 %	0 %	40 %	60 %	344199049
557	NC_015942	AATTG	2	10	885609	885618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015942	GTGGC	2	10	885637	885646	0 %	20 %	60 %	20 %	344199051
559	NC_015942	CAAAC	2	10	887095	887104	60 %	0 %	0 %	40 %	344199052
560	NC_015942	ACCAC	2	10	887566	887575	40 %	0 %	0 %	60 %	344199052
561	NC_015942	CAATC	2	10	889819	889828	40 %	20 %	0 %	40 %	344199053
562	NC_015942	ACTAC	2	10	890755	890764	40 %	20 %	0 %	40 %	344199053
563	NC_015942	GAAAA	2	10	891073	891082	80 %	0 %	20 %	0 %	344199054
564	NC_015942	TGCGT	2	10	891776	891785	0 %	40 %	40 %	20 %	344199055
565	NC_015942	GCGTG	2	10	892302	892311	0 %	20 %	60 %	20 %	344199055
566	NC_015942	TCGAT	2	10	893084	893093	20 %	40 %	20 %	20 %	344199055
567	NC_015942	AGACG	2	10	893189	893198	40 %	0 %	40 %	20 %	344199055
568	NC_015942	CTTCA	2	10	897528	897537	20 %	40 %	0 %	40 %	344199057
569	NC_015942	ACGCA	2	10	897610	897619	40 %	0 %	20 %	40 %	344199057
570	NC_015942	GAAGA	2	10	898021	898030	60 %	0 %	40 %	0 %	344199057
571	NC_015942	CGCGG	2	10	898363	898372	0 %	0 %	60 %	40 %	344199057
572	NC_015942	TCGTT	2	10	898412	898421	0 %	60 %	20 %	20 %	344199057
573	NC_015942	CACTC	2	10	898553	898562	20 %	20 %	0 %	60 %	344199057
574	NC_015942	CTCTC	2	10	899063	899072	0 %	40 %	0 %	60 %	344199057
575	NC_015942	CGGGT	2	10	901116	901125	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
576	NC_015942	TTTCC	2	10	901456	901465	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
577	NC_015942	GAAAA	2	10	903432	903441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015942	GCGCG	2	10	904356	904365	0 %	0 %	60 %	40 %	344199062
579	NC_015942	AATGG	2	10	905409	905418	40 %	20 %	40 %	0 %	344199062
580	NC_015942	CGGCA	2	10	906731	906740	20 %	0 %	40 %	40 %	344199063
581	NC_015942	GCTGC	2	10	906995	907004	0 %	20 %	40 %	40 %	344199063
582	NC_015942	CAACC	2	10	907109	907118	40 %	0 %	0 %	60 %	344199063
583	NC_015942	TCGCC	2	10	911184	911193	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
584	NC_015942	GATCA	2	10	914260	914269	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
585	NC_015942	ACTCG	2	10	916078	916087	20 %	20 %	20 %	40 %	344199070
586	NC_015942	AACCG	2	10	916093	916102	40 %	0 %	20 %	40 %	344199070
587	NC_015942	CCGAC	2	10	917036	917045	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
588	NC_015942	CCGCT	2	10	918808	918817	0 %	20 %	20 %	60 %	344199072
589	NC_015942	CCGTG	2	10	920007	920016	0 %	20 %	40 %	40 %	344199073
590	NC_015942	CGGCA	2	10	920203	920212	20 %	0 %	40 %	40 %	344199073
591	NC_015942	TCCGG	2	10	920932	920941	0 %	20 %	40 %	40 %	344199073
592	NC_015942	CATGG	2	10	922453	922462	20 %	20 %	40 %	20 %	344199074
593	NC_015942	GGGCA	2	10	925135	925144	20 %	0 %	60 %	20 %	344199076
594	NC_015942	CTGCC	2	10	927903	927912	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
595	NC_015942	CCTTT	2	10	928634	928643	0 %	60 %	0 %	40 %	344199079
596	NC_015942	CGGGA	2	10	929060	929069	20 %	0 %	60 %	20 %	344199079
597	NC_015942	TCGTG	2	10	929719	929728	0 %	40 %	40 %	20 %	344199080
598	NC_015942	TCTGG	2	10	932880	932889	0 %	40 %	40 %	20 %	344199082
599	NC_015942	TATTT	2	10	934904	934913	20 %	80 %	0 %	0 %	344199084
600	NC_015942	TGCGA	2	10	935839	935848	20 %	20 %	40 %	20 %	344199086
601	NC_015942	TCATC	2	10	936618	936627	20 %	40 %	0 %	40 %	344199087
602	NC_015942	GTCCA	2	10	938869	938878	20 %	20 %	20 %	40 %	344199090
603	NC_015942	ATAGA	2	10	941490	941499	60 %	20 %	20 %	0 %	344199090
604	NC_015942	GCTCC	2	10	944069	944078	0 %	20 %	20 %	60 %	344199091
605	NC_015942	TGCCC	2	10	944306	944315	0 %	20 %	20 %	60 %	344199092
606	NC_015942	TTCCC	2	10	945566	945575	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
607	NC_015942	GAGCA	2	10	949510	949519	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_015942	CTGCC	2	10	950772	950781	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
609	NC_015942	TTCCA	2	10	952668	952677	20 %	40 %	0 %	40 %	344199096
610	NC_015942	GCGGG	2	10	954451	954460	0 %	0 %	80 %	20 %	344199097
611	NC_015942	CGCGG	2	10	955016	955025	0 %	0 %	60 %	40 %	344199098
612	NC_015942	GCGGT	2	10	956661	956670	0 %	20 %	60 %	20 %	344199099
613	NC_015942	GGGCA	2	10	957705	957714	20 %	0 %	60 %	20 %	344199100
614	NC_015942	CTGGG	2	10	959358	959367	0 %	20 %	60 %	20 %	344199102
615	NC_015942	GGTGG	2	10	959371	959380	0 %	20 %	80 %	0 %	344199102
616	NC_015942	AGCTG	2	10	961311	961320	20 %	20 %	40 %	20 %	344199103
617	NC_015942	CGGTG	2	10	962462	962471	0 %	20 %	60 %	20 %	344199105
618	NC_015942	CGGCT	2	10	963152	963161	0 %	20 %	40 %	40 %	344199106
619	NC_015942	CAGGG	2	10	964129	964138	20 %	0 %	60 %	20 %	344199107
620	NC_015942	TTTTC	2	10	964647	964656	0 %	80 %	0 %	20 %	344199107
621	NC_015942	GCCCC	2	10	964863	964872	0 %	0 %	20 %	80 %	344199107
622	NC_015942	ATTTC	2	10	967672	967681	20 %	60 %	0 %	20 %	344199112
623	NC_015942	TGCAC	2	10	967770	967779	20 %	20 %	20 %	40 %	344199112
624	NC_015942	GGCTC	2	10	968738	968747	0 %	20 %	40 %	40 %	344199113
625	NC_015942	CGACT	2	10	969293	969302	20 %	20 %	20 %	40 %	344199113
626	NC_015942	GACAA	2	10	974835	974844	60 %	0 %	20 %	20 %	344199121
627	NC_015942	GCGCC	2	10	981219	981228	0 %	0 %	40 %	60 %	344199128
628	NC_015942	CAAAG	2	10	983842	983851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
629	NC_015942	GCCTT	2	10	983939	983948	0 %	40 %	20 %	40 %	344199132
630	NC_015942	CCGTT	2	10	985894	985903	0 %	40 %	20 %	40 %	344199133
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632	NC_015942	GCGGA	2	10	997091	997100	20 %	0 %	60 %	20 %	344199142
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