MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015942	CCGC	2	8	1265	1272	0 %	0 %	25 %	75 %	344198244
2	NC_015942	ACCA	2	8	1444	1451	50 %	0 %	0 %	50 %	344198244
3	NC_015942	GATG	2	8	1551	1558	25 %	25 %	50 %	0 %	344198244
4	NC_015942	CCCG	2	8	2087	2094	0 %	0 %	25 %	75 %	344198245
5	NC_015942	CCAT	2	8	3103	3110	25 %	25 %	0 %	50 %	344198246
6	NC_015942	CTGC	2	8	3650	3657	0 %	25 %	25 %	50 %	344198246
7	NC_015942	GCAG	2	8	3824	3831	25 %	0 %	50 %	25 %	344198246
8	NC_015942	CCAT	2	8	4218	4225	25 %	25 %	0 %	50 %	344198247
9	NC_015942	GCTG	2	8	5248	5255	0 %	25 %	50 %	25 %	344198247
10	NC_015942	GGGT	2	8	5979	5986	0 %	25 %	75 %	0 %	344198247
11	NC_015942	GCGA	2	8	6150	6157	25 %	0 %	50 %	25 %	344198247
12	NC_015942	GAGT	2	8	7495	7502	25 %	25 %	50 %	0 %	344198249
13	NC_015942	CTGG	2	8	7693	7700	0 %	25 %	50 %	25 %	344198249
14	NC_015942	CCGT	2	8	8685	8692	0 %	25 %	25 %	50 %	344198249
15	NC_015942	CGCC	2	8	9285	9292	0 %	0 %	25 %	75 %	344198249
16	NC_015942	GCTG	2	8	9438	9445	0 %	25 %	50 %	25 %	344198249
17	NC_015942	GGAT	2	8	9861	9868	25 %	25 %	50 %	0 %	344198249
18	NC_015942	CCGG	2	8	9928	9935	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
19	NC_015942	GCGG	2	8	10228	10235	0 %	0 %	75 %	25 %	344198249
20	NC_015942	GATC	2	8	10651	10658	25 %	25 %	25 %	25 %	344198249
21	NC_015942	CCAG	2	8	10782	10789	25 %	0 %	25 %	50 %	344198249
22	NC_015942	CAGA	2	8	12469	12476	50 %	0 %	25 %	25 %	344198252
23	NC_015942	GCTG	2	8	13358	13365	0 %	25 %	50 %	25 %	344198254
24	NC_015942	CGGG	2	8	14021	14028	0 %	0 %	75 %	25 %	344198254
25	NC_015942	TGGT	2	8	14301	14308	0 %	50 %	50 %	0 %	344198254
26	NC_015942	TGGA	2	8	14413	14420	25 %	25 %	50 %	0 %	344198254
27	NC_015942	CGAT	2	8	16032	16039	25 %	25 %	25 %	25 %	344198255
28	NC_015942	TCCA	2	8	16194	16201	25 %	25 %	0 %	50 %	344198255
29	NC_015942	ATGG	2	8	16670	16677	25 %	25 %	50 %	0 %	344198256
30	NC_015942	CCAG	2	8	17224	17231	25 %	0 %	25 %	50 %	344198256
31	NC_015942	GGGC	2	8	17763	17770	0 %	0 %	75 %	25 %	344198257
32	NC_015942	TGGA	2	8	18181	18188	25 %	25 %	50 %	0 %	344198257
33	NC_015942	ATGA	2	8	18521	18528	50 %	25 %	25 %	0 %	344198257
34	NC_015942	ACAA	2	8	18678	18685	75 %	0 %	0 %	25 %	344198258
35	NC_015942	GAAG	2	8	18865	18872	50 %	0 %	50 %	0 %	344198258
36	NC_015942	GGGC	2	8	19230	19237	0 %	0 %	75 %	25 %	344198259
37	NC_015942	CCTG	3	12	19442	19453	0 %	25 %	25 %	50 %	344198259
38	NC_015942	AAAG	2	8	19497	19504	75 %	0 %	25 %	0 %	344198259
39	NC_015942	CAGC	2	8	19594	19601	25 %	0 %	25 %	50 %	344198259
40	NC_015942	GCCT	2	8	20344	20351	0 %	25 %	25 %	50 %	344198260
41	NC_015942	CTGG	2	8	20500	20507	0 %	25 %	50 %	25 %	344198260
42	NC_015942	GCTG	2	8	20732	20739	0 %	25 %	50 %	25 %	344198260
43	NC_015942	GATG	2	8	21295	21302	25 %	25 %	50 %	0 %	344198260
44	NC_015942	GCAT	2	8	21425	21432	25 %	25 %	25 %	25 %	344198261
45	NC_015942	CAGT	2	8	21989	21996	25 %	25 %	25 %	25 %	344198262
46	NC_015942	GCCT	2	8	22351	22358	0 %	25 %	25 %	50 %	344198262
47	NC_015942	GCAG	2	8	22523	22530	25 %	0 %	50 %	25 %	344198262
48	NC_015942	GCGG	2	8	23558	23565	0 %	0 %	75 %	25 %	344198262
49	NC_015942	GGCT	2	8	24344	24351	0 %	25 %	50 %	25 %	344198263
50	NC_015942	TCGC	2	8	24544	24551	0 %	25 %	25 %	50 %	344198263
51	NC_015942	GGGT	2	8	24718	24725	0 %	25 %	75 %	0 %	344198263
52	NC_015942	GCAC	2	8	25252	25259	25 %	0 %	25 %	50 %	344198263
53	NC_015942	CCAG	2	8	25918	25925	25 %	0 %	25 %	50 %	344198264
54	NC_015942	GTGC	2	8	27172	27179	0 %	25 %	50 %	25 %	344198265
55	NC_015942	AAAC	2	8	27551	27558	75 %	0 %	0 %	25 %	344198265
56	NC_015942	CAAA	2	8	28214	28221	75 %	0 %	0 %	25 %	344198265
57	NC_015942	CAGG	2	8	28437	28444	25 %	0 %	50 %	25 %	344198265
58	NC_015942	GCGA	2	8	28609	28616	25 %	0 %	50 %	25 %	344198265
59	NC_015942	ATCC	2	8	28707	28714	25 %	25 %	0 %	50 %	344198266
60	NC_015942	ATTT	2	8	28940	28947	25 %	75 %	0 %	0 %	344198267
61	NC_015942	GGGT	2	8	29510	29517	0 %	25 %	75 %	0 %	344198267
62	NC_015942	GCCA	2	8	29847	29854	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
63	NC_015942	GACC	2	8	29878	29885	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
64	NC_015942	CGCA	2	8	29967	29974	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
65	NC_015942	GCCA	2	8	30252	30259	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
66	NC_015942	CCCG	2	8	30317	30324	0 %	0 %	25 %	75 %	344198267
67	NC_015942	CCAG	2	8	30376	30383	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
68	NC_015942	GCTG	2	8	30533	30540	0 %	25 %	50 %	25 %	344198267
69	NC_015942	AAAC	2	8	30550	30557	75 %	0 %	0 %	25 %	344198267
70	NC_015942	GGGC	2	8	31258	31265	0 %	0 %	75 %	25 %	344198267
71	NC_015942	TGAC	2	8	31737	31744	25 %	25 %	25 %	25 %	344198267
72	NC_015942	GAAC	2	8	32341	32348	50 %	0 %	25 %	25 %	344198267
73	NC_015942	CCGC	2	8	32542	32549	0 %	0 %	25 %	75 %	344198267
74	NC_015942	GGGT	2	8	32590	32597	0 %	25 %	75 %	0 %	344198267
75	NC_015942	TGCC	2	8	33515	33522	0 %	25 %	25 %	50 %	344198267
76	NC_015942	ATGC	2	8	34065	34072	25 %	25 %	25 %	25 %	344198267
77	NC_015942	GCAG	2	8	34168	34175	25 %	0 %	50 %	25 %	344198267
78	NC_015942	CTGA	2	8	34565	34572	25 %	25 %	25 %	25 %	344198267
79	NC_015942	CAGT	2	8	34873	34880	25 %	25 %	25 %	25 %	344198267
80	NC_015942	CAGC	2	8	35207	35214	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
81	NC_015942	GGCA	2	8	37000	37007	25 %	0 %	50 %	25 %	344198267
82	NC_015942	CAAT	2	8	37162	37169	50 %	25 %	0 %	25 %	344198267
83	NC_015942	TTGC	2	8	37232	37239	0 %	50 %	25 %	25 %	344198267
84	NC_015942	GCCA	2	8	37319	37326	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
85	NC_015942	CGCA	2	8	37376	37383	25 %	0 %	25 %	50 %	344198267
86	NC_015942	CCTG	2	8	38020	38027	0 %	25 %	25 %	50 %	344198269
87	NC_015942	TGCG	2	8	38305	38312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015942	CTGG	2	8	38350	38357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015942	TTCT	2	8	38819	38826	0 %	75 %	0 %	25 %	344198270
90	NC_015942	TCCG	2	8	38883	38890	0 %	25 %	25 %	50 %	344198270
91	NC_015942	GTTC	2	8	39357	39364	0 %	50 %	25 %	25 %	344198270
92	NC_015942	ACCC	2	8	39708	39715	25 %	0 %	0 %	75 %	344198270
93	NC_015942	GCTC	2	8	41100	41107	0 %	25 %	25 %	50 %	344198270
94	NC_015942	TATG	2	8	41381	41388	25 %	50 %	25 %	0 %	344198270
95	NC_015942	AGTA	2	8	41634	41641	50 %	25 %	25 %	0 %	344198270
96	NC_015942	GGAA	2	8	41922	41929	50 %	0 %	50 %	0 %	344198270
97	NC_015942	TTTG	2	8	41976	41983	0 %	75 %	25 %	0 %	344198270
98	NC_015942	GAAG	2	8	42169	42176	50 %	0 %	50 %	0 %	344198270
99	NC_015942	GCGT	2	8	42233	42240	0 %	25 %	50 %	25 %	344198270
100	NC_015942	CCAG	2	8	43193	43200	25 %	0 %	25 %	50 %	344198271
101	NC_015942	CCAG	2	8	43615	43622	25 %	0 %	25 %	50 %	344198272
102	NC_015942	AATC	2	8	43696	43703	50 %	25 %	0 %	25 %	344198272
103	NC_015942	GGCG	2	8	43726	43733	0 %	0 %	75 %	25 %	344198272
104	NC_015942	TCCG	2	8	43773	43780	0 %	25 %	25 %	50 %	344198272
105	NC_015942	GAGC	2	8	43960	43967	25 %	0 %	50 %	25 %	344198272
106	NC_015942	GCTC	2	8	44560	44567	0 %	25 %	25 %	50 %	344198273
107	NC_015942	CGCT	2	8	44680	44687	0 %	25 %	25 %	50 %	344198273
108	NC_015942	CCCG	2	8	45049	45056	0 %	0 %	25 %	75 %	344198273
109	NC_015942	AGCG	2	8	45666	45673	25 %	0 %	50 %	25 %	344198275
110	NC_015942	TGCG	2	8	45688	45695	0 %	25 %	50 %	25 %	344198275
111	NC_015942	CTCC	2	8	45951	45958	0 %	25 %	0 %	75 %	344198275
112	NC_015942	GCGG	2	8	46568	46575	0 %	0 %	75 %	25 %	344198275
113	NC_015942	CGCC	2	8	47602	47609	0 %	0 %	25 %	75 %	344198277
114	NC_015942	GCTG	2	8	47632	47639	0 %	25 %	50 %	25 %	344198277
115	NC_015942	TGGC	2	8	48068	48075	0 %	25 %	50 %	25 %	344198278
116	NC_015942	CACC	2	8	48212	48219	25 %	0 %	0 %	75 %	344198278
117	NC_015942	ATCC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	344198278
118	NC_015942	ATGG	2	8	48909	48916	25 %	25 %	50 %	0 %	344198278
119	NC_015942	GGGC	2	8	49423	49430	0 %	0 %	75 %	25 %	344198279
120	NC_015942	GCCT	2	8	49625	49632	0 %	25 %	25 %	50 %	344198279
121	NC_015942	CGCC	2	8	50086	50093	0 %	0 %	25 %	75 %	344198280
122	NC_015942	GCGG	2	8	50497	50504	0 %	0 %	75 %	25 %	344198280
123	NC_015942	CCGT	2	8	51011	51018	0 %	25 %	25 %	50 %	344198280
124	NC_015942	AAGG	2	8	51491	51498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015942	ATCA	2	8	51526	51533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015942	CTCG	2	8	51938	51945	0 %	25 %	25 %	50 %	344198281
127	NC_015942	CTGG	2	8	53063	53070	0 %	25 %	50 %	25 %	344198284
128	NC_015942	GCTT	2	8	53419	53426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015942	GGAG	2	8	53993	54000	25 %	0 %	75 %	0 %	344198285
130	NC_015942	TGAG	2	8	54192	54199	25 %	25 %	50 %	0 %	344198286
131	NC_015942	GTGG	2	8	54523	54530	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015942	ATCT	2	8	54569	54576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015942	TCGG	2	8	54838	54845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015942	GGCA	2	8	55032	55039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015942	GCGG	2	8	55044	55051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015942	TCGG	2	8	55120	55127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015942	GAGT	2	8	55269	55276	25 %	25 %	50 %	0 %	344198287
138	NC_015942	GGCA	2	8	56383	56390	25 %	0 %	50 %	25 %	344198288
139	NC_015942	TCCC	2	8	57448	57455	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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141	NC_015942	GGTG	2	8	58207	58214	0 %	25 %	75 %	0 %	344198290
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