MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015942	CTGA	2	8	215444	215451	25 %	25 %	25 %	25 %	344198435
502	NC_015942	GCAT	2	8	215964	215971	25 %	25 %	25 %	25 %	344198435
503	NC_015942	GATT	2	8	216255	216262	25 %	50 %	25 %	0 %	344198435
504	NC_015942	ATCC	2	8	216556	216563	25 %	25 %	0 %	50 %	344198435
505	NC_015942	GCCA	2	8	216747	216754	25 %	0 %	25 %	50 %	344198435
506	NC_015942	ACAG	2	8	216806	216813	50 %	0 %	25 %	25 %	344198435
507	NC_015942	CGGG	2	8	216931	216938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
508	NC_015942	ATAA	2	8	217047	217054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015942	GCCA	2	8	217154	217161	25 %	0 %	25 %	50 %	344198436
510	NC_015942	GGGT	2	8	217534	217541	0 %	25 %	75 %	0 %	344198436
511	NC_015942	ACAG	2	8	217554	217561	50 %	0 %	25 %	25 %	344198436
512	NC_015942	TTAC	2	8	217809	217816	25 %	50 %	0 %	25 %	344198436
513	NC_015942	ATCA	2	8	218980	218987	50 %	25 %	0 %	25 %	344198438
514	NC_015942	GCGG	2	8	219156	219163	0 %	0 %	75 %	25 %	344198438
515	NC_015942	TAAT	2	8	220510	220517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015942	GGGT	2	8	220687	220694	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015942	CCTG	2	8	220767	220774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_015942	TTCA	2	8	221073	221080	25 %	50 %	0 %	25 %	344198440
519	NC_015942	GTGG	2	8	223104	223111	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015942	CGAA	2	8	223587	223594	50 %	0 %	25 %	25 %	344198444
521	NC_015942	GTGC	2	8	223835	223842	0 %	25 %	50 %	25 %	344198445
522	NC_015942	GCTC	2	8	224006	224013	0 %	25 %	25 %	50 %	344198445
523	NC_015942	GCGA	2	8	224125	224132	25 %	0 %	50 %	25 %	344198445
524	NC_015942	TGCG	2	8	224188	224195	0 %	25 %	50 %	25 %	344198445
525	NC_015942	CACC	2	8	224492	224499	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
526	NC_015942	GTCT	2	8	225051	225058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_015942	AGCG	2	8	225564	225571	25 %	0 %	50 %	25 %	344198446
528	NC_015942	TTGT	2	8	225649	225656	0 %	75 %	25 %	0 %	344198446
529	NC_015942	TCAT	2	8	226034	226041	25 %	50 %	0 %	25 %	344198446
530	NC_015942	GCAA	2	8	226496	226503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_015942	CTGG	2	8	228387	228394	0 %	25 %	50 %	25 %	344198449
532	NC_015942	GCGT	2	8	229019	229026	0 %	25 %	50 %	25 %	344198449
533	NC_015942	GCGG	2	8	229209	229216	0 %	0 %	75 %	25 %	344198450
534	NC_015942	CAGC	2	8	229490	229497	25 %	0 %	25 %	50 %	344198450
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538	NC_015942	CGTC	2	8	232655	232662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015942	TCTG	2	8	232710	232717	0 %	50 %	25 %	25 %	344198454
540	NC_015942	GCGG	2	8	232958	232965	0 %	0 %	75 %	25 %	344198454
541	NC_015942	GCTG	2	8	234071	234078	0 %	25 %	50 %	25 %	344198454
542	NC_015942	TGGC	2	8	235298	235305	0 %	25 %	50 %	25 %	344198455
543	NC_015942	CTGT	2	8	235509	235516	0 %	50 %	25 %	25 %	344198455
544	NC_015942	GGCT	2	8	235782	235789	0 %	25 %	50 %	25 %	344198456
545	NC_015942	GCCG	2	8	235796	235803	0 %	0 %	50 %	50 %	344198456
546	NC_015942	GCAT	2	8	236877	236884	25 %	25 %	25 %	25 %	344198457
547	NC_015942	TGCC	2	8	237061	237068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
548	NC_015942	GTGG	2	8	237257	237264	0 %	25 %	75 %	0 %	344198458
549	NC_015942	TACT	2	8	237497	237504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015942	TGCC	2	8	238251	238258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_015942	GCAC	2	8	238732	238739	25 %	0 %	25 %	50 %	344198461
552	NC_015942	GCAC	2	8	238854	238861	25 %	0 %	25 %	50 %	344198462
553	NC_015942	GCCA	2	8	239403	239410	25 %	0 %	25 %	50 %	344198463
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559	NC_015942	GATG	2	8	240569	240576	25 %	25 %	50 %	0 %	344198463
560	NC_015942	CCGA	2	8	240601	240608	25 %	0 %	25 %	50 %	344198463
561	NC_015942	CGTC	2	8	240742	240749	0 %	25 %	25 %	50 %	344198463
562	NC_015942	GATC	2	8	241541	241548	25 %	25 %	25 %	25 %	344198463
563	NC_015942	GCGG	2	8	241596	241603	0 %	0 %	75 %	25 %	344198463
564	NC_015942	GGAC	2	8	241960	241967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_015942	GAAA	2	8	243024	243031	75 %	0 %	25 %	0 %	344198464
566	NC_015942	TTTA	2	8	243607	243614	25 %	75 %	0 %	0 %	344198465
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569	NC_015942	GGCG	2	8	244209	244216	0 %	0 %	75 %	25 %	344198466
570	NC_015942	CTGG	2	8	244338	244345	0 %	25 %	50 %	25 %	344198466
571	NC_015942	CGCA	2	8	244444	244451	25 %	0 %	25 %	50 %	344198466
572	NC_015942	ATTT	2	8	244611	244618	25 %	75 %	0 %	0 %	344198466
573	NC_015942	GACC	2	8	245719	245726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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576	NC_015942	CAGA	2	8	247384	247391	50 %	0 %	25 %	25 %	344198470
577	NC_015942	CCAA	2	8	248892	248899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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579	NC_015942	AGCA	2	8	249926	249933	50 %	0 %	25 %	25 %	344198471
580	NC_015942	CCAA	2	8	250073	250080	50 %	0 %	0 %	50 %	344198471
581	NC_015942	GCCA	2	8	250484	250491	25 %	0 %	25 %	50 %	344198472
582	NC_015942	GATG	2	8	250659	250666	25 %	25 %	50 %	0 %	344198472
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587	NC_015942	GCCA	2	8	252005	252012	25 %	0 %	25 %	50 %	344198473
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593	NC_015942	GCCA	2	8	255366	255373	25 %	0 %	25 %	50 %	344198474
594	NC_015942	CATT	2	8	255526	255533	25 %	50 %	0 %	25 %	344198474
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600	NC_015942	GCGG	2	8	258481	258488	0 %	0 %	75 %	25 %	344198477
601	NC_015942	GATA	2	8	259070	259077	50 %	25 %	25 %	0 %	344198478
602	NC_015942	GCGG	2	8	259095	259102	0 %	0 %	75 %	25 %	344198478
603	NC_015942	CATC	2	8	259532	259539	25 %	25 %	0 %	50 %	344198478
604	NC_015942	CCCG	2	8	259870	259877	0 %	0 %	25 %	75 %	344198478
605	NC_015942	TCCC	2	8	260465	260472	0 %	25 %	0 %	75 %	344198479
606	NC_015942	CAGC	3	12	261178	261189	25 %	0 %	25 %	50 %	344198479
607	NC_015942	GCCC	2	8	261421	261428	0 %	0 %	25 %	75 %	344198479
608	NC_015942	GAAA	2	8	262159	262166	75 %	0 %	25 %	0 %	344198480
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610	NC_015942	GGGC	2	8	264120	264127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
611	NC_015942	GCCT	2	8	264668	264675	0 %	25 %	25 %	50 %	344198482
612	NC_015942	TCTT	2	8	264859	264866	0 %	75 %	0 %	25 %	344198482
613	NC_015942	ATTG	2	8	265288	265295	25 %	50 %	25 %	0 %	344198482
614	NC_015942	CTGG	2	8	265571	265578	0 %	25 %	50 %	25 %	344198483
615	NC_015942	CCGT	2	8	265950	265957	0 %	25 %	25 %	50 %	344198483
616	NC_015942	GGAT	2	8	266878	266885	25 %	25 %	50 %	0 %	344198483
617	NC_015942	AGGC	2	8	267264	267271	25 %	0 %	50 %	25 %	344198483
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619	NC_015942	GCGG	2	8	268284	268291	0 %	0 %	75 %	25 %	344198483
620	NC_015942	GCCT	2	8	268509	268516	0 %	25 %	25 %	50 %	344198483
621	NC_015942	GGAA	2	8	269127	269134	50 %	0 %	50 %	0 %	344198484
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623	NC_015942	CACG	2	8	269558	269565	25 %	0 %	25 %	50 %	344198484
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625	NC_015942	AGGT	2	8	270297	270304	25 %	25 %	50 %	0 %	344198485
626	NC_015942	TGCT	2	8	271338	271345	0 %	50 %	25 %	25 %	344198485
627	NC_015942	GAAG	2	8	271572	271579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015942	GCAG	2	8	272265	272272	25 %	0 %	50 %	25 %	344198486
629	NC_015942	CAGC	2	8	272853	272860	25 %	0 %	25 %	50 %	344198487
630	NC_015942	TGAG	2	8	272987	272994	25 %	25 %	50 %	0 %	344198487
631	NC_015942	GGCT	2	8	273976	273983	0 %	25 %	50 %	25 %	344198488
632	NC_015942	CAGA	2	8	274155	274162	50 %	0 %	25 %	25 %	344198488
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