MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 1728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015873	TTCGT	2	10	77	86	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015873	CAGGG	2	10	930	939	20 %	0 %	60 %	20 %	348025248
3	NC_015873	CGAAG	2	10	3829	3838	40 %	0 %	40 %	20 %	348025250
4	NC_015873	AGTAA	2	10	3979	3988	60 %	20 %	20 %	0 %	348025251
5	NC_015873	GGCCC	2	10	7519	7528	0 %	0 %	40 %	60 %	348025254
6	NC_015873	GGAAT	2	10	8933	8942	40 %	20 %	40 %	0 %	348025255
7	NC_015873	GGCTG	2	10	9745	9754	0 %	20 %	60 %	20 %	348025256
8	NC_015873	GCGCC	2	10	13405	13414	0 %	0 %	40 %	60 %	348025259
9	NC_015873	TGGCC	2	10	14109	14118	0 %	20 %	40 %	40 %	348025260
10	NC_015873	CCTTC	2	10	14442	14451	0 %	40 %	0 %	60 %	348025260
11	NC_015873	CGTCC	2	10	15976	15985	0 %	20 %	20 %	60 %	348025260
12	NC_015873	TACGG	2	10	17413	17422	20 %	20 %	40 %	20 %	348025260
13	NC_015873	GTACA	2	10	17733	17742	40 %	20 %	20 %	20 %	348025261
14	NC_015873	TCTAT	2	10	19155	19164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015873	AGGCC	2	10	21078	21087	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015873	TCCAG	2	10	23254	23263	20 %	20 %	20 %	40 %	348025266
17	NC_015873	GCGCC	2	10	24468	24477	0 %	0 %	40 %	60 %	348025268
18	NC_015873	CGGCC	2	10	25595	25604	0 %	0 %	40 %	60 %	348025269
19	NC_015873	GTCAT	2	10	26479	26488	20 %	40 %	20 %	20 %	348025270
20	NC_015873	CCGGC	2	10	28010	28019	0 %	0 %	40 %	60 %	348025271
21	NC_015873	ACCAG	2	10	29044	29053	40 %	0 %	20 %	40 %	348025271
22	NC_015873	CCCGT	2	10	29064	29073	0 %	20 %	20 %	60 %	348025271
23	NC_015873	AGACG	2	10	30872	30881	40 %	0 %	40 %	20 %	348025274
24	NC_015873	CGATA	2	10	31380	31389	40 %	20 %	20 %	20 %	348025274
25	NC_015873	TTCTT	2	10	32297	32306	0 %	80 %	0 %	20 %	348025275
26	NC_015873	CGTTC	2	10	36279	36288	0 %	40 %	20 %	40 %	348025275
27	NC_015873	GCTGC	2	10	36489	36498	0 %	20 %	40 %	40 %	348025275
28	NC_015873	CTTTT	2	10	38393	38402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015873	GCCCG	2	10	39229	39238	0 %	0 %	40 %	60 %	348025278
30	NC_015873	TCTTT	2	10	39845	39854	0 %	80 %	0 %	20 %	348025278
31	NC_015873	CCTGC	2	10	41066	41075	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015873	GGACA	2	10	42238	42247	40 %	0 %	40 %	20 %	348025279
33	NC_015873	ATCAT	2	10	46053	46062	40 %	40 %	0 %	20 %	348025283
34	NC_015873	AAAGT	2	10	46065	46074	60 %	20 %	20 %	0 %	348025283
35	NC_015873	AATAA	2	10	49708	49717	80 %	20 %	0 %	0 %	348025287
36	NC_015873	ATTTT	2	10	51548	51557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015873	GCTAA	2	10	54654	54663	40 %	20 %	20 %	20 %	348025291
38	NC_015873	AGAAA	2	10	55166	55175	80 %	0 %	20 %	0 %	348025291
39	NC_015873	GTACA	2	10	55464	55473	40 %	20 %	20 %	20 %	348025291
40	NC_015873	GGGCA	2	10	57073	57082	20 %	0 %	60 %	20 %	348025293
41	NC_015873	AATTT	2	10	61695	61704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015873	AAATA	2	10	62158	62167	80 %	20 %	0 %	0 %	348025297
43	NC_015873	CTTTT	2	10	62568	62577	0 %	80 %	0 %	20 %	348025297
44	NC_015873	TTTTC	2	10	62582	62591	0 %	80 %	0 %	20 %	348025297
45	NC_015873	AAACA	2	10	63040	63049	80 %	0 %	0 %	20 %	348025297
46	NC_015873	CTTTC	2	10	63318	63327	0 %	60 %	0 %	40 %	348025297
47	NC_015873	TTTTC	2	10	63332	63341	0 %	80 %	0 %	20 %	348025297
48	NC_015873	GGGCC	2	10	63646	63655	0 %	0 %	60 %	40 %	348025298
49	NC_015873	ACATT	2	10	64889	64898	40 %	40 %	0 %	20 %	348025298
50	NC_015873	TAAAG	2	10	69002	69011	60 %	20 %	20 %	0 %	348025300
51	NC_015873	AATAT	2	10	69356	69365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015873	CATTG	2	10	69824	69833	20 %	40 %	20 %	20 %	348025301
53	NC_015873	GAAAA	2	10	72965	72974	80 %	0 %	20 %	0 %	348025302
54	NC_015873	TCCAT	2	10	73748	73757	20 %	40 %	0 %	40 %	348025303
55	NC_015873	GGTAA	2	10	75328	75337	40 %	20 %	40 %	0 %	348025303
56	NC_015873	TTCCC	2	10	77001	77010	0 %	40 %	0 %	60 %	348025304
57	NC_015873	GCCAG	2	10	77208	77217	20 %	0 %	40 %	40 %	348025304
58	NC_015873	ATACA	2	10	77299	77308	60 %	20 %	0 %	20 %	348025304
59	NC_015873	ATCGA	2	10	78408	78417	40 %	20 %	20 %	20 %	348025305
60	NC_015873	CTTTC	2	10	78564	78573	0 %	60 %	0 %	40 %	348025305
61	NC_015873	ATTCA	2	10	79123	79132	40 %	40 %	0 %	20 %	348025306
62	NC_015873	GCATG	2	10	80085	80094	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015873	GGCCG	2	10	81075	81084	0 %	0 %	60 %	40 %	348025308
64	NC_015873	CCCTT	2	10	82887	82896	0 %	40 %	0 %	60 %	348025310
65	NC_015873	ATCTT	2	10	82974	82983	20 %	60 %	0 %	20 %	348025310
66	NC_015873	CCGTG	2	10	83275	83284	0 %	20 %	40 %	40 %	348025310
67	NC_015873	ATACT	2	10	83638	83647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015873	TGGAC	2	10	86096	86105	20 %	20 %	40 %	20 %	348025312
69	NC_015873	CGGCG	2	10	86302	86311	0 %	0 %	60 %	40 %	348025312
70	NC_015873	TGGCC	2	10	88846	88855	0 %	20 %	40 %	40 %	348025315
71	NC_015873	TTCGA	2	10	88941	88950	20 %	40 %	20 %	20 %	348025315
72	NC_015873	TAATT	2	10	89378	89387	40 %	60 %	0 %	0 %	348025315
73	NC_015873	ATTAC	2	10	89917	89926	40 %	40 %	0 %	20 %	348025317
74	NC_015873	TGGCC	2	10	90202	90211	0 %	20 %	40 %	40 %	348025317
75	NC_015873	ATCTT	2	10	91183	91192	20 %	60 %	0 %	20 %	348025318
76	NC_015873	TTTTC	2	10	93515	93524	0 %	80 %	0 %	20 %	348025320
77	NC_015873	CCGTC	2	10	95170	95179	0 %	20 %	20 %	60 %	348025323
78	NC_015873	AGGCC	2	10	95521	95530	20 %	0 %	40 %	40 %	348025323
79	NC_015873	GGCTC	2	10	96499	96508	0 %	20 %	40 %	40 %	348025325
80	NC_015873	ATTAT	2	10	97274	97283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015873	GGGCA	2	10	97765	97774	20 %	0 %	60 %	20 %	348025326
82	NC_015873	GGAAT	2	10	100913	100922	40 %	20 %	40 %	0 %	348025330
83	NC_015873	CCCTT	2	10	101241	101250	0 %	40 %	0 %	60 %	348025330
84	NC_015873	CGAAA	2	10	101717	101726	60 %	0 %	20 %	20 %	348025331
85	NC_015873	GCGCG	2	10	106361	106370	0 %	0 %	60 %	40 %	348025336
86	NC_015873	ATGGC	2	10	107025	107034	20 %	20 %	40 %	20 %	348025336
87	NC_015873	CCGGC	2	10	108417	108426	0 %	0 %	40 %	60 %	348025337
88	NC_015873	TATTG	2	10	108970	108979	20 %	60 %	20 %	0 %	348025337
89	NC_015873	ATCGT	2	10	110625	110634	20 %	40 %	20 %	20 %	348025339
90	NC_015873	AGTAT	2	10	116557	116566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015873	TCCCA	2	10	121400	121409	20 %	20 %	0 %	60 %	348025349
92	NC_015873	TTCCT	2	10	121417	121426	0 %	60 %	0 %	40 %	348025350
93	NC_015873	CTTTA	2	10	123186	123195	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015873	TTTCA	2	10	125899	125908	20 %	60 %	0 %	20 %	348025354
95	NC_015873	GTTTC	2	10	128715	128724	0 %	60 %	20 %	20 %	348025357
96	NC_015873	CAGGC	2	10	130903	130912	20 %	0 %	40 %	40 %	348025358
97	NC_015873	TAATA	2	10	132844	132853	60 %	40 %	0 %	0 %	348025360
98	NC_015873	TTTTC	2	10	133276	133285	0 %	80 %	0 %	20 %	348025360
99	NC_015873	ATCAT	2	10	136701	136710	40 %	40 %	0 %	20 %	348025364
100	NC_015873	TCAGT	2	10	136839	136848	20 %	40 %	20 %	20 %	348025364
101	NC_015873	CCCGG	2	10	137440	137449	0 %	0 %	40 %	60 %	348025364
102	NC_015873	CTGCA	2	10	138007	138016	20 %	20 %	20 %	40 %	348025365
103	NC_015873	GGCCC	2	10	139430	139439	0 %	0 %	40 %	60 %	348025366
104	NC_015873	CCGTC	2	10	143299	143308	0 %	20 %	20 %	60 %	348025370
105	NC_015873	CTTAA	2	10	143490	143499	40 %	40 %	0 %	20 %	348025370
106	NC_015873	CGTCC	2	10	143653	143662	0 %	20 %	20 %	60 %	348025371
107	NC_015873	GCCCG	2	10	145195	145204	0 %	0 %	40 %	60 %	348025372
108	NC_015873	AATTT	2	10	147223	147232	40 %	60 %	0 %	0 %	348025374
109	NC_015873	ATTCA	2	10	147308	147317	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015873	TTATT	2	10	149670	149679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015873	TATTT	2	10	149717	149726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015873	CTTAT	2	10	151210	151219	20 %	60 %	0 %	20 %	348025379
113	NC_015873	TTCAT	2	10	151961	151970	20 %	60 %	0 %	20 %	348025379
114	NC_015873	GCCGC	2	10	152081	152090	0 %	0 %	40 %	60 %	348025379
115	NC_015873	CCGAA	2	10	154095	154104	40 %	0 %	20 %	40 %	348025381
116	NC_015873	TTCAA	2	10	156380	156389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015873	ATTTA	2	10	158515	158524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015873	GCACC	2	10	160586	160595	20 %	0 %	20 %	60 %	348025387
119	NC_015873	CCCCG	2	10	160625	160634	0 %	0 %	20 %	80 %	348025387
120	NC_015873	CAGGG	2	10	163732	163741	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015873	CTGTG	2	10	164461	164470	0 %	40 %	40 %	20 %	348025391
122	NC_015873	TGAAA	2	10	165102	165111	60 %	20 %	20 %	0 %	348025391
123	NC_015873	GCCTT	2	10	165604	165613	0 %	40 %	20 %	40 %	348025392
124	NC_015873	TAATT	2	10	169566	169575	40 %	60 %	0 %	0 %	348025397
125	NC_015873	CTGCG	2	10	172426	172435	0 %	20 %	40 %	40 %	348025402
126	NC_015873	CAGGT	2	10	173240	173249	20 %	20 %	40 %	20 %	348025402
127	NC_015873	GCTAA	2	10	174778	174787	40 %	20 %	20 %	20 %	348025403
128	NC_015873	AGAAA	2	10	175290	175299	80 %	0 %	20 %	0 %	348025403
129	NC_015873	GTACA	2	10	175588	175597	40 %	20 %	20 %	20 %	348025403
130	NC_015873	TTTCA	2	10	177108	177117	20 %	60 %	0 %	20 %	348025404
131	NC_015873	TGCGG	2	10	178014	178023	0 %	20 %	60 %	20 %	348025405
132	NC_015873	CGGCA	2	10	179612	179621	20 %	0 %	40 %	40 %	348025406
133	NC_015873	CATCC	2	10	181437	181446	20 %	20 %	0 %	60 %	348025408
134	NC_015873	GCCCG	2	10	184369	184378	0 %	0 %	40 %	60 %	348025411
135	NC_015873	CCCTT	2	10	185854	185863	0 %	40 %	0 %	60 %	348025412
136	NC_015873	CGGTT	2	10	188391	188400	0 %	40 %	40 %	20 %	348025414
137	NC_015873	GGCCT	2	10	189970	189979	0 %	20 %	40 %	40 %	348025415
138	NC_015873	TGGCC	2	10	195496	195505	0 %	20 %	40 %	40 %	348025417
139	NC_015873	GGAAC	2	10	196540	196549	40 %	0 %	40 %	20 %	348025417
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149	NC_015873	GGCCG	2	10	221269	221278	0 %	0 %	60 %	40 %	348025434
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249	NC_015873	GGGCC	2	10	371173	371182	0 %	0 %	60 %	40 %	348025568
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252	NC_015873	TCCTT	2	10	373607	373616	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
253	NC_015873	ATATT	2	10	373648	373657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_015873	CTGTC	2	10	377080	377089	0 %	40 %	20 %	40 %	348025573
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259	NC_015873	CTTTT	2	10	384954	384963	0 %	80 %	0 %	20 %	348025582
260	NC_015873	CATAC	2	10	385131	385140	40 %	20 %	0 %	40 %	348025582
261	NC_015873	ATATA	2	10	385920	385929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015873	AAAGC	2	10	389091	389100	60 %	0 %	20 %	20 %	348025586
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264	NC_015873	TGCCG	2	10	391391	391400	0 %	20 %	40 %	40 %	348025588
265	NC_015873	CAACG	2	10	392395	392404	40 %	0 %	20 %	40 %	348025588
266	NC_015873	TTTTA	2	10	392824	392833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_015873	GCCAG	2	10	591492	591501	20 %	0 %	40 %	40 %	348025754
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