MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 1728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015873	ATATT	2	10	2126936	2126945	40 %	60 %	0 %	0 %	348027166
1502	NC_015873	GGGTT	2	10	2128314	2128323	0 %	40 %	60 %	0 %	348027167
1503	NC_015873	CGTTA	2	10	2131902	2131911	20 %	40 %	20 %	20 %	348027172
1504	NC_015873	TCACC	2	10	2133569	2133578	20 %	20 %	0 %	60 %	348027173
1505	NC_015873	AAAAT	2	10	2133896	2133905	80 %	20 %	0 %	0 %	348027173
1506	NC_015873	AGATG	2	10	2135593	2135602	40 %	20 %	40 %	0 %	348027175
1507	NC_015873	AATTT	2	10	2137277	2137286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015873	TGTAT	2	10	2137341	2137350	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015873	AATCA	2	10	2137989	2137998	60 %	20 %	0 %	20 %	348027178
1510	NC_015873	CCTCA	2	10	2144525	2144534	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1511	NC_015873	TTGAA	2	10	2145104	2145113	40 %	40 %	20 %	0 %	348027191
1512	NC_015873	TGCCT	2	10	2145265	2145274	0 %	40 %	20 %	40 %	348027191
1513	NC_015873	AATTT	2	10	2147796	2147805	40 %	60 %	0 %	0 %	348027196
1514	NC_015873	GTAAT	2	10	2151320	2151329	40 %	40 %	20 %	0 %	348027200
1515	NC_015873	GATAC	2	10	2151333	2151342	40 %	20 %	20 %	20 %	348027200
1516	NC_015873	GAAAA	2	10	2151496	2151505	80 %	0 %	20 %	0 %	348027200
1517	NC_015873	GCTAC	2	10	2154669	2154678	20 %	20 %	20 %	40 %	348027205
1518	NC_015873	GCGCC	2	10	2156429	2156438	0 %	0 %	40 %	60 %	348027207
1519	NC_015873	CGTTC	2	10	2156452	2156461	0 %	40 %	20 %	40 %	348027207
1520	NC_015873	TTTCT	2	10	2157744	2157753	0 %	80 %	0 %	20 %	348027208
1521	NC_015873	GGACG	2	10	2159884	2159893	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_015873	CCGTA	2	10	2164432	2164441	20 %	20 %	20 %	40 %	348027210
1523	NC_015873	GCCAG	2	10	2166516	2166525	20 %	0 %	40 %	40 %	348027211
1524	NC_015873	CGGTA	2	10	2167219	2167228	20 %	20 %	40 %	20 %	348027212
1525	NC_015873	GTACT	2	10	2168826	2168835	20 %	40 %	20 %	20 %	348027212
1526	NC_015873	CCCAG	2	10	2171009	2171018	20 %	0 %	20 %	60 %	348027213
1527	NC_015873	GATTC	2	10	2171066	2171075	20 %	40 %	20 %	20 %	348027213
1528	NC_015873	GGCTT	2	10	2171918	2171927	0 %	40 %	40 %	20 %	348027214
1529	NC_015873	CCGGA	2	10	2172248	2172257	20 %	0 %	40 %	40 %	348027214
1530	NC_015873	GTCGA	2	10	2173381	2173390	20 %	20 %	40 %	20 %	348027215
1531	NC_015873	CAGTT	2	10	2173420	2173429	20 %	40 %	20 %	20 %	348027215
1532	NC_015873	CGCTT	2	10	2173655	2173664	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1533	NC_015873	ATCGT	2	10	2173692	2173701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1534	NC_015873	ATATA	2	10	2173742	2173751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015873	CTGGC	2	10	2174813	2174822	0 %	20 %	40 %	40 %	348027217
1536	NC_015873	CCGTC	2	10	2175752	2175761	0 %	20 %	20 %	60 %	348027218
1537	NC_015873	CCGTC	2	10	2177262	2177271	0 %	20 %	20 %	60 %	348027220
1538	NC_015873	TCATG	2	10	2177352	2177361	20 %	40 %	20 %	20 %	348027220
1539	NC_015873	TGGCC	2	10	2178036	2178045	0 %	20 %	40 %	40 %	348027220
1540	NC_015873	CGTTC	2	10	2178405	2178414	0 %	40 %	20 %	40 %	348027220
1541	NC_015873	TGATG	2	10	2182485	2182494	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015873	CGGCG	2	10	2182587	2182596	0 %	0 %	60 %	40 %	348027225
1543	NC_015873	GACGG	2	10	2182705	2182714	20 %	0 %	60 %	20 %	348027225
1544	NC_015873	GGCCG	2	10	2183371	2183380	0 %	0 %	60 %	40 %	348027225
1545	NC_015873	CGGTT	2	10	2184379	2184388	0 %	40 %	40 %	20 %	348027227
1546	NC_015873	TGGCC	2	10	2184980	2184989	0 %	20 %	40 %	40 %	348027227
1547	NC_015873	CCAGT	2	10	2188984	2188993	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1548	NC_015873	GACTG	2	10	2191814	2191823	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_015873	ATTTA	2	10	2193649	2193658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015873	TACAT	2	10	2196224	2196233	40 %	40 %	0 %	20 %	348027233
1551	NC_015873	AGGAT	2	10	2196606	2196615	40 %	20 %	40 %	0 %	348027233
1552	NC_015873	ATATT	2	10	2199684	2199693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015873	CTGTC	2	10	2201827	2201836	0 %	40 %	20 %	40 %	348027237
1554	NC_015873	TCGAA	2	10	2202889	2202898	40 %	20 %	20 %	20 %	348027237
1555	NC_015873	CACCT	2	10	2203080	2203089	20 %	20 %	0 %	60 %	348027237
1556	NC_015873	GGATT	2	10	2207099	2207108	20 %	40 %	40 %	0 %	348027242
1557	NC_015873	TTTGG	2	10	2207240	2207249	0 %	60 %	40 %	0 %	348027242
1558	NC_015873	CCCTT	2	10	2208407	2208416	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1559	NC_015873	ATTTG	2	10	2208769	2208778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015873	TTATT	2	10	2209789	2209798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015873	TATGA	2	10	2210840	2210849	40 %	40 %	20 %	0 %	348027245
1562	NC_015873	CTCAT	2	10	2211343	2211352	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1563	NC_015873	GGAAA	2	10	2212969	2212978	60 %	0 %	40 %	0 %	348027248
1564	NC_015873	ATTTC	2	10	2213619	2213628	20 %	60 %	0 %	20 %	348027248
1565	NC_015873	AGGCC	2	10	2214331	2214340	20 %	0 %	40 %	40 %	348027249
1566	NC_015873	TAAAA	2	10	2215977	2215986	80 %	20 %	0 %	0 %	348027251
1567	NC_015873	CCATA	2	10	2217613	2217622	40 %	20 %	0 %	40 %	348027253
1568	NC_015873	TTAAA	2	10	2218209	2218218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015873	CAGCG	2	10	2218279	2218288	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1570	NC_015873	TGTAA	2	10	2224281	2224290	40 %	40 %	20 %	0 %	348027259
1571	NC_015873	TCCGG	2	10	2226523	2226532	0 %	20 %	40 %	40 %	348027261
1572	NC_015873	TCACT	2	10	2226819	2226828	20 %	40 %	0 %	40 %	348027262
1573	NC_015873	CGTCG	2	10	2227603	2227612	0 %	20 %	40 %	40 %	348027262
1574	NC_015873	GTGCT	2	10	2227865	2227874	0 %	40 %	40 %	20 %	348027262
1575	NC_015873	TGCCA	2	10	2228290	2228299	20 %	20 %	20 %	40 %	348027263
1576	NC_015873	ATTCG	2	10	2231341	2231350	20 %	40 %	20 %	20 %	348027266
1577	NC_015873	TATAC	2	10	2233312	2233321	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1578	NC_015873	ACGGC	2	10	2233697	2233706	20 %	0 %	40 %	40 %	348027268
1579	NC_015873	CGAAT	2	10	2235447	2235456	40 %	20 %	20 %	20 %	348027269
1580	NC_015873	CGGCA	2	10	2238489	2238498	20 %	0 %	40 %	40 %	348027272
1581	NC_015873	AGGCC	2	10	2240514	2240523	20 %	0 %	40 %	40 %	348027273
1582	NC_015873	CCAGG	2	10	2241049	2241058	20 %	0 %	40 %	40 %	348027273
1583	NC_015873	TGACC	2	10	2241147	2241156	20 %	20 %	20 %	40 %	348027273
1584	NC_015873	GCATG	2	10	2241657	2241666	20 %	20 %	40 %	20 %	348027273
1585	NC_015873	TCTTT	2	10	2245316	2245325	0 %	80 %	0 %	20 %	348027276
1586	NC_015873	TGGCC	2	10	2246787	2246796	0 %	20 %	40 %	40 %	348027278
1587	NC_015873	CCTGC	2	10	2247492	2247501	0 %	20 %	20 %	60 %	348027279
1588	NC_015873	GTATC	2	10	2249708	2249717	20 %	40 %	20 %	20 %	348027280
1589	NC_015873	CGTTC	2	10	2250119	2250128	0 %	40 %	20 %	40 %	348027281
1590	NC_015873	TCCCC	2	10	2250729	2250738	0 %	20 %	0 %	80 %	348027281
1591	NC_015873	CCGGC	2	10	2259956	2259965	0 %	0 %	40 %	60 %	348027286
1592	NC_015873	GGAGC	2	10	2260881	2260890	20 %	0 %	60 %	20 %	348027287
1593	NC_015873	CCATT	2	10	2261105	2261114	20 %	40 %	0 %	40 %	348027287
1594	NC_015873	CCCTT	2	10	2261911	2261920	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1595	NC_015873	GGCTG	2	10	2262350	2262359	0 %	20 %	60 %	20 %	348027289
1596	NC_015873	TGTAT	2	10	2263362	2263371	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015873	AAAAT	2	10	2264078	2264087	80 %	20 %	0 %	0 %	348027290
1598	NC_015873	GGTCT	2	10	2264188	2264197	0 %	40 %	40 %	20 %	348027290
1599	NC_015873	ATTTT	2	10	2265200	2265209	20 %	80 %	0 %	0 %	348027291
1600	NC_015873	GTTTC	2	10	2267113	2267122	0 %	60 %	20 %	20 %	348027291
1601	NC_015873	TATCG	2	10	2267609	2267618	20 %	40 %	20 %	20 %	348027292
1602	NC_015873	TCGTT	2	10	2268343	2268352	0 %	60 %	20 %	20 %	348027292
1603	NC_015873	TTACC	2	10	2268982	2268991	20 %	40 %	0 %	40 %	348027292
1604	NC_015873	ACCGA	2	10	2272620	2272629	40 %	0 %	20 %	40 %	348027295
1605	NC_015873	GGACG	2	10	2273556	2273565	20 %	0 %	60 %	20 %	348027296
1606	NC_015873	TCCCC	2	10	2273690	2273699	0 %	20 %	0 %	80 %	348027296
1607	NC_015873	TATAA	2	10	2274127	2274136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015873	CTTCA	2	10	2275350	2275359	20 %	40 %	0 %	40 %	348027298
1609	NC_015873	AGGCC	2	10	2275630	2275639	20 %	0 %	40 %	40 %	348027299
1610	NC_015873	GCCGA	2	10	2276169	2276178	20 %	0 %	40 %	40 %	348027299
1611	NC_015873	GCCGA	2	10	2276776	2276785	20 %	0 %	40 %	40 %	348027300
1612	NC_015873	TGACC	2	10	2284845	2284854	20 %	20 %	20 %	40 %	348027309
1613	NC_015873	CGATG	2	10	2286109	2286118	20 %	20 %	40 %	20 %	348027310
1614	NC_015873	ATGCG	2	10	2287065	2287074	20 %	20 %	40 %	20 %	348027311
1615	NC_015873	GGCGA	2	10	2290821	2290830	20 %	0 %	60 %	20 %	348027315
1616	NC_015873	CAGGC	2	10	2291900	2291909	20 %	0 %	40 %	40 %	348027315
1617	NC_015873	GCCCG	2	10	2295281	2295290	0 %	0 %	40 %	60 %	348027318
1618	NC_015873	CCTGG	2	10	2297688	2297697	0 %	20 %	40 %	40 %	348027319
1619	NC_015873	GCAAT	2	10	2301508	2301517	40 %	20 %	20 %	20 %	348027322
1620	NC_015873	TTTTG	2	10	2301649	2301658	0 %	80 %	20 %	0 %	348027322
1621	NC_015873	ATAAA	2	10	2303936	2303945	80 %	20 %	0 %	0 %	348027324
1622	NC_015873	GCCGT	2	10	2304459	2304468	0 %	20 %	40 %	40 %	348027324
1623	NC_015873	CCATC	2	10	2305380	2305389	20 %	20 %	0 %	60 %	348027325
1624	NC_015873	CCTTC	2	10	2305421	2305430	0 %	40 %	0 %	60 %	348027325
1625	NC_015873	ATCAA	2	10	2305625	2305634	60 %	20 %	0 %	20 %	348027325
1626	NC_015873	AATTT	2	10	2307837	2307846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015873	TTCAT	2	10	2308102	2308111	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1628	NC_015873	TTCAT	2	10	2308473	2308482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_015873	AGTGC	2	10	2315682	2315691	20 %	20 %	40 %	20 %	348027335
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1633	NC_015873	TTCGC	2	10	2320995	2321004	0 %	40 %	20 %	40 %	348027340
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1719	NC_015873	TAAAT	2	10	2458211	2458220	60 %	40 %	0 %	0 %	348027459
1720	NC_015873	TTTAA	2	10	2462193	2462202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1721	NC_015873	CGATG	2	10	2464277	2464286	20 %	20 %	40 %	20 %	348027462
1722	NC_015873	GGCCC	2	10	2465006	2465015	0 %	0 %	40 %	60 %	348027462
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1725	NC_015873	TGCGG	2	10	2466308	2466317	0 %	20 %	60 %	20 %	348027463
1726	NC_015873	AAGGG	2	10	2467563	2467572	40 %	0 %	60 %	0 %	348027465
1727	NC_015873	AAGTC	2	10	2469952	2469961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1728	NC_015873	CACGA	2	10	2473490	2473499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.