MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	ATGG	2	8	559	566	25 %	25 %	50 %	0 %	340783626
2	NC_015851	GTTG	2	8	1378	1385	0 %	50 %	50 %	0 %	340783627
3	NC_015851	TGCC	2	8	1480	1487	0 %	25 %	25 %	50 %	340783627
4	NC_015851	AAAG	2	8	1736	1743	75 %	0 %	25 %	0 %	340783628
5	NC_015851	GCCT	2	8	2567	2574	0 %	25 %	25 %	50 %	340783629
6	NC_015851	TTTC	2	8	2645	2652	0 %	75 %	0 %	25 %	340783629
7	NC_015851	CTAT	2	8	3204	3211	25 %	50 %	0 %	25 %	340783629
8	NC_015851	TTGC	2	8	3238	3245	0 %	50 %	25 %	25 %	340783629
9	NC_015851	GAGC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	50 %	25 %	340783630
10	NC_015851	GCGG	2	8	4838	4845	0 %	0 %	75 %	25 %	340783630
11	NC_015851	AGAA	2	8	5092	5099	75 %	0 %	25 %	0 %	340783631
12	NC_015851	ATAG	2	8	6373	6380	50 %	25 %	25 %	0 %	340783632
13	NC_015851	TATC	2	8	6448	6455	25 %	50 %	0 %	25 %	340783632
14	NC_015851	ACGA	2	8	7229	7236	50 %	0 %	25 %	25 %	340783633
15	NC_015851	TGGG	2	8	7618	7625	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015851	AGGA	2	8	7660	7667	50 %	0 %	50 %	0 %	340783634
17	NC_015851	CGCC	2	8	8893	8900	0 %	0 %	25 %	75 %	340783634
18	NC_015851	TTTG	2	8	9188	9195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015851	TGCC	2	8	9382	9389	0 %	25 %	25 %	50 %	340783635
20	NC_015851	AGAA	2	8	9415	9422	75 %	0 %	25 %	0 %	340783635
21	NC_015851	GCCA	2	8	9868	9875	25 %	0 %	25 %	50 %	340783636
22	NC_015851	ACGA	2	8	10256	10263	50 %	0 %	25 %	25 %	340783637
23	NC_015851	CTGG	2	8	11071	11078	0 %	25 %	50 %	25 %	340783638
24	NC_015851	CGTC	2	8	11222	11229	0 %	25 %	25 %	50 %	340783638
25	NC_015851	TGGC	2	8	12076	12083	0 %	25 %	50 %	25 %	340783639
26	NC_015851	CCCA	2	8	12606	12613	25 %	0 %	0 %	75 %	340783639
27	NC_015851	CTGC	2	8	12722	12729	0 %	25 %	25 %	50 %	340783639
28	NC_015851	TCCG	2	8	12882	12889	0 %	25 %	25 %	50 %	340783639
29	NC_015851	CCAA	2	8	13059	13066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015851	ATTC	2	8	13444	13451	25 %	50 %	0 %	25 %	340783640
31	NC_015851	CCAA	2	8	14339	14346	50 %	0 %	0 %	50 %	340783641
32	NC_015851	GCGA	2	8	15453	15460	25 %	0 %	50 %	25 %	340783642
33	NC_015851	GGGT	2	8	15633	15640	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015851	AAGC	2	8	15745	15752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015851	TTTG	2	8	16594	16601	0 %	75 %	25 %	0 %	340783643
36	NC_015851	CTAC	2	8	17190	17197	25 %	25 %	0 %	50 %	340783643
37	NC_015851	TGGC	2	8	17272	17279	0 %	25 %	50 %	25 %	340783643
38	NC_015851	CTTT	2	8	18222	18229	0 %	75 %	0 %	25 %	340783643
39	NC_015851	CCAC	2	8	18384	18391	25 %	0 %	0 %	75 %	340783644
40	NC_015851	CGGC	2	8	18394	18401	0 %	0 %	50 %	50 %	340783644
41	NC_015851	CATC	2	8	18476	18483	25 %	25 %	0 %	50 %	340783644
42	NC_015851	TGCG	2	8	18500	18507	0 %	25 %	50 %	25 %	340783644
43	NC_015851	TGCT	2	8	18792	18799	0 %	50 %	25 %	25 %	340783644
44	NC_015851	TATT	2	8	19428	19435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015851	GGGA	2	8	19467	19474	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015851	GGCA	2	8	19804	19811	25 %	0 %	50 %	25 %	340783645
47	NC_015851	TTGC	2	8	20043	20050	0 %	50 %	25 %	25 %	340783645
48	NC_015851	ACGT	2	8	20734	20741	25 %	25 %	25 %	25 %	340783645
49	NC_015851	ACCA	2	8	20763	20770	50 %	0 %	0 %	50 %	340783645
50	NC_015851	GGAT	2	8	20860	20867	25 %	25 %	50 %	0 %	340783645
51	NC_015851	GCAG	2	8	20999	21006	25 %	0 %	50 %	25 %	340783645
52	NC_015851	TGCT	2	8	21011	21018	0 %	50 %	25 %	25 %	340783645
53	NC_015851	AGCA	2	8	21025	21032	50 %	0 %	25 %	25 %	340783645
54	NC_015851	TTGG	2	8	21688	21695	0 %	50 %	50 %	0 %	340783645
55	NC_015851	AAGG	2	8	21723	21730	50 %	0 %	50 %	0 %	340783645
56	NC_015851	ATGG	2	8	21864	21871	25 %	25 %	50 %	0 %	340783645
57	NC_015851	GCCC	2	8	21872	21879	0 %	0 %	25 %	75 %	340783645
58	NC_015851	GCTG	2	8	22556	22563	0 %	25 %	50 %	25 %	340783647
59	NC_015851	GGAG	2	8	22629	22636	25 %	0 %	75 %	0 %	340783647
60	NC_015851	CTGG	2	8	23538	23545	0 %	25 %	50 %	25 %	340783648
61	NC_015851	AGGC	2	8	24269	24276	25 %	0 %	50 %	25 %	340783649
62	NC_015851	AGAC	2	8	24341	24348	50 %	0 %	25 %	25 %	340783649
63	NC_015851	GCCT	2	8	25813	25820	0 %	25 %	25 %	50 %	340783650
64	NC_015851	ACGG	2	8	26163	26170	25 %	0 %	50 %	25 %	340783652
65	NC_015851	GTTG	2	8	26298	26305	0 %	50 %	50 %	0 %	340783652
66	NC_015851	AATC	2	8	26400	26407	50 %	25 %	0 %	25 %	340783652
67	NC_015851	TTGG	2	8	26473	26480	0 %	50 %	50 %	0 %	340783652
68	NC_015851	GGAG	2	8	26587	26594	25 %	0 %	75 %	0 %	340783652
69	NC_015851	ACGG	2	8	26705	26712	25 %	0 %	50 %	25 %	340783652
70	NC_015851	TCAT	2	8	27346	27353	25 %	50 %	0 %	25 %	340783652
71	NC_015851	AAGG	2	8	28533	28540	50 %	0 %	50 %	0 %	340783654
72	NC_015851	GGCA	2	8	29493	29500	25 %	0 %	50 %	25 %	340783654
73	NC_015851	TGGG	2	8	29805	29812	0 %	25 %	75 %	0 %	340783654
74	NC_015851	GTGC	2	8	29969	29976	0 %	25 %	50 %	25 %	340783654
75	NC_015851	ATAA	2	8	31044	31051	75 %	25 %	0 %	0 %	340783655
76	NC_015851	ACGA	2	8	31237	31244	50 %	0 %	25 %	25 %	340783656
77	NC_015851	GGGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	75 %	25 %	340783656
78	NC_015851	ATTC	2	8	31851	31858	25 %	50 %	0 %	25 %	340783656
79	NC_015851	CTGC	2	8	32048	32055	0 %	25 %	25 %	50 %	340783656
80	NC_015851	GTGC	2	8	32086	32093	0 %	25 %	50 %	25 %	340783656
81	NC_015851	AACC	2	8	33148	33155	50 %	0 %	0 %	50 %	340783657
82	NC_015851	CCCG	2	8	33187	33194	0 %	0 %	25 %	75 %	340783657
83	NC_015851	GATG	2	8	33879	33886	25 %	25 %	50 %	0 %	340783658
84	NC_015851	CCAT	2	8	34008	34015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015851	AGGA	2	8	34517	34524	50 %	0 %	50 %	0 %	340783659
86	NC_015851	CAGA	2	8	35147	35154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015851	ATCC	2	8	35665	35672	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015851	GCGG	2	8	36084	36091	0 %	0 %	75 %	25 %	340783661
89	NC_015851	TGCC	2	8	37734	37741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015851	CGGG	2	8	38449	38456	0 %	0 %	75 %	25 %	340783666
91	NC_015851	GATC	2	8	38458	38465	25 %	25 %	25 %	25 %	340783666
92	NC_015851	CCAG	2	8	38844	38851	25 %	0 %	25 %	50 %	340783667
93	NC_015851	CCAA	2	8	39151	39158	50 %	0 %	0 %	50 %	340783667
94	NC_015851	GCAG	2	8	39310	39317	25 %	0 %	50 %	25 %	340783668
95	NC_015851	TTGG	2	8	39396	39403	0 %	50 %	50 %	0 %	340783668
96	NC_015851	GCCA	2	8	40069	40076	25 %	0 %	25 %	50 %	340783670
97	NC_015851	CCAA	2	8	40727	40734	50 %	0 %	0 %	50 %	340783670
98	NC_015851	GGCG	2	8	41006	41013	0 %	0 %	75 %	25 %	340783671
99	NC_015851	CCTC	2	8	41448	41455	0 %	25 %	0 %	75 %	340783671
100	NC_015851	TCGA	2	8	41655	41662	25 %	25 %	25 %	25 %	340783671
101	NC_015851	TCTG	2	8	41686	41693	0 %	50 %	25 %	25 %	340783671
102	NC_015851	CGCC	2	8	42091	42098	0 %	0 %	25 %	75 %	340783671
103	NC_015851	CACG	2	8	42145	42152	25 %	0 %	25 %	50 %	340783671
104	NC_015851	CGGC	2	8	42198	42205	0 %	0 %	50 %	50 %	340783671
105	NC_015851	GACC	2	8	42277	42284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015851	TGCG	2	8	42499	42506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015851	TCAA	2	8	42636	42643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015851	GCTG	2	8	42778	42785	0 %	25 %	50 %	25 %	340783672
109	NC_015851	GGTT	2	8	43071	43078	0 %	50 %	50 %	0 %	340783672
110	NC_015851	GCGG	2	8	43103	43110	0 %	0 %	75 %	25 %	340783672
111	NC_015851	GCGG	2	8	43590	43597	0 %	0 %	75 %	25 %	340783673
112	NC_015851	TGCT	2	8	43769	43776	0 %	50 %	25 %	25 %	340783673
113	NC_015851	TCCC	2	8	43874	43881	0 %	25 %	0 %	75 %	340783673
114	NC_015851	CGAG	2	8	44369	44376	25 %	0 %	50 %	25 %	340783673
115	NC_015851	GGAT	2	8	44698	44705	25 %	25 %	50 %	0 %	340783673
116	NC_015851	GCGA	2	8	44857	44864	25 %	0 %	50 %	25 %	340783673
117	NC_015851	GCGG	2	8	45033	45040	0 %	0 %	75 %	25 %	340783673
118	NC_015851	CCGC	2	8	45122	45129	0 %	0 %	25 %	75 %	340783673
119	NC_015851	CGGG	2	8	45232	45239	0 %	0 %	75 %	25 %	340783673
120	NC_015851	CGCA	2	8	46518	46525	25 %	0 %	25 %	50 %	340783675
121	NC_015851	GCCG	2	8	46712	46719	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
122	NC_015851	CCGG	2	8	46919	46926	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
123	NC_015851	CAGC	2	8	47498	47505	25 %	0 %	25 %	50 %	340783675
124	NC_015851	GCGA	2	8	47975	47982	25 %	0 %	50 %	25 %	340783676
125	NC_015851	CCCA	2	8	48434	48441	25 %	0 %	0 %	75 %	340783676
126	NC_015851	TGCG	2	8	49242	49249	0 %	25 %	50 %	25 %	340783676
127	NC_015851	GCCG	2	8	49263	49270	0 %	0 %	50 %	50 %	340783676
128	NC_015851	CCTC	2	8	49521	49528	0 %	25 %	0 %	75 %	340783676
129	NC_015851	GATG	2	8	50441	50448	25 %	25 %	50 %	0 %	340783678
130	NC_015851	ATTC	2	8	50645	50652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015851	GATG	2	8	50686	50693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015851	AGCA	2	8	51158	51165	50 %	0 %	25 %	25 %	340783679
133	NC_015851	AACC	2	8	51206	51213	50 %	0 %	0 %	50 %	340783679
134	NC_015851	ATAA	2	8	51627	51634	75 %	25 %	0 %	0 %	340783679
135	NC_015851	ACTG	2	8	51957	51964	25 %	25 %	25 %	25 %	340783680
136	NC_015851	TATC	2	8	52446	52453	25 %	50 %	0 %	25 %	340783681
137	NC_015851	ATAC	2	8	53632	53639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015851	TGAG	2	8	53821	53828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015851	TTGG	2	8	54245	54252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015851	AGTC	2	8	54372	54379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015851	CAAA	2	8	54414	54421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015851	CAGT	2	8	54743	54750	25 %	25 %	25 %	25 %	340783684
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