MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015851	AGCG	2	8	199699	199706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_015851	ACGA	2	8	200076	200083	50 %	0 %	25 %	25 %	340783827
503	NC_015851	GGGC	2	8	200219	200226	0 %	0 %	75 %	25 %	340783827
504	NC_015851	ATTC	2	8	200690	200697	25 %	50 %	0 %	25 %	340783827
505	NC_015851	TGCA	2	8	203481	203488	25 %	25 %	25 %	25 %	340783830
506	NC_015851	TGCG	2	8	203714	203721	0 %	25 %	50 %	25 %	340783831
507	NC_015851	GCCA	2	8	203933	203940	25 %	0 %	25 %	50 %	340783832
508	NC_015851	TGTA	2	8	204187	204194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015851	TGGT	2	8	205568	205575	0 %	50 %	50 %	0 %	340783834
510	NC_015851	TGCT	2	8	205648	205655	0 %	50 %	25 %	25 %	340783834
511	NC_015851	AGAA	2	8	206361	206368	75 %	0 %	25 %	0 %	340783834
512	NC_015851	CGCA	2	8	206663	206670	25 %	0 %	25 %	50 %	340783834
513	NC_015851	GTCC	2	8	209334	209341	0 %	25 %	25 %	50 %	340783836
514	NC_015851	GCGG	2	8	209490	209497	0 %	0 %	75 %	25 %	340783836
515	NC_015851	ACCC	2	8	210292	210299	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
516	NC_015851	TGGA	2	8	211567	211574	25 %	25 %	50 %	0 %	340783837
517	NC_015851	AGGG	2	8	212060	212067	25 %	0 %	75 %	0 %	340783838
518	NC_015851	TTGA	2	8	212100	212107	25 %	50 %	25 %	0 %	340783838
519	NC_015851	GGTG	2	8	213075	213082	0 %	25 %	75 %	0 %	340783838
520	NC_015851	TGAT	2	8	213334	213341	25 %	50 %	25 %	0 %	340783838
521	NC_015851	TGGT	2	8	213757	213764	0 %	50 %	50 %	0 %	340783838
522	NC_015851	CGTT	2	8	214064	214071	0 %	50 %	25 %	25 %	340783838
523	NC_015851	CAGC	2	8	214569	214576	25 %	0 %	25 %	50 %	340783839
524	NC_015851	GCGG	2	8	214888	214895	0 %	0 %	75 %	25 %	340783839
525	NC_015851	TGCC	2	8	215061	215068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_015851	GCGG	2	8	215821	215828	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
527	NC_015851	CCGA	2	8	216086	216093	25 %	0 %	25 %	50 %	340783841
528	NC_015851	CTGG	2	8	216815	216822	0 %	25 %	50 %	25 %	340783842
529	NC_015851	CGTC	2	8	216966	216973	0 %	25 %	25 %	50 %	340783842
530	NC_015851	TGGC	2	8	217820	217827	0 %	25 %	50 %	25 %	340783843
531	NC_015851	CCCA	2	8	218350	218357	25 %	0 %	0 %	75 %	340783843
532	NC_015851	CTGC	2	8	218466	218473	0 %	25 %	25 %	50 %	340783843
533	NC_015851	TCCG	2	8	218626	218633	0 %	25 %	25 %	50 %	340783843
534	NC_015851	CCAA	2	8	218803	218810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_015851	CGCT	2	8	221369	221376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_015851	CCGC	2	8	221586	221593	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
537	NC_015851	TTGG	2	8	222026	222033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015851	CTGC	2	8	222630	222637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015851	ACGT	2	8	222818	222825	25 %	25 %	25 %	25 %	340783848
540	NC_015851	ATGG	2	8	223055	223062	25 %	25 %	50 %	0 %	340783848
541	NC_015851	GCTG	2	8	223471	223478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_015851	GGCT	2	8	223532	223539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_015851	TGCT	2	8	223671	223678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_015851	CTGC	2	8	223697	223704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015851	GCTC	2	8	223713	223720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_015851	ATGC	2	8	224018	224025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_015851	TGGC	2	8	224309	224316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015851	CCCT	2	8	224661	224668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
549	NC_015851	TGCG	2	8	224770	224777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015851	CAAG	2	8	224920	224927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_015851	TCGC	2	8	225416	225423	0 %	25 %	25 %	50 %	340783851
552	NC_015851	GAAT	2	8	225535	225542	50 %	25 %	25 %	0 %	340783851
553	NC_015851	GGCA	2	8	225716	225723	25 %	0 %	50 %	25 %	340783851
554	NC_015851	TCGT	2	8	226149	226156	0 %	50 %	25 %	25 %	340783851
555	NC_015851	TCCG	2	8	226503	226510	0 %	25 %	25 %	50 %	340783852
556	NC_015851	TCCG	2	8	226961	226968	0 %	25 %	25 %	50 %	340783852
557	NC_015851	TCGT	2	8	227681	227688	0 %	50 %	25 %	25 %	340783854
558	NC_015851	GGGC	2	8	228397	228404	0 %	0 %	75 %	25 %	340783854
559	NC_015851	CGAT	2	8	228614	228621	25 %	25 %	25 %	25 %	340783854
560	NC_015851	CTCG	2	8	228691	228698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_015851	TCTT	2	8	228787	228794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_015851	AGAA	2	8	229095	229102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015851	CCGC	2	8	229497	229504	0 %	0 %	25 %	75 %	340783855
564	NC_015851	TGCG	2	8	229553	229560	0 %	25 %	50 %	25 %	340783855
565	NC_015851	ATGA	2	8	229570	229577	50 %	25 %	25 %	0 %	340783855
566	NC_015851	GGCG	2	8	230063	230070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
567	NC_015851	GGAT	2	8	230113	230120	25 %	25 %	50 %	0 %	340783856
568	NC_015851	ATTT	2	8	230788	230795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015851	AAAT	2	8	230835	230842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015851	ACGA	2	8	231559	231566	50 %	0 %	25 %	25 %	340783859
571	NC_015851	GGGC	2	8	231702	231709	0 %	0 %	75 %	25 %	340783859
572	NC_015851	ATTC	2	8	232173	232180	25 %	50 %	0 %	25 %	340783859
573	NC_015851	CGGC	2	8	234094	234101	0 %	0 %	50 %	50 %	340783861
574	NC_015851	GATC	2	8	234187	234194	25 %	25 %	25 %	25 %	340783861
575	NC_015851	CGGG	2	8	235316	235323	0 %	0 %	75 %	25 %	340783863
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577	NC_015851	AGAA	2	8	236909	236916	75 %	0 %	25 %	0 %	340783865
578	NC_015851	CTAA	2	8	238209	238216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_015851	TTAA	2	8	238471	238478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015851	GTCC	2	8	238936	238943	0 %	25 %	25 %	50 %	340783866
581	NC_015851	TCGA	2	8	239487	239494	25 %	25 %	25 %	25 %	340783866
582	NC_015851	CGAA	3	12	240088	240099	50 %	0 %	25 %	25 %	340783867
583	NC_015851	GCAG	2	8	241271	241278	25 %	0 %	50 %	25 %	340783868
584	NC_015851	GGCG	2	8	242812	242819	0 %	0 %	75 %	25 %	340783871
585	NC_015851	CCTC	2	8	243254	243261	0 %	25 %	0 %	75 %	340783871
586	NC_015851	TCGA	2	8	243461	243468	25 %	25 %	25 %	25 %	340783871
587	NC_015851	TCTG	2	8	243492	243499	0 %	50 %	25 %	25 %	340783871
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589	NC_015851	CACG	2	8	243951	243958	25 %	0 %	25 %	50 %	340783871
590	NC_015851	CGGC	2	8	244004	244011	0 %	0 %	50 %	50 %	340783871
591	NC_015851	GACC	2	8	244083	244090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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593	NC_015851	TCGG	2	8	245318	245325	0 %	25 %	50 %	25 %	340783874
594	NC_015851	CTGC	2	8	245821	245828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015851	CCGC	2	8	246047	246054	0 %	0 %	25 %	75 %	340783875
596	NC_015851	AGGA	2	8	246157	246164	50 %	0 %	50 %	0 %	340783875
597	NC_015851	CCCG	2	8	246173	246180	0 %	0 %	25 %	75 %	340783875
598	NC_015851	TTGC	2	8	246807	246814	0 %	50 %	25 %	25 %	340783875
599	NC_015851	CATC	2	8	247489	247496	25 %	25 %	0 %	50 %	340783876
600	NC_015851	GCGA	2	8	247986	247993	25 %	0 %	50 %	25 %	340783877
601	NC_015851	TGCG	2	8	248215	248222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_015851	TCAA	2	8	248352	248359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_015851	GGCA	2	8	248398	248405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_015851	GCTG	2	8	248475	248482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_015851	GGTT	2	8	248768	248775	0 %	50 %	50 %	0 %	340783878
606	NC_015851	CGCC	2	8	249488	249495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
607	NC_015851	GCTA	2	8	249862	249869	25 %	25 %	25 %	25 %	340783879
608	NC_015851	GATA	2	8	250132	250139	50 %	25 %	25 %	0 %	340783879
609	NC_015851	AAGG	2	8	250862	250869	50 %	0 %	50 %	0 %	340783880
610	NC_015851	GGAA	2	8	250960	250967	50 %	0 %	50 %	0 %	340783880
611	NC_015851	CGAC	2	8	250986	250993	25 %	0 %	25 %	50 %	340783880

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