MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 3330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015851	CAC	2	6	76583	76588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783700
1002	NC_015851	CCA	2	6	76615	76620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783700
1003	NC_015851	GGC	2	6	76666	76671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783700
1004	NC_015851	ATC	2	6	76764	76769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783700
1005	NC_015851	ATG	2	6	76874	76879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783700
1006	NC_015851	CAT	2	6	76926	76931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015851	TTA	2	6	77077	77082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783701
1008	NC_015851	CGG	2	6	77114	77119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783701
1009	NC_015851	CTG	2	6	77228	77233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783701
1010	NC_015851	ATC	2	6	77235	77240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783701
1011	NC_015851	TGC	2	6	77354	77359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783701
1012	NC_015851	ACC	2	6	77372	77377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783701
1013	NC_015851	CGG	2	6	77442	77447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783701
1014	NC_015851	GGT	2	6	77528	77533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015851	TGT	2	6	77708	77713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015851	CGA	2	6	77857	77862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783702
1017	NC_015851	TGC	2	6	77902	77907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783702
1018	NC_015851	GGC	2	6	77909	77914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783702
1019	NC_015851	CGA	2	6	78031	78036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015851	CAA	2	6	78100	78105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015851	CTG	2	6	78117	78122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015851	GAA	2	6	78279	78284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015851	CTG	2	6	78328	78333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015851	TGA	2	6	78476	78481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015851	CAT	2	6	78499	78504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015851	TCA	2	6	78747	78752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783703
1027	NC_015851	GCA	2	6	78767	78772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783703
1028	NC_015851	TGG	2	6	78818	78823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015851	TCC	2	6	78847	78852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015851	TAG	2	6	78873	78878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015851	GAT	2	6	78889	78894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015851	ATA	2	6	78903	78908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015851	TGA	2	6	78982	78987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783704
1034	NC_015851	GCC	3	9	79272	79280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783704
1035	NC_015851	TGT	2	6	79333	79338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783704
1036	NC_015851	AAT	2	6	79380	79385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015851	CCT	2	6	79396	79401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015851	CGC	2	6	79512	79517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783705
1039	NC_015851	GGC	2	6	79626	79631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1040	NC_015851	AGC	2	6	79682	79687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783705
1041	NC_015851	CAC	2	6	79780	79785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783705
1042	NC_015851	GCG	2	6	79855	79860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1043	NC_015851	GCG	2	6	79900	79905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1044	NC_015851	AGG	2	6	79925	79930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783705
1045	NC_015851	CGG	2	6	79989	79994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1046	NC_015851	GCC	2	6	80005	80010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783705
1047	NC_015851	AGG	2	6	80072	80077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783705
1048	NC_015851	CAT	2	6	80101	80106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783705
1049	NC_015851	CCA	2	6	80119	80124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783705
1050	NC_015851	GCA	2	6	80136	80141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783705
1051	NC_015851	TCC	2	6	80197	80202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_015851	CCG	2	6	80273	80278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1053	NC_015851	CCG	2	6	80564	80569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1054	NC_015851	CGC	2	6	80592	80597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1055	NC_015851	CGC	2	6	80599	80604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1056	NC_015851	CAA	2	6	80626	80631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783706
1057	NC_015851	CAT	2	6	80713	80718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783706
1058	NC_015851	ACG	2	6	80724	80729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783706
1059	NC_015851	AAT	2	6	80927	80932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783706
1060	NC_015851	CAT	2	6	80941	80946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783706
1061	NC_015851	TCC	2	6	80950	80955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783706
1062	NC_015851	CAT	2	6	81010	81015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783706
1063	NC_015851	GCC	2	6	81099	81104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1064	NC_015851	GGC	2	6	81114	81119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1065	NC_015851	TCA	2	6	81128	81133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783707
1066	NC_015851	ATG	2	6	81160	81165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1067	NC_015851	GCA	2	6	81218	81223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1068	NC_015851	GCC	2	6	81284	81289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1069	NC_015851	GGA	2	6	81290	81295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783707
1070	NC_015851	CAC	2	6	81321	81326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1071	NC_015851	CCG	2	6	81335	81340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1072	NC_015851	CCG	2	6	81418	81423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1073	NC_015851	GAT	2	6	81450	81455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1074	NC_015851	CAG	2	6	81504	81509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1075	NC_015851	GGC	2	6	81543	81548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1076	NC_015851	CCT	2	6	81592	81597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1077	NC_015851	CGC	2	6	81621	81626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1078	NC_015851	GAC	2	6	81695	81700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1079	NC_015851	TGT	2	6	81701	81706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783707
1080	NC_015851	CCT	2	6	81727	81732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1081	NC_015851	GGT	2	6	81879	81884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1082	NC_015851	CGC	2	6	81893	81898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1083	NC_015851	ACG	2	6	81976	81981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1084	NC_015851	GCC	2	6	81990	81995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1085	NC_015851	CAC	2	6	82269	82274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1086	NC_015851	CTG	2	6	82380	82385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1087	NC_015851	GCC	2	6	82396	82401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1088	NC_015851	AGC	2	6	82444	82449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1089	NC_015851	GTA	2	6	82500	82505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1090	NC_015851	AGC	2	6	82519	82524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1091	NC_015851	GGA	2	6	82625	82630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783707
1092	NC_015851	GGC	4	12	82686	82697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1093	NC_015851	GCG	2	6	82724	82729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1094	NC_015851	CTC	2	6	82743	82748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1095	NC_015851	GCC	2	6	82749	82754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1096	NC_015851	GAT	3	9	82785	82793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1097	NC_015851	GAA	2	6	82800	82805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783707
1098	NC_015851	TCC	2	6	82822	82827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1099	NC_015851	GCC	3	9	82840	82848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1100	NC_015851	GCC	2	6	82944	82949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1101	NC_015851	ATG	2	6	82957	82962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1102	NC_015851	GGC	2	6	82998	83003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1103	NC_015851	CGA	2	6	83024	83029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1104	NC_015851	CCA	2	6	83033	83038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1105	NC_015851	CAG	2	6	83055	83060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1106	NC_015851	TTC	2	6	83094	83099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783707
1107	NC_015851	TGC	2	6	83126	83131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1108	NC_015851	GTG	2	6	83158	83163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1109	NC_015851	TGG	2	6	83221	83226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1110	NC_015851	GCC	2	6	83244	83249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1111	NC_015851	TCA	3	9	83255	83263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783707
1112	NC_015851	CAC	2	6	83274	83279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1113	NC_015851	CGT	2	6	83366	83371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1114	NC_015851	TCC	2	6	83392	83397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1115	NC_015851	CTC	2	6	83447	83452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1116	NC_015851	CCA	2	6	83459	83464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1117	NC_015851	GGC	2	6	83487	83492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1118	NC_015851	GGT	2	6	83525	83530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1119	NC_015851	GAG	2	6	83535	83540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783707
1120	NC_015851	CCA	3	9	83552	83560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1121	NC_015851	GGT	2	6	83652	83657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1122	NC_015851	CCG	2	6	83680	83685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
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1243	NC_015851	CCA	2	6	94871	94876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783716
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1485	NC_015851	GGA	2	6	116878	116883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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