MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 3330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015851	GCG	2	6	39216	39221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015851	ACA	2	6	39328	39333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783668
503	NC_015851	CCA	2	6	39347	39352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783668
504	NC_015851	CGC	2	6	39460	39465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783669
505	NC_015851	GCC	2	6	39470	39475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783669
506	NC_015851	TGT	2	6	39517	39522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783669
507	NC_015851	TGC	2	6	39581	39586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783669
508	NC_015851	GCA	2	6	39668	39673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783669
509	NC_015851	GGT	2	6	39716	39721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783669
510	NC_015851	GCG	2	6	39727	39732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783669
511	NC_015851	CTC	2	6	39765	39770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783669
512	NC_015851	GTG	2	6	39864	39869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783670
513	NC_015851	TCG	2	6	40003	40008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783670
514	NC_015851	GGC	2	6	40030	40035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783670
515	NC_015851	ACC	2	6	40084	40089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783670
516	NC_015851	ATC	2	6	40243	40248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783670
517	NC_015851	GGT	2	6	40254	40259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783670
518	NC_015851	CGG	2	6	40337	40342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783670
519	NC_015851	TCG	2	6	40345	40350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783670
520	NC_015851	CCA	2	6	40502	40507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783670
521	NC_015851	GCC	2	6	40639	40644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783670
522	NC_015851	GCC	2	6	40673	40678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783670
523	NC_015851	TCG	2	6	40742	40747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783670
524	NC_015851	CAC	2	6	40812	40817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783670
525	NC_015851	ACT	2	6	40895	40900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015851	TAA	2	6	40923	40928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783671
527	NC_015851	TCC	2	6	40997	41002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783671
528	NC_015851	TTC	2	6	41108	41113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783671
529	NC_015851	AGC	2	6	41141	41146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783671
530	NC_015851	GCC	3	9	41149	41157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783671
531	NC_015851	CTC	2	6	41243	41248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783671
532	NC_015851	CGA	2	6	41257	41262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783671
533	NC_015851	GTC	2	6	41268	41273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783671
534	NC_015851	GCC	2	6	41347	41352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783671
535	NC_015851	TGG	2	6	41355	41360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783671
536	NC_015851	GGC	2	6	41398	41403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783671
537	NC_015851	TCC	2	6	41421	41426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783671
538	NC_015851	GCA	2	6	41439	41444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783671
539	NC_015851	GGT	2	6	41456	41461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783671
540	NC_015851	CGC	2	6	41672	41677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783671
541	NC_015851	AGC	2	6	41751	41756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783671
542	NC_015851	GTT	2	6	41797	41802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783671
543	NC_015851	CGA	2	6	41839	41844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783671
544	NC_015851	GAA	2	6	41851	41856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783671
545	NC_015851	TGT	2	6	41865	41870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783671
546	NC_015851	TGG	3	9	42045	42053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783671
547	NC_015851	ACC	2	6	42110	42115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783671
548	NC_015851	GGA	2	6	42318	42323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015851	AGC	2	6	42349	42354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015851	TGC	2	6	42372	42377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015851	TCA	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783672
552	NC_015851	CAT	2	6	42722	42727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783672
553	NC_015851	TTG	2	6	42753	42758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783672
554	NC_015851	CCG	2	6	43027	43032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783672
555	NC_015851	CGG	2	6	43085	43090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783672
556	NC_015851	GAG	2	6	43215	43220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783672
557	NC_015851	GCT	2	6	43281	43286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015851	TGG	2	6	43315	43320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015851	GAA	2	6	43483	43488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783673
560	NC_015851	CGC	2	6	43510	43515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
561	NC_015851	CCG	2	6	43559	43564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
562	NC_015851	CGC	2	6	43644	43649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
563	NC_015851	CTG	2	6	43678	43683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
564	NC_015851	CGC	2	6	43706	43711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
565	NC_015851	TGG	2	6	43712	43717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783673
566	NC_015851	TGG	2	6	43790	43795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783673
567	NC_015851	TGG	2	6	43826	43831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783673
568	NC_015851	GTG	2	6	43959	43964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783673
569	NC_015851	GAC	2	6	44056	44061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783673
570	NC_015851	CTG	2	6	44074	44079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
571	NC_015851	TCG	4	12	44135	44146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
572	NC_015851	CGA	3	9	44229	44237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783673
573	NC_015851	ACG	2	6	44390	44395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783673
574	NC_015851	GCG	2	6	44419	44424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783673
575	NC_015851	TCG	2	6	44489	44494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
576	NC_015851	CGG	2	6	44509	44514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783673
577	NC_015851	CCA	2	6	44522	44527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783673
578	NC_015851	ACC	2	6	44549	44554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783673
579	NC_015851	CTG	2	6	44578	44583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
580	NC_015851	CTT	2	6	44622	44627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783673
581	NC_015851	GAC	2	6	44686	44691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783673
582	NC_015851	AGG	2	6	44846	44851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783673
583	NC_015851	GCC	2	6	44947	44952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
584	NC_015851	GGA	2	6	45282	45287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783673
585	NC_015851	GCG	2	6	45288	45293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783673
586	NC_015851	CTG	2	6	45337	45342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
587	NC_015851	CGC	2	6	45389	45394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
588	NC_015851	GCG	2	6	45407	45412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783673
589	NC_015851	CCG	2	6	45526	45531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_015851	GCC	2	6	45575	45580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_015851	TTC	2	6	45660	45665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015851	TCA	2	6	45720	45725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783674
593	NC_015851	GTG	2	6	45762	45767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783674
594	NC_015851	GCC	2	6	45809	45814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783674
595	NC_015851	TCG	2	6	45837	45842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783674
596	NC_015851	GGC	2	6	45852	45857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783674
597	NC_015851	TCA	2	6	45927	45932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783674
598	NC_015851	CAG	2	6	46079	46084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783674
599	NC_015851	TGG	2	6	46150	46155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783674
600	NC_015851	ACG	2	6	46208	46213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783674
601	NC_015851	ACG	2	6	46244	46249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783674
602	NC_015851	AAC	2	6	46476	46481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783675
603	NC_015851	ACG	2	6	46734	46739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783675
604	NC_015851	GTG	2	6	46803	46808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783675
605	NC_015851	GGC	2	6	46874	46879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783675
606	NC_015851	GTG	2	6	46959	46964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783675
607	NC_015851	CAT	2	6	47012	47017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783675
608	NC_015851	GCC	2	6	47046	47051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
609	NC_015851	TCG	2	6	47085	47090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783675
610	NC_015851	ATC	2	6	47142	47147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783675
611	NC_015851	CGC	2	6	47189	47194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
612	NC_015851	GGC	2	6	47214	47219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783675
613	NC_015851	TTG	2	6	47280	47285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783675
614	NC_015851	CGC	2	6	47297	47302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
615	NC_015851	GCC	2	6	47355	47360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
616	NC_015851	GCC	2	6	47391	47396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
617	NC_015851	GCC	2	6	47409	47414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
618	NC_015851	AGC	2	6	47542	47547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783675
619	NC_015851	TGC	2	6	47658	47663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783676
620	NC_015851	GCC	2	6	47804	47809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
621	NC_015851	GCA	2	6	47857	47862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
622	NC_015851	GAT	2	6	47893	47898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783676
623	NC_015851	CGG	2	6	47934	47939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
624	NC_015851	CAG	2	6	48179	48184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
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626	NC_015851	GCG	2	6	48233	48238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
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