MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015850	ATAC	2	8	6192	6199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015850	GGCG	2	8	23452	23459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015850	GCCT	2	8	35885	35892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015850	ATGA	2	8	41894	41901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015850	GAGG	2	8	57865	57872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015850	TGCC	2	8	67073	67080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015850	CCCT	2	8	86166	86173	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_015850	GTGC	2	8	96138	96145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015850	CTTT	2	8	96607	96614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015850	TGAT	2	8	96684	96691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015850	CGCC	2	8	96773	96780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_015850	TTGA	2	8	98283	98290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015850	GACG	2	8	99652	99659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015850	ATGG	2	8	100102	100109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015850	GACT	2	8	100318	100325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015850	AGCG	2	8	107822	107829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015850	ACCT	2	8	107982	107989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015850	CCCA	2	8	108186	108193	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_015850	GCAT	2	8	114413	114420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015850	GTGC	2	8	114513	114520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015850	TCCA	2	8	114631	114638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015850	AGCC	2	8	114979	114986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015850	CTAC	2	8	115024	115031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015850	GCAG	2	8	115135	115142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015850	GCAT	2	8	117071	117078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015850	CTGG	2	8	117215	117222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015850	CTGA	2	8	117257	117264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015850	CGAC	2	8	119066	119073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015850	CAAT	2	8	119099	119106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015850	GAAA	2	8	119193	119200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015850	CAGT	2	8	122938	122945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015850	GCTT	2	8	123135	123142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015850	CCCA	2	8	123189	123196	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015850	CGCC	2	8	124752	124759	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_015850	TGGG	2	8	126032	126039	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015850	GTGC	2	8	126667	126674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015850	TTGG	2	8	126918	126925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015850	GCCG	2	8	128136	128143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015850	CCCT	2	8	128169	128176	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_015850	GCTC	2	8	128455	128462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015850	CTAC	2	8	128666	128673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015850	CTGG	2	8	128829	128836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015850	ACTC	2	8	129725	129732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015850	CTTG	2	8	134522	134529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015850	CGCA	2	8	134672	134679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015850	TGCT	2	8	134789	134796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015850	AATC	2	8	135940	135947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015850	GCCT	2	8	136201	136208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015850	ATCG	2	8	138052	138059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015850	GAAA	2	8	140079	140086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015850	AGAA	2	8	140907	140914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015850	CAAG	2	8	140930	140937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015850	CTTT	2	8	146259	146266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015850	GGCA	2	8	150273	150280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015850	CGCA	2	8	154438	154445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015850	GCAT	2	8	154738	154745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015850	ACTG	2	8	156716	156723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015850	AAAT	2	8	157117	157124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015850	TCTT	2	8	157893	157900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015850	CCAA	2	8	157905	157912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015850	GGTC	2	8	161236	161243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015850	GGCT	2	8	161871	161878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015850	GCCG	2	8	163897	163904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015850	GGGA	2	8	168418	168425	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015850	GCCC	2	8	171362	171369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015850	ATTG	2	8	175863	175870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015850	TGCG	2	8	177744	177751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015850	GAGG	2	8	179105	179112	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015850	AAGA	2	8	179152	179159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015850	AGCG	2	8	180181	180188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015850	GAGG	2	8	180320	180327	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015850	CCCA	2	8	185323	185330	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_015850	CAAT	2	8	185519	185526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015850	AATA	2	8	185585	185592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015850	AGGG	2	8	190740	190747	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015850	TGCC	2	8	192866	192873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015850	AGCC	2	8	194501	194508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015850	TAGT	2	8	194514	194521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015850	CCGG	2	8	195321	195328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015850	CAAC	2	8	197878	197885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015850	CGTT	2	8	203556	203563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015850	GACA	2	8	212431	212438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015850	CCTG	2	8	212791	212798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015850	GCAC	2	8	212814	212821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015850	CCTA	2	8	221996	222003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015850	TGAG	2	8	222078	222085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015850	TACA	2	8	223939	223946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015850	AGCA	2	8	231879	231886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015850	CTGA	2	8	232341	232348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015850	CTGC	2	8	232383	232390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015850	GTAG	2	8	232925	232932	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015850	CATG	2	8	236440	236447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015850	TCCT	2	8	240769	240776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015850	GGAG	2	8	241820	241827	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015850	GGAG	2	8	257447	257454	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015850	AGGG	2	8	261225	261232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015850	ACCT	2	8	267901	267908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015850	AGGG	2	8	293110	293117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015850	GATC	2	8	304986	304993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015850	AACC	2	8	313116	313123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015850	GTCG	2	8	322641	322648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015850	CGGG	2	8	324774	324781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015850	TGGG	2	8	347719	347726	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015850	TTCC	2	8	351660	351667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015850	GGGA	2	8	358699	358706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015850	GGAT	2	8	393414	393421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015850	GGAC	2	8	416658	416665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015850	GGAG	2	8	424238	424245	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015850	CTCC	2	8	424303	424310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015850	GGGC	2	8	424478	424485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015850	CTAG	2	8	431651	431658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015850	GATT	2	8	437029	437036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015850	ATTC	2	8	439393	439400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015850	AACA	2	8	450880	450887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015850	GCGG	2	8	450917	450924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015850	CCCG	2	8	459272	459279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_015850	GGCG	2	8	472928	472935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015850	CCCG	2	8	484657	484664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_015850	TGGG	2	8	487614	487621	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015850	CGGG	2	8	488985	488992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015850	TATC	2	8	489028	489035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015850	TTCA	2	8	498420	498427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015850	TTGT	2	8	498555	498562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015850	AGTC	2	8	498674	498681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015850	GCCA	2	8	514627	514634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015850	TGCC	2	8	516656	516663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015850	TATC	2	8	517376	517383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015850	CCTG	2	8	517823	517830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015850	ATTG	2	8	518085	518092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015850	AGAT	2	8	518395	518402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015850	CCTG	2	8	523275	523282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015850	TCGG	2	8	529259	529266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015850	ATCC	2	8	529470	529477	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015850	GCTT	2	8	534729	534736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015850	CGGA	2	8	546905	546912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015850	TCAT	2	8	547002	547009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015850	GCCC	2	8	548718	548725	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_015850	CCGT	2	8	554412	554419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015850	TGGT	2	8	555742	555749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015850	GGCA	2	8	558145	558152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015850	CCAA	2	8	558198	558205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015850	CAAG	2	8	559267	559274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015850	ATCT	2	8	559296	559303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015850	GCCA	2	8	559423	559430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015850	CATA	2	8	561182	561189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015850	AGAA	2	8	563163	563170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015850	CAAG	2	8	567223	567230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015850	CTTC	2	8	568747	568754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015850	GTAA	2	8	570186	570193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015850	AATA	2	8	571617	571624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_015850	TACG	2	8	1623149	1623156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_015850	TCAG	2	8	1628828	1628835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_015850	GTAT	2	8	1630930	1630937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_015850	ATGG	2	8	1638170	1638177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015850	GTCC	2	8	1638402	1638409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_015850	ATTA	2	8	1648417	1648424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_015850	TGCC	2	8	1649455	1649462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_015850	CGTG	2	8	1652712	1652719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_015850	AAAC	2	8	1694179	1694186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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