MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015850	GACC	2	8	1704585	1704592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015850	ACTC	2	8	1706514	1706521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_015850	CCTC	2	8	1706781	1706788	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
504	NC_015850	GCAG	2	8	1707972	1707979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
505	NC_015850	TCGG	2	8	1708280	1708287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_015850	CTCA	2	8	1720792	1720799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015850	TCAC	2	8	1721788	1721795	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_015850	TGCC	2	8	1722751	1722758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015850	GCAG	2	8	1724246	1724253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_015850	GCCG	2	8	1735254	1735261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_015850	AGCT	2	8	1737381	1737388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_015850	GTCG	2	8	1747203	1747210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_015850	AGGC	2	8	1761931	1761938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
514	NC_015850	TCCC	2	8	1787555	1787562	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
515	NC_015850	CACC	2	8	1789528	1789535	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
516	NC_015850	GCAA	2	8	1798492	1798499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_015850	GAAG	2	8	1826257	1826264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015850	TTCG	2	8	1842335	1842342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015850	ATTT	2	8	1854238	1854245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015850	CGCC	2	8	1857365	1857372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
521	NC_015850	CGCC	2	8	1857431	1857438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
522	NC_015850	TATC	2	8	1858729	1858736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015850	TGTA	2	8	1864040	1864047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015850	AGCA	2	8	1864513	1864520	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_015850	AACC	2	8	1864561	1864568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_015850	AATG	2	8	1865080	1865087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015850	CATA	2	8	1867675	1867682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_015850	CAGA	2	8	1875964	1875971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_015850	GAAA	2	8	1877368	1877375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015850	GGAT	2	8	1878351	1878358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015850	TGGC	2	8	1880399	1880406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
532	NC_015850	ACGC	2	8	1880440	1880447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_015850	CGAG	2	8	1881016	1881023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_015850	GCCA	2	8	1883737	1883744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_015850	GCAC	2	8	1885503	1885510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_015850	CCTC	2	8	1891432	1891439	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
537	NC_015850	AAAG	2	8	1891888	1891895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015850	CAGA	2	8	1895878	1895885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_015850	TGAC	2	8	1896894	1896901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_015850	TCGT	2	8	1897847	1897854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_015850	GATT	2	8	1904070	1904077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015850	GGTC	2	8	1905303	1905310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_015850	GACG	2	8	1908513	1908520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_015850	CGGC	2	8	1908581	1908588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015850	GCTG	2	8	1910225	1910232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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547	NC_015850	CCGT	2	8	1913478	1913485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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550	NC_015850	TATT	2	8	1914911	1914918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015850	CGGC	2	8	1915472	1915479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015850	GGCA	2	8	1915613	1915620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_015850	GGTC	2	8	1922476	1922483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_015850	TGGC	2	8	1922530	1922537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015850	GATC	2	8	1926738	1926745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_015850	GGAC	2	8	1928168	1928175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_015850	CCAG	2	8	1929320	1929327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015850	CGAG	2	8	1931279	1931286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_015850	GCAG	2	8	1931398	1931405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_015850	AGGC	2	8	1931462	1931469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_015850	GGAT	2	8	1940927	1940934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015850	TTTA	2	8	1944339	1944346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015850	CTTA	2	8	1945771	1945778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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571	NC_015850	TTGG	2	8	1957760	1957767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_015850	AGCT	2	8	1962910	1962917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_015850	ATAG	2	8	1971078	1971085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_015850	GGCA	2	8	1994142	1994149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_015850	GCTA	2	8	1995605	1995612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_015850	GGAT	2	8	1995755	1995762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015850	GGTT	2	8	1995824	1995831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_015850	AGCA	2	8	2055914	2055921	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_015850	ATGG	2	8	2056444	2056451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_015850	CCCA	2	8	2058857	2058864	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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607	NC_015850	TCGG	2	8	2071001	2071008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
608	NC_015850	TCGT	2	8	2071068	2071075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_015850	ATCG	2	8	2071399	2071406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_015850	GTTT	2	8	2071437	2071444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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615	NC_015850	CGCC	2	8	2074063	2074070	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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626	NC_015850	ACGG	2	8	2106994	2107001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_015850	CATC	2	8	2113979	2113986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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629	NC_015850	CTTT	2	8	2114745	2114752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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632	NC_015850	CCAG	2	8	2115386	2115393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015850	TCAA	2	8	2115460	2115467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_015850	ACTC	2	8	2117404	2117411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_015850	CAGT	2	8	2118898	2118905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_015850	GAAA	2	8	2119622	2119629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_015850	GCAG	2	8	2122392	2122399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_015850	ATTG	2	8	2124564	2124571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015850	GAAA	2	8	2125289	2125296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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790	NC_015850	ACGC	2	8	2794848	2794855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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822	NC_015850	TGGG	2	8	2931997	2932004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
823	NC_015850	CAGC	2	8	2932021	2932028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
824	NC_015850	GGGT	2	8	2932113	2932120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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