MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	CGGATG	2	12	5317	5328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340623185
2	NC_015847	TGGAAA	2	12	6641	6652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623187
3	NC_015847	ATTTTT	2	12	11368	11379	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340623190
4	NC_015847	GATGTG	2	12	12723	12734	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340623193
5	NC_015847	TAATGA	2	12	15978	15989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340623196
6	NC_015847	ATCTTG	2	12	17784	17795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340623198
7	NC_015847	TTTAAA	2	12	22315	22326	50 %	50 %	0 %	0 %	340623202
8	NC_015847	ATCTGA	2	12	22775	22786	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623203
9	NC_015847	TCCTGT	2	12	23219	23230	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340623203
10	NC_015847	CAATAT	2	12	26718	26729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623209
11	NC_015847	CTGGAA	2	12	27206	27217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623209
12	NC_015847	GCCATT	2	12	40092	40103	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340623212
13	NC_015847	GCAAAA	2	12	42276	42287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340623213
14	NC_015847	TTAAAA	2	12	45362	45373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623216
15	NC_015847	TTAATT	2	12	47490	47501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623217
16	NC_015847	TGATTT	2	12	49343	49354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340623220
17	NC_015847	ATTGCT	2	12	55449	55460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340623226
18	NC_015847	TCAATT	2	12	56061	56072	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623226
19	NC_015847	CATTTT	2	12	62099	62110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623235
20	NC_015847	TTTTAT	2	12	64239	64250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340623237
21	NC_015847	TTCTTT	2	12	65928	65939	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340623239
22	NC_015847	TTCTTT	2	12	67119	67130	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340623240
23	NC_015847	TTTTAT	2	12	68684	68695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340623242
24	NC_015847	ATTCTA	2	12	69355	69366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623244
25	NC_015847	TTAAAT	2	12	72292	72303	50 %	50 %	0 %	0 %	340623248
26	NC_015847	TTGCAG	2	12	72592	72603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340623248
27	NC_015847	AGGATT	2	12	72992	73003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623248
28	NC_015847	TTTTAT	2	12	74230	74241	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340623251
29	NC_015847	GAAAAA	2	12	76784	76795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340623253
30	NC_015847	AATTAA	2	12	78100	78111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623254
31	NC_015847	TATCAA	2	12	78189	78200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623254
32	NC_015847	GAAATT	2	12	80149	80160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340623256
33	NC_015847	TTCCAG	2	12	80228	80239	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340623256
34	NC_015847	GAAAAA	2	12	81037	81048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340623257
35	NC_015847	TCAAAA	2	12	81340	81351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340623257
36	NC_015847	CAGATG	2	12	87412	87423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623263
37	NC_015847	AATACA	2	12	88341	88352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340623264
38	NC_015847	TTTTAA	2	12	93316	93327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623269
39	NC_015847	TCCAAA	2	12	95457	95468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	340623271
40	NC_015847	TAAAAT	2	12	95963	95974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623272
41	NC_015847	ATAATT	2	12	97670	97681	50 %	50 %	0 %	0 %	340623275
42	NC_015847	CTGGAA	2	12	107071	107082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623285
43	NC_015847	TTGCAA	2	12	114254	114265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623292
44	NC_015847	ATCTTC	2	12	117293	117304	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340623295
45	NC_015847	AAGTTG	2	12	119045	119056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623298
46	NC_015847	ACACAG	2	12	119586	119597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340623298
47	NC_015847	CGCATT	2	12	128460	128471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340623309
48	NC_015847	CTTTAG	2	12	129177	129188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340623309
49	NC_015847	TCACAC	2	12	130472	130483	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340623311
50	NC_015847	GATTTT	2	12	132765	132776	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340623313
51	NC_015847	TGGATG	2	12	132883	132894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340623313
52	NC_015847	AACTCC	2	12	134802	134813	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340623315
53	NC_015847	TGAAAT	2	12	135945	135956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340623316
54	NC_015847	TAAAAA	2	12	136136	136147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340623316
55	NC_015847	GCTTCA	2	12	137449	137460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340623317
56	NC_015847	AAGAAA	2	12	138786	138797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340623319
57	NC_015847	GATAAA	2	12	142242	142253	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340623320
58	NC_015847	TGCAAT	2	12	143307	143318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623321
59	NC_015847	TTCATT	2	12	144588	144599	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623321
60	NC_015847	ATTTTC	2	12	145158	145169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623321
61	NC_015847	TTTTTC	2	12	146041	146052	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340623322
62	NC_015847	TTTTCA	2	12	146371	146382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623323
63	NC_015847	TATTTT	2	12	147338	147349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340623323
64	NC_015847	TCAATT	2	12	149050	149061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623325
65	NC_015847	ATTTAA	2	12	150464	150475	50 %	50 %	0 %	0 %	340623327
66	NC_015847	CTTTAT	2	12	151306	151317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623327
67	NC_015847	TCAAAA	2	12	153331	153342	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340623329
68	NC_015847	AAACTG	2	12	154037	154048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340623329
69	NC_015847	TGGAAT	2	12	154119	154130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623329
70	NC_015847	TGATGT	2	12	154131	154142	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	340623329
71	NC_015847	GCAAAA	2	12	157660	157671	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340623333
72	NC_015847	TTGCAG	2	12	158114	158125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340623333
73	NC_015847	GATTTT	2	12	159064	159075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340623335
74	NC_015847	TACAAT	2	12	161372	161383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623336
75	NC_015847	CAAAAA	2	12	162897	162908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340623339
76	NC_015847	GAAATT	2	12	166157	166168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340623343
77	NC_015847	ACAATA	2	12	174505	174516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340623353
78	NC_015847	TAGGAA	2	12	178868	178879	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623358
79	NC_015847	TTTTAC	2	12	179640	179651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623358
80	NC_015847	TTTTCA	2	12	182480	182491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623361
81	NC_015847	TTCCTT	2	12	183270	183281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623361
82	NC_015847	CTGCAG	2	12	183867	183878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340623361
83	NC_015847	CTTCGT	2	12	185628	185639	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340623362
84	NC_015847	CTTTGT	2	12	185718	185729	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340623362
85	NC_015847	GAAATG	2	12	188378	188389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623366
86	NC_015847	TCTTTT	2	12	192700	192711	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340623372
87	NC_015847	TGGAGA	2	12	194115	194126	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340623373
88	NC_015847	TGAAAA	2	12	197202	197213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340623377
89	NC_015847	CTTATG	2	12	199540	199551	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340623380
90	NC_015847	TTGGAA	2	12	203560	203571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623383
91	NC_015847	ATATTG	2	12	213523	213534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340623394
92	NC_015847	TTATTT	2	12	217101	217112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340623397
93	NC_015847	AATTAC	2	12	217126	217137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623397
94	NC_015847	ATGGCA	2	12	222542	222553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623402
95	NC_015847	CCATTT	2	12	223796	223807	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340623405
96	NC_015847	GCAATT	2	12	225390	225401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623406
97	NC_015847	CAATAG	2	12	225484	225495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340623406
98	NC_015847	TGACGA	2	12	235436	235447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623416
99	NC_015847	TCCCGA	2	12	236832	236843	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340623418
100	NC_015847	CTAAAT	2	12	238275	238286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623420
101	NC_015847	ATATTT	2	12	238294	238305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623420
102	NC_015847	ATCCAA	2	12	238600	238611	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	340623420
103	NC_015847	GTATGG	2	12	241661	241672	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340623422
104	NC_015847	ATTAAA	2	12	241673	241684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623422
105	NC_015847	AATAAA	2	12	241693	241704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340623422
106	NC_015847	ATTTTA	2	12	242036	242047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623424
107	NC_015847	AAGTTG	2	12	242961	242972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623425
108	NC_015847	TTAAAA	2	12	244486	244497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623428
109	NC_015847	ATTATC	2	12	244558	244569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623428
110	NC_015847	TACTTT	2	12	244771	244782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340623430
111	NC_015847	CATTTG	2	12	247833	247844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340623435
112	NC_015847	GAAAAT	2	12	249869	249880	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340623436
113	NC_015847	AAAAAT	2	12	250124	250135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340623436
114	NC_015847	GATGCA	2	12	250559	250570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623436
115	NC_015847	TTTAAA	2	12	250595	250606	50 %	50 %	0 %	0 %	340623436
116	NC_015847	TGGAAA	2	12	251550	251561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623437
117	NC_015847	GCTGCA	2	12	253322	253333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340623440
118	NC_015847	TTTGCA	2	12	254871	254882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340623442
119	NC_015847	CTAATT	2	12	255697	255708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623443
120	NC_015847	GTTTTT	2	12	255716	255727	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	340623443
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122	NC_015847	CTTCAA	2	12	263696	263707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623454
123	NC_015847	TAATTT	2	12	265804	265815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623456
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130	NC_015847	AATTGA	2	12	273856	273867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340623463
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132	NC_015847	TTTTGA	2	12	277364	277375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340623466
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230	NC_015847	TCCGCC	2	12	474427	474438	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	340623678
231	NC_015847	TCAAAT	2	12	475512	475523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623680
232	NC_015847	TTATAA	2	12	482149	482160	50 %	50 %	0 %	0 %	340623688
233	NC_015847	GCTGCC	2	12	482430	482441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340623688
234	NC_015847	ATGAAA	2	12	484422	484433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340623689
235	NC_015847	GTTGCA	2	12	485066	485077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340623691
236	NC_015847	AGTTGC	2	12	485118	485129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340623691
237	NC_015847	TTCTGG	2	12	485460	485471	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340623692
238	NC_015847	TGCAAT	2	12	485607	485618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623692
239	NC_015847	TTTCAA	2	12	486662	486673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623692
240	NC_015847	CTGAAA	2	12	491495	491506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340623694
241	NC_015847	ATTTCC	2	12	493679	493690	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340623697
242	NC_015847	ATTTGA	2	12	493714	493725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340623697
243	NC_015847	CATTTA	2	12	494030	494041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623698
244	NC_015847	TCAATT	2	12	495197	495208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623699
245	NC_015847	ATTGGC	2	12	505918	505929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340623710
246	NC_015847	TAAATC	2	12	509517	509528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623712
247	NC_015847	CCTGGA	2	12	512247	512258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340623714
248	NC_015847	GAAAAT	2	12	518007	518018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340623720
249	NC_015847	ATTGCA	2	12	518855	518866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623721
250	NC_015847	TTTTGA	2	12	520714	520725	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340623723
251	NC_015847	CGTTTC	2	12	520950	520961	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340623723
252	NC_015847	GAAAAG	2	12	526420	526431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623726
253	NC_015847	CAGATT	2	12	529203	529214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623729
254	NC_015847	GCCCAT	2	12	531448	531459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340623731
255	NC_015847	GTGCAA	2	12	531501	531512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623731
256	NC_015847	AAAGTT	2	12	533303	533314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340623732
257	NC_015847	TTTTGG	2	12	537362	537373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623737
258	NC_015847	ATGGAA	2	12	538476	538487	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623739
259	NC_015847	GCAAAA	2	12	538926	538937	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340623739
260	NC_015847	TGGAAC	2	12	543322	543333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340623743
261	NC_015847	TGAAAA	2	12	546245	546256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340623747
262	NC_015847	GAAAAA	2	12	548048	548059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340623749
263	NC_015847	AAAATT	2	12	551605	551616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623753
264	NC_015847	TTCTTT	2	12	553069	553080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340623755
265	NC_015847	GAAAAA	2	12	555323	555334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340623757
266	NC_015847	TTTAAA	2	12	560868	560879	50 %	50 %	0 %	0 %	340623764
267	NC_015847	GTTTCT	2	12	564601	564612	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340623769
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269	NC_015847	TTAGTT	2	12	566594	566605	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340623770
270	NC_015847	TCTGAA	2	12	575246	575257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623782
271	NC_015847	TCTGAA	2	12	581090	581101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623794
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341	NC_015847	CAATTG	2	12	743201	743212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340623971
342	NC_015847	AATTTC	2	12	744150	744161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340623971
343	NC_015847	TAAACT	2	12	744641	744652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340623972
344	NC_015847	AAAAGA	2	12	747635	747646	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340623973
345	NC_015847	TTTAAT	2	12	753134	753145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623975
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