MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015847	GATAGA	2	12	1141795	1141806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624379
502	NC_015847	TGAAAA	2	12	1142128	1142139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624380
503	NC_015847	CAAAAA	2	12	1142531	1142542	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340624380
504	NC_015847	GAAAAA	2	12	1144832	1144843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624382
505	NC_015847	CATTTG	2	12	1146728	1146739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340624384
506	NC_015847	TAAAAG	2	12	1149877	1149888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624385
507	NC_015847	TTCTTT	2	12	1152285	1152296	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340624389
508	NC_015847	CTTCAA	2	12	1155854	1155865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340624392
509	NC_015847	ATCTTC	2	12	1156248	1156259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624393
510	NC_015847	GGACTT	2	12	1158288	1158299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340624396
511	NC_015847	TTCCAT	2	12	1158521	1158532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624397
512	NC_015847	TCTTTT	2	12	1160273	1160284	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340624399
513	NC_015847	TGAAAA	2	12	1161673	1161684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624400
514	NC_015847	TTTTAG	2	12	1162790	1162801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624401
515	NC_015847	TGAAAA	2	12	1163439	1163450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624401
516	NC_015847	ATAAAA	2	12	1166934	1166945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624404
517	NC_015847	TTATTG	2	12	1167126	1167137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624404
518	NC_015847	TCATAA	2	12	1169081	1169092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340624407
519	NC_015847	TAAAAT	2	12	1170763	1170774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624408
520	NC_015847	TAAAAA	2	12	1171237	1171248	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624408
521	NC_015847	ATATTT	2	12	1171926	1171937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624409
522	NC_015847	CAATTG	2	12	1174844	1174855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624413
523	NC_015847	AATAGT	2	12	1180380	1180391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624417
524	NC_015847	AATGGA	2	12	1180765	1180776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624418
525	NC_015847	CAGTTC	2	12	1182406	1182417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340624419
526	NC_015847	ACTTTT	2	12	1186509	1186520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624425
527	NC_015847	TCCTTT	2	12	1187292	1187303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340624426
528	NC_015847	TTTCTA	2	12	1187537	1187548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624426
529	NC_015847	TTAATT	2	12	1188495	1188506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624427
530	NC_015847	TCGATA	2	12	1188522	1188533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624427
531	NC_015847	TTGTAA	2	12	1189354	1189365	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340624428
532	NC_015847	CCTTTT	2	12	1193650	1193661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340624433
533	NC_015847	TTTTAA	2	12	1195775	1195786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624434
534	NC_015847	CATTTA	2	12	1209607	1209618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340624448
535	NC_015847	CATTGA	2	12	1211569	1211580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624449
536	NC_015847	GCAAGA	2	12	1211661	1211672	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	340624449
537	NC_015847	AAATTT	2	12	1213972	1213983	50 %	50 %	0 %	0 %	340624451
538	NC_015847	TTATTG	2	12	1214843	1214854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624453
539	NC_015847	TAAAAA	2	12	1216693	1216704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624455
540	NC_015847	AAATAA	2	12	1217261	1217272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624456
541	NC_015847	GCAATG	2	12	1217335	1217346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340624456
542	NC_015847	CAATTG	2	12	1217537	1217548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624456
543	NC_015847	ATGAAT	2	12	1219354	1219365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624457
544	NC_015847	TCAACA	2	12	1230460	1230471	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	340624468
545	NC_015847	CCAATC	2	12	1230926	1230937	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340624468
546	NC_015847	TAATTT	2	12	1233359	1233370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624472
547	NC_015847	AAAAAT	2	12	1238542	1238553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624481
548	NC_015847	ATTAAA	2	12	1240302	1240313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624484
549	NC_015847	TCCAAA	2	12	1241348	1241359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	340624485
550	NC_015847	GTTGGA	2	12	1241682	1241693	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340624485
551	NC_015847	AAAATG	2	12	1247432	1247443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624491
552	NC_015847	TGCAGA	2	12	1251785	1251796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340624496
553	NC_015847	GTTTCA	2	12	1255282	1255293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340624499
554	NC_015847	TTAAGA	2	12	1257815	1257826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624502
555	NC_015847	AGAATC	2	12	1260511	1260522	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340624505
556	NC_015847	TTGCAA	2	12	1272475	1272486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624513
557	NC_015847	ATTTTC	2	12	1275599	1275610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624516
558	NC_015847	TCGATT	2	12	1279026	1279037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340624520
559	NC_015847	ATGAAT	2	12	1280113	1280124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624521
560	NC_015847	GATTAC	2	12	1286117	1286128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624526
561	NC_015847	GGTAAA	2	12	1287859	1287870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624528
562	NC_015847	AATCAA	2	12	1288184	1288195	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340624529
563	NC_015847	TTGGAA	2	12	1291279	1291290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340624531
564	NC_015847	CAAATC	2	12	1292026	1292037	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	340624532
565	NC_015847	CCAGTT	2	12	1292984	1292995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340624533
566	NC_015847	GAAACA	2	12	1297598	1297609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340624536
567	NC_015847	TTTTGA	2	12	1302090	1302101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624540
568	NC_015847	TGGAAA	2	12	1302626	1302637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624541
569	NC_015847	ATTTTT	2	12	1303781	1303792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624542
570	NC_015847	AAATTC	2	12	1304169	1304180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340624543
571	NC_015847	ACTATT	2	12	1304653	1304664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340624544
572	NC_015847	TTGCAA	2	12	1308008	1308019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624547
573	NC_015847	TTGAAT	2	12	1309879	1309890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340624550
574	NC_015847	ATTTTA	2	12	1312985	1312996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624554
575	NC_015847	ATGAAG	2	12	1313732	1313743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624555
576	NC_015847	TTGGGG	2	12	1319090	1319101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340624563
577	NC_015847	CTGGAA	2	12	1322476	1322487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340624567
578	NC_015847	TTTAAA	2	12	1326243	1326254	50 %	50 %	0 %	0 %	340624570
579	NC_015847	TTTGAA	2	12	1326865	1326876	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340624570
580	NC_015847	TCGAAC	2	12	1326983	1326994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340624570
581	NC_015847	ATTTCT	2	12	1332928	1332939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624577
582	NC_015847	CACCTT	2	12	1333348	1333359	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340624578
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584	NC_015847	TTTTTA	2	12	1334266	1334277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624579
585	NC_015847	GTAATT	2	12	1336295	1336306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340624580
586	NC_015847	TTGCAA	2	12	1339329	1339340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624582
587	NC_015847	AGAATT	2	12	1341161	1341172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624584
588	NC_015847	TAACTG	2	12	1341710	1341721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624585
589	NC_015847	CAATAT	2	12	1342269	1342280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340624585
590	NC_015847	GTCGTA	2	12	1346299	1346310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340624589
591	NC_015847	TCCTTT	2	12	1347481	1347492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340624590
592	NC_015847	ATCTTC	2	12	1352314	1352325	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624597
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594	NC_015847	ATTTTT	2	12	1353668	1353679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624599
595	NC_015847	TGAAGA	2	12	1354622	1354633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624599
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597	NC_015847	TAAAAT	2	12	1356116	1356127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624600
598	NC_015847	ATTTCC	2	12	1364170	1364181	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624607
599	NC_015847	TTGCAA	2	12	1365974	1365985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340624609
600	NC_015847	TAGAAT	2	12	1367253	1367264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624610
601	NC_015847	AAAAGA	2	12	1367302	1367313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624610
602	NC_015847	GAAAAA	2	12	1367647	1367658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624610
603	NC_015847	CAACTC	2	12	1368086	1368097	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340624610
604	NC_015847	AAAAGA	2	12	1369761	1369772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624611
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607	NC_015847	TAAAAA	2	12	1376941	1376952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624616
608	NC_015847	CTAAAA	2	12	1377525	1377536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340624617
609	NC_015847	TTTAAT	2	12	1381587	1381598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624623
610	NC_015847	ATTTTT	2	12	1382621	1382632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624624
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612	NC_015847	TTTTTA	2	12	1387179	1387190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624628
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723	NC_015847	TTTTGA	2	12	1630094	1630105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624909
724	NC_015847	TGAATA	2	12	1630472	1630483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624909
725	NC_015847	AAAATT	2	12	1639376	1639387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624919
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