MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 1446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	TAAAA	2	10	55	64	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015847	GGGAT	2	10	142	151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015847	TTAAA	2	10	190	199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015847	CATAC	2	10	2665	2674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015847	CCAAG	2	10	3165	3174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015847	TGGAA	2	10	5743	5752	40 %	20 %	40 %	0 %	340623186
7	NC_015847	CTGTT	2	10	7991	8000	0 %	60 %	20 %	20 %	340623188
8	NC_015847	ATTTT	2	10	8631	8640	20 %	80 %	0 %	0 %	340623189
9	NC_015847	ATATG	2	10	9746	9755	40 %	40 %	20 %	0 %	340623189
10	NC_015847	AAAAT	2	10	10030	10039	80 %	20 %	0 %	0 %	340623189
11	NC_015847	CATAA	2	10	10117	10126	60 %	20 %	0 %	20 %	340623189
12	NC_015847	AAAAC	2	10	11052	11061	80 %	0 %	0 %	20 %	340623190
13	NC_015847	TAAAA	5	25	12517	12541	80 %	20 %	0 %	0 %	340623192
14	NC_015847	TCAAT	2	10	13673	13682	40 %	40 %	0 %	20 %	340623193
15	NC_015847	TTTTA	2	10	14193	14202	20 %	80 %	0 %	0 %	340623193
16	NC_015847	CAATT	2	10	16917	16926	40 %	40 %	0 %	20 %	340623196
17	NC_015847	TGGAA	2	10	19971	19980	40 %	20 %	40 %	0 %	340623199
18	NC_015847	CTTTT	2	10	21281	21290	0 %	80 %	0 %	20 %	340623201
19	NC_015847	TAGAT	2	10	21529	21538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015847	CAGAA	2	10	22878	22887	60 %	0 %	20 %	20 %	340623203
21	NC_015847	CGTAT	2	10	23013	23022	20 %	40 %	20 %	20 %	340623203
22	NC_015847	AAAAC	2	10	23487	23496	80 %	0 %	0 %	20 %	340623203
23	NC_015847	CTAAA	2	10	23752	23761	60 %	20 %	0 %	20 %	340623204
24	NC_015847	TTAAA	2	10	23879	23888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015847	TAAAA	2	10	23939	23948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015847	AGTGG	2	10	24174	24183	20 %	20 %	60 %	0 %	340623205
27	NC_015847	TATCC	2	10	24360	24369	20 %	40 %	0 %	40 %	340623205
28	NC_015847	AATTT	2	10	25384	25393	40 %	60 %	0 %	0 %	340623207
29	NC_015847	ATTTA	2	10	30421	30430	40 %	60 %	0 %	0 %	340623211
30	NC_015847	ATTTA	2	10	30811	30820	40 %	60 %	0 %	0 %	340623211
31	NC_015847	ACCGT	2	10	31063	31072	20 %	20 %	20 %	40 %	340623211
32	NC_015847	ATGAA	2	10	32064	32073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015847	GGGAT	2	10	32159	32168	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015847	TTAAA	2	10	32207	32216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015847	CATAC	2	10	34682	34691	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015847	CCAAG	2	10	35182	35191	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015847	TAATG	2	10	37088	37097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015847	TTATA	2	10	39189	39198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015847	TAAAT	2	10	39477	39486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015847	TAAAT	2	10	39671	39680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015847	ACTAA	2	10	39780	39789	60 %	20 %	0 %	20 %	340623212
42	NC_015847	TTTTA	2	10	39914	39923	20 %	80 %	0 %	0 %	340623212
43	NC_015847	AAAAT	2	10	40977	40986	80 %	20 %	0 %	0 %	340623213
44	NC_015847	GCACA	2	10	42012	42021	40 %	0 %	20 %	40 %	340623213
45	NC_015847	GTTCA	2	10	42217	42226	20 %	40 %	20 %	20 %	340623213
46	NC_015847	ATTTT	2	10	43996	44005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015847	ATTAT	2	10	44164	44173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015847	CAAAA	2	10	44238	44247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015847	TAAAA	2	10	44482	44491	80 %	20 %	0 %	0 %	340623215
50	NC_015847	ATGCA	2	10	46546	46555	40 %	20 %	20 %	20 %	340623217
51	NC_015847	AAATT	2	10	48963	48972	60 %	40 %	0 %	0 %	340623219
52	NC_015847	AACAA	2	10	51310	51319	80 %	0 %	0 %	20 %	340623222
53	NC_015847	TTTTC	2	10	51702	51711	0 %	80 %	0 %	20 %	340623222
54	NC_015847	AATCA	2	10	52553	52562	60 %	20 %	0 %	20 %	340623223
55	NC_015847	TTTCT	2	10	53722	53731	0 %	80 %	0 %	20 %	340623224
56	NC_015847	GACAG	2	10	54269	54278	40 %	0 %	40 %	20 %	340623224
57	NC_015847	CAAAG	2	10	56325	56334	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015847	TTTAA	2	10	57579	57588	40 %	60 %	0 %	0 %	340623227
59	NC_015847	TAATT	2	10	57685	57694	40 %	60 %	0 %	0 %	340623227
60	NC_015847	ACTGT	2	10	60779	60788	20 %	40 %	20 %	20 %	340623232
61	NC_015847	AAATT	2	10	61565	61574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015847	AAGAA	2	10	61871	61880	80 %	0 %	20 %	0 %	340623234
63	NC_015847	ATTTA	2	10	62888	62897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015847	TATTT	2	10	64870	64879	20 %	80 %	0 %	0 %	340623239
65	NC_015847	TTTTA	2	10	68384	68393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015847	TTTTC	2	10	68620	68629	0 %	80 %	0 %	20 %	340623242
67	NC_015847	TATTG	2	10	70007	70016	20 %	60 %	20 %	0 %	340623245
68	NC_015847	TTAAA	2	10	71862	71871	60 %	40 %	0 %	0 %	340623247
69	NC_015847	GGTCA	2	10	72036	72045	20 %	20 %	40 %	20 %	340623248
70	NC_015847	GAACA	2	10	73904	73913	60 %	0 %	20 %	20 %	340623250
71	NC_015847	GATGT	2	10	74201	74210	20 %	40 %	40 %	0 %	340623251
72	NC_015847	ATTCC	2	10	74627	74636	20 %	40 %	0 %	40 %	340623251
73	NC_015847	TTTTA	2	10	77371	77380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015847	ATTTT	2	10	79614	79623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015847	TGAAT	2	10	82015	82024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015847	GAAAA	2	10	82165	82174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015847	GGGGA	2	10	82769	82778	20 %	0 %	80 %	0 %	340623259
78	NC_015847	AATAA	2	10	83015	83024	80 %	20 %	0 %	0 %	340623259
79	NC_015847	ATAAA	2	10	83352	83361	80 %	20 %	0 %	0 %	340623259
80	NC_015847	TTTTA	2	10	84101	84110	20 %	80 %	0 %	0 %	340623260
81	NC_015847	AATTA	2	10	86222	86231	60 %	40 %	0 %	0 %	340623262
82	NC_015847	TTTAA	2	10	86374	86383	40 %	60 %	0 %	0 %	340623262
83	NC_015847	CTGTT	2	10	89437	89446	0 %	60 %	20 %	20 %	340623265
84	NC_015847	TCTTT	2	10	90344	90353	0 %	80 %	0 %	20 %	340623266
85	NC_015847	CTATT	2	10	90909	90918	20 %	60 %	0 %	20 %	340623267
86	NC_015847	GTATG	2	10	91660	91669	20 %	40 %	40 %	0 %	340623267
87	NC_015847	TGAAG	2	10	92112	92121	40 %	20 %	40 %	0 %	340623268
88	NC_015847	ATGGA	2	10	99812	99821	40 %	20 %	40 %	0 %	340623277
89	NC_015847	AATAA	2	10	100141	100150	80 %	20 %	0 %	0 %	340623277
90	NC_015847	GAAAT	2	10	100463	100472	60 %	20 %	20 %	0 %	340623277
91	NC_015847	ATTTA	2	10	100688	100697	40 %	60 %	0 %	0 %	340623278
92	NC_015847	ATCTA	2	10	101962	101971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015847	AAAAG	2	10	102050	102059	80 %	0 %	20 %	0 %	340623279
94	NC_015847	TTTAT	2	10	103175	103184	20 %	80 %	0 %	0 %	340623281
95	NC_015847	AATTT	2	10	107510	107519	40 %	60 %	0 %	0 %	340623285
96	NC_015847	TTTTA	2	10	107539	107548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015847	ATCCC	2	10	108112	108121	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_015847	ATCAT	2	10	109725	109734	40 %	40 %	0 %	20 %	340623287
99	NC_015847	CAGTG	2	10	110718	110727	20 %	20 %	40 %	20 %	340623289
100	NC_015847	TTTTA	2	10	111071	111080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015847	CGGAT	2	10	115174	115183	20 %	20 %	40 %	20 %	340623293
102	NC_015847	TTGTT	2	10	115432	115441	0 %	80 %	20 %	0 %	340623294
103	NC_015847	AATTC	2	10	115773	115782	40 %	40 %	0 %	20 %	340623294
104	NC_015847	AAAAT	2	10	117150	117159	80 %	20 %	0 %	0 %	340623295
105	NC_015847	TTTTA	2	10	117483	117492	20 %	80 %	0 %	0 %	340623296
106	NC_015847	GTATT	2	10	117893	117902	20 %	60 %	20 %	0 %	340623296
107	NC_015847	ACACT	2	10	118347	118356	40 %	20 %	0 %	40 %	340623297
108	NC_015847	CTTAA	2	10	119996	120005	40 %	40 %	0 %	20 %	340623298
109	NC_015847	TATTT	2	10	121975	121984	20 %	80 %	0 %	0 %	340623301
110	NC_015847	ATTTT	2	10	122737	122746	20 %	80 %	0 %	0 %	340623303
111	NC_015847	TCCAA	2	10	122914	122923	40 %	20 %	0 %	40 %	340623304
112	NC_015847	AAAAG	2	10	124094	124103	80 %	0 %	20 %	0 %	340623305
113	NC_015847	ACAGA	2	10	128160	128169	60 %	0 %	20 %	20 %	340623308
114	NC_015847	AGCAA	2	10	129301	129310	60 %	0 %	20 %	20 %	340623309
115	NC_015847	TCATA	2	10	129501	129510	40 %	40 %	0 %	20 %	340623309
116	NC_015847	GTTTT	2	10	129887	129896	0 %	80 %	20 %	0 %	340623310
117	NC_015847	GAAAA	2	10	131954	131963	80 %	0 %	20 %	0 %	340623312
118	NC_015847	CTTTT	2	10	132470	132479	0 %	80 %	0 %	20 %	340623313
119	NC_015847	GAGAA	2	10	133147	133156	60 %	0 %	40 %	0 %	340623313
120	NC_015847	TAAAA	2	10	133896	133905	80 %	20 %	0 %	0 %	340623314
121	NC_015847	AAAAT	2	10	136004	136013	80 %	20 %	0 %	0 %	340623316
122	NC_015847	AAAAT	2	10	138717	138726	80 %	20 %	0 %	0 %	340623319
123	NC_015847	TTTTG	2	10	138743	138752	0 %	80 %	20 %	0 %	340623319
124	NC_015847	ATGGG	2	10	139084	139093	20 %	20 %	60 %	0 %	340623319
125	NC_015847	AAAGA	2	10	139287	139296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015847	TTGAT	2	10	140507	140516	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015847	TTCAC	2	10	142112	142121	20 %	40 %	0 %	40 %	340623320
128	NC_015847	ATTTT	2	10	145444	145453	20 %	80 %	0 %	0 %	340623322
129	NC_015847	CCTGA	2	10	145779	145788	20 %	20 %	20 %	40 %	340623322
130	NC_015847	ATAAC	2	10	150286	150295	60 %	20 %	0 %	20 %	340623327
131	NC_015847	AAAAG	2	10	150521	150530	80 %	0 %	20 %	0 %	340623327
132	NC_015847	ACTGG	2	10	152976	152985	20 %	20 %	40 %	20 %	340623329
133	NC_015847	AAATG	2	10	153678	153687	60 %	20 %	20 %	0 %	340623329
134	NC_015847	GAAAA	2	10	154001	154010	80 %	0 %	20 %	0 %	340623329
135	NC_015847	GACTG	2	10	156097	156106	20 %	20 %	40 %	20 %	340623331
136	NC_015847	CTTTT	2	10	156572	156581	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015847	TTTTC	2	10	158935	158944	0 %	80 %	0 %	20 %	340623335
138	NC_015847	TTGAT	2	10	159696	159705	20 %	60 %	20 %	0 %	340623335
139	NC_015847	TGAAC	2	10	162289	162298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015847	AAAAC	2	10	163797	163806	80 %	0 %	0 %	20 %	340623341
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251	NC_015847	ATTAT	2	10	293914	293923	40 %	60 %	0 %	0 %	340623484
252	NC_015847	TTTTA	2	10	294577	294586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_015847	GTCTG	2	10	294897	294906	0 %	40 %	40 %	20 %	340623487
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259	NC_015847	ATAAA	2	10	300408	300417	80 %	20 %	0 %	0 %	340623495
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262	NC_015847	TAAAA	2	10	302534	302543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015847	ATTTA	2	10	302784	302793	40 %	60 %	0 %	0 %	340623500
264	NC_015847	GTATG	2	10	303525	303534	20 %	40 %	40 %	0 %	340623500
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267	NC_015847	ATATT	2	10	309704	309713	40 %	60 %	0 %	0 %	340623505
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269	NC_015847	TTTGA	2	10	314284	314293	20 %	60 %	20 %	0 %	340623510
270	NC_015847	TATTT	2	10	314466	314475	20 %	80 %	0 %	0 %	340623510
271	NC_015847	TGCAA	2	10	317525	317534	40 %	20 %	20 %	20 %	340623513
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