MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 1446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015847	CTTGA	2	10	571408	571417	20 %	40 %	20 %	20 %	340623777
502	NC_015847	AATAA	2	10	572606	572615	80 %	20 %	0 %	0 %	340623777
503	NC_015847	TACAG	2	10	573472	573481	40 %	20 %	20 %	20 %	340623779
504	NC_015847	AAGGC	2	10	574120	574129	40 %	0 %	40 %	20 %	340623780
505	NC_015847	AACTG	2	10	576710	576719	40 %	20 %	20 %	20 %	340623784
506	NC_015847	TCTAT	2	10	578016	578025	20 %	60 %	0 %	20 %	340623788
507	NC_015847	GTCTT	2	10	578378	578387	0 %	60 %	20 %	20 %	340623789
508	NC_015847	TATAA	2	10	578483	578492	60 %	40 %	0 %	0 %	340623789
509	NC_015847	TTAAA	2	10	583004	583013	60 %	40 %	0 %	0 %	340623795
510	NC_015847	AATTA	2	10	585706	585715	60 %	40 %	0 %	0 %	340623801
511	NC_015847	TAAGT	2	10	586581	586590	40 %	40 %	20 %	0 %	340623801
512	NC_015847	GATAA	2	10	588265	588274	60 %	20 %	20 %	0 %	340623802
513	NC_015847	TCTTA	2	10	588297	588306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_015847	CTTTT	2	10	588710	588719	0 %	80 %	0 %	20 %	340623803
515	NC_015847	TAAAA	2	10	589826	589835	80 %	20 %	0 %	0 %	340623803
516	NC_015847	TTTCT	2	10	590139	590148	0 %	80 %	0 %	20 %	340623803
517	NC_015847	ATTGT	2	10	592527	592536	20 %	60 %	20 %	0 %	340623804
518	NC_015847	TTTAA	2	10	593017	593026	40 %	60 %	0 %	0 %	340623805
519	NC_015847	CTTTC	2	10	593453	593462	0 %	60 %	0 %	40 %	340623805
520	NC_015847	TTTTC	2	10	595986	595995	0 %	80 %	0 %	20 %	340623807
521	NC_015847	GGCGA	2	10	596381	596390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
522	NC_015847	AGTTT	2	10	596649	596658	20 %	60 %	20 %	0 %	340623808
523	NC_015847	ATTTA	2	10	598315	598324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015847	GAAAG	2	10	599385	599394	60 %	0 %	40 %	0 %	340623811
525	NC_015847	TGTTT	2	10	599606	599615	0 %	80 %	20 %	0 %	340623811
526	NC_015847	TTAAT	2	10	604265	604274	40 %	60 %	0 %	0 %	340623816
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529	NC_015847	TTAAA	2	10	609162	609171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015847	AATTA	2	10	610975	610984	60 %	40 %	0 %	0 %	340623823
531	NC_015847	ATTGT	2	10	614597	614606	20 %	60 %	20 %	0 %	340623827
532	NC_015847	TTTTA	2	10	614869	614878	20 %	80 %	0 %	0 %	340623827
533	NC_015847	ACTAA	2	10	617614	617623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
534	NC_015847	GAATT	2	10	621857	621866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015847	AAGGT	2	10	623713	623722	40 %	20 %	40 %	0 %	340623840
536	NC_015847	TGTCA	2	10	626743	626752	20 %	40 %	20 %	20 %	340623843
537	NC_015847	TTTTA	2	10	629853	629862	20 %	80 %	0 %	0 %	340623847
538	NC_015847	AGAAA	2	10	630832	630841	80 %	0 %	20 %	0 %	340623848
539	NC_015847	GGAAA	2	10	631009	631018	60 %	0 %	40 %	0 %	340623848
540	NC_015847	AATGA	2	10	631717	631726	60 %	20 %	20 %	0 %	340623848
541	NC_015847	GATAC	2	10	631808	631817	40 %	20 %	20 %	20 %	340623848
542	NC_015847	CTTTT	2	10	632498	632507	0 %	80 %	0 %	20 %	340623849
543	NC_015847	TTTCA	2	10	632559	632568	20 %	60 %	0 %	20 %	340623849
544	NC_015847	TGACT	2	10	633653	633662	20 %	40 %	20 %	20 %	340623850
545	NC_015847	TATAA	2	10	634845	634854	60 %	40 %	0 %	0 %	340623853
546	NC_015847	TTTAA	2	10	634864	634873	40 %	60 %	0 %	0 %	340623853
547	NC_015847	ATTTT	2	10	637645	637654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015847	TGTAT	2	10	638625	638634	20 %	60 %	20 %	0 %	340623856
549	NC_015847	CATTT	2	10	639185	639194	20 %	60 %	0 %	20 %	340623857
550	NC_015847	CTTTT	2	10	642146	642155	0 %	80 %	0 %	20 %	340623860
551	NC_015847	ATATT	2	10	642271	642280	40 %	60 %	0 %	0 %	340623860
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559	NC_015847	ATTCC	2	10	654155	654164	20 %	40 %	0 %	40 %	340623874
560	NC_015847	TTTTC	2	10	656676	656685	0 %	80 %	0 %	20 %	340623877
561	NC_015847	ATTAA	2	10	658530	658539	60 %	40 %	0 %	0 %	340623878
562	NC_015847	TTAAT	2	10	659724	659733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015847	CAGTG	2	10	664097	664106	20 %	20 %	40 %	20 %	340623884
564	NC_015847	AATAA	2	10	664575	664584	80 %	20 %	0 %	0 %	340623884
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569	NC_015847	TTTAA	2	10	668334	668343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_015847	TAAAT	2	10	670115	670124	60 %	40 %	0 %	0 %	340623892
572	NC_015847	TACAA	2	10	674970	674979	60 %	20 %	0 %	20 %	340623898
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580	NC_015847	AAGTG	2	10	688746	688755	40 %	20 %	40 %	0 %	340623913
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588	NC_015847	CATTA	2	10	696685	696694	40 %	40 %	0 %	20 %	340623921
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593	NC_015847	AAATT	2	10	703080	703089	60 %	40 %	0 %	0 %	340623929
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597	NC_015847	ATCAA	2	10	708972	708981	60 %	20 %	0 %	20 %	340623937
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599	NC_015847	ATTTA	2	10	709531	709540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015847	ATTTA	2	10	710188	710197	40 %	60 %	0 %	0 %	340623938
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603	NC_015847	ATTGT	2	10	713255	713264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015847	AGTAT	2	10	713328	713337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015847	AAAAT	2	10	714612	714621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015847	GATTA	2	10	714664	714673	40 %	40 %	20 %	0 %	340623944
607	NC_015847	TAATT	2	10	715073	715082	40 %	60 %	0 %	0 %	340623945
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609	NC_015847	TAATA	2	10	721180	721189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015847	TTGAT	2	10	721295	721304	20 %	60 %	20 %	0 %	340623950
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612	NC_015847	TAATT	2	10	723101	723110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015847	GAATC	2	10	723773	723782	40 %	20 %	20 %	20 %	340623953
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615	NC_015847	AAAAT	2	10	725136	725145	80 %	20 %	0 %	0 %	340623955
616	NC_015847	TTCTT	2	10	726798	726807	0 %	80 %	0 %	20 %	340623956
617	NC_015847	ATTGG	2	10	728323	728332	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015847	CATAT	2	10	732493	732502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
619	NC_015847	TTTCT	2	10	732685	732694	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
620	NC_015847	GCTTT	2	10	734114	734123	0 %	60 %	20 %	20 %	340623961
621	NC_015847	ATTAT	2	10	736054	736063	40 %	60 %	0 %	0 %	340623963
622	NC_015847	CTAAA	2	10	738489	738498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
623	NC_015847	TTTTC	2	10	739032	739041	0 %	80 %	0 %	20 %	340623966
624	NC_015847	ATACA	2	10	739063	739072	60 %	20 %	0 %	20 %	340623966
625	NC_015847	GAATT	2	10	740190	740199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015847	TCACT	2	10	741647	741656	20 %	40 %	0 %	40 %	340623969
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629	NC_015847	TACAA	2	10	745036	745045	60 %	20 %	0 %	20 %	340623972
630	NC_015847	TACAA	2	10	746233	746242	60 %	20 %	0 %	20 %	340623973
631	NC_015847	GAATT	2	10	749470	749479	40 %	40 %	20 %	0 %	340623974
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