MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 20220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	TGA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623185
2	NC_015847	CTT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623185
3	NC_015847	TTG	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623185
4	NC_015847	AGA	2	6	5231	5236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
5	NC_015847	GAA	3	9	5258	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
6	NC_015847	ATA	2	6	5420	5425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
7	NC_015847	GAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
8	NC_015847	GAA	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
9	NC_015847	AAT	2	6	5561	5566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
10	NC_015847	CTT	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
11	NC_015847	AAT	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
12	NC_015847	AGA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
13	NC_015847	TGA	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
14	NC_015847	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
15	NC_015847	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
16	NC_015847	GAT	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
17	NC_015847	CTT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
18	NC_015847	AAT	2	6	6106	6111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
19	NC_015847	AAT	2	6	6149	6154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
20	NC_015847	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
21	NC_015847	TCA	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623186
22	NC_015847	GAA	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
23	NC_015847	TGA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
24	NC_015847	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
25	NC_015847	ATA	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
26	NC_015847	CCA	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623187
27	NC_015847	ACT	2	6	6537	6542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
28	NC_015847	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
29	NC_015847	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
30	NC_015847	CTG	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
31	NC_015847	TGG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623187
32	NC_015847	TCT	2	6	6969	6974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
33	NC_015847	ACT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
34	NC_015847	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
35	NC_015847	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623187
36	NC_015847	CAT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
37	NC_015847	GCT	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
38	NC_015847	TTG	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623187
39	NC_015847	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623187
40	NC_015847	TCC	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623187
41	NC_015847	TTC	2	6	7714	7719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
42	NC_015847	CTT	2	6	7731	7736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
43	NC_015847	AAT	2	6	7795	7800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623188
44	NC_015847	AAT	2	6	7855	7860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623188
45	NC_015847	CCA	2	6	7887	7892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623188
46	NC_015847	TTC	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
47	NC_015847	AAG	2	6	7933	7938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623188
48	NC_015847	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
49	NC_015847	ATT	3	9	7976	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623188
50	NC_015847	TGG	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623188
51	NC_015847	CTT	2	6	8217	8222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
52	NC_015847	CCA	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623188
53	NC_015847	TTG	2	6	8333	8338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623188
54	NC_015847	ATT	2	6	8456	8461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623188
55	NC_015847	CAA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623188
56	NC_015847	ATT	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
57	NC_015847	AGT	2	6	8603	8608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623189
58	NC_015847	CAA	2	6	8661	8666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
59	NC_015847	ATT	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
60	NC_015847	TTC	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623189
61	NC_015847	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
62	NC_015847	CAG	2	6	8994	8999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623189
63	NC_015847	CAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623189
64	NC_015847	ATT	2	6	9323	9328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
65	NC_015847	AAT	2	6	9517	9522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
66	NC_015847	ATA	2	6	9523	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
67	NC_015847	TTA	2	6	9633	9638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
68	NC_015847	TTC	2	6	9680	9685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623189
69	NC_015847	TAT	2	6	9847	9852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
70	NC_015847	CTG	2	6	9904	9909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623189
71	NC_015847	CAA	2	6	9927	9932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
72	NC_015847	CAA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
73	NC_015847	CAA	2	6	9954	9959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
74	NC_015847	TCA	2	6	10007	10012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623189
75	NC_015847	AAT	2	6	10044	10049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
76	NC_015847	TGC	2	6	10069	10074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623189
77	NC_015847	ACA	2	6	10304	10309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623190
78	NC_015847	GAA	2	6	10388	10393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
79	NC_015847	TAA	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623190
80	NC_015847	AGA	2	6	10549	10554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
81	NC_015847	GTT	2	6	10601	10606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623190
82	NC_015847	ATT	2	6	10628	10633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623190
83	NC_015847	CAT	2	6	10645	10650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623190
84	NC_015847	GAA	2	6	10667	10672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
85	NC_015847	ATG	2	6	10904	10909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623190
86	NC_015847	TAT	2	6	11134	11139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623190
87	NC_015847	TTG	2	6	11175	11180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623190
88	NC_015847	TCC	2	6	11214	11219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623190
89	NC_015847	GTT	2	6	11270	11275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623190
90	NC_015847	ATT	3	9	11520	11528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623191
91	NC_015847	ATG	2	6	11746	11751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623192
92	NC_015847	GAA	3	9	11797	11805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623192
93	NC_015847	TGA	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623192
94	NC_015847	AAT	2	6	11889	11894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623192
95	NC_015847	GGA	2	6	11899	11904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340623192
96	NC_015847	AAT	2	6	11913	11918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623192
97	NC_015847	AAT	2	6	11967	11972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623192
98	NC_015847	ATT	2	6	11973	11978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623192
99	NC_015847	AAG	2	6	12005	12010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623192
100	NC_015847	GTG	2	6	12278	12283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623192
101	NC_015847	CGG	2	6	12351	12356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340623192
102	NC_015847	TGT	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623192
103	NC_015847	TGT	2	6	12583	12588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623193
104	NC_015847	AAT	2	6	12615	12620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623193
105	NC_015847	ATC	2	6	12688	12693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623193
106	NC_015847	CTT	2	6	12832	12837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623193
107	NC_015847	GGA	2	6	12862	12867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340623193
108	NC_015847	TGA	2	6	12882	12887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623193
109	NC_015847	ATC	2	6	12903	12908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623193
110	NC_015847	ACA	2	6	12955	12960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623193
111	NC_015847	CAA	2	6	12971	12976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623193
112	NC_015847	TCA	2	6	13015	13020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623193
113	NC_015847	CAT	2	6	13145	13150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623193
114	NC_015847	GTT	2	6	13363	13368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623193
115	NC_015847	TCA	2	6	13511	13516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623193
116	NC_015847	TCT	2	6	13543	13548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623193
117	NC_015847	TGG	2	6	13574	13579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623193
118	NC_015847	CGT	2	6	13766	13771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623193
119	NC_015847	TCG	2	6	13774	13779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623193
120	NC_015847	TTA	2	6	13828	13833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623193
121	NC_015847	CTT	2	6	13922	13927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623193
122	NC_015847	TTC	2	6	13983	13988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623193
123	NC_015847	ATC	2	6	14022	14027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623193
124	NC_015847	TTC	2	6	14100	14105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623193
125	NC_015847	ATT	2	6	14121	14126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623193
126	NC_015847	GAG	2	6	14157	14162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340623193
127	NC_015847	TGT	2	6	14340	14345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623194
128	NC_015847	CCA	2	6	14426	14431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623194
129	NC_015847	TCA	2	6	14432	14437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623194
130	NC_015847	GTA	2	6	14506	14511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623194
131	NC_015847	TAT	2	6	14557	14562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623194
132	NC_015847	TAA	2	6	14622	14627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623194
133	NC_015847	CTT	2	6	14631	14636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623194
134	NC_015847	ACA	2	6	14681	14686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623194
135	NC_015847	TCC	2	6	14716	14721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623194
136	NC_015847	GGA	2	6	14756	14761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340623194
137	NC_015847	TGT	2	6	14823	14828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623194
138	NC_015847	CTT	2	6	14853	14858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623194
139	NC_015847	ATT	2	6	15031	15036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623194
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141	NC_015847	CTT	2	6	15090	15095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623194
142	NC_015847	TTC	2	6	15118	15123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623194
143	NC_015847	TGC	2	6	15163	15168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623194
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145	NC_015847	AAT	2	6	15258	15263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623194
146	NC_015847	TTC	2	6	15298	15303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623194
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148	NC_015847	ATT	2	6	15522	15527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623195
149	NC_015847	TGA	2	6	15579	15584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623195
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151	NC_015847	CAT	2	6	15701	15706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623195
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153	NC_015847	TTC	2	6	15849	15854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623195
154	NC_015847	CTT	2	6	15962	15967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623196
155	NC_015847	AGG	2	6	15990	15995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340623196
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158	NC_015847	AAT	2	6	16365	16370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623196
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162	NC_015847	TTC	2	6	16785	16790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623196
163	NC_015847	ATC	2	6	16794	16799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623196
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199	NC_015847	ATG	2	6	20194	20199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623199
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239	NC_015847	AGA	2	6	23399	23404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623203
240	NC_015847	TAT	2	6	23478	23483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623203
241	NC_015847	GAA	2	6	23544	23549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623203
242	NC_015847	ATT	2	6	23646	23651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623204
243	NC_015847	CAA	2	6	23668	23673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623204
244	NC_015847	AAT	2	6	23820	23825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623204
245	NC_015847	ACT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623205
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248	NC_015847	AAT	2	6	24254	24259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623205
249	NC_015847	TTC	2	6	24306	24311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623205
250	NC_015847	TCG	2	6	24319	24324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623205
251	NC_015847	CCA	2	6	24374	24379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623205
252	NC_015847	GTT	2	6	24503	24508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623206
253	NC_015847	TAC	2	6	24515	24520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623206
254	NC_015847	TGA	2	6	24631	24636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623206
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491	NC_015847	GTG	2	6	51322	51327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623222
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493	NC_015847	ATC	3	9	51337	51345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623222
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495	NC_015847	ATT	2	6	51724	51729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623223
496	NC_015847	TTG	2	6	51810	51815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623223
497	NC_015847	TCT	2	6	51900	51905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623223
498	NC_015847	ACA	2	6	51930	51935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623223
499	NC_015847	CAA	2	6	52003	52008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623223
500	NC_015847	GCT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623223

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