MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 20220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015847	GAA	2	6	436102	436107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623628
5002	NC_015847	AGA	2	6	436196	436201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623629
5003	NC_015847	TTA	2	6	436248	436253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623629
5004	NC_015847	TAC	2	6	436476	436481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623630
5005	NC_015847	TGA	2	6	436617	436622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623630
5006	NC_015847	CCA	2	6	436649	436654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623630
5007	NC_015847	GAA	2	6	436690	436695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623630
5008	NC_015847	TGA	2	6	436761	436766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623630
5009	NC_015847	GAA	2	6	436834	436839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623630
5010	NC_015847	ATT	2	6	436887	436892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623631
5011	NC_015847	AAG	2	6	436896	436901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623631
5012	NC_015847	TTG	2	6	436967	436972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623631
5013	NC_015847	CAA	2	6	437084	437089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623631
5014	NC_015847	GAA	3	9	437125	437133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623631
5015	NC_015847	GGA	2	6	437151	437156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340623631
5016	NC_015847	ATA	2	6	437157	437162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623631
5017	NC_015847	CAA	2	6	437190	437195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623632
5018	NC_015847	TAC	2	6	437207	437212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623632
5019	NC_015847	GAA	2	6	437357	437362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623632
5020	NC_015847	TTC	2	6	437589	437594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623633
5021	NC_015847	TGG	2	6	437631	437636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623633
5022	NC_015847	ATC	2	6	437930	437935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623634
5023	NC_015847	CAG	2	6	438073	438078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623634
5024	NC_015847	TCC	2	6	438083	438088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623634
5025	NC_015847	TAC	2	6	438131	438136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623634
5026	NC_015847	TAT	2	6	438250	438255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623634
5027	NC_015847	ATT	2	6	438302	438307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623634
5028	NC_015847	CTT	2	6	438476	438481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623635
5029	NC_015847	TCT	2	6	438499	438504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623635
5030	NC_015847	CAA	2	6	438524	438529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623635
5031	NC_015847	ACT	2	6	438574	438579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623635
5032	NC_015847	AGC	2	6	438657	438662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623635
5033	NC_015847	ATT	2	6	438700	438705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623635
5034	NC_015847	ATT	2	6	438708	438713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623635
5035	NC_015847	TCT	2	6	438900	438905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623636
5036	NC_015847	TCT	2	6	438925	438930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623636
5037	NC_015847	CTT	2	6	438959	438964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623636
5038	NC_015847	AGT	2	6	439068	439073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623636
5039	NC_015847	TAA	2	6	439077	439082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623636
5040	NC_015847	ATT	2	6	439279	439284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623637
5041	NC_015847	ATC	2	6	439301	439306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623637
5042	NC_015847	TAT	2	6	439387	439392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623637
5043	NC_015847	ATT	2	6	439443	439448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623637
5044	NC_015847	ATT	2	6	439485	439490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623637
5045	NC_015847	ATC	2	6	439541	439546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623637
5046	NC_015847	TGT	2	6	439556	439561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623637
5047	NC_015847	ACT	2	6	439575	439580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623637
5048	NC_015847	TAA	2	6	439643	439648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623637
5049	NC_015847	CAG	2	6	439810	439815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623637
5050	NC_015847	ATT	2	6	439977	439982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623637
5051	NC_015847	TTA	2	6	440104	440109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623637
5052	NC_015847	ATA	2	6	440124	440129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623637
5053	NC_015847	TCA	2	6	440306	440311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623638
5054	NC_015847	AAT	2	6	440418	440423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623638
5055	NC_015847	TTA	2	6	440442	440447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623638
5056	NC_015847	AAT	2	6	441047	441052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623639
5057	NC_015847	TAC	2	6	441151	441156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623639
5058	NC_015847	ACT	2	6	441173	441178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623639
5059	NC_015847	TAA	2	6	441591	441596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623640
5060	NC_015847	ATT	2	6	441649	441654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623640
5061	NC_015847	TAA	2	6	441681	441686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623640
5062	NC_015847	TTA	2	6	441725	441730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623640
5063	NC_015847	TCA	2	6	441787	441792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623640
5064	NC_015847	GTT	2	6	441849	441854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623641
5065	NC_015847	ATT	2	6	441901	441906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623641
5066	NC_015847	GAT	2	6	442048	442053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623641
5067	NC_015847	CAT	2	6	442142	442147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623641
5068	NC_015847	TCT	2	6	442156	442161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623641
5069	NC_015847	ATA	2	6	442189	442194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623641
5070	NC_015847	CAA	2	6	442229	442234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623641
5071	NC_015847	TTG	2	6	442364	442369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623641
5072	NC_015847	AAG	2	6	442464	442469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623641
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5075	NC_015847	TCA	2	6	442622	442627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623641
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5080	NC_015847	TTC	2	6	443263	443268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623642
5081	NC_015847	CTT	2	6	443430	443435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623642
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5086	NC_015847	ATT	2	6	443834	443839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623643
5087	NC_015847	ATT	2	6	443877	443882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623643
5088	NC_015847	ATC	2	6	443933	443938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623643
5089	NC_015847	AAC	2	6	443939	443944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623643
5090	NC_015847	TAC	2	6	444005	444010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623643
5091	NC_015847	ATT	2	6	444101	444106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623643
5092	NC_015847	GGT	2	6	444237	444242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623643
5093	NC_015847	GTC	2	6	444516	444521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623644
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5095	NC_015847	TCA	2	6	444736	444741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623644
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5099	NC_015847	CGG	2	6	446449	446454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340623645
5100	NC_015847	AAG	2	6	446485	446490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623645
5101	NC_015847	TTG	3	9	446502	446510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623645
5102	NC_015847	GAA	2	6	446520	446525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623645
5103	NC_015847	AAG	2	6	446542	446547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623645
5104	NC_015847	TGA	2	6	446593	446598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623645
5105	NC_015847	GAA	2	6	446630	446635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623645
5106	NC_015847	CAT	2	6	446737	446742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623645
5107	NC_015847	CAG	2	6	446756	446761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623645
5108	NC_015847	ACT	2	6	446768	446773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623645
5109	NC_015847	TCT	2	6	446868	446873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623645
5110	NC_015847	TGC	2	6	446929	446934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623645
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