MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 5874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	TTAA	2	8	10	17	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015562	TTTA	2	8	64	71	25 %	75 %	0 %	0 %	333909895
3	NC_015562	CAAT	2	8	291	298	50 %	25 %	0 %	25 %	333909896
4	NC_015562	AGTC	3	12	543	554	25 %	25 %	25 %	25 %	333909896
5	NC_015562	AGAA	2	8	722	729	75 %	0 %	25 %	0 %	333909896
6	NC_015562	AGTT	2	8	871	878	25 %	50 %	25 %	0 %	333909896
7	NC_015562	AGCA	2	8	1063	1070	50 %	0 %	25 %	25 %	333909896
8	NC_015562	AAGG	2	8	1118	1125	50 %	0 %	50 %	0 %	333909896
9	NC_015562	TTCA	2	8	1274	1281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015562	ATTC	2	8	1354	1361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015562	ATTT	2	8	1392	1399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015562	TGTA	2	8	1438	1445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015562	GTGA	2	8	1463	1470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015562	TGCT	2	8	1497	1504	0 %	50 %	25 %	25 %	333909897
15	NC_015562	AAAC	2	8	1785	1792	75 %	0 %	0 %	25 %	333909897
16	NC_015562	GCAT	2	8	2050	2057	25 %	25 %	25 %	25 %	333909897
17	NC_015562	ATCA	2	8	2503	2510	50 %	25 %	0 %	25 %	333909897
18	NC_015562	AGAT	2	8	2556	2563	50 %	25 %	25 %	0 %	333909897
19	NC_015562	TAAA	2	8	3019	3026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015562	TTAA	2	8	3158	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015562	AAAT	2	8	3550	3557	75 %	25 %	0 %	0 %	333909898
22	NC_015562	GCAT	2	8	3829	3836	25 %	25 %	25 %	25 %	333909898
23	NC_015562	ATCC	2	8	3921	3928	25 %	25 %	0 %	50 %	333909899
24	NC_015562	TTTC	2	8	3987	3994	0 %	75 %	0 %	25 %	333909899
25	NC_015562	CTTT	2	8	4416	4423	0 %	75 %	0 %	25 %	333909899
26	NC_015562	TAAG	2	8	4850	4857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015562	TAAA	2	8	4866	4873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015562	AAGG	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	333909900
29	NC_015562	TAAG	2	8	5538	5545	50 %	25 %	25 %	0 %	333909900
30	NC_015562	AAAT	2	8	5550	5557	75 %	25 %	0 %	0 %	333909900
31	NC_015562	TTCT	2	8	5665	5672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015562	AGAT	2	8	5772	5779	50 %	25 %	25 %	0 %	333909901
33	NC_015562	ATGG	2	8	5813	5820	25 %	25 %	50 %	0 %	333909901
34	NC_015562	GATT	2	8	6430	6437	25 %	50 %	25 %	0 %	333909901
35	NC_015562	TGAA	2	8	6854	6861	50 %	25 %	25 %	0 %	333909902
36	NC_015562	AATT	2	8	6950	6957	50 %	50 %	0 %	0 %	333909902
37	NC_015562	AATT	2	8	7014	7021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015562	TTAG	2	8	7253	7260	25 %	50 %	25 %	0 %	333909903
39	NC_015562	ATTG	2	8	7525	7532	25 %	50 %	25 %	0 %	333909903
40	NC_015562	TAAA	2	8	7951	7958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015562	AGTT	2	8	8358	8365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015562	TTTA	2	8	8500	8507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015562	CAAA	3	12	8614	8625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015562	TCTT	2	8	8735	8742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015562	AAGA	2	8	8793	8800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015562	TTAA	2	8	9027	9034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015562	ATTT	2	8	9220	9227	25 %	75 %	0 %	0 %	333909904
48	NC_015562	ACAT	2	8	9386	9393	50 %	25 %	0 %	25 %	333909904
49	NC_015562	ATCA	2	8	9617	9624	50 %	25 %	0 %	25 %	333909904
50	NC_015562	CATT	2	8	10156	10163	25 %	50 %	0 %	25 %	333909904
51	NC_015562	TCCA	2	8	10348	10355	25 %	25 %	0 %	50 %	333909904
52	NC_015562	TTAA	2	8	10485	10492	50 %	50 %	0 %	0 %	333909904
53	NC_015562	AATT	2	8	10685	10692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015562	TGAA	2	8	11001	11008	50 %	25 %	25 %	0 %	333909905
55	NC_015562	TATC	2	8	11119	11126	25 %	50 %	0 %	25 %	333909905
56	NC_015562	AATT	2	8	11427	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	333909906
57	NC_015562	CATG	2	8	11901	11908	25 %	25 %	25 %	25 %	333909906
58	NC_015562	TCCT	2	8	12579	12586	0 %	50 %	0 %	50 %	333909906
59	NC_015562	ATAA	2	8	12730	12737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015562	TTTA	2	8	12758	12765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015562	ACTG	2	8	13087	13094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015562	TATT	2	8	13101	13108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015562	TACT	2	8	13325	13332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015562	ATTT	2	8	13631	13638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015562	GGGA	2	8	13727	13734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015562	ATAA	2	8	13745	13752	75 %	25 %	0 %	0 %	333909908
67	NC_015562	ATGA	2	8	13820	13827	50 %	25 %	25 %	0 %	333909908
68	NC_015562	CAAC	2	8	14104	14111	50 %	0 %	0 %	50 %	333909908
69	NC_015562	ATTT	2	8	14587	14594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015562	TATT	2	8	14628	14635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015562	CAAA	2	8	14749	14756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015562	ATTA	2	8	14872	14879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015562	GAAA	2	8	14881	14888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015562	AAAT	2	8	14904	14911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015562	ACAT	2	8	14919	14926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015562	AGAT	2	8	15474	15481	50 %	25 %	25 %	0 %	333909909
77	NC_015562	AAAG	2	8	16029	16036	75 %	0 %	25 %	0 %	333909909
78	NC_015562	GTAT	2	8	16273	16280	25 %	50 %	25 %	0 %	333909910
79	NC_015562	TTCA	2	8	16306	16313	25 %	50 %	0 %	25 %	333909910
80	NC_015562	AAGA	2	8	17416	17423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015562	TTAA	2	8	17483	17490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015562	AAAT	2	8	17499	17506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015562	TTAT	2	8	17701	17708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015562	ATAA	2	8	17772	17779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015562	TAAA	2	8	17940	17947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015562	TCCA	2	8	18646	18653	25 %	25 %	0 %	50 %	333909911
87	NC_015562	GTTT	2	8	19024	19031	0 %	75 %	25 %	0 %	333909911
88	NC_015562	ATTT	2	8	19684	19691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015562	AGGG	2	8	19724	19731	25 %	0 %	75 %	0 %	333909912
90	NC_015562	TAAA	2	8	19990	19997	75 %	25 %	0 %	0 %	333909912
91	NC_015562	CTTT	2	8	20184	20191	0 %	75 %	0 %	25 %	333909912
92	NC_015562	TCCA	2	8	20475	20482	25 %	25 %	0 %	50 %	333909912
93	NC_015562	TCTT	2	8	20574	20581	0 %	75 %	0 %	25 %	333909912
94	NC_015562	CTCC	2	8	20813	20820	0 %	25 %	0 %	75 %	333909912
95	NC_015562	TTTC	2	8	20962	20969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015562	CAAC	2	8	21286	21293	50 %	0 %	0 %	50 %	333909913
97	NC_015562	ACAA	2	8	21516	21523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015562	TGTA	2	8	21678	21685	25 %	50 %	25 %	0 %	333909914
99	NC_015562	TAAT	2	8	22444	22451	50 %	50 %	0 %	0 %	333909915
100	NC_015562	TCAT	2	8	23140	23147	25 %	50 %	0 %	25 %	333909915
101	NC_015562	ACCA	2	8	23207	23214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015562	GCTT	2	8	23637	23644	0 %	50 %	25 %	25 %	333909916
103	NC_015562	GTAT	2	8	23984	23991	25 %	50 %	25 %	0 %	333909916
104	NC_015562	ATGA	2	8	24512	24519	50 %	25 %	25 %	0 %	333909917
105	NC_015562	TCCT	2	8	24973	24980	0 %	50 %	0 %	50 %	333909917
106	NC_015562	ATTT	2	8	25622	25629	25 %	75 %	0 %	0 %	333909917
107	NC_015562	AGAA	2	8	26613	26620	75 %	0 %	25 %	0 %	333909918
108	NC_015562	TATG	2	8	26953	26960	25 %	50 %	25 %	0 %	333909918
109	NC_015562	TTGG	2	8	27173	27180	0 %	50 %	50 %	0 %	333909918
110	NC_015562	GATG	2	8	27247	27254	25 %	25 %	50 %	0 %	333909918
111	NC_015562	ATAG	2	8	27473	27480	50 %	25 %	25 %	0 %	333909918
112	NC_015562	GACA	2	8	28265	28272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015562	TATC	2	8	28624	28631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015562	TATT	2	8	28686	28693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015562	TATC	2	8	29340	29347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015562	TAAA	2	8	30166	30173	75 %	25 %	0 %	0 %	333909920
117	NC_015562	TTAA	2	8	30870	30877	50 %	50 %	0 %	0 %	333909920
118	NC_015562	TTTG	2	8	31193	31200	0 %	75 %	25 %	0 %	333909920
119	NC_015562	AAAT	2	8	31615	31622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015562	AAAT	2	8	31662	31669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015562	TTAT	2	8	31919	31926	25 %	75 %	0 %	0 %	333909921
122	NC_015562	TTCA	2	8	31975	31982	25 %	50 %	0 %	25 %	333909921
123	NC_015562	GAAA	2	8	32578	32585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015562	ATCA	2	8	32963	32970	50 %	25 %	0 %	25 %	333909922
125	NC_015562	ACCC	2	8	33215	33222	25 %	0 %	0 %	75 %	333909922
126	NC_015562	CTTT	2	8	33235	33242	0 %	75 %	0 %	25 %	333909922
127	NC_015562	TAGA	2	8	33506	33513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015562	AGTA	2	8	33515	33522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015562	CAAT	2	8	33952	33959	50 %	25 %	0 %	25 %	333909923
130	NC_015562	TGAT	2	8	34167	34174	25 %	50 %	25 %	0 %	333909923
131	NC_015562	AATT	2	8	34284	34291	50 %	50 %	0 %	0 %	333909923
132	NC_015562	AATA	2	8	34522	34529	75 %	25 %	0 %	0 %	333909923
133	NC_015562	ATTA	2	8	34999	35006	50 %	50 %	0 %	0 %	333909923
134	NC_015562	TTAA	2	8	35349	35356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015562	AAAC	2	8	35685	35692	75 %	0 %	0 %	25 %	333909924
136	NC_015562	TGTA	2	8	37167	37174	25 %	50 %	25 %	0 %	333909926
137	NC_015562	TAAA	2	8	37358	37365	75 %	25 %	0 %	0 %	333909926
138	NC_015562	CATC	2	8	37438	37445	25 %	25 %	0 %	50 %	333909926
139	NC_015562	AAAT	2	8	37487	37494	75 %	25 %	0 %	0 %	333909926
140	NC_015562	TGAA	2	8	37760	37767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015562	TAAA	2	8	37788	37795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015562	ATTT	2	8	37936	37943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015562	TACA	2	8	39143	39150	50 %	25 %	0 %	25 %	333909928
144	NC_015562	CAAT	2	8	39575	39582	50 %	25 %	0 %	25 %	333909928
145	NC_015562	CTAT	2	8	40193	40200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015562	AAGC	2	8	40842	40849	50 %	0 %	25 %	25 %	333909929
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148	NC_015562	AATG	2	8	41572	41579	50 %	25 %	25 %	0 %	333909929
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