MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 5874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015562	ATTT	2	8	304116	304123	25 %	75 %	0 %	0 %	333910186
1002	NC_015562	AATG	2	8	304588	304595	50 %	25 %	25 %	0 %	333910186
1003	NC_015562	ATTT	2	8	304975	304982	25 %	75 %	0 %	0 %	333910187
1004	NC_015562	ATTT	2	8	305294	305301	25 %	75 %	0 %	0 %	333910187
1005	NC_015562	TAAA	2	8	305309	305316	75 %	25 %	0 %	0 %	333910187
1006	NC_015562	GTTT	2	8	305402	305409	0 %	75 %	25 %	0 %	333910187
1007	NC_015562	GGGA	2	8	305511	305518	25 %	0 %	75 %	0 %	333910187
1008	NC_015562	AGTT	2	8	305624	305631	25 %	50 %	25 %	0 %	333910187
1009	NC_015562	TTAA	2	8	305875	305882	50 %	50 %	0 %	0 %	333910187
1010	NC_015562	ATTA	2	8	306099	306106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015562	GTTT	2	8	306312	306319	0 %	75 %	25 %	0 %	333910188
1012	NC_015562	TCAA	2	8	306575	306582	50 %	25 %	0 %	25 %	333910188
1013	NC_015562	TTTG	2	8	306856	306863	0 %	75 %	25 %	0 %	333910188
1014	NC_015562	CCAT	2	8	306936	306943	25 %	25 %	0 %	50 %	333910188
1015	NC_015562	TATT	2	8	307562	307569	25 %	75 %	0 %	0 %	333910189
1016	NC_015562	ATAA	2	8	308208	308215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015562	ATTG	2	8	308352	308359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015562	CAAA	2	8	308523	308530	75 %	0 %	0 %	25 %	333910190
1019	NC_015562	TTAT	2	8	309633	309640	25 %	75 %	0 %	0 %	333910191
1020	NC_015562	TAAA	2	8	309655	309662	75 %	25 %	0 %	0 %	333910191
1021	NC_015562	AACA	2	8	310575	310582	75 %	0 %	0 %	25 %	333910192
1022	NC_015562	AAAG	2	8	310738	310745	75 %	0 %	25 %	0 %	333910192
1023	NC_015562	AATT	2	8	311115	311122	50 %	50 %	0 %	0 %	333910192
1024	NC_015562	AAAG	2	8	311178	311185	75 %	0 %	25 %	0 %	333910192
1025	NC_015562	GTAT	2	8	311446	311453	25 %	50 %	25 %	0 %	333910192
1026	NC_015562	TCTT	2	8	311861	311868	0 %	75 %	0 %	25 %	333910192
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1029	NC_015562	GTTT	2	8	312282	312289	0 %	75 %	25 %	0 %	333910192
1030	NC_015562	TGTA	2	8	312362	312369	25 %	50 %	25 %	0 %	333910192
1031	NC_015562	ATGA	2	8	312549	312556	50 %	25 %	25 %	0 %	333910193
1032	NC_015562	ATAA	2	8	312645	312652	75 %	25 %	0 %	0 %	333910193
1033	NC_015562	ATTA	2	8	312737	312744	50 %	50 %	0 %	0 %	333910193
1034	NC_015562	CAAA	2	8	312826	312833	75 %	0 %	0 %	25 %	333910193
1035	NC_015562	ACAA	2	8	312909	312916	75 %	0 %	0 %	25 %	333910193
1036	NC_015562	AATG	2	8	313166	313173	50 %	25 %	25 %	0 %	333910193
1037	NC_015562	TACA	2	8	313488	313495	50 %	25 %	0 %	25 %	333910193
1038	NC_015562	TTCA	2	8	314332	314339	25 %	50 %	0 %	25 %	333910195
1039	NC_015562	CCAT	2	8	314656	314663	25 %	25 %	0 %	50 %	333910196
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1041	NC_015562	TCCC	2	8	315330	315337	0 %	25 %	0 %	75 %	333910197
1042	NC_015562	CTAT	2	8	315451	315458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_015562	CTTT	2	8	316034	316041	0 %	75 %	0 %	25 %	333910199
1044	NC_015562	CTAT	2	8	316513	316520	25 %	50 %	0 %	25 %	333910199
1045	NC_015562	AAAT	2	8	316928	316935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015562	CAAA	2	8	316983	316990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_015562	CCCT	2	8	317466	317473	0 %	25 %	0 %	75 %	333910200
1048	NC_015562	ATAA	2	8	317832	317839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015562	TTGT	2	8	317910	317917	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015562	AGAT	2	8	318368	318375	50 %	25 %	25 %	0 %	333910201
1051	NC_015562	TAAA	2	8	318553	318560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015562	ATTT	2	8	318603	318610	25 %	75 %	0 %	0 %	333910202
1053	NC_015562	CATG	2	8	318695	318702	25 %	25 %	25 %	25 %	333910202
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1055	NC_015562	AATT	2	8	319083	319090	50 %	50 %	0 %	0 %	333910203
1056	NC_015562	ATAA	2	8	320016	320023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015562	TAAA	2	8	320174	320181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015562	ATAA	2	8	320362	320369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015562	TTAT	2	8	320429	320436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_015562	TTTA	2	8	321218	321225	25 %	75 %	0 %	0 %	333910204
1063	NC_015562	AGTA	2	8	322708	322715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015562	CAAA	2	8	322818	322825	75 %	0 %	0 %	25 %	333910205
1065	NC_015562	ACAA	2	8	323285	323292	75 %	0 %	0 %	25 %	333910205
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1067	NC_015562	ATTT	2	8	323404	323411	25 %	75 %	0 %	0 %	333910205
1068	NC_015562	TTAA	2	8	323804	323811	50 %	50 %	0 %	0 %	333910206
1069	NC_015562	ATAA	2	8	325055	325062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015562	CATA	2	8	325149	325156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1072	NC_015562	AACC	2	8	325549	325556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_015562	AGTA	2	8	325941	325948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015562	TTAA	2	8	325986	325993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_015562	AGGA	2	8	327063	327070	50 %	0 %	50 %	0 %	333910208
1078	NC_015562	TATT	2	8	327433	327440	25 %	75 %	0 %	0 %	333910208
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1085	NC_015562	ATAA	2	8	330899	330906	75 %	25 %	0 %	0 %	333910210
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1089	NC_015562	AAAG	2	8	331721	331728	75 %	0 %	25 %	0 %	333910211
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1095	NC_015562	ATTA	2	8	332973	332980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015562	AGAT	2	8	333225	333232	50 %	25 %	25 %	0 %	333910212
1097	NC_015562	AACC	2	8	333308	333315	50 %	0 %	0 %	50 %	333910213
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1099	NC_015562	TAAT	2	8	335029	335036	50 %	50 %	0 %	0 %	333910215
1100	NC_015562	GTTT	2	8	335081	335088	0 %	75 %	25 %	0 %	333910215
1101	NC_015562	GAAA	2	8	335673	335680	75 %	0 %	25 %	0 %	333910215
1102	NC_015562	AGGA	2	8	336179	336186	50 %	0 %	50 %	0 %	333910216
1103	NC_015562	ATTC	2	8	336284	336291	25 %	50 %	0 %	25 %	333910216
1104	NC_015562	AAAC	2	8	336480	336487	75 %	0 %	0 %	25 %	333910216
1105	NC_015562	TAAA	2	8	336569	336576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015562	TAAA	2	8	336665	336672	75 %	25 %	0 %	0 %	333910217
1107	NC_015562	TAGA	2	8	336719	336726	50 %	25 %	25 %	0 %	333910217
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1109	NC_015562	GAAA	2	8	338202	338209	75 %	0 %	25 %	0 %	333910218
1110	NC_015562	ATTA	2	8	338339	338346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015562	AATT	2	8	338617	338624	50 %	50 %	0 %	0 %	333910219
1112	NC_015562	AACC	2	8	339059	339066	50 %	0 %	0 %	50 %	333910219
1113	NC_015562	TACT	2	8	339574	339581	25 %	50 %	0 %	25 %	333910219
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1115	NC_015562	ATGA	2	8	339750	339757	50 %	25 %	25 %	0 %	333910219
1116	NC_015562	TCCT	2	8	340271	340278	0 %	50 %	0 %	50 %	333910219
1117	NC_015562	ATTT	2	8	340321	340328	25 %	75 %	0 %	0 %	333910219
1118	NC_015562	ATTT	2	8	340835	340842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015562	TAAA	2	8	340891	340898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1123	NC_015562	ATTT	2	8	342261	342268	25 %	75 %	0 %	0 %	333910220
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1125	NC_015562	TCTT	2	8	342381	342388	0 %	75 %	0 %	25 %	333910220
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1128	NC_015562	ATTA	2	8	342810	342817	50 %	50 %	0 %	0 %	333910220
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1131	NC_015562	TTAT	2	8	344076	344083	25 %	75 %	0 %	0 %	333910221
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