MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 4523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015422	ACCAC	2	10	1419	1428	40 %	0 %	0 %	60 %	330822654
2	NC_015422	ACAAG	2	10	1672	1681	60 %	0 %	20 %	20 %	330822655
3	NC_015422	CCACG	2	10	3698	3707	20 %	0 %	20 %	60 %	330822656
4	NC_015422	CAGGC	2	10	4932	4941	20 %	0 %	40 %	40 %	330822656
5	NC_015422	TGCGC	2	10	5429	5438	0 %	20 %	40 %	40 %	330822656
6	NC_015422	CTTGG	2	10	5685	5694	0 %	40 %	40 %	20 %	330822657
7	NC_015422	TGTGG	2	10	7591	7600	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015422	GTTGC	2	10	8575	8584	0 %	40 %	40 %	20 %	330822659
9	NC_015422	TTTGT	2	10	9585	9594	0 %	80 %	20 %	0 %	330822661
10	NC_015422	GGCGC	2	10	10717	10726	0 %	0 %	60 %	40 %	330822662
11	NC_015422	CCAGG	2	10	10827	10836	20 %	0 %	40 %	40 %	330822662
12	NC_015422	CCGGG	2	10	10908	10917	0 %	0 %	60 %	40 %	330822663
13	NC_015422	CAGGC	2	10	12582	12591	20 %	0 %	40 %	40 %	330822664
14	NC_015422	CCAGG	2	10	14391	14400	20 %	0 %	40 %	40 %	330822666
15	NC_015422	TGCGC	2	10	15687	15696	0 %	20 %	40 %	40 %	330822667
16	NC_015422	GCGCC	2	10	16239	16248	0 %	0 %	40 %	60 %	330822667
17	NC_015422	CTGCC	2	10	16918	16927	0 %	20 %	20 %	60 %	330822668
18	NC_015422	CTGCA	2	10	17158	17167	20 %	20 %	20 %	40 %	330822668
19	NC_015422	GCGCC	2	10	18252	18261	0 %	0 %	40 %	60 %	330822668
20	NC_015422	GGCCG	2	10	20652	20661	0 %	0 %	60 %	40 %	330822670
21	NC_015422	CGGCC	2	10	20973	20982	0 %	0 %	40 %	60 %	330822670
22	NC_015422	TGCGC	2	10	21575	21584	0 %	20 %	40 %	40 %	330822670
23	NC_015422	CGGGG	2	10	21870	21879	0 %	0 %	80 %	20 %	330822671
24	NC_015422	GCACT	2	10	22042	22051	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015422	CCGCC	2	10	22463	22472	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_015422	CAGCC	2	10	22685	22694	20 %	0 %	20 %	60 %	330822673
27	NC_015422	CCCTG	2	10	22732	22741	0 %	20 %	20 %	60 %	330822673
28	NC_015422	CGCGG	2	10	23495	23504	0 %	0 %	60 %	40 %	330822673
29	NC_015422	GCGCC	2	10	23881	23890	0 %	0 %	40 %	60 %	330822673
30	NC_015422	CGCGG	2	10	25201	25210	0 %	0 %	60 %	40 %	330822674
31	NC_015422	CGCCC	2	10	26140	26149	0 %	0 %	20 %	80 %	330822674
32	NC_015422	GCGCG	2	10	26185	26194	0 %	0 %	60 %	40 %	330822674
33	NC_015422	CGCGC	2	10	29743	29752	0 %	0 %	40 %	60 %	330822678
34	NC_015422	GGGCG	2	10	31705	31714	0 %	0 %	80 %	20 %	330822678
35	NC_015422	TCCCG	2	10	33970	33979	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015422	GACCC	2	10	33991	34000	20 %	0 %	20 %	60 %	330822680
37	NC_015422	GCGCC	2	10	35540	35549	0 %	0 %	40 %	60 %	330822681
38	NC_015422	CAGGG	2	10	35896	35905	20 %	0 %	60 %	20 %	330822681
39	NC_015422	GCGCA	2	10	36256	36265	20 %	0 %	40 %	40 %	330822682
40	NC_015422	CCGGC	2	10	37031	37040	0 %	0 %	40 %	60 %	330822682
41	NC_015422	GGCGC	2	10	37057	37066	0 %	0 %	60 %	40 %	330822682
42	NC_015422	GCGCC	2	10	39995	40004	0 %	0 %	40 %	60 %	330822684
43	NC_015422	GGGTT	2	10	42311	42320	0 %	40 %	60 %	0 %	330822687
44	NC_015422	GCGCC	2	10	43103	43112	0 %	0 %	40 %	60 %	330822688
45	NC_015422	CAGGC	2	10	43547	43556	20 %	0 %	40 %	40 %	330822688
46	NC_015422	GCCGC	2	10	43694	43703	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015422	CGCGC	2	10	43705	43714	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_015422	GGCCG	2	10	44989	44998	0 %	0 %	60 %	40 %	330822690
49	NC_015422	AGGCC	2	10	45157	45166	20 %	0 %	40 %	40 %	330822690
50	NC_015422	GCTGG	2	10	45715	45724	0 %	20 %	60 %	20 %	330822690
51	NC_015422	GGCCC	2	10	46169	46178	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_015422	TTCGC	2	10	47878	47887	0 %	40 %	20 %	40 %	330822692
53	NC_015422	AGGTA	2	10	48416	48425	40 %	20 %	40 %	0 %	330822692
54	NC_015422	CGTGG	2	10	48429	48438	0 %	20 %	60 %	20 %	330822692
55	NC_015422	CCGGC	2	10	48705	48714	0 %	0 %	40 %	60 %	330822693
56	NC_015422	GCTGC	2	10	48781	48790	0 %	20 %	40 %	40 %	330822693
57	NC_015422	CGCGG	2	10	51262	51271	0 %	0 %	60 %	40 %	330822695
58	NC_015422	CGCAC	2	10	51545	51554	20 %	0 %	20 %	60 %	330822695
59	NC_015422	AGCCC	2	10	51999	52008	20 %	0 %	20 %	60 %	330822696
60	NC_015422	GCGCA	2	10	52570	52579	20 %	0 %	40 %	40 %	330822696
61	NC_015422	CGCAG	3	15	53078	53092	20 %	0 %	40 %	40 %	330822696
62	NC_015422	GCGCG	2	10	53700	53709	0 %	0 %	60 %	40 %	330822697
63	NC_015422	TGGCG	2	10	56358	56367	0 %	20 %	60 %	20 %	330822697
64	NC_015422	CCTGG	2	10	57322	57331	0 %	20 %	40 %	40 %	330822698
65	NC_015422	GGCCG	2	10	57934	57943	0 %	0 %	60 %	40 %	330822698
66	NC_015422	GCCGG	2	10	58582	58591	0 %	0 %	60 %	40 %	330822699
67	NC_015422	GCAGC	2	10	59444	59453	20 %	0 %	40 %	40 %	330822700
68	NC_015422	GCGCG	2	10	59623	59632	0 %	0 %	60 %	40 %	330822700
69	NC_015422	GCCGC	2	10	60093	60102	0 %	0 %	40 %	60 %	330822700
70	NC_015422	CGTGC	2	10	60518	60527	0 %	20 %	40 %	40 %	330822701
71	NC_015422	GCCGT	2	10	60792	60801	0 %	20 %	40 %	40 %	330822701
72	NC_015422	GCAGG	2	10	61477	61486	20 %	0 %	60 %	20 %	330822701
73	NC_015422	GCGCC	2	10	61786	61795	0 %	0 %	40 %	60 %	330822702
74	NC_015422	GCGGG	2	10	62790	62799	0 %	0 %	80 %	20 %	330822703
75	NC_015422	TAGGC	2	10	63285	63294	20 %	20 %	40 %	20 %	330822703
76	NC_015422	GGGCG	3	15	66817	66831	0 %	0 %	80 %	20 %	330822708
77	NC_015422	CGGGC	2	10	67345	67354	0 %	0 %	60 %	40 %	330822709
78	NC_015422	GCGTG	2	10	70291	70300	0 %	20 %	60 %	20 %	330822713
79	NC_015422	GCGCG	2	10	71401	71410	0 %	0 %	60 %	40 %	330822714
80	NC_015422	GGCGC	2	10	72552	72561	0 %	0 %	60 %	40 %	330822715
81	NC_015422	GGCGG	2	10	73093	73102	0 %	0 %	80 %	20 %	330822715
82	NC_015422	CTGGG	2	10	73625	73634	0 %	20 %	60 %	20 %	330822716
83	NC_015422	CGCGC	3	15	77794	77808	0 %	0 %	40 %	60 %	330822721
84	NC_015422	GCCGT	2	10	79452	79461	0 %	20 %	40 %	40 %	330822723
85	NC_015422	GCGCG	2	10	80482	80491	0 %	0 %	60 %	40 %	330822724
86	NC_015422	GCCGC	2	10	80716	80725	0 %	0 %	40 %	60 %	330822724
87	NC_015422	TCGGC	2	10	82067	82076	0 %	20 %	40 %	40 %	330822726
88	NC_015422	GCCGT	2	10	83141	83150	0 %	20 %	40 %	40 %	330822727
89	NC_015422	GGCGG	2	10	84250	84259	0 %	0 %	80 %	20 %	330822728
90	NC_015422	CGTTG	2	10	84601	84610	0 %	40 %	40 %	20 %	330822728
91	NC_015422	TGATG	2	10	86658	86667	20 %	40 %	40 %	0 %	330822731
92	NC_015422	CCGCG	2	10	87687	87696	0 %	0 %	40 %	60 %	330822732
93	NC_015422	GCGCC	2	10	88424	88433	0 %	0 %	40 %	60 %	330822732
94	NC_015422	GGCCG	2	10	88657	88666	0 %	0 %	60 %	40 %	330822732
95	NC_015422	CGCTG	2	10	90751	90760	0 %	20 %	40 %	40 %	330822733
96	NC_015422	GCCGA	2	10	91627	91636	20 %	0 %	40 %	40 %	330822734
97	NC_015422	TGGCC	2	10	91739	91748	0 %	20 %	40 %	40 %	330822734
98	NC_015422	GCGCC	2	10	92924	92933	0 %	0 %	40 %	60 %	330822735
99	NC_015422	CCGCG	2	10	94322	94331	0 %	0 %	40 %	60 %	330822737
100	NC_015422	CTGCG	2	10	94584	94593	0 %	20 %	40 %	40 %	330822737
101	NC_015422	CGGCG	2	10	94817	94826	0 %	0 %	60 %	40 %	330822737
102	NC_015422	CGGCC	2	10	95690	95699	0 %	0 %	40 %	60 %	330822738
103	NC_015422	GACCT	2	10	95715	95724	20 %	20 %	20 %	40 %	330822738
104	NC_015422	TGCGC	2	10	97557	97566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015422	TGGGG	2	10	97792	97801	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015422	CCCGC	2	10	98924	98933	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
107	NC_015422	CGTGG	2	10	99439	99448	0 %	20 %	60 %	20 %	330822740
108	NC_015422	GGCGA	2	10	101581	101590	20 %	0 %	60 %	20 %	330822744
109	NC_015422	TGGCC	2	10	101608	101617	0 %	20 %	40 %	40 %	330822744
110	NC_015422	CGCGC	2	10	101653	101662	0 %	0 %	40 %	60 %	330822744
111	NC_015422	CCACG	2	10	101807	101816	20 %	0 %	20 %	60 %	330822744
112	NC_015422	CGATC	2	10	102954	102963	20 %	20 %	20 %	40 %	330822745
113	NC_015422	CCCAT	2	10	104246	104255	20 %	20 %	0 %	60 %	330822746
114	NC_015422	GATCC	2	10	104266	104275	20 %	20 %	20 %	40 %	330822746
115	NC_015422	CCGCG	2	10	105239	105248	0 %	0 %	40 %	60 %	330822747
116	NC_015422	TGCGG	2	10	105680	105689	0 %	20 %	60 %	20 %	330822748
117	NC_015422	GCGCC	2	10	105829	105838	0 %	0 %	40 %	60 %	330822748
118	NC_015422	TGCCC	2	10	105909	105918	0 %	20 %	20 %	60 %	330822748
119	NC_015422	ATTGA	2	10	106226	106235	40 %	40 %	20 %	0 %	330822748
120	NC_015422	TGGCG	2	10	108294	108303	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015422	GCGCG	2	10	109700	109709	0 %	0 %	60 %	40 %	330822753
122	NC_015422	ATGCG	2	10	111138	111147	20 %	20 %	40 %	20 %	330822754
123	NC_015422	CTGGT	2	10	111266	111275	0 %	40 %	40 %	20 %	330822754
124	NC_015422	GCGGG	2	10	115292	115301	0 %	0 %	80 %	20 %	330822757
125	NC_015422	GTCCA	2	10	115406	115415	20 %	20 %	20 %	40 %	330822757
126	NC_015422	TCCTG	2	10	117022	117031	0 %	40 %	20 %	40 %	330822758
127	NC_015422	GCGCC	2	10	118596	118605	0 %	0 %	40 %	60 %	330822759
128	NC_015422	TGGCG	2	10	118638	118647	0 %	20 %	60 %	20 %	330822759
129	NC_015422	GGTGG	2	10	119448	119457	0 %	20 %	80 %	0 %	330822760
130	NC_015422	AGGTC	2	10	122168	122177	20 %	20 %	40 %	20 %	330822763
131	NC_015422	GGCGT	2	10	122434	122443	0 %	20 %	60 %	20 %	330822763
132	NC_015422	GGCGC	2	10	125039	125048	0 %	0 %	60 %	40 %	330822765
133	NC_015422	GCCGC	2	10	125504	125513	0 %	0 %	40 %	60 %	330822765
134	NC_015422	GCCGC	2	10	126152	126161	0 %	0 %	40 %	60 %	330822767
135	NC_015422	CTCCA	2	10	132062	132071	20 %	20 %	0 %	60 %	330822769
136	NC_015422	ACGCC	2	10	132193	132202	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_015422	GACCA	2	10	133812	133821	40 %	0 %	20 %	40 %	330822770
138	NC_015422	CAAAT	2	10	134640	134649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015422	CCGGC	2	10	135533	135542	0 %	0 %	40 %	60 %	330822771
140	NC_015422	GCCGC	2	10	135958	135967	0 %	0 %	40 %	60 %	330822771
141	NC_015422	CGCGG	2	10	135984	135993	0 %	0 %	60 %	40 %	330822771
142	NC_015422	GCGCC	2	10	136102	136111	0 %	0 %	40 %	60 %	330822771
143	NC_015422	CGGCG	2	10	138117	138126	0 %	0 %	60 %	40 %	330822773
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147	NC_015422	TCGGC	2	10	141784	141793	0 %	20 %	40 %	40 %	330822776
148	NC_015422	CGCGG	2	10	143078	143087	0 %	0 %	60 %	40 %	330822778
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150	NC_015422	GCCTG	2	10	148042	148051	0 %	20 %	40 %	40 %	330822782
151	NC_015422	GACGA	2	10	148449	148458	40 %	0 %	40 %	20 %	330822782
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154	NC_015422	GCCGG	2	10	153890	153899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
155	NC_015422	CGCAG	2	10	155924	155933	20 %	0 %	40 %	40 %	330822791
156	NC_015422	GGCGC	2	10	158819	158828	0 %	0 %	60 %	40 %	330822793
157	NC_015422	TGGCC	2	10	159642	159651	0 %	20 %	40 %	40 %	330822794
158	NC_015422	CGCGG	2	10	159727	159736	0 %	0 %	60 %	40 %	330822794
159	NC_015422	CTGGT	2	10	160992	161001	0 %	40 %	40 %	20 %	330822795
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162	NC_015422	CGCGG	2	10	163997	164006	0 %	0 %	60 %	40 %	330822798
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177	NC_015422	CCGGC	2	10	173767	173776	0 %	0 %	40 %	60 %	330822807
178	NC_015422	GCGCG	3	15	174218	174232	0 %	0 %	60 %	40 %	330822807
179	NC_015422	CGGTG	2	10	176452	176461	0 %	20 %	60 %	20 %	330822809
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184	NC_015422	GGGGC	2	10	178719	178728	0 %	0 %	80 %	20 %	330822811
185	NC_015422	GCGCT	2	10	178774	178783	0 %	20 %	40 %	40 %	330822811
186	NC_015422	TGGCA	2	10	179148	179157	20 %	20 %	40 %	20 %	330822812
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188	NC_015422	CCGCG	2	10	180234	180243	0 %	0 %	40 %	60 %	330822813
189	NC_015422	CTGCC	2	10	181015	181024	0 %	20 %	20 %	60 %	330822813
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196	NC_015422	GCGCC	2	10	188696	188705	0 %	0 %	40 %	60 %	330822820
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222	NC_015422	GCCCC	2	10	210962	210971	0 %	0 %	20 %	80 %	330822840
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238	NC_015422	CGCGG	2	10	225289	225298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
239	NC_015422	GCAGC	2	10	226041	226050	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
240	NC_015422	CTTCG	2	10	226730	226739	0 %	40 %	20 %	40 %	330822851
241	NC_015422	GCAAC	2	10	227209	227218	40 %	0 %	20 %	40 %	330822851
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243	NC_015422	GGCCG	2	10	233860	233869	0 %	0 %	60 %	40 %	330822853
244	NC_015422	CGCCC	2	10	235219	235228	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
245	NC_015422	CGGCG	2	10	236177	236186	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
246	NC_015422	GCCGC	2	10	236825	236834	0 %	0 %	40 %	60 %	330822856
247	NC_015422	CGGCG	2	10	238604	238613	0 %	0 %	60 %	40 %	330822857
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259	NC_015422	GCGCC	2	10	245069	245078	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
260	NC_015422	CTGTA	2	10	245653	245662	20 %	40 %	20 %	20 %	330822860
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263	NC_015422	CGCAG	2	10	253036	253045	20 %	0 %	40 %	40 %	330822865
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265	NC_015422	AGCAC	2	10	254417	254426	40 %	0 %	20 %	40 %	330822867
266	NC_015422	CGGGC	2	10	254754	254763	0 %	0 %	60 %	40 %	330822867
267	NC_015422	CGGGC	2	10	256017	256026	0 %	0 %	60 %	40 %	330822869
268	NC_015422	GCCGT	2	10	258388	258397	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
269	NC_015422	TACGC	2	10	259105	259114	20 %	20 %	20 %	40 %	330822871
270	NC_015422	CCGCG	2	10	259689	259698	0 %	0 %	40 %	60 %	330822871
271	NC_015422	GGCGC	2	10	261296	261305	0 %	0 %	60 %	40 %	330822873
272	NC_015422	GCGCG	2	10	263768	263777	0 %	0 %	60 %	40 %	330822874
273	NC_015422	ATGGC	2	10	263984	263993	20 %	20 %	40 %	20 %	330822874
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282	NC_015422	GCGCT	2	10	273156	273165	0 %	20 %	40 %	40 %	330822883
283	NC_015422	CGCGC	2	10	273965	273974	0 %	0 %	40 %	60 %	330822883
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287	NC_015422	CGGCG	2	10	276218	276227	0 %	0 %	60 %	40 %	330822885
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400	NC_015422	GCGCC	2	10	406838	406847	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
401	NC_015422	CGCGG	2	10	407029	407038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
402	NC_015422	CCCAG	2	10	407797	407806	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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