MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 4523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015422	GCGTA	2	10	517707	517716	20 %	20 %	40 %	20 %	330823127
502	NC_015422	GCGGG	2	10	518311	518320	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
503	NC_015422	CCCAG	2	10	518827	518836	20 %	0 %	20 %	60 %	330823128
504	NC_015422	CGGCG	2	10	519054	519063	0 %	0 %	60 %	40 %	330823128
505	NC_015422	TGCGC	2	10	519383	519392	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
506	NC_015422	GCCGT	2	10	519982	519991	0 %	20 %	40 %	40 %	330823129
507	NC_015422	GGGCC	2	10	520892	520901	0 %	0 %	60 %	40 %	330823130
508	NC_015422	ATCAG	2	10	521752	521761	40 %	20 %	20 %	20 %	330823131
509	NC_015422	GCCGC	2	10	527266	527275	0 %	0 %	40 %	60 %	330823135
510	NC_015422	ACCCG	2	10	528168	528177	20 %	0 %	20 %	60 %	330823136
511	NC_015422	GGGCT	2	10	529027	529036	0 %	20 %	60 %	20 %	330823136
512	NC_015422	GCTGC	2	10	529323	529332	0 %	20 %	40 %	40 %	330823136
513	NC_015422	GCGCC	2	10	529640	529649	0 %	0 %	40 %	60 %	330823136
514	NC_015422	GCCGC	2	10	530156	530165	0 %	0 %	40 %	60 %	330823137
515	NC_015422	CGCCC	2	10	530171	530180	0 %	0 %	20 %	80 %	330823137
516	NC_015422	CGCGG	2	10	530185	530194	0 %	0 %	60 %	40 %	330823137
517	NC_015422	GCGCC	2	10	531530	531539	0 %	0 %	40 %	60 %	330823139
518	NC_015422	ATTCG	2	10	532479	532488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
519	NC_015422	GCCGC	2	10	534536	534545	0 %	0 %	40 %	60 %	330823141
520	NC_015422	CAGGC	2	10	537462	537471	20 %	0 %	40 %	40 %	330823144
521	NC_015422	GGGCT	2	10	537603	537612	0 %	20 %	60 %	20 %	330823144
522	NC_015422	GGCCC	2	10	537661	537670	0 %	0 %	40 %	60 %	330823144
523	NC_015422	ACCGG	2	10	539190	539199	20 %	0 %	40 %	40 %	330823145
524	NC_015422	GGCGG	2	10	540966	540975	0 %	0 %	80 %	20 %	330823147
525	NC_015422	CTTGC	2	10	543471	543480	0 %	40 %	20 %	40 %	330823150
526	NC_015422	GCCGG	2	10	543972	543981	0 %	0 %	60 %	40 %	330823150
527	NC_015422	CAGGC	2	10	544302	544311	20 %	0 %	40 %	40 %	330823151
528	NC_015422	CCAGC	2	10	544442	544451	20 %	0 %	20 %	60 %	330823151
529	NC_015422	CACGC	2	10	544700	544709	20 %	0 %	20 %	60 %	330823151
530	NC_015422	ATGGC	2	10	544985	544994	20 %	20 %	40 %	20 %	330823152
531	NC_015422	GTGAC	2	10	545627	545636	20 %	20 %	40 %	20 %	330823153
532	NC_015422	TGCCG	2	10	546884	546893	0 %	20 %	40 %	40 %	330823154
533	NC_015422	CAGGA	2	10	547173	547182	40 %	0 %	40 %	20 %	330823155
534	NC_015422	GACGC	2	10	547354	547363	20 %	0 %	40 %	40 %	330823155
535	NC_015422	GCGCG	2	10	549624	549633	0 %	0 %	60 %	40 %	330823157
536	NC_015422	GGCCC	2	10	549947	549956	0 %	0 %	40 %	60 %	330823157
537	NC_015422	GTGCG	2	10	550931	550940	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
538	NC_015422	CGATG	2	10	551358	551367	20 %	20 %	40 %	20 %	330823158
539	NC_015422	TCGCG	2	10	553544	553553	0 %	20 %	40 %	40 %	330823160
540	NC_015422	GCGCC	2	10	554228	554237	0 %	0 %	40 %	60 %	330823160
541	NC_015422	CGGCG	2	10	557302	557311	0 %	0 %	60 %	40 %	330823162
542	NC_015422	AGGCC	2	10	558043	558052	20 %	0 %	40 %	40 %	330823162
543	NC_015422	GCAGG	2	10	558290	558299	20 %	0 %	60 %	20 %	330823162
544	NC_015422	GCGCT	2	10	558472	558481	0 %	20 %	40 %	40 %	330823162
545	NC_015422	GGACG	2	10	558500	558509	20 %	0 %	60 %	20 %	330823162
546	NC_015422	CGCGC	2	10	559383	559392	0 %	0 %	40 %	60 %	330823163
547	NC_015422	GCAGC	2	10	559462	559471	20 %	0 %	40 %	40 %	330823163
548	NC_015422	CTGCG	2	10	562890	562899	0 %	20 %	40 %	40 %	330823167
549	NC_015422	CGGCG	2	10	563460	563469	0 %	0 %	60 %	40 %	330823168
550	NC_015422	GGGCG	2	10	564284	564293	0 %	0 %	80 %	20 %	330823168
551	NC_015422	CCCGC	2	10	564362	564371	0 %	0 %	20 %	80 %	330823169
552	NC_015422	CGGCG	2	10	566225	566234	0 %	0 %	60 %	40 %	330823170
553	NC_015422	GCTGC	2	10	567478	567487	0 %	20 %	40 %	40 %	330823172
554	NC_015422	CGGCG	2	10	568104	568113	0 %	0 %	60 %	40 %	330823172
555	NC_015422	GCGGG	2	10	568122	568131	0 %	0 %	80 %	20 %	330823172
556	NC_015422	CGGCG	2	10	569556	569565	0 %	0 %	60 %	40 %	330823174
557	NC_015422	GCCGC	2	10	571539	571548	0 %	0 %	40 %	60 %	330823175
558	NC_015422	GCAGC	2	10	571598	571607	20 %	0 %	40 %	40 %	330823175
559	NC_015422	GCGGT	2	10	573003	573012	0 %	20 %	60 %	20 %	330823175
560	NC_015422	CGGCA	2	10	573424	573433	20 %	0 %	40 %	40 %	330823176
561	NC_015422	GCGCG	2	10	574140	574149	0 %	0 %	60 %	40 %	330823176
562	NC_015422	GGCGC	2	10	574780	574789	0 %	0 %	60 %	40 %	330823176
563	NC_015422	GCCGC	2	10	574937	574946	0 %	0 %	40 %	60 %	330823176
564	NC_015422	CAGGG	2	10	574991	575000	20 %	0 %	60 %	20 %	330823176
565	NC_015422	CGGCG	2	10	576146	576155	0 %	0 %	60 %	40 %	330823178
566	NC_015422	GCGCC	2	10	577864	577873	0 %	0 %	40 %	60 %	330823180
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568	NC_015422	GCCCA	2	10	580020	580029	20 %	0 %	20 %	60 %	330823183
569	NC_015422	GTTCG	2	10	580643	580652	0 %	40 %	40 %	20 %	330823184
570	NC_015422	GGCGC	2	10	581921	581930	0 %	0 %	60 %	40 %	330823185
571	NC_015422	TGCGC	2	10	586385	586394	0 %	20 %	40 %	40 %	330823192
572	NC_015422	CGGTG	2	10	587245	587254	0 %	20 %	60 %	20 %	330823193
573	NC_015422	TCCAG	2	10	587272	587281	20 %	20 %	20 %	40 %	330823193
574	NC_015422	GCGCG	2	10	589771	589780	0 %	0 %	60 %	40 %	330823194
575	NC_015422	CCGCG	2	10	590378	590387	0 %	0 %	40 %	60 %	330823195
576	NC_015422	CGCTG	2	10	591819	591828	0 %	20 %	40 %	40 %	330823197
577	NC_015422	CGGGC	2	10	592563	592572	0 %	0 %	60 %	40 %	330823197
578	NC_015422	TCGGC	2	10	594129	594138	0 %	20 %	40 %	40 %	330823199
579	NC_015422	GGCGA	2	10	594284	594293	20 %	0 %	60 %	20 %	330823199
580	NC_015422	CATCG	2	10	594622	594631	20 %	20 %	20 %	40 %	330823199
581	NC_015422	CGTCC	2	10	594763	594772	0 %	20 %	20 %	60 %	330823199
582	NC_015422	CCCAT	2	10	595591	595600	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
583	NC_015422	CGGTG	2	10	596488	596497	0 %	20 %	60 %	20 %	330823201
584	NC_015422	GCGCC	2	10	597006	597015	0 %	0 %	40 %	60 %	330823202
585	NC_015422	CGGGC	2	10	597263	597272	0 %	0 %	60 %	40 %	330823202
586	NC_015422	GATCA	2	10	599157	599166	40 %	20 %	20 %	20 %	330823205
587	NC_015422	CCGCG	2	10	599825	599834	0 %	0 %	40 %	60 %	330823205
588	NC_015422	GCCCA	2	10	600921	600930	20 %	0 %	20 %	60 %	330823206
589	NC_015422	GCGCG	2	10	601111	601120	0 %	0 %	60 %	40 %	330823206
590	NC_015422	CAGGC	2	10	601173	601182	20 %	0 %	40 %	40 %	330823206
591	NC_015422	CGGCG	2	10	603048	603057	0 %	0 %	60 %	40 %	330823209
592	NC_015422	CGGGG	2	10	608735	608744	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
593	NC_015422	GGCGT	2	10	610333	610342	0 %	20 %	60 %	20 %	330823214
594	NC_015422	CAGGT	2	10	611217	611226	20 %	20 %	40 %	20 %	330823215
595	NC_015422	CGGCG	2	10	612569	612578	0 %	0 %	60 %	40 %	330823216
596	NC_015422	GCGCG	2	10	613832	613841	0 %	0 %	60 %	40 %	330823217
597	NC_015422	TCACC	2	10	615758	615767	20 %	20 %	0 %	60 %	330823220
598	NC_015422	CCTGT	2	10	617704	617713	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
599	NC_015422	TGGGC	2	10	618335	618344	0 %	20 %	60 %	20 %	330823222
600	NC_015422	CCGCC	2	10	618723	618732	0 %	0 %	20 %	80 %	330823222
601	NC_015422	GCGCT	2	10	619048	619057	0 %	20 %	40 %	40 %	330823223
602	NC_015422	CGGCC	2	10	620551	620560	0 %	0 %	40 %	60 %	330823224
603	NC_015422	CGCGG	2	10	621280	621289	0 %	0 %	60 %	40 %	330823224
604	NC_015422	GCGCG	2	10	622551	622560	0 %	0 %	60 %	40 %	330823225
605	NC_015422	CAGCC	2	10	623018	623027	20 %	0 %	20 %	60 %	330823226
606	NC_015422	CTGGG	2	10	623231	623240	0 %	20 %	60 %	20 %	330823226
607	NC_015422	GCGCC	2	10	624509	624518	0 %	0 %	40 %	60 %	330823227
608	NC_015422	TCGCC	2	10	626083	626092	0 %	20 %	20 %	60 %	330823228
609	NC_015422	CTGGC	2	10	628536	628545	0 %	20 %	40 %	40 %	330823231
610	NC_015422	GTAGC	2	10	629434	629443	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
611	NC_015422	GGGCA	2	10	629455	629464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
612	NC_015422	TGCCG	2	10	629498	629507	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
613	NC_015422	GCGCG	2	10	630459	630468	0 %	0 %	60 %	40 %	330823234
614	NC_015422	AGGGC	2	10	631109	631118	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
615	NC_015422	GCAGC	2	10	632890	632899	20 %	0 %	40 %	40 %	330823237
616	NC_015422	TAATA	2	10	633553	633562	60 %	40 %	0 %	0 %	330823237
617	NC_015422	CAGCC	2	10	633984	633993	20 %	0 %	20 %	60 %	330823238
618	NC_015422	GCAGG	2	10	634364	634373	20 %	0 %	60 %	20 %	330823238
619	NC_015422	CGCGG	2	10	634850	634859	0 %	0 %	60 %	40 %	330823239
620	NC_015422	GGCGC	2	10	636543	636552	0 %	0 %	60 %	40 %	330823241
621	NC_015422	CCGCG	2	10	636708	636717	0 %	0 %	40 %	60 %	330823241
622	NC_015422	CGCGG	2	10	637686	637695	0 %	0 %	60 %	40 %	330823242
623	NC_015422	CCGCG	2	10	641524	641533	0 %	0 %	40 %	60 %	330823246
624	NC_015422	CGGTG	2	10	642845	642854	0 %	20 %	60 %	20 %	330823248
625	NC_015422	TGCCC	2	10	643525	643534	0 %	20 %	20 %	60 %	330823249
626	NC_015422	GCCTC	2	10	646311	646320	0 %	20 %	20 %	60 %	330823253
627	NC_015422	GACGC	2	10	646497	646506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
628	NC_015422	CGCGG	2	10	648954	648963	0 %	0 %	60 %	40 %	330823256
629	NC_015422	GACTG	2	10	649822	649831	20 %	20 %	40 %	20 %	330823257
630	NC_015422	CGCTG	2	10	650874	650883	0 %	20 %	40 %	40 %	330823258
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