MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 4561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015138	ACAAG	2	10	1770	1779	60 %	0 %	20 %	20 %	326314825
2	NC_015138	CCACG	2	10	3814	3823	20 %	0 %	20 %	60 %	326314826
3	NC_015138	CCGAG	2	10	7739	7748	20 %	0 %	40 %	40 %	326314828
4	NC_015138	CCAAC	2	10	9470	9479	40 %	0 %	0 %	60 %	326314830
5	NC_015138	TCGGC	2	10	10860	10869	0 %	20 %	40 %	40 %	326314831
6	NC_015138	CAGAC	2	10	12498	12507	40 %	0 %	20 %	40 %	326314832
7	NC_015138	CACGC	2	10	16299	16308	20 %	0 %	20 %	60 %	326314834
8	NC_015138	GCTTG	2	10	17157	17166	0 %	40 %	40 %	20 %	326314835
9	NC_015138	CCCAA	2	10	19150	19159	40 %	0 %	0 %	60 %	326314836
10	NC_015138	GCACG	2	10	19628	19637	20 %	0 %	40 %	40 %	326314836
11	NC_015138	GCGGG	2	10	20358	20367	0 %	0 %	80 %	20 %	326314836
12	NC_015138	CGTTC	2	10	21665	21674	0 %	40 %	20 %	40 %	326314837
13	NC_015138	CGTGG	2	10	23624	23633	0 %	20 %	60 %	20 %	326314838
14	NC_015138	GATGC	2	10	24336	24345	20 %	20 %	40 %	20 %	326314839
15	NC_015138	CCCGG	2	10	25374	25383	0 %	0 %	40 %	60 %	326314840
16	NC_015138	GCTGG	2	10	25784	25793	0 %	20 %	60 %	20 %	326314840
17	NC_015138	GGCGC	2	10	26474	26483	0 %	0 %	60 %	40 %	326314841
18	NC_015138	CGGGG	2	10	28799	28808	0 %	0 %	80 %	20 %	326314844
19	NC_015138	CCGCG	2	10	30234	30243	0 %	0 %	40 %	60 %	326314846
20	NC_015138	GCGCT	2	10	30964	30973	0 %	20 %	40 %	40 %	326314846
21	NC_015138	CGCGC	2	10	31041	31050	0 %	0 %	40 %	60 %	326314846
22	NC_015138	GGCAC	2	10	31581	31590	20 %	0 %	40 %	40 %	326314846
23	NC_015138	AGCGC	2	10	34003	34012	20 %	0 %	40 %	40 %	326314850
24	NC_015138	GGCAG	2	10	36642	36651	20 %	0 %	60 %	20 %	326314852
25	NC_015138	ACGCC	2	10	37716	37725	20 %	0 %	20 %	60 %	326314853
26	NC_015138	GCCGC	2	10	38263	38272	0 %	0 %	40 %	60 %	326314853
27	NC_015138	GGGCA	2	10	38438	38447	20 %	0 %	60 %	20 %	326314853
28	NC_015138	CGACG	2	10	38512	38521	20 %	0 %	40 %	40 %	326314853
29	NC_015138	GCCAT	2	10	38881	38890	20 %	20 %	20 %	40 %	326314854
30	NC_015138	CCGCG	2	10	39495	39504	0 %	0 %	40 %	60 %	326314855
31	NC_015138	GCCGC	2	10	39638	39647	0 %	0 %	40 %	60 %	326314855
32	NC_015138	GGCCA	2	10	39721	39730	20 %	0 %	40 %	40 %	326314855
33	NC_015138	CGCGG	2	10	40282	40291	0 %	0 %	60 %	40 %	326314855
34	NC_015138	CGGAG	2	10	43086	43095	20 %	0 %	60 %	20 %	326314856
35	NC_015138	CGCGG	2	10	43614	43623	0 %	0 %	60 %	40 %	326314856
36	NC_015138	TGGGG	2	10	45018	45027	0 %	20 %	80 %	0 %	326314856
37	NC_015138	GTGGC	2	10	46736	46745	0 %	20 %	60 %	20 %	326314857
38	NC_015138	TGCGG	2	10	47561	47570	0 %	20 %	60 %	20 %	326314858
39	NC_015138	GGGCC	2	10	48366	48375	0 %	0 %	60 %	40 %	326314859
40	NC_015138	CGGCG	2	10	49723	49732	0 %	0 %	60 %	40 %	326314860
41	NC_015138	CTTGC	2	10	50732	50741	0 %	40 %	20 %	40 %	326314862
42	NC_015138	GGCGC	2	10	52984	52993	0 %	0 %	60 %	40 %	326314864
43	NC_015138	TGCGC	2	10	53776	53785	0 %	20 %	40 %	40 %	326314866
44	NC_015138	GGCGG	2	10	54043	54052	0 %	0 %	80 %	20 %	326314866
45	NC_015138	CGGGG	2	10	54241	54250	0 %	0 %	80 %	20 %	326314866
46	NC_015138	CGGAC	2	10	54397	54406	20 %	0 %	40 %	40 %	326314866
47	NC_015138	GCTGC	2	10	55067	55076	0 %	20 %	40 %	40 %	326314866
48	NC_015138	GCCGG	2	10	55600	55609	0 %	0 %	60 %	40 %	326314866
49	NC_015138	ATTCG	2	10	56061	56070	20 %	40 %	20 %	20 %	326314867
50	NC_015138	CGCAG	2	10	57281	57290	20 %	0 %	40 %	40 %	326314867
51	NC_015138	GGCGT	2	10	61971	61980	0 %	20 %	60 %	20 %	326314870
52	NC_015138	GGTCG	2	10	62851	62860	0 %	20 %	60 %	20 %	326314871
53	NC_015138	CCGGA	2	10	62877	62886	20 %	0 %	40 %	40 %	326314871
54	NC_015138	CTGCC	2	10	63136	63145	0 %	20 %	20 %	60 %	326314871
55	NC_015138	GCCCG	2	10	64669	64678	0 %	0 %	40 %	60 %	326314872
56	NC_015138	CGGCC	2	10	64933	64942	0 %	0 %	40 %	60 %	326314872
57	NC_015138	GCAGC	2	10	65229	65238	20 %	0 %	40 %	40 %	326314873
58	NC_015138	TGGCC	2	10	66695	66704	0 %	20 %	40 %	40 %	326314874
59	NC_015138	GAAGG	2	10	67486	67495	40 %	0 %	60 %	0 %	326314875
60	NC_015138	AGGCC	2	10	68188	68197	20 %	0 %	40 %	40 %	326314876
61	NC_015138	AGGCC	2	10	72664	72673	20 %	0 %	40 %	40 %	326314880
62	NC_015138	CGCTG	2	10	75187	75196	0 %	20 %	40 %	40 %	326314883
63	NC_015138	GCCGC	2	10	75223	75232	0 %	0 %	40 %	60 %	326314883
64	NC_015138	CCCGG	2	10	76779	76788	0 %	0 %	40 %	60 %	326314885
65	NC_015138	GGCCC	2	10	76997	77006	0 %	0 %	40 %	60 %	326314885
66	NC_015138	CCGCG	2	10	79820	79829	0 %	0 %	40 %	60 %	326314889
67	NC_015138	GCCGG	2	10	80864	80873	0 %	0 %	60 %	40 %	326314890
68	NC_015138	CACGC	2	10	81635	81644	20 %	0 %	20 %	60 %	326314890
69	NC_015138	CCAGG	2	10	82187	82196	20 %	0 %	40 %	40 %	326314891
70	NC_015138	GCCGC	2	10	83438	83447	0 %	0 %	40 %	60 %	326314891
71	NC_015138	CGCGG	2	10	83960	83969	0 %	0 %	60 %	40 %	326314892
72	NC_015138	CGCGG	2	10	87074	87083	0 %	0 %	60 %	40 %	326314894
73	NC_015138	TGCGC	2	10	87305	87314	0 %	20 %	40 %	40 %	326314894
74	NC_015138	GCCGT	2	10	88229	88238	0 %	20 %	40 %	40 %	326314895
75	NC_015138	GAACG	2	10	90295	90304	40 %	0 %	40 %	20 %	326314897
76	NC_015138	GGCCC	2	10	90381	90390	0 %	0 %	40 %	60 %	326314897
77	NC_015138	GGGGC	2	10	91805	91814	0 %	0 %	80 %	20 %	326314898
78	NC_015138	CGGCA	2	10	92185	92194	20 %	0 %	40 %	40 %	326314899
79	NC_015138	TGCGT	2	10	95446	95455	0 %	40 %	40 %	20 %	326314902
80	NC_015138	CGCGC	3	15	96424	96438	0 %	0 %	40 %	60 %	326314903
81	NC_015138	CGCGG	2	10	97029	97038	0 %	0 %	60 %	40 %	326314903
82	NC_015138	CCAGG	2	10	97101	97110	20 %	0 %	40 %	40 %	326314903
83	NC_015138	GCCGC	2	10	98008	98017	0 %	0 %	40 %	60 %	326314904
84	NC_015138	GCGGA	2	10	98445	98454	20 %	0 %	60 %	20 %	326314905
85	NC_015138	GCCCG	2	10	98880	98889	0 %	0 %	40 %	60 %	326314905
86	NC_015138	CCGGG	2	10	99019	99028	0 %	0 %	60 %	40 %	326314905
87	NC_015138	CGGCC	2	10	99182	99191	0 %	0 %	40 %	60 %	326314905
88	NC_015138	CCATG	2	10	99601	99610	20 %	20 %	20 %	40 %	326314905
89	NC_015138	ACGCC	2	10	99981	99990	20 %	0 %	20 %	60 %	326314906
90	NC_015138	GCTGC	2	10	100630	100639	0 %	20 %	40 %	40 %	326314906
91	NC_015138	CCTGG	2	10	101417	101426	0 %	20 %	40 %	40 %	326314907
92	NC_015138	CGCTG	2	10	101848	101857	0 %	20 %	40 %	40 %	326314907
93	NC_015138	CGGCG	2	10	104476	104485	0 %	0 %	60 %	40 %	326314909
94	NC_015138	GTGCG	2	10	105164	105173	0 %	20 %	60 %	20 %	326314909
95	NC_015138	CTCAC	2	10	107060	107069	20 %	20 %	0 %	60 %	326314911
96	NC_015138	GGCCA	2	10	107835	107844	20 %	0 %	40 %	40 %	326314912
97	NC_015138	CGGCC	2	10	108864	108873	0 %	0 %	40 %	60 %	326314913
98	NC_015138	GCGCC	2	10	110097	110106	0 %	0 %	40 %	60 %	326314914
99	NC_015138	CGCTG	2	10	112935	112944	0 %	20 %	40 %	40 %	326314917
100	NC_015138	CGGCC	2	10	114765	114774	0 %	0 %	40 %	60 %	326314919
101	NC_015138	CCGGC	2	10	115582	115591	0 %	0 %	40 %	60 %	326314921
102	NC_015138	CGGCC	2	10	116189	116198	0 %	0 %	40 %	60 %	326314921
103	NC_015138	GGGCG	2	10	116667	116676	0 %	0 %	80 %	20 %	326314922
104	NC_015138	GCGCC	2	10	116787	116796	0 %	0 %	40 %	60 %	326314922
105	NC_015138	GCCCG	2	10	117616	117625	0 %	0 %	40 %	60 %	326314923
106	NC_015138	CGGCG	2	10	118351	118360	0 %	0 %	60 %	40 %	326314925
107	NC_015138	GCGGT	2	10	120467	120476	0 %	20 %	60 %	20 %	326314928
108	NC_015138	CACGC	2	10	120623	120632	20 %	0 %	20 %	60 %	326314929
109	NC_015138	CTGGG	2	10	121052	121061	0 %	20 %	60 %	20 %	326314929
110	NC_015138	CTGCG	2	10	122346	122355	0 %	20 %	40 %	40 %	326314930
111	NC_015138	GCGCC	2	10	122716	122725	0 %	0 %	40 %	60 %	326314930
112	NC_015138	CCCGG	2	10	130271	130280	0 %	0 %	40 %	60 %	326314942
113	NC_015138	GGCGT	2	10	134173	134182	0 %	20 %	60 %	20 %	326314946
114	NC_015138	CGGCG	2	10	134441	134450	0 %	0 %	60 %	40 %	326314947
115	NC_015138	GCGGT	2	10	135076	135085	0 %	20 %	60 %	20 %	326314947
116	NC_015138	GCGCA	2	10	135132	135141	20 %	0 %	40 %	40 %	326314947
117	NC_015138	GGCGC	2	10	135986	135995	0 %	0 %	60 %	40 %	326314948
118	NC_015138	GCGCG	2	10	136894	136903	0 %	0 %	60 %	40 %	326314950
119	NC_015138	GCAGG	2	10	137539	137548	20 %	0 %	60 %	20 %	326314951
120	NC_015138	CGCAG	2	10	138301	138310	20 %	0 %	40 %	40 %	326314951
121	NC_015138	GGTCG	2	10	138644	138653	0 %	20 %	60 %	20 %	326314951
122	NC_015138	GCGCG	2	10	139465	139474	0 %	0 %	60 %	40 %	326314952
123	NC_015138	CGCGC	2	10	139701	139710	0 %	0 %	40 %	60 %	326314952
124	NC_015138	TCTGG	2	10	139865	139874	0 %	40 %	40 %	20 %	326314952
125	NC_015138	GCCGC	2	10	139916	139925	0 %	0 %	40 %	60 %	326314953
126	NC_015138	GGGCC	2	10	141491	141500	0 %	0 %	60 %	40 %	326314954
127	NC_015138	CGGCC	2	10	141869	141878	0 %	0 %	40 %	60 %	326314954
128	NC_015138	GCCAG	2	10	142246	142255	20 %	0 %	40 %	40 %	326314954
129	NC_015138	GGCCG	2	10	142967	142976	0 %	0 %	60 %	40 %	326314955
130	NC_015138	GCCCA	2	10	146427	146436	20 %	0 %	20 %	60 %	326314956
131	NC_015138	GGCCG	2	10	146561	146570	0 %	0 %	60 %	40 %	326314956
132	NC_015138	GGCGT	2	10	148552	148561	0 %	20 %	60 %	20 %	326314958
133	NC_015138	GAGGG	2	10	149023	149032	20 %	0 %	80 %	0 %	326314959
134	NC_015138	GGAGG	2	10	149066	149075	20 %	0 %	80 %	0 %	326314960
135	NC_015138	GCCGG	2	10	149368	149377	0 %	0 %	60 %	40 %	326314960
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254	NC_015138	GGCCG	2	10	284293	284302	0 %	0 %	60 %	40 %	326315074
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266	NC_015138	GCTGG	2	10	310797	310806	0 %	20 %	60 %	20 %	326315093
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