MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 4561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015138	GCATC	2	10	5397507	5397516	20 %	20 %	20 %	40 %	326319486
4502	NC_015138	ACCGC	2	10	5397603	5397612	20 %	0 %	20 %	60 %	326319486
4503	NC_015138	TCGTC	2	10	5398347	5398356	0 %	40 %	20 %	40 %	326319486
4504	NC_015138	GCGGA	2	10	5400480	5400489	20 %	0 %	60 %	20 %	326319487
4505	NC_015138	GAGCG	2	10	5402171	5402180	20 %	0 %	60 %	20 %	326319490
4506	NC_015138	CGGGC	2	10	5402570	5402579	0 %	0 %	60 %	40 %	326319490
4507	NC_015138	GGTCG	2	10	5404908	5404917	0 %	20 %	60 %	20 %	326319492
4508	NC_015138	GGGAG	2	10	5406136	5406145	20 %	0 %	80 %	0 %	326319492
4509	NC_015138	CCCGC	2	10	5408920	5408929	0 %	0 %	20 %	80 %	326319493
4510	NC_015138	AACTG	2	10	5412250	5412259	40 %	20 %	20 %	20 %	326319497
4511	NC_015138	GCACC	2	10	5413731	5413740	20 %	0 %	20 %	60 %	326319498
4512	NC_015138	CGCCA	2	10	5414312	5414321	20 %	0 %	20 %	60 %	326319499
4513	NC_015138	CGGCC	2	10	5414851	5414860	0 %	0 %	40 %	60 %	326319501
4514	NC_015138	AGCAC	2	10	5415373	5415382	40 %	0 %	20 %	40 %	326319502
4515	NC_015138	GCCGC	2	10	5418602	5418611	0 %	0 %	40 %	60 %	326319506
4516	NC_015138	GCCTC	2	10	5420185	5420194	0 %	20 %	20 %	60 %	326319507
4517	NC_015138	ACAGC	2	10	5421900	5421909	40 %	0 %	20 %	40 %	326319508
4518	NC_015138	CGGGG	2	10	5422256	5422265	0 %	0 %	80 %	20 %	326319509
4519	NC_015138	GGCCG	2	10	5422854	5422863	0 %	0 %	60 %	40 %	326319510
4520	NC_015138	GCACG	2	10	5423813	5423822	20 %	0 %	40 %	40 %	326319510
4521	NC_015138	GGGCA	2	10	5427227	5427236	20 %	0 %	60 %	20 %	326319514
4522	NC_015138	CTCGC	2	10	5427524	5427533	0 %	20 %	20 %	60 %	326319514
4523	NC_015138	GCGCG	2	10	5428000	5428009	0 %	0 %	60 %	40 %	326319514
4524	NC_015138	AGGCA	2	10	5428815	5428824	40 %	0 %	40 %	20 %	326319515
4525	NC_015138	GGCCT	2	10	5429517	5429526	0 %	20 %	40 %	40 %	326319516
4526	NC_015138	CGTGC	2	10	5430697	5430706	0 %	20 %	40 %	40 %	326319517
4527	NC_015138	ACGCC	2	10	5433810	5433819	20 %	0 %	20 %	60 %	326319521
4528	NC_015138	ACGGC	2	10	5434038	5434047	20 %	0 %	40 %	40 %	326319521
4529	NC_015138	CCAGC	2	10	5435746	5435755	20 %	0 %	20 %	60 %	326319521
4530	NC_015138	CGGCG	2	10	5437648	5437657	0 %	0 %	60 %	40 %	326319524
4531	NC_015138	GCCCA	2	10	5438618	5438627	20 %	0 %	20 %	60 %	326319525
4532	NC_015138	GGCGT	2	10	5439080	5439089	0 %	20 %	60 %	20 %	326319525
4533	NC_015138	CGGCA	2	10	5439094	5439103	20 %	0 %	40 %	40 %	326319525
4534	NC_015138	GCGCG	2	10	5439642	5439651	0 %	0 %	60 %	40 %	326319525
4535	NC_015138	GCGTG	2	10	5440819	5440828	0 %	20 %	60 %	20 %	326319526
4536	NC_015138	CCTGG	2	10	5442694	5442703	0 %	20 %	40 %	40 %	326319527
4537	NC_015138	TGGCC	2	10	5444166	5444175	0 %	20 %	40 %	40 %	326319528
4538	NC_015138	CTGCG	2	10	5448026	5448035	0 %	20 %	40 %	40 %	326319531
4539	NC_015138	CGCGC	2	10	5448503	5448512	0 %	0 %	40 %	60 %	326319531
4540	NC_015138	CGGCG	2	10	5449598	5449607	0 %	0 %	60 %	40 %	326319532
4541	NC_015138	CGCGC	2	10	5452005	5452014	0 %	0 %	40 %	60 %	326319534
4542	NC_015138	GCATG	2	10	5452436	5452445	20 %	20 %	40 %	20 %	326319534
4543	NC_015138	CCTGG	2	10	5453456	5453465	0 %	20 %	40 %	40 %	326319535
4544	NC_015138	CGCAC	2	10	5456335	5456344	20 %	0 %	20 %	60 %	326319537
4545	NC_015138	CTGGG	2	10	5456861	5456870	0 %	20 %	60 %	20 %	326319537
4546	NC_015138	GCGCT	2	10	5459323	5459332	0 %	20 %	40 %	40 %	326319539
4547	NC_015138	TGGGG	2	10	5463739	5463748	0 %	20 %	80 %	0 %	326319543
4548	NC_015138	CGCGC	2	10	5465486	5465495	0 %	0 %	40 %	60 %	326319546
4549	NC_015138	CGGCC	2	10	5466501	5466510	0 %	0 %	40 %	60 %	326319547
4550	NC_015138	CCAGC	2	10	5467129	5467138	20 %	0 %	20 %	60 %	326319548
4551	NC_015138	ACGCG	2	10	5467392	5467401	20 %	0 %	40 %	40 %	326319548
4552	NC_015138	ATGGC	2	10	5467609	5467618	20 %	20 %	40 %	20 %	326319549
4553	NC_015138	CGCGG	2	10	5467669	5467678	0 %	0 %	60 %	40 %	326319549
4554	NC_015138	CGCTG	2	10	5472058	5472067	0 %	20 %	40 %	40 %	326319552
4555	NC_015138	CGCGG	2	10	5472947	5472956	0 %	0 %	60 %	40 %	326319552
4556	NC_015138	CGCGC	2	10	5473577	5473586	0 %	0 %	40 %	60 %	326319552
4557	NC_015138	GCGCC	2	10	5475313	5475322	0 %	0 %	40 %	60 %	326319554
4558	NC_015138	GGCGA	2	10	5476299	5476308	20 %	0 %	60 %	20 %	326319555
4559	NC_015138	GCCCC	2	10	5477262	5477271	0 %	0 %	20 %	80 %	326319555
4560	NC_015138	GGCCG	2	10	5480180	5480189	0 %	0 %	60 %	40 %	326319557
4561	NC_015138	GCACG	2	10	5481335	5481344	20 %	0 %	40 %	40 %	326319559

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.