MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 1284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	CGC	2	6	267	272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
2	NC_014908	TGC	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760025
3	NC_014908	ACG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
4	NC_014908	TTC	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760025
5	NC_014908	CGA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
6	NC_014908	GGC	2	6	487	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760025
7	NC_014908	GCG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760025
8	NC_014908	AGT	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760025
9	NC_014908	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
10	NC_014908	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760025
11	NC_014908	GCT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760025
12	NC_014908	GCC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
13	NC_014908	ACC	2	6	881	886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760025
14	NC_014908	ACG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
15	NC_014908	AGG	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760025
16	NC_014908	CTT	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760026
17	NC_014908	TCG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760026
18	NC_014908	GTG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760026
19	NC_014908	AGC	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760026
20	NC_014908	TCG	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760026
21	NC_014908	GAT	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760026
22	NC_014908	AGA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760026
23	NC_014908	CCA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760026
24	NC_014908	CCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760026
25	NC_014908	CGA	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760028
26	NC_014908	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760028
27	NC_014908	GCC	2	6	3690	3695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760028
28	NC_014908	GCA	2	6	3780	3785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760028
29	NC_014908	GAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760029
30	NC_014908	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760029
31	NC_014908	TGG	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760029
32	NC_014908	TTC	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760029
33	NC_014908	GCG	2	6	4668	4673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760030
34	NC_014908	GAA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760030
35	NC_014908	GAG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760030
36	NC_014908	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760030
37	NC_014908	AGA	2	6	5036	5041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760031
38	NC_014908	ACA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760031
39	NC_014908	CCT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760031
40	NC_014908	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760031
41	NC_014908	GTG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760031
42	NC_014908	TCG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760031
43	NC_014908	GTC	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760031
44	NC_014908	ATT	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760032
45	NC_014908	GGC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
46	NC_014908	GGT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760032
47	NC_014908	GCG	3	9	5540	5548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
48	NC_014908	AAG	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760032
49	NC_014908	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760032
50	NC_014908	AGC	2	6	6175	6180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
51	NC_014908	GTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760032
52	NC_014908	TCA	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
53	NC_014908	ACG	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
54	NC_014908	CTA	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
55	NC_014908	GAT	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760032
56	NC_014908	TGT	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760032
57	NC_014908	CGT	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760032
58	NC_014908	ATC	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
59	NC_014908	CGA	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
60	NC_014908	CGG	2	6	6762	6767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
61	NC_014908	GCC	2	6	6833	6838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760032
62	NC_014908	GGT	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760032
63	NC_014908	CAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760032
64	NC_014908	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
65	NC_014908	GAA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760032
66	NC_014908	ACC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760032
67	NC_014908	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
68	NC_014908	CCA	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760033
69	NC_014908	TCG	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760033
70	NC_014908	TGC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760033
71	NC_014908	TGG	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760033
72	NC_014908	TTC	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760033
73	NC_014908	AGC	3	9	7834	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760033
74	NC_014908	GCT	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760034
75	NC_014908	GCC	3	9	8062	8070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760034
76	NC_014908	TTG	2	6	8192	8197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760034
77	NC_014908	ATG	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760034
78	NC_014908	ATT	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760034
79	NC_014908	AAG	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760034
80	NC_014908	AGC	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760034
81	NC_014908	CTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760034
82	NC_014908	AAT	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760035
83	NC_014908	TTC	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760035
84	NC_014908	CTC	2	6	8757	8762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760035
85	NC_014908	GGC	2	6	8769	8774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760035
86	NC_014908	ATC	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760035
87	NC_014908	AGC	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
88	NC_014908	ATT	2	6	8877	8882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760035
89	NC_014908	CGC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760035
90	NC_014908	TAA	2	6	8954	8959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760035
91	NC_014908	CAG	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
92	NC_014908	CGT	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760035
93	NC_014908	AGA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760035
94	NC_014908	CAG	2	6	9041	9046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
95	NC_014908	AGA	2	6	9047	9052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760035
96	NC_014908	ATG	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760036
97	NC_014908	CGC	2	6	9359	9364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760036
98	NC_014908	CAA	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760036
99	NC_014908	CAG	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760036
100	NC_014908	ACA	2	6	9541	9546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760036
101	NC_014908	GCG	2	6	9702	9707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760036
102	NC_014908	AAG	2	6	9729	9734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760036
103	NC_014908	CGA	2	6	11462	11467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760037
104	NC_014908	GAA	2	6	11475	11480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760037
105	NC_014908	TCG	2	6	11548	11553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760037
106	NC_014908	GTC	2	6	11571	11576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760037
107	NC_014908	CAT	2	6	11618	11623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760037
108	NC_014908	TGA	2	6	11725	11730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760037
109	NC_014908	CCG	2	6	11830	11835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760037
110	NC_014908	CCA	2	6	11848	11853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760037
111	NC_014908	AGC	2	6	12247	12252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760037
112	NC_014908	GAA	2	6	12270	12275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760037
113	NC_014908	AGA	2	6	12451	12456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760037
114	NC_014908	CAA	2	6	12527	12532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760037
115	NC_014908	TGT	2	6	12563	12568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760037
116	NC_014908	TTC	2	6	12613	12618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760037
117	NC_014908	CGC	2	6	12658	12663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760037
118	NC_014908	CAA	2	6	12950	12955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760037
119	NC_014908	GCA	2	6	13307	13312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760037
120	NC_014908	AAG	2	6	13485	13490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760037
121	NC_014908	CTA	2	6	13571	13576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760037
122	NC_014908	AAG	3	9	13992	14000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760038
123	NC_014908	GGC	2	6	14081	14086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760038
124	NC_014908	GTG	2	6	14217	14222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760038
125	NC_014908	CGA	2	6	14344	14349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760039
126	NC_014908	TTC	2	6	14438	14443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760039
127	NC_014908	TGG	2	6	14492	14497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760039
128	NC_014908	TGA	2	6	14505	14510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760039
129	NC_014908	GGT	2	6	14820	14825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760040
130	NC_014908	TGG	2	6	15133	15138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760040
131	NC_014908	CGA	2	6	15156	15161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760040
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153	NC_014908	CGC	2	6	16534	16539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760042
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254	NC_014908	TGA	2	6	25516	25521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760050
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282	NC_014908	ACA	2	6	27682	27687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760050
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