MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 1284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014908	ACA	2	6	89582	89587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760125
1002	NC_014908	CGC	2	6	89640	89645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760125
1003	NC_014908	AAC	2	6	89675	89680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760125
1004	NC_014908	CAT	2	6	89701	89706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760125
1005	NC_014908	ACC	2	6	89733	89738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760125
1006	NC_014908	CGA	2	6	89825	89830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760125
1007	NC_014908	CTG	2	6	89841	89846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760125
1008	NC_014908	ACT	2	6	89848	89853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760125
1009	NC_014908	TGC	2	6	89983	89988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760125
1010	NC_014908	CAT	2	6	90014	90019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760125
1011	NC_014908	CTG	2	6	90170	90175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760125
1012	NC_014908	TTG	2	6	90235	90240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760125
1013	NC_014908	CTG	2	6	90273	90278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760125
1014	NC_014908	ACC	2	6	90297	90302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760125
1015	NC_014908	GTC	2	6	90598	90603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760126
1016	NC_014908	GTC	2	6	90658	90663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760126
1017	NC_014908	AGC	2	6	90668	90673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760126
1018	NC_014908	CAT	2	6	90694	90699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760126
1019	NC_014908	TGC	2	6	90925	90930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760126
1020	NC_014908	CTG	2	6	91084	91089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760126
1021	NC_014908	GAT	2	6	91149	91154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760126
1022	NC_014908	TGC	2	6	91291	91296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760127
1023	NC_014908	CGC	2	6	91304	91309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760127
1024	NC_014908	GCA	2	6	91335	91340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760127
1025	NC_014908	TGT	2	6	91404	91409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760127
1026	NC_014908	TCT	2	6	91465	91470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760127
1027	NC_014908	GTG	2	6	91545	91550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760127
1028	NC_014908	GTG	2	6	91617	91622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760127
1029	NC_014908	AGT	2	6	91672	91677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760127
1030	NC_014908	TCA	2	6	91683	91688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760127
1031	NC_014908	CTT	2	6	91721	91726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760127
1032	NC_014908	GGC	2	6	91801	91806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760127
1033	NC_014908	CAA	2	6	91847	91852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760127
1034	NC_014908	GAA	2	6	91886	91891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760127
1035	NC_014908	CGC	2	6	91939	91944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760127
1036	NC_014908	GCA	2	6	91987	91992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760127
1037	NC_014908	GTA	2	6	92048	92053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760127
1038	NC_014908	CGC	2	6	92107	92112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760127
1039	NC_014908	CGA	2	6	92212	92217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760127
1040	NC_014908	CTT	2	6	92438	92443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760127
1041	NC_014908	CCG	2	6	92494	92499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760127
1042	NC_014908	CGG	2	6	92507	92512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760127
1043	NC_014908	GGC	2	6	92531	92536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760127
1044	NC_014908	GGT	2	6	92606	92611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760127
1045	NC_014908	TGT	2	6	92707	92712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760127
1046	NC_014908	GAA	2	6	93073	93078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760128
1047	NC_014908	GGC	2	6	93132	93137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760128
1048	NC_014908	GCG	2	6	93161	93166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760128
1049	NC_014908	CTG	2	6	93293	93298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760128
1050	NC_014908	AGC	2	6	93315	93320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760128
1051	NC_014908	GGC	2	6	93368	93373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760128
1052	NC_014908	GCC	2	6	93411	93416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760128
1053	NC_014908	TCG	2	6	93525	93530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760128
1054	NC_014908	GCG	2	6	93551	93556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760128
1055	NC_014908	TTG	2	6	93602	93607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760128
1056	NC_014908	TGC	2	6	93665	93670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760128
1057	NC_014908	TCG	2	6	94933	94938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1058	NC_014908	TCG	2	6	94952	94957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1059	NC_014908	GAG	2	6	94980	94985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760129
1060	NC_014908	GCA	2	6	94991	94996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1061	NC_014908	GAA	2	6	95124	95129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760129
1062	NC_014908	GGA	2	6	95157	95162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760129
1063	NC_014908	GGC	2	6	95253	95258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760129
1064	NC_014908	AAC	2	6	95301	95306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760129
1065	NC_014908	GGC	2	6	95384	95389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760129
1066	NC_014908	TGA	2	6	95504	95509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760129
1067	NC_014908	CGA	2	6	95847	95852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1068	NC_014908	CAG	3	9	95883	95891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1069	NC_014908	CCA	2	6	95945	95950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760129
1070	NC_014908	GAG	2	6	96033	96038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760129
1071	NC_014908	ATG	2	6	96067	96072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760129
1072	NC_014908	AAG	2	6	96123	96128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760129
1073	NC_014908	TCG	2	6	96136	96141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1074	NC_014908	CCA	2	6	96179	96184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760129
1075	NC_014908	TGA	2	6	96290	96295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760129
1076	NC_014908	GCT	2	6	96419	96424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1077	NC_014908	CCT	2	6	96443	96448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760129
1078	NC_014908	AGG	2	6	96481	96486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760129
1079	NC_014908	TCC	2	6	96532	96537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760129
1080	NC_014908	GCA	2	6	96596	96601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760129
1081	NC_014908	GGC	2	6	96626	96631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760129
1082	NC_014908	CGG	2	6	96716	96721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760129
1083	NC_014908	CAT	2	6	97160	97165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760130
1084	NC_014908	GGT	2	6	97359	97364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760130
1085	NC_014908	GAC	2	6	97376	97381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760130
1086	NC_014908	ACG	2	6	97482	97487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760130
1087	NC_014908	TGC	2	6	97720	97725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1088	NC_014908	TTG	2	6	97729	97734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760131
1089	NC_014908	AGT	2	6	97829	97834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760131
1090	NC_014908	CCA	2	6	97893	97898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760131
1091	NC_014908	AGG	2	6	97925	97930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760131
1092	NC_014908	CGT	2	6	97967	97972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1093	NC_014908	TCA	2	6	97985	97990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760131
1094	NC_014908	TCA	2	6	97999	98004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760131
1095	NC_014908	TTC	2	6	98019	98024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760131
1096	NC_014908	CCA	2	6	98025	98030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760131
1097	NC_014908	GCG	2	6	98031	98036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1098	NC_014908	GAA	2	6	98090	98095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760131
1099	NC_014908	CGA	2	6	98192	98197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1100	NC_014908	CTT	2	6	98213	98218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760131
1101	NC_014908	GCG	2	6	98254	98259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1102	NC_014908	GAT	2	6	98364	98369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760131
1103	NC_014908	CTT	2	6	98381	98386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760131
1104	NC_014908	GGC	2	6	98433	98438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1105	NC_014908	CTG	2	6	98508	98513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1106	NC_014908	CTG	2	6	98537	98542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1107	NC_014908	GCG	2	6	98738	98743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1108	NC_014908	TGG	2	6	98745	98750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760131
1109	NC_014908	CAG	2	6	98805	98810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1110	NC_014908	CTG	2	6	98814	98819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1111	NC_014908	GCG	2	6	98986	98991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1112	NC_014908	TGG	2	6	99035	99040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760131
1113	NC_014908	TCG	2	6	99199	99204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1114	NC_014908	CGG	2	6	99338	99343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1115	NC_014908	GGC	2	6	99364	99369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1116	NC_014908	CTT	2	6	99401	99406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760131
1117	NC_014908	CAG	2	6	99438	99443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1118	NC_014908	GCG	2	6	99525	99530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760131
1119	NC_014908	CTG	2	6	99543	99548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1120	NC_014908	CAC	2	6	99609	99614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760131
1121	NC_014908	GTC	2	6	99615	99620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1122	NC_014908	GCC	2	6	99838	99843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760131
1123	NC_014908	CGT	3	9	99854	99862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1124	NC_014908	GTC	2	6	99973	99978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1125	NC_014908	GCA	2	6	100001	100006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1126	NC_014908	GCA	2	6	100136	100141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760131
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1129	NC_014908	GTC	2	6	100282	100287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
1130	NC_014908	TGC	2	6	100468	100473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
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1142	NC_014908	TGA	2	6	100906	100911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760132
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1149	NC_014908	CGT	2	6	101379	101384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
1150	NC_014908	GTA	2	6	101465	101470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760132
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1152	NC_014908	TGC	2	6	101560	101565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
1153	NC_014908	GCC	3	9	101692	101700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760132
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1236	NC_014908	TGC	2	6	109386	109391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760142
1237	NC_014908	AAC	2	6	109406	109411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760142
1238	NC_014908	GCG	2	6	109445	109450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760143
1239	NC_014908	GCG	2	6	109522	109527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760143
1240	NC_014908	TCG	2	6	109535	109540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760143
1241	NC_014908	GCA	2	6	109590	109595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760143
1242	NC_014908	GCC	2	6	109616	109621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760143
1243	NC_014908	GTC	2	6	109954	109959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760144
1244	NC_014908	GCT	2	6	109999	110004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760144
1245	NC_014908	GAC	2	6	110060	110065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760144
1246	NC_014908	ACG	2	6	110231	110236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760144
1247	NC_014908	GTC	2	6	110309	110314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760144
1248	NC_014908	GCC	2	6	110327	110332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760144
1249	NC_014908	CGG	2	6	110350	110355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760144
1250	NC_014908	TCG	2	6	110394	110399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760144
1251	NC_014908	GGC	2	6	110411	110416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760144
1252	NC_014908	GGC	2	6	110425	110430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760144
1253	NC_014908	GAC	2	6	110523	110528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760144
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1258	NC_014908	TCG	2	6	114501	114506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760145
1259	NC_014908	GCG	2	6	114527	114532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760145
1260	NC_014908	TTG	2	6	114578	114583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760145
1261	NC_014908	TGC	2	6	114641	114646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760145
1262	NC_014908	CTG	2	6	115189	115194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760146
1263	NC_014908	TCA	2	6	115253	115258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760146
1264	NC_014908	AAC	2	6	115321	115326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760146
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1266	NC_014908	AAG	2	6	116318	116323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760147
1267	NC_014908	AGA	2	6	116432	116437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760147
1268	NC_014908	ACC	2	6	116489	116494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760147
1269	NC_014908	GCG	2	6	117160	117165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760148
1270	NC_014908	GCC	2	6	117186	117191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760148
1271	NC_014908	CTC	2	6	117320	117325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760148
1272	NC_014908	TGG	2	6	117362	117367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760148
1273	NC_014908	TCG	2	6	117376	117381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760148
1274	NC_014908	AGC	2	6	117462	117467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760148
1275	NC_014908	TGG	2	6	117951	117956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760149
1276	NC_014908	GCG	2	6	117998	118003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760149
1277	NC_014908	CAA	2	6	118121	118126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760149
1278	NC_014908	AAT	2	6	118330	118335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760149
1279	NC_014908	CCA	2	6	118455	118460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760149
1280	NC_014908	TTG	2	6	118552	118557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760149
1281	NC_014908	TCC	2	6	118647	118652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760149
1282	NC_014908	CAT	2	6	118706	118711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760149
1283	NC_014908	GAA	2	6	118887	118892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760149
1284	NC_014908	CAG	2	6	118902	118907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760149

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.